More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tery_3778 on replicon NC_008312
Organism: Trichodesmium erythraeum IMS101



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008312  Tery_3778  ribosome recycling factor  100 
 
 		 182 aa  365  1e-100  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.343725 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0629  ribosome recycling factor  71.98 
 
 		 187 aa  277  7e-74  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.418172 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2698  ribosome recycling factor  70.88 
 
 		 182 aa  274  4e-73  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0065  ribosome recycling factor  70.33 
 
 		 182 aa  271  5.000000000000001e-72  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.759475  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4637  ribosome recycling factor  68.68 
 
 		 182 aa  267  5e-71  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.138932  normal  0.818253 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3546  ribosome recycling factor  70.56 
 
 		 181 aa  265  2.9999999999999995e-70  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2560  ribosome recycling factor  70 
 
 		 181 aa  263  1e-69  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0507  ribosome recycling factor  65.93 
 
 		 182 aa  256  1e-67  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0710  ribosome recycling factor  57.69 
 
 		 182 aa  227  8e-59  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_05231  ribosome recycling factor  59.89 
 
 		 182 aa  227  9e-59  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_07611  ribosome recycling factor  60.69 
 
 		 173 aa  223  1e-57  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0633499 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1649  ribosome recycling factor  57.95 
 
 		 182 aa  222  3e-57  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_05771  ribosome recycling factor  60.44 
 
 		 182 aa  220  9e-57  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.409534  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0521  ribosome recycling factor  58.24 
 
 		 182 aa  215  2.9999999999999998e-55  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_05781  ribosome recycling factor  56.04 
 
 		 182 aa  215  2.9999999999999998e-55  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_05851  ribosome recycling factor  58.24 
 
 		 182 aa  214  4e-55  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_05471  ribosome recycling factor  61.27 
 
 		 173 aa  214  5e-55  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1853  ribosome recycling factor  56.04 
 
 		 182 aa  213  9.999999999999999e-55  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3871  ribosome recycling factor  53.89 
 
 		 185 aa  201  4e-51  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0168076  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3865  ribosome recycling factor  53.89 
 
 		 185 aa  201  4e-51  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00928808  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3922  ribosome recycling factor  53.33 
 
 		 185 aa  199  9.999999999999999e-51  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0969461  n/a   
 
 
-
 
NC_011690  PHATRDRAFT_40048  predicted protein  53.93 
 
 		 225 aa  198  3e-50  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  hitchhiker  0.00311694  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3647  ribosome recycling factor  52.78 
 
 		 185 aa  198  3e-50  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0174734  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3565  ribosome recycling factor  52.78 
 
 		 185 aa  197  5e-50  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.603259  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3583  ribosome recycling factor  52.78 
 
 		 185 aa  197  5e-50  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1813  ribosome recycling factor  53.11 
 
 		 184 aa  197  5e-50  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000182094  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3836  ribosome recycling factor  52.78 
 
 		 185 aa  197  5e-50  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  3.64109e-62 
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_12187  predicted protein  53.14 
 
 		 176 aa  197  7e-50  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.17047  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3675  ribosome recycling factor  52.78 
 
 		 185 aa  197  7.999999999999999e-50  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.979275  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3962  ribosome recycling factor  52.78 
 
 		 185 aa  197  7.999999999999999e-50  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.60954  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1321  ribosome recycling factor  52.22 
 
 		 185 aa  196  1.0000000000000001e-49  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.198825  hitchhiker  0.00000000000000123018 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3706  ribosome recycling factor  52.22 
 
 		 185 aa  196  1.0000000000000001e-49  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0497206  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2476  ribosome recycling factor  52.22 
 
 		 185 aa  196  2.0000000000000003e-49  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000697706  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2112  ribosome recycling factor  51.67 
 
 		 186 aa  196  2.0000000000000003e-49  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011696  PHATRDRAFT_41282  predicted protein  54.91 
 
 		 173 aa  195  3e-49  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  decreased coverage  0.000037701  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1128  ribosome recycling factor  50.56 
 
 		 184 aa  192  2e-48  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.440044  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2036  ribosome recycling factor  51.67 
 
 		 186 aa  192  2e-48  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0519  ribosome recycling factor  51.11 
 
 		 186 aa  192  3e-48  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1422  ribosome recycling factor  53.41 
 
 		 187 aa  191  4e-48  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0768793  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1144  ribosome recycling factor  53.67 
 
 		 185 aa  191  5e-48  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000279866  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3210  ribosome recycling factor  50 
 
 		 185 aa  190  1e-47  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000000238814  hitchhiker  0.0000000602253 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2919  ribosome recycling factor  50.28 
 
 		 186 aa  189  1e-47  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.174611 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0077  ribosome recycling factor  51.11 
 
 		 185 aa  189  2e-47  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.010398  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0581  ribosome recycling factor  50.56 
 
 		 184 aa  188  4e-47  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1975  ribosome recycling factor  50.28 
 
 		 184 aa  187  5.999999999999999e-47  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.552095  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2472  ribosome recycling factor  49.44 
 
 		 185 aa  187  5.999999999999999e-47  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0477  ribosome recycling factor  50.57 
 
 		 185 aa  187  8e-47  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0474478  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_10920  ribosome recycling factor  48.88 
 
 		 186 aa  187  9e-47  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0728725  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1512  ribosome recycling factor  49.15 
 
 		 185 aa  186  1e-46  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  decreased coverage  0.00300903  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1401  ribosome recycling factor  48.9 
 
 		 186 aa  185  2e-46  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.100309  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07680  ribosome recycling factor  50.28 
 
 		 185 aa  185  3e-46  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.029169  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1035  ribosome recycling factor  50 
 
 		 185 aa  184  6e-46  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000462528  unclonable  0.0000000105333 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0804  ribosome recycling factor  48.31 
 
 		 185 aa  184  6e-46  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000144692  hitchhiker  0.0000000000784009 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3514  ribosome recycling factor  46.67 
 
 		 185 aa  184  7e-46  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.763665  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1658  ribosome recycling factor  49.44 
 
 		 184 aa  181  4.0000000000000006e-45  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.375108  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2379  ribosome recycling factor  46.96 
 
 		 184 aa  181  4.0000000000000006e-45  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23610  ribosome recycling factor  47.22 
 
 		 184 aa  180  8.000000000000001e-45  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.093506 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1944  ribosome recycling factor  49.44 
 
 		 184 aa  180  8.000000000000001e-45  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.757618 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3730  ribosome recycling factor  47.98 
 
 		 185 aa  180  9.000000000000001e-45  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000000151569  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0826  ribosome recycling factor  47.78 
 
 		 184 aa  180  1e-44  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.000458151  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0885  ribosome recycling factor  47.22 
 
 		 185 aa  179  1e-44  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.0000000127588  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1319  ribosome recycling factor  48.33 
 
 		 184 aa  180  1e-44  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.362878  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1345  ribosome recycling factor  48.33 
 
 		 184 aa  180  1e-44  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00867514  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0374  ribosome recycling factor  47.78 
 
 		 185 aa  179  2e-44  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1007  ribosome recycling factor  46.67 
 
 		 185 aa  179  2e-44  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2638  ribosome recycling factor  47.49 
 
 		 185 aa  179  2e-44  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.00000000456907  normal  0.10147 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2705  ribosome recycling factor  47.49 
 
 		 185 aa  179  2e-44  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.00000841959  hitchhiker  0.00246061 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1843  ribosome recycling factor  48.33 
 
 		 185 aa  179  2e-44  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.773787 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2812  ribosome recycling factor  47.49 
 
 		 185 aa  179  2e-44  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.0000000100926  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1878  ribosome recycling factor  50.28 
 
 		 186 aa  179  2.9999999999999997e-44  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.556612  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1430  ribosome recycling factor  51.67 
 
 		 184 aa  178  4e-44  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00121871  normal  0.0745134 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2291  ribosome recycling factor  48.02 
 
 		 185 aa  178  4.999999999999999e-44  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  decreased coverage  0.000106212  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0475  ribosome recycling factor  49.44 
 
 		 185 aa  178  4.999999999999999e-44  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.840836  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1918  ribosome recycling factor  46.82 
 
 		 185 aa  177  5.999999999999999e-44  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2711  ribosome recycling factor  47.22 
 
 		 185 aa  177  5.999999999999999e-44  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0873966  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_318  ribosome recycling factor  48.33 
 
 		 185 aa  177  7e-44  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.108452  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1632  ribosome recycling factor  46.37 
 
 		 185 aa  177  9e-44  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0788  ribosome recycling factor  49.15 
 
 		 189 aa  177  9e-44  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.119602 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1200  ribosome recycling factor  45.86 
 
 		 185 aa  176  1e-43  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0000906097  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1003  ribosome recycling factor  46.93 
 
 		 183 aa  176  2e-43  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000000111257  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1539  ribosome recycling factor  47.22 
 
 		 185 aa  175  3e-43  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.34519 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1676  ribosome recycling factor  48.04 
 
 		 185 aa  175  4e-43  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1351  ribosome recycling factor  45.81 
 
 		 185 aa  175  4e-43  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0000000717676  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2452  ribosome recycling factor  46.93 
 
 		 186 aa  174  4e-43  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.26871  hitchhiker  0.00149746 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1670  ribosome recycling factor  48.04 
 
 		 185 aa  174  5e-43  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1162  ribosome recycling factor  46.93 
 
 		 185 aa  174  9e-43  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1685  ribosome recycling factor  46.37 
 
 		 186 aa  174  9e-43  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.188884 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2345  ribosome recycling factor  47.16 
 
 		 185 aa  173  9.999999999999999e-43  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.082368  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1918  ribosome recycling factor  47.22 
 
 		 185 aa  173  9.999999999999999e-43  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  6.36169e-22  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0708  ribosome recycling factor  46.89 
 
 		 181 aa  173  9.999999999999999e-43  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.0000756586  unclonable  0.0000000210923 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3162  ribosome recycling factor  49.43 
 
 		 185 aa  173  9.999999999999999e-43  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0860569  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0216  ribosome recycling factor  47.7 
 
 		 185 aa  173  9.999999999999999e-43  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0660  ribosome recycling factor  48.6 
 
 		 185 aa  172  1.9999999999999998e-42  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1335  ribosome recycling factor  45.81 
 
 		 186 aa  172  1.9999999999999998e-42  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.43872  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2625  ribosome recycling factor  46.67 
 
 		 184 aa  172  2.9999999999999996e-42  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000000230935  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1275  ribosome recycling factor  48.33 
 
 		 185 aa  172  2.9999999999999996e-42  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  decreased coverage  0.00110727  normal  0.535196 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1781  ribosome recycling factor  46.11 
 
 		 185 aa  172  2.9999999999999996e-42  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1407  ribosome recycling factor  46.37 
 
 		 186 aa  171  3.9999999999999995e-42  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1557  ribosome recycling factor  45 
 
 		 185 aa  171  3.9999999999999995e-42  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000000135969  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0356  ribosome recycling factor  48.55 
 
 		 173 aa  171  3.9999999999999995e-42  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.0472189  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>