More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tmel_1278 on replicon NC_009616
Organism: Thermosipho melanesiensis BI429



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009616  Tmel_1278  ribosome recycling factor  100 
 
 		 185 aa  365  1e-100  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1384  ribosome recycling factor  69.19 
 
 		 185 aa  273  1.0000000000000001e-72  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.0000000000556086  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1502  ribosome recycling factor  77.3 
 
 		 184 aa  270  8.000000000000001e-72  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1430  ribosome recycling factor  67.57 
 
 		 185 aa  269  2e-71  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.792469  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0616  ribosome recycling factor  52.46 
 
 		 187 aa  207  1e-52  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1813  ribosome recycling factor  53.51 
 
 		 184 aa  203  1e-51  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000182094  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1003  ribosome recycling factor  55.31 
 
 		 183 aa  198  3.9999999999999996e-50  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000000111257  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0445  ribosome recycling factor  51.35 
 
 		 185 aa  196  2.0000000000000003e-49  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00199228  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0581  ribosome recycling factor  51.11 
 
 		 184 aa  190  9e-48  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1128  ribosome recycling factor  50 
 
 		 184 aa  188  4e-47  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.440044  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2919  ribosome recycling factor  50.82 
 
 		 186 aa  187  5e-47  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.174611 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2036  ribosome recycling factor  49.73 
 
 		 186 aa  186  1e-46  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1200  ribosome recycling factor  51.69 
 
 		 185 aa  186  1e-46  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0000906097  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1275  ribosome recycling factor  48.11 
 
 		 185 aa  187  1e-46  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  decreased coverage  0.00110727  normal  0.535196 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1422  ribosome recycling factor  45.41 
 
 		 187 aa  186  2e-46  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0768793  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1918  ribosome recycling factor  50.27 
 
 		 185 aa  184  6e-46  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  6.36169e-22  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2472  ribosome recycling factor  46.49 
 
 		 185 aa  184  7e-46  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1162  ribosome recycling factor  50.27 
 
 		 185 aa  184  9e-46  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2594  ribosome recycling factor  46.49 
 
 		 187 aa  183  2.0000000000000003e-45  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.00709219  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09920  ribosome recycling factor  49.46 
 
 		 185 aa  182  2.0000000000000003e-45  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.95344  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0804  ribosome recycling factor  46.74 
 
 		 185 aa  182  2.0000000000000003e-45  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000144692  hitchhiker  0.0000000000784009 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0519  ribosome recycling factor  48.63 
 
 		 186 aa  182  2.0000000000000003e-45  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1658  ribosome recycling factor  52.22 
 
 		 184 aa  182  3e-45  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.375108  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3210  ribosome recycling factor  50.28 
 
 		 185 aa  181  4.0000000000000006e-45  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000000238814  hitchhiker  0.0000000602253 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2379  ribosome recycling factor  47.7 
 
 		 184 aa  181  5.0000000000000004e-45  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0566  ribosome recycling factor  48.65 
 
 		 185 aa  181  5.0000000000000004e-45  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.395524  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2112  ribosome recycling factor  48.07 
 
 		 186 aa  181  6e-45  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0885  ribosome recycling factor  50.28 
 
 		 185 aa  181  7e-45  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.0000000127588  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1539  ribosome recycling factor  46.2 
 
 		 185 aa  181  7e-45  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.34519 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0611  ribosome recycling factor  48.63 
 
 		 185 aa  180  8.000000000000001e-45  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.106434  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4958  ribosome recycling factor  46.96 
 
 		 192 aa  180  1e-44  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.759908  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1144  ribosome recycling factor  48.11 
 
 		 185 aa  180  1e-44  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000279866  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1007  ribosome recycling factor  46.2 
 
 		 185 aa  179  2e-44  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3836  ribosome recycling factor  47.57 
 
 		 185 aa  179  2.9999999999999997e-44  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  3.64109e-62 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3565  ribosome recycling factor  47.57 
 
 		 185 aa  179  2.9999999999999997e-44  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.603259  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3583  ribosome recycling factor  47.57 
 
 		 185 aa  179  2.9999999999999997e-44  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2476  ribosome recycling factor  46.49 
 
 		 185 aa  179  2.9999999999999997e-44  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000697706  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1321  ribosome recycling factor  47.57 
 
 		 185 aa  178  2.9999999999999997e-44  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.198825  hitchhiker  0.00000000000000123018 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_10920  ribosome recycling factor  46.41 
 
 		 186 aa  178  2.9999999999999997e-44  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0728725  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3514  ribosome recycling factor  46.2 
 
 		 185 aa  179  2.9999999999999997e-44  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.763665  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3730  ribosome recycling factor  46.49 
 
 		 185 aa  178  4e-44  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000000151569  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1951  ribosome recycling factor  47.51 
 
 		 185 aa  178  4.999999999999999e-44  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1669  ribosome recycling factor  47.51 
 
 		 185 aa  178  4.999999999999999e-44  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.17061  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0609  ribosome recycling factor  51.15 
 
 		 174 aa  178  4.999999999999999e-44  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.000570491  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2452  ribosome recycling factor  49.16 
 
 		 186 aa  178  4.999999999999999e-44  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.26871  hitchhiker  0.00149746 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3647  ribosome recycling factor  47.03 
 
 		 185 aa  178  4.999999999999999e-44  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0174734  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3675  ribosome recycling factor  47.83 
 
 		 185 aa  177  5.999999999999999e-44  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.979275  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3962  ribosome recycling factor  47.83 
 
 		 185 aa  177  5.999999999999999e-44  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.60954  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1335  ribosome recycling factor  49.72 
 
 		 186 aa  177  5.999999999999999e-44  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.43872  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3110  ribosome recycling factor  47.73 
 
 		 185 aa  177  5.999999999999999e-44  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.000000000193761  hitchhiker  0.00426294 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1542  ribosome recycling factor  48.09 
 
 		 185 aa  177  7e-44  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0570  ribosome recycling factor  46.99 
 
 		 185 aa  177  8e-44  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0496987  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07680  ribosome recycling factor  50.28 
 
 		 185 aa  177  8e-44  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.029169  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3922  ribosome recycling factor  47.03 
 
 		 185 aa  177  9e-44  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0969461  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1676  ribosome recycling factor  43.78 
 
 		 185 aa  177  9e-44  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1438  ribosome recycling factor  49.72 
 
 		 186 aa  177  9e-44  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.389466  hitchhiker  0.000418835 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3865  ribosome recycling factor  47.03 
 
 		 185 aa  176  1e-43  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00928808  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1670  ribosome recycling factor  43.78 
 
 		 185 aa  177  1e-43  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1517  ribosome recycling factor  44.26 
 
 		 185 aa  176  1e-43  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3871  ribosome recycling factor  47.03 
 
 		 185 aa  176  1e-43  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0168076  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0389  ribosome recycling factor  46.37 
 
 		 187 aa  176  1e-43  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0303033 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2345  ribosome recycling factor  47.83 
 
 		 185 aa  176  2e-43  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.082368  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0679  ribosome recycling factor  48.3 
 
 		 185 aa  176  2e-43  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.445733  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1494  ribosome recycling factor  45.41 
 
 		 185 aa  176  2e-43  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1035  ribosome recycling factor  49.17 
 
 		 185 aa  176  2e-43  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000462528  unclonable  0.0000000105333 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1448  ribosome recycling factor  50.86 
 
 		 186 aa  176  2e-43  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1685  ribosome recycling factor  48.6 
 
 		 186 aa  176  2e-43  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.188884 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0997  ribosome recycling factor  45.65 
 
 		 185 aa  176  2e-43  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.168842  normal  0.480698 
 
 
-
 
NC_002936  DET0374  ribosome recycling factor  46.7 
 
 		 185 aa  175  3e-43  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1512  ribosome recycling factor  46.74 
 
 		 185 aa  175  4e-43  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  decreased coverage  0.00300903  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1486  ribosome recycling factor  44.81 
 
 		 185 aa  175  4e-43  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0107069  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1848  ribosome recycling factor  50.27 
 
 		 185 aa  175  4e-43  Vibrio cholerae O395  Bacteria  unclonable  0.00000000000000201497  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1801  ribosome recycling factor  45.41 
 
 		 184 aa  174  5e-43  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0761482  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23610  ribosome recycling factor  46.41 
 
 		 184 aa  174  5e-43  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.093506 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1878  ribosome recycling factor  49.15 
 
 		 186 aa  174  6e-43  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.556612  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5908  ribosome recycling factor  46.74 
 
 		 185 aa  174  7e-43  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.107758  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2545  ribosome recycling factor  48.81 
 
 		 196 aa  174  8e-43  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1345  ribosome recycling factor  49.15 
 
 		 186 aa  174  9e-43  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0459515  normal  0.505766 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_318  ribosome recycling factor  46.7 
 
 		 185 aa  174  9e-43  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.108452  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1975  ribosome recycling factor  46.41 
 
 		 184 aa  173  9.999999999999999e-43  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.552095  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1281  ribosome recycling factor  49.15 
 
 		 186 aa  173  9.999999999999999e-43  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.208847 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1282  ribosome recycling factor  42.7 
 
 		 185 aa  173  9.999999999999999e-43  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  unclonable  0.00000000000000366075  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1918  ribosome recycling factor  46.49 
 
 		 185 aa  173  1.9999999999999998e-42  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1407  ribosome recycling factor  47.49 
 
 		 186 aa  172  1.9999999999999998e-42  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1745  ribosome recycling factor  45.9 
 
 		 198 aa  172  1.9999999999999998e-42  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2030  ribosome recycling factor  48.04 
 
 		 186 aa  173  1.9999999999999998e-42  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2625  ribosome recycling factor  51.12 
 
 		 184 aa  172  1.9999999999999998e-42  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000000230935  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17100  ribosome recycling factor  44.26 
 
 		 185 aa  172  1.9999999999999998e-42  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38960  ribosome recycling factor  45.9 
 
 		 185 aa  172  1.9999999999999998e-42  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3988  ribosome recycling factor  44.86 
 
 		 185 aa  172  1.9999999999999998e-42  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.556234  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1463  ribosome recycling factor  43.78 
 
 		 185 aa  172  1.9999999999999998e-42  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.318607  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1594  ribosome recycling factor  46.99 
 
 		 185 aa  172  2.9999999999999996e-42  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.409738  normal  0.821893 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0806  ribosome recycling factor  48.62 
 
 		 184 aa  172  2.9999999999999996e-42  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1918  ribosome recycling factor  47.46 
 
 		 186 aa  172  2.9999999999999996e-42  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.415446 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0510  ribosome recycling factor  49.71 
 
 		 186 aa  172  2.9999999999999996e-42  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.0317856  normal  0.376064 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4183  ribosome recycling factor  46.99 
 
 		 185 aa  172  2.9999999999999996e-42  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2036  ribosome recycling factor  47.46 
 
 		 186 aa  172  2.9999999999999996e-42  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.605835  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6061  ribosome recycling factor  47.46 
 
 		 186 aa  172  2.9999999999999996e-42  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.791603  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2016  ribosome recycling factor  47.46 
 
 		 186 aa  172  2.9999999999999996e-42  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2753  ribosome recycling factor  47.98 
 
 		 185 aa  172  2.9999999999999996e-42  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.63878  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>