More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pmob_0616 on replicon NC_010003
Organism: Petrotoga mobilis SJ95



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010003  Pmob_0616  ribosome recycling factor  100 
 
 		 187 aa  372  1e-102  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1384  ribosome recycling factor  61.24 
 
 		 185 aa  222  2e-57  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.0000000000556086  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1430  ribosome recycling factor  57.69 
 
 		 185 aa  218  5e-56  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.792469  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1278  ribosome recycling factor  52.46 
 
 		 185 aa  207  1e-52  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1502  ribosome recycling factor  53.3 
 
 		 184 aa  183  1.0000000000000001e-45  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2753  ribosome recycling factor  49.71 
 
 		 185 aa  176  2e-43  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.63878  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1488  ribosome recycling factor  49.71 
 
 		 185 aa  174  7e-43  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0169142 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1253  ribosome recycling factor  49.13 
 
 		 185 aa  171  5e-42  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000298645  hitchhiker  0.00105804 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1200  ribosome recycling factor  51.11 
 
 		 185 aa  169  2e-41  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0000906097  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2047  ribosome recycling factor  48.84 
 
 		 185 aa  169  3e-41  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.082584  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3730  ribosome recycling factor  47.98 
 
 		 185 aa  168  5e-41  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000000151569  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0477  ribosome recycling factor  48.88 
 
 		 185 aa  167  6e-41  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0474478  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1128  ribosome recycling factor  45.51 
 
 		 184 aa  166  2e-40  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.440044  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1003  ribosome recycling factor  50.84 
 
 		 183 aa  165  2.9999999999999998e-40  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000000111257  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1813  ribosome recycling factor  47.16 
 
 		 184 aa  165  2.9999999999999998e-40  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000182094  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1918  ribosome recycling factor  46.82 
 
 		 185 aa  164  5e-40  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0885  ribosome recycling factor  48.59 
 
 		 185 aa  164  6.9999999999999995e-40  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.0000000127588  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2711  ribosome recycling factor  46.15 
 
 		 185 aa  163  1.0000000000000001e-39  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0873966  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1944  ribosome recycling factor  43.09 
 
 		 184 aa  161  5.0000000000000005e-39  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.757618 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1517  ribosome recycling factor  42.05 
 
 		 185 aa  160  9e-39  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1144  ribosome recycling factor  44.89 
 
 		 185 aa  159  2e-38  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000279866  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0660  ribosome recycling factor  44.63 
 
 		 185 aa  159  3e-38  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0581  ribosome recycling factor  44.32 
 
 		 184 aa  159  3e-38  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0445  ribosome recycling factor  46.63 
 
 		 185 aa  158  4e-38  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00199228  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2919  ribosome recycling factor  44.38 
 
 		 186 aa  158  4e-38  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.174611 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_10920  ribosome recycling factor  44.94 
 
 		 186 aa  158  5e-38  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0728725  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2036  ribosome recycling factor  43.26 
 
 		 186 aa  158  5e-38  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2379  ribosome recycling factor  41.67 
 
 		 184 aa  158  5e-38  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1781  ribosome recycling factor  42.94 
 
 		 185 aa  155  2e-37  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0519  ribosome recycling factor  44.94 
 
 		 186 aa  155  3e-37  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0745  ribosome recycling factor  45.76 
 
 		 185 aa  154  7e-37  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.000000436383  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3647  ribosome recycling factor  42.7 
 
 		 185 aa  154  7e-37  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0174734  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3865  ribosome recycling factor  43.26 
 
 		 185 aa  153  1e-36  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00928808  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1676  ribosome recycling factor  40.22 
 
 		 185 aa  153  1e-36  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3871  ribosome recycling factor  43.26 
 
 		 185 aa  153  1e-36  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0168076  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1321  ribosome recycling factor  42.7 
 
 		 185 aa  153  1e-36  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.198825  hitchhiker  0.00000000000000123018 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3836  ribosome recycling factor  42.7 
 
 		 185 aa  153  2e-36  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  3.64109e-62 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2345  ribosome recycling factor  44.44 
 
 		 185 aa  152  2e-36  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.082368  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1335  ribosome recycling factor  43.26 
 
 		 186 aa  153  2e-36  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.43872  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3565  ribosome recycling factor  42.7 
 
 		 185 aa  153  2e-36  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.603259  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3583  ribosome recycling factor  42.7 
 
 		 185 aa  153  2e-36  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1670  ribosome recycling factor  40.22 
 
 		 185 aa  153  2e-36  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1918  ribosome recycling factor  43.02 
 
 		 185 aa  153  2e-36  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  6.36169e-22  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1951  ribosome recycling factor  46.33 
 
 		 185 aa  152  2e-36  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1669  ribosome recycling factor  46.33 
 
 		 185 aa  152  2e-36  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.17061  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3922  ribosome recycling factor  42.7 
 
 		 185 aa  152  2.9999999999999998e-36  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0969461  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3675  ribosome recycling factor  42.7 
 
 		 185 aa  151  5e-36  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.979275  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3962  ribosome recycling factor  42.7 
 
 		 185 aa  151  5e-36  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.60954  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1658  ribosome recycling factor  47.25 
 
 		 184 aa  151  5e-36  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.375108  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1438  ribosome recycling factor  41.81 
 
 		 186 aa  151  5e-36  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.389466  hitchhiker  0.000418835 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1422  ribosome recycling factor  37.71 
 
 		 187 aa  151  5.9999999999999996e-36  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0768793  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2476  ribosome recycling factor  41.57 
 
 		 185 aa  151  7e-36  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000697706  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2452  ribosome recycling factor  40.68 
 
 		 186 aa  150  7e-36  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.26871  hitchhiker  0.00149746 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4958  ribosome recycling factor  40.45 
 
 		 192 aa  150  1e-35  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.759908  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1007  ribosome recycling factor  41.24 
 
 		 185 aa  150  1e-35  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0389  ribosome recycling factor  44.07 
 
 		 187 aa  150  1e-35  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0303033 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0609  ribosome recycling factor  45.66 
 
 		 174 aa  150  1e-35  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.000570491  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1407  ribosome recycling factor  41.57 
 
 		 186 aa  149  2e-35  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1162  ribosome recycling factor  40.88 
 
 		 185 aa  149  2e-35  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1783  ribosome recycling factor  42.7 
 
 		 185 aa  150  2e-35  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00108157  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1860  ribosome recycling factor  44.13 
 
 		 185 aa  149  2e-35  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.747676  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1685  ribosome recycling factor  40.68 
 
 		 186 aa  149  3e-35  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.188884 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1448  ribosome recycling factor  42.53 
 
 		 186 aa  149  3e-35  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2472  ribosome recycling factor  41.81 
 
 		 185 aa  148  4e-35  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0292  ribosome recycling factor  42.2 
 
 		 188 aa  148  4e-35  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0303  ribosome recycling factor  43.18 
 
 		 188 aa  148  5e-35  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2112  ribosome recycling factor  41.57 
 
 		 186 aa  148  5e-35  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07680  ribosome recycling factor  44.38 
 
 		 185 aa  147  8e-35  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.029169  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1918  ribosome recycling factor  38.98 
 
 		 186 aa  146  1.0000000000000001e-34  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.415446 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2049  ribosome recycling factor  38.98 
 
 		 186 aa  146  1.0000000000000001e-34  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.360804  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0804  ribosome recycling factor  37.29 
 
 		 185 aa  146  1.0000000000000001e-34  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000144692  hitchhiker  0.0000000000784009 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0116  ribosome recycling factor  43.26 
 
 		 187 aa  147  1.0000000000000001e-34  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0510  ribosome recycling factor  42.29 
 
 		 186 aa  146  1.0000000000000001e-34  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.0317856  normal  0.376064 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1325  ribosome recycling factor  38.42 
 
 		 186 aa  145  2.0000000000000003e-34  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0289556  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2053  ribosome recycling factor  38.42 
 
 		 186 aa  145  2.0000000000000003e-34  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1552  ribosome recycling factor  38.42 
 
 		 186 aa  145  2.0000000000000003e-34  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1745  ribosome recycling factor  38.76 
 
 		 198 aa  145  2.0000000000000003e-34  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1878  ribosome recycling factor  41.01 
 
 		 186 aa  146  2.0000000000000003e-34  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.556612  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2580  ribosome recycling factor  38.42 
 
 		 186 aa  145  2.0000000000000003e-34  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0281  ribosome recycling factor  42.05 
 
 		 188 aa  146  2.0000000000000003e-34  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2490  ribosome recycling factor  38.42 
 
 		 186 aa  145  2.0000000000000003e-34  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6061  ribosome recycling factor  38.98 
 
 		 186 aa  146  2.0000000000000003e-34  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.791603  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2036  ribosome recycling factor  38.98 
 
 		 186 aa  146  2.0000000000000003e-34  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.605835  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3258  ribosome recycling factor  38.42 
 
 		 186 aa  145  2.0000000000000003e-34  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.797404  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2016  ribosome recycling factor  38.98 
 
 		 186 aa  146  2.0000000000000003e-34  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2434  ribosome recycling factor  38.42 
 
 		 186 aa  145  2.0000000000000003e-34  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0313731  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2291  ribosome recycling factor  39.2 
 
 		 185 aa  145  3e-34  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  decreased coverage  0.000106212  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3514  ribosome recycling factor  39.33 
 
 		 185 aa  145  3e-34  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.763665  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0010  ribosome recycling factor  41.01 
 
 		 192 aa  145  3e-34  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0696052  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2030  ribosome recycling factor  38.98 
 
 		 186 aa  145  4.0000000000000006e-34  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1975  ribosome recycling factor  43.18 
 
 		 184 aa  145  5e-34  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.552095  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1494  ribosome recycling factor  39.33 
 
 		 185 aa  144  6e-34  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4123  ribosome recycling factor  40.11 
 
 		 185 aa  144  6e-34  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2221  ribosome recycling factor  41.24 
 
 		 185 aa  144  7.0000000000000006e-34  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0750591  normal  0.159368 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3210  ribosome recycling factor  41.81 
 
 		 185 aa  144  8.000000000000001e-34  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000000238814  hitchhiker  0.0000000602253 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_11220  ribosome recycling factor  38.98 
 
 		 186 aa  144  8.000000000000001e-34  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0977787  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1260  ribosome recycling factor  38.98 
 
 		 186 aa  144  8.000000000000001e-34  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.194359  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3706  ribosome recycling factor  41.57 
 
 		 185 aa  144  8.000000000000001e-34  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0497206  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1163  ribosome recycling factor  39.33 
 
 		 186 aa  144  9e-34  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011690  PHATRDRAFT_40048  predicted protein  39.2 
 
 		 225 aa  144  9e-34  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  hitchhiker  0.00311694  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>