More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Emin_0706 on replicon NC_010644
Organism: Elusimicrobium minutum Pei191



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010644  Emin_0706  ribosome recycling factor  100 
 
 		 187 aa  375  1e-103  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000000018395 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1813  ribosome recycling factor  49.46 
 
 		 184 aa  190  1e-47  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000182094  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2379  ribosome recycling factor  52.02 
 
 		 184 aa  189  2e-47  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1128  ribosome recycling factor  53.18 
 
 		 184 aa  188  4e-47  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.440044  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1918  ribosome recycling factor  52.49 
 
 		 185 aa  187  7e-47  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  6.36169e-22  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0826  ribosome recycling factor  48.37 
 
 		 184 aa  186  1e-46  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.000458151  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2919  ribosome recycling factor  55.42 
 
 		 186 aa  186  2e-46  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.174611 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1144  ribosome recycling factor  50.54 
 
 		 185 aa  186  2e-46  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000279866  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2036  ribosome recycling factor  50 
 
 		 186 aa  186  2e-46  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2476  ribosome recycling factor  50 
 
 		 185 aa  184  5e-46  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000697706  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1321  ribosome recycling factor  50.55 
 
 		 185 aa  183  1.0000000000000001e-45  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.198825  hitchhiker  0.00000000000000123018 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3565  ribosome recycling factor  50.55 
 
 		 185 aa  183  1.0000000000000001e-45  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.603259  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3583  ribosome recycling factor  50.55 
 
 		 185 aa  183  1.0000000000000001e-45  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3836  ribosome recycling factor  50.55 
 
 		 185 aa  183  1.0000000000000001e-45  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  3.64109e-62 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0519  ribosome recycling factor  54.91 
 
 		 186 aa  183  2.0000000000000003e-45  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1319  ribosome recycling factor  47.83 
 
 		 184 aa  182  2.0000000000000003e-45  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.362878  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3647  ribosome recycling factor  50 
 
 		 185 aa  182  2.0000000000000003e-45  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0174734  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1345  ribosome recycling factor  47.83 
 
 		 184 aa  182  2.0000000000000003e-45  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00867514  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3675  ribosome recycling factor  50.55 
 
 		 185 aa  182  3e-45  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.979275  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3962  ribosome recycling factor  50.55 
 
 		 185 aa  182  3e-45  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.60954  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3922  ribosome recycling factor  50 
 
 		 185 aa  181  4.0000000000000006e-45  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0969461  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3865  ribosome recycling factor  49.45 
 
 		 185 aa  180  8.000000000000001e-45  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00928808  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3871  ribosome recycling factor  49.45 
 
 		 185 aa  180  8.000000000000001e-45  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0168076  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2112  ribosome recycling factor  52.02 
 
 		 186 aa  178  4.999999999999999e-44  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1944  ribosome recycling factor  49.17 
 
 		 184 aa  177  5.999999999999999e-44  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.757618 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0581  ribosome recycling factor  44.02 
 
 		 184 aa  177  7e-44  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2291  ribosome recycling factor  46.99 
 
 		 185 aa  176  1e-43  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  decreased coverage  0.000106212  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1918  ribosome recycling factor  46.96 
 
 		 185 aa  176  2e-43  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3730  ribosome recycling factor  46.41 
 
 		 185 aa  176  2e-43  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000000151569  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1512  ribosome recycling factor  45.6 
 
 		 185 aa  175  3e-43  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  decreased coverage  0.00300903  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1003  ribosome recycling factor  52.02 
 
 		 183 aa  175  3e-43  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000000111257  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1253  ribosome recycling factor  46.15 
 
 		 185 aa  175  3e-43  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000298645  hitchhiker  0.00105804 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2711  ribosome recycling factor  46.96 
 
 		 185 aa  173  1.9999999999999998e-42  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0873966  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1035  ribosome recycling factor  44.02 
 
 		 185 aa  172  2.9999999999999996e-42  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000462528  unclonable  0.0000000105333 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1422  ribosome recycling factor  42.86 
 
 		 187 aa  172  2.9999999999999996e-42  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0768793  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1488  ribosome recycling factor  44.57 
 
 		 185 aa  171  5e-42  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0169142 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1384  ribosome recycling factor  45.05 
 
 		 185 aa  171  7.999999999999999e-42  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.0000000000556086  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0475  ribosome recycling factor  48.62 
 
 		 185 aa  170  1e-41  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.840836  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23610  ribosome recycling factor  41.3 
 
 		 184 aa  169  2e-41  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.093506 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0507  ribosome recycling factor  47.16 
 
 		 182 aa  169  2e-41  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1658  ribosome recycling factor  48.91 
 
 		 184 aa  169  3e-41  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.375108  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0885  ribosome recycling factor  47.28 
 
 		 185 aa  169  3e-41  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.0000000127588  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0745  ribosome recycling factor  48.5 
 
 		 185 aa  168  4e-41  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.000000436383  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2753  ribosome recycling factor  44.57 
 
 		 185 aa  168  4e-41  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.63878  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_05231  ribosome recycling factor  47.13 
 
 		 182 aa  167  6e-41  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0609  ribosome recycling factor  48.28 
 
 		 174 aa  167  7e-41  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.000570491  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2047  ribosome recycling factor  43.65 
 
 		 185 aa  167  7e-41  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.082584  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_318  ribosome recycling factor  45.86 
 
 		 185 aa  167  1e-40  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.108452  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1278  ribosome recycling factor  45.3 
 
 		 185 aa  167  1e-40  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1951  ribosome recycling factor  46.2 
 
 		 185 aa  166  2e-40  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1669  ribosome recycling factor  46.2 
 
 		 185 aa  166  2e-40  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.17061  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0077  ribosome recycling factor  45.11 
 
 		 185 aa  166  2e-40  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.010398  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0804  ribosome recycling factor  43.33 
 
 		 185 aa  166  2e-40  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000144692  hitchhiker  0.0000000000784009 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0445  ribosome recycling factor  45.09 
 
 		 185 aa  166  2e-40  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00199228  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_05771  ribosome recycling factor  46.55 
 
 		 182 aa  166  2e-40  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.409534  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_05471  ribosome recycling factor  46.82 
 
 		 173 aa  166  2e-40  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0374  ribosome recycling factor  45.3 
 
 		 185 aa  165  4e-40  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0521  ribosome recycling factor  46.55 
 
 		 182 aa  165  4e-40  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_05851  ribosome recycling factor  46.59 
 
 		 182 aa  165  4e-40  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4637  ribosome recycling factor  46.24 
 
 		 182 aa  164  5e-40  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.138932  normal  0.818253 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1430  ribosome recycling factor  42.86 
 
 		 185 aa  164  5.9999999999999996e-40  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.792469  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0510  ribosome recycling factor  47.98 
 
 		 186 aa  164  5.9999999999999996e-40  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.0317856  normal  0.376064 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1517  ribosome recycling factor  43.48 
 
 		 185 aa  164  8e-40  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1853  ribosome recycling factor  45.45 
 
 		 182 aa  164  1.0000000000000001e-39  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1781  ribosome recycling factor  45.65 
 
 		 185 aa  163  1.0000000000000001e-39  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1843  ribosome recycling factor  46.41 
 
 		 185 aa  163  1.0000000000000001e-39  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.773787 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2345  ribosome recycling factor  49.12 
 
 		 185 aa  162  2.0000000000000002e-39  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.082368  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_05781  ribosome recycling factor  45.45 
 
 		 182 aa  162  2.0000000000000002e-39  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1200  ribosome recycling factor  46.24 
 
 		 185 aa  162  2.0000000000000002e-39  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0000906097  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3210  ribosome recycling factor  46.15 
 
 		 185 aa  162  2.0000000000000002e-39  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000000238814  hitchhiker  0.0000000602253 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0710  ribosome recycling factor  44.32 
 
 		 182 aa  162  3e-39  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1345  ribosome recycling factor  48.55 
 
 		 186 aa  162  3e-39  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0459515  normal  0.505766 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2854  ribosome recycling factor  43.33 
 
 		 187 aa  162  3e-39  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.144432  normal  0.265175 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3706  ribosome recycling factor  45.65 
 
 		 185 aa  162  3e-39  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0497206  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07680  ribosome recycling factor  45.65 
 
 		 185 aa  162  3e-39  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.029169  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0477  ribosome recycling factor  45.66 
 
 		 185 aa  161  4.0000000000000004e-39  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0474478  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1975  ribosome recycling factor  42.93 
 
 		 184 aa  162  4.0000000000000004e-39  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.552095  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1335  ribosome recycling factor  47.4 
 
 		 186 aa  161  4.0000000000000004e-39  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.43872  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1281  ribosome recycling factor  47.98 
 
 		 186 aa  161  5.0000000000000005e-39  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.208847 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0629  ribosome recycling factor  42.78 
 
 		 187 aa  161  6e-39  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.418172 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2030  ribosome recycling factor  46.82 
 
 		 186 aa  160  9e-39  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1448  ribosome recycling factor  46.24 
 
 		 186 aa  160  9e-39  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3514  ribosome recycling factor  39.67 
 
 		 185 aa  160  1e-38  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.763665  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1552  ribosome recycling factor  46.24 
 
 		 186 aa  160  1e-38  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2580  ribosome recycling factor  46.24 
 
 		 186 aa  160  1e-38  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2452  ribosome recycling factor  46.24 
 
 		 186 aa  160  1e-38  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.26871  hitchhiker  0.00149746 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1325  ribosome recycling factor  46.24 
 
 		 186 aa  160  1e-38  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0289556  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2434  ribosome recycling factor  46.24 
 
 		 186 aa  160  1e-38  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0313731  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2046  ribosome recycling factor  45.66 
 
 		 187 aa  160  1e-38  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.89448  normal  0.451673 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3265  ribosome recycling factor  42.78 
 
 		 186 aa  160  1e-38  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2490  ribosome recycling factor  46.24 
 
 		 186 aa  160  1e-38  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2053  ribosome recycling factor  46.24 
 
 		 186 aa  160  1e-38  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3258  ribosome recycling factor  46.24 
 
 		 186 aa  160  1e-38  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.797404  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1878  ribosome recycling factor  45.09 
 
 		 186 aa  159  2e-38  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.556612  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1856  ribosome recycling factor  45.09 
 
 		 187 aa  159  2e-38  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.791714  normal  0.0290341 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0708  ribosome recycling factor  43.82 
 
 		 181 aa  159  2e-38  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.0000756586  unclonable  0.0000000210923 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1685  ribosome recycling factor  46.24 
 
 		 186 aa  159  2e-38  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.188884 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1438  ribosome recycling factor  44.51 
 
 		 186 aa  159  2e-38  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.389466  hitchhiker  0.000418835 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6061  ribosome recycling factor  46.24 
 
 		 186 aa  159  2e-38  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.791603  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2016  ribosome recycling factor  46.24 
 
 		 186 aa  159  2e-38  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>