More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fjoh_0575 on replicon NC_009441
Organism: Flavobacterium johnsoniae UW101



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009441  Fjoh_0575  ribosome recycling factor  100 
 
 		 187 aa  377  1e-104  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04050  ribosome recycling factor  66.84 
 
 		 185 aa  259  2e-68  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.647484  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1898  ribosome recycling factor  64.17 
 
 		 184 aa  255  3e-67  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0633541  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0389  ribosome recycling factor  55.61 
 
 		 187 aa  216  1e-55  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0303033 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0578  ribosome recycling factor (ribosome releasing factor)  56.76 
 
 		 186 aa  213  9.999999999999999e-55  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.552167 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2999  ribosome recycling factor  54.05 
 
 		 186 aa  213  1.9999999999999998e-54  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0116  ribosome recycling factor  54.01 
 
 		 187 aa  202  2e-51  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2387  ribosome recycling factor  51.35 
 
 		 186 aa  201  6e-51  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.164667  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1351  hypothetical protein  51.89 
 
 		 186 aa  200  9.999999999999999e-51  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2112  ribosome recycling factor  50.81 
 
 		 186 aa  199  1.9999999999999998e-50  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0010  ribosome recycling factor  48.92 
 
 		 192 aa  195  3e-49  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0696052  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1901  ribosome recycling factor  49.73 
 
 		 186 aa  191  4e-48  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.782843 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2919  ribosome recycling factor  47.03 
 
 		 186 aa  191  6e-48  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.174611 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1128  ribosome recycling factor  47.28 
 
 		 184 aa  190  1e-47  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.440044  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1918  ribosome recycling factor  50.28 
 
 		 185 aa  189  2e-47  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0519  ribosome recycling factor  47.57 
 
 		 186 aa  189  2.9999999999999997e-47  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2753  ribosome recycling factor  48.07 
 
 		 185 aa  188  5e-47  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.63878  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1282  ribosome recycling factor  46.2 
 
 		 185 aa  186  2e-46  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  unclonable  0.00000000000000366075  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1142  ribosome recycling factor  47.28 
 
 		 185 aa  184  8e-46  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.0000869669  normal  0.111417 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3730  ribosome recycling factor  47.51 
 
 		 185 aa  184  9e-46  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000000151569  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1813  ribosome recycling factor  51.11 
 
 		 184 aa  182  2.0000000000000003e-45  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000182094  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1556  ribosome recycling factor  46.74 
 
 		 185 aa  182  3e-45  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.188026  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1438  ribosome recycling factor  49.72 
 
 		 186 aa  181  5.0000000000000004e-45  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.389466  hitchhiker  0.000418835 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3647  ribosome recycling factor  49.17 
 
 		 185 aa  181  6e-45  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0174734  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1144  ribosome recycling factor  46.96 
 
 		 185 aa  181  8.000000000000001e-45  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000279866  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1253  ribosome recycling factor  46.28 
 
 		 185 aa  180  8.000000000000001e-45  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000298645  hitchhiker  0.00105804 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1321  ribosome recycling factor  49.17 
 
 		 185 aa  180  9.000000000000001e-45  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.198825  hitchhiker  0.00000000000000123018 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3565  ribosome recycling factor  49.17 
 
 		 185 aa  180  9.000000000000001e-45  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.603259  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3583  ribosome recycling factor  49.17 
 
 		 185 aa  180  9.000000000000001e-45  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3836  ribosome recycling factor  49.17 
 
 		 185 aa  180  9.000000000000001e-45  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  3.64109e-62 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1783  ribosome recycling factor  50 
 
 		 185 aa  180  9.000000000000001e-45  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00108157  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01376  ribosome recycling factor  48.37 
 
 		 185 aa  180  1e-44  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0186665  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1918  ribosome recycling factor  44.2 
 
 		 185 aa  179  2e-44  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  6.36169e-22  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1848  ribosome recycling factor  46.74 
 
 		 185 aa  179  2e-44  Vibrio cholerae O395  Bacteria  unclonable  0.00000000000000201497  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3210  ribosome recycling factor  46.96 
 
 		 185 aa  179  2e-44  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000000238814  hitchhiker  0.0000000602253 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2036  ribosome recycling factor  46.41 
 
 		 186 aa  179  2e-44  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0570  ribosome recycling factor  46.74 
 
 		 185 aa  179  2.9999999999999997e-44  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0496987  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3922  ribosome recycling factor  48.62 
 
 		 185 aa  179  2.9999999999999997e-44  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0969461  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1488  ribosome recycling factor  47.4 
 
 		 185 aa  179  2.9999999999999997e-44  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0169142 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3706  ribosome recycling factor  44.57 
 
 		 185 aa  178  4e-44  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0497206  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3865  ribosome recycling factor  48.62 
 
 		 185 aa  178  4e-44  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00928808  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03234  ribosome recycling factor  45.11 
 
 		 185 aa  178  4e-44  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3871  ribosome recycling factor  48.62 
 
 		 185 aa  178  4e-44  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0168076  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2476  ribosome recycling factor  48.62 
 
 		 185 aa  178  4.999999999999999e-44  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000697706  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0885  ribosome recycling factor  46.2 
 
 		 185 aa  178  4.999999999999999e-44  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.0000000127588  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3675  ribosome recycling factor  48.62 
 
 		 185 aa  177  5.999999999999999e-44  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.979275  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3962  ribosome recycling factor  48.62 
 
 		 185 aa  177  5.999999999999999e-44  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.60954  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2582  ribosome recycling factor  49.17 
 
 		 186 aa  177  7e-44  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.336075  normal  0.0361828 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1226  ribosome recycling factor  49.17 
 
 		 186 aa  177  7e-44  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.125254  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1407  ribosome recycling factor  47.51 
 
 		 186 aa  177  1e-43  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1975  ribosome recycling factor  43.89 
 
 		 184 aa  177  1e-43  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.552095  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2973  ribosome recycling factor  48.86 
 
 		 185 aa  177  1e-43  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2434  ribosome recycling factor  48.62 
 
 		 186 aa  176  2e-43  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0313731  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0826  ribosome recycling factor  48.62 
 
 		 184 aa  176  2e-43  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.000458151  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1552  ribosome recycling factor  48.62 
 
 		 186 aa  176  2e-43  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2580  ribosome recycling factor  48.62 
 
 		 186 aa  176  2e-43  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1325  ribosome recycling factor  48.62 
 
 		 186 aa  176  2e-43  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0289556  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3258  ribosome recycling factor  48.62 
 
 		 186 aa  176  2e-43  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.797404  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1275  ribosome recycling factor  47.28 
 
 		 185 aa  176  2e-43  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  decreased coverage  0.00110727  normal  0.535196 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2594  ribosome recycling factor  46.74 
 
 		 187 aa  176  2e-43  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.00709219  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0581  ribosome recycling factor  47.22 
 
 		 184 aa  176  2e-43  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002749  ribosome recycling factor  45.65 
 
 		 185 aa  176  2e-43  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000016264  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2053  ribosome recycling factor  48.62 
 
 		 186 aa  176  2e-43  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2490  ribosome recycling factor  48.62 
 
 		 186 aa  176  2e-43  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1944  ribosome recycling factor  45.3 
 
 		 184 aa  175  4e-43  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.757618 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2602  ribosome recycling factor  48.13 
 
 		 189 aa  175  4e-43  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2882  ribosome recycling factor  46.15 
 
 		 185 aa  175  4e-43  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.000000000396733  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2379  ribosome recycling factor  47.4 
 
 		 184 aa  174  5e-43  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1801  ribosome recycling factor  47.83 
 
 		 184 aa  173  9.999999999999999e-43  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0761482  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3278  ribosome recycling factor  45.3 
 
 		 185 aa  173  9.999999999999999e-43  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000213543  hitchhiker  0.000283754 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1878  ribosome recycling factor  48.6 
 
 		 186 aa  173  9.999999999999999e-43  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.556612  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1527  ribosome recycling factor  48.88 
 
 		 185 aa  173  9.999999999999999e-43  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00139576  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1281  ribosome recycling factor  47.51 
 
 		 186 aa  173  9.999999999999999e-43  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.208847 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3158  ribosome recycling factor  46.82 
 
 		 185 aa  173  9.999999999999999e-43  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000691666  normal  0.144971 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1826  ribosome recycling factor  48.07 
 
 		 186 aa  173  9.999999999999999e-43  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.866362 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1453  ribosome recycling factor  44.57 
 
 		 185 aa  172  1.9999999999999998e-42  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000049819  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1441  ribosome recycling factor  50.88 
 
 		 186 aa  172  1.9999999999999998e-42  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.378711 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2899  ribosome recycling factor  44.57 
 
 		 185 aa  172  1.9999999999999998e-42  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000932331  normal  0.103531 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0660  ribosome recycling factor  49.17 
 
 		 185 aa  172  1.9999999999999998e-42  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1035  ribosome recycling factor  46.41 
 
 		 185 aa  172  1.9999999999999998e-42  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000462528  unclonable  0.0000000105333 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2632  ribosome recycling factor  44.57 
 
 		 185 aa  173  1.9999999999999998e-42  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.00000000751677  normal  0.363086 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1422  ribosome recycling factor  43.09 
 
 		 187 aa  172  1.9999999999999998e-42  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0768793  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1951  ribosome recycling factor  45.65 
 
 		 185 aa  172  1.9999999999999998e-42  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1669  ribosome recycling factor  45.65 
 
 		 185 aa  172  1.9999999999999998e-42  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.17061  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4945  ribosome recycling factor  46.41 
 
 		 186 aa  172  1.9999999999999998e-42  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.345232 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1448  ribosome recycling factor  44.02 
 
 		 185 aa  172  2.9999999999999996e-42  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000214173  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2345  ribosome recycling factor  45.6 
 
 		 185 aa  172  2.9999999999999996e-42  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.082368  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0216  ribosome recycling factor  49.38 
 
 		 185 aa  172  2.9999999999999996e-42  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2711  ribosome recycling factor  49.13 
 
 		 185 aa  172  2.9999999999999996e-42  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0873966  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1260  ribosome recycling factor  48.62 
 
 		 186 aa  172  2.9999999999999996e-42  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.194359  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0609  ribosome recycling factor  45.4 
 
 		 174 aa  172  2.9999999999999996e-42  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.000570491  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2978  ribosome recycling factor  46.15 
 
 		 185 aa  172  2.9999999999999996e-42  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0077  ribosome recycling factor  45.65 
 
 		 185 aa  172  2.9999999999999996e-42  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.010398  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0986  ribosome recycling factor  46.15 
 
 		 185 aa  172  2.9999999999999996e-42  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.00114143  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0510  ribosome recycling factor  48 
 
 		 186 aa  172  2.9999999999999996e-42  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.0317856  normal  0.376064 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1484  ribosome recycling factor  44.02 
 
 		 185 aa  172  2.9999999999999996e-42  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.0000000709639  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1534  ribosome recycling factor  46.96 
 
 		 184 aa  171  3.9999999999999995e-42  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0202403 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1448  ribosome recycling factor  47.19 
 
 		 186 aa  171  3.9999999999999995e-42  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1539  ribosome recycling factor  45.11 
 
 		 185 aa  172  3.9999999999999995e-42  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.34519 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2050  ribosome recycling factor  43.48 
 
 		 185 aa  171  3.9999999999999995e-42  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.774761  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>