More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fnod_1502 on replicon NC_009718
Organism: Fervidobacterium nodosum Rt17-B1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009718  Fnod_1502  ribosome recycling factor  100 
 
 		 184 aa  363  1e-100  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1278  ribosome recycling factor  77.3 
 
 		 185 aa  286  2e-76  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1384  ribosome recycling factor  66.49 
 
 		 185 aa  254  4e-67  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.0000000000556086  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1430  ribosome recycling factor  65.95 
 
 		 185 aa  252  2.0000000000000002e-66  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.792469  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0616  ribosome recycling factor  53.3 
 
 		 187 aa  193  1e-48  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0581  ribosome recycling factor  52.78 
 
 		 184 aa  187  5e-47  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3565  ribosome recycling factor  51.09 
 
 		 185 aa  185  2e-46  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.603259  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3583  ribosome recycling factor  51.09 
 
 		 185 aa  185  2e-46  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0445  ribosome recycling factor  51.35 
 
 		 185 aa  186  2e-46  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00199228  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3836  ribosome recycling factor  51.09 
 
 		 185 aa  185  2e-46  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  3.64109e-62 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2472  ribosome recycling factor  48.65 
 
 		 185 aa  186  2e-46  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1321  ribosome recycling factor  51.09 
 
 		 185 aa  185  3e-46  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.198825  hitchhiker  0.00000000000000123018 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3647  ribosome recycling factor  50.54 
 
 		 185 aa  185  4e-46  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0174734  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1813  ribosome recycling factor  51.96 
 
 		 184 aa  185  4e-46  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000182094  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3922  ribosome recycling factor  51.09 
 
 		 185 aa  185  4e-46  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0969461  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3865  ribosome recycling factor  51.09 
 
 		 185 aa  184  6e-46  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00928808  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3871  ribosome recycling factor  51.09 
 
 		 185 aa  184  6e-46  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0168076  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3675  ribosome recycling factor  51.09 
 
 		 185 aa  184  7e-46  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.979275  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3962  ribosome recycling factor  51.09 
 
 		 185 aa  184  7e-46  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.60954  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1144  ribosome recycling factor  48.11 
 
 		 185 aa  181  4.0000000000000006e-45  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000279866  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1128  ribosome recycling factor  49.18 
 
 		 184 aa  180  9.000000000000001e-45  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.440044  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3210  ribosome recycling factor  49.19 
 
 		 185 aa  180  1e-44  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000000238814  hitchhiker  0.0000000602253 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1975  ribosome recycling factor  49.73 
 
 		 184 aa  179  2e-44  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.552095  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1275  ribosome recycling factor  45.95 
 
 		 185 aa  179  2e-44  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  decreased coverage  0.00110727  normal  0.535196 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2476  ribosome recycling factor  47.83 
 
 		 185 aa  179  2.9999999999999997e-44  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000697706  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1003  ribosome recycling factor  53.07 
 
 		 183 aa  179  2.9999999999999997e-44  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000000111257  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4637  ribosome recycling factor  48.55 
 
 		 182 aa  178  4e-44  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.138932  normal  0.818253 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1422  ribosome recycling factor  45.95 
 
 		 187 aa  178  4.999999999999999e-44  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0768793  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2379  ribosome recycling factor  48.85 
 
 		 184 aa  177  5.999999999999999e-44  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1035  ribosome recycling factor  50.81 
 
 		 185 aa  177  9e-44  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000462528  unclonable  0.0000000105333 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0519  ribosome recycling factor  48.91 
 
 		 186 aa  177  1e-43  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3730  ribosome recycling factor  45.95 
 
 		 185 aa  176  1e-43  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000000151569  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2112  ribosome recycling factor  47.8 
 
 		 186 aa  177  1e-43  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3514  ribosome recycling factor  44.02 
 
 		 185 aa  176  2e-43  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.763665  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0804  ribosome recycling factor  46.2 
 
 		 185 aa  175  3e-43  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000144692  hitchhiker  0.0000000000784009 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1517  ribosome recycling factor  44.81 
 
 		 185 aa  175  4e-43  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2594  ribosome recycling factor  44.86 
 
 		 187 aa  175  4e-43  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.00709219  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0885  ribosome recycling factor  48.11 
 
 		 185 aa  175  4e-43  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.0000000127588  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2919  ribosome recycling factor  46.74 
 
 		 186 aa  175  4e-43  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.174611 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1676  ribosome recycling factor  43.24 
 
 		 185 aa  174  9e-43  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0374  ribosome recycling factor  43.41 
 
 		 185 aa  173  9.999999999999999e-43  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0570  ribosome recycling factor  45.36 
 
 		 185 aa  173  9.999999999999999e-43  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0496987  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1670  ribosome recycling factor  43.24 
 
 		 185 aa  173  9.999999999999999e-43  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_10920  ribosome recycling factor  45.76 
 
 		 186 aa  172  1.9999999999999998e-42  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0728725  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07680  ribosome recycling factor  48.65 
 
 		 185 aa  172  1.9999999999999998e-42  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.029169  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_318  ribosome recycling factor  42.86 
 
 		 185 aa  172  2.9999999999999996e-42  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.108452  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2036  ribosome recycling factor  46.49 
 
 		 186 aa  171  3.9999999999999995e-42  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1594  ribosome recycling factor  47.54 
 
 		 185 aa  171  5e-42  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.409738  normal  0.821893 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1200  ribosome recycling factor  48.37 
 
 		 185 aa  171  5e-42  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0000906097  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4183  ribosome recycling factor  47.54 
 
 		 185 aa  171  5e-42  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1149  ribosome recycling factor  47.54 
 
 		 185 aa  170  1e-41  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1848  ribosome recycling factor  49.19 
 
 		 185 aa  170  1e-41  Vibrio cholerae O395  Bacteria  unclonable  0.00000000000000201497  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1918  ribosome recycling factor  46.74 
 
 		 185 aa  169  2e-41  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1486  ribosome recycling factor  42.62 
 
 		 185 aa  169  2e-41  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0107069  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1463  ribosome recycling factor  42.16 
 
 		 185 aa  169  2e-41  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.318607  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2291  ribosome recycling factor  44.86 
 
 		 185 aa  169  2e-41  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  decreased coverage  0.000106212  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2625  ribosome recycling factor  50 
 
 		 184 aa  168  3e-41  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000000230935  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0708  ribosome recycling factor  47.49 
 
 		 181 aa  168  4e-41  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.0000756586  unclonable  0.0000000210923 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4079  ribosome recycling factor  46.45 
 
 		 185 aa  168  4e-41  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.330007 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1951  ribosome recycling factor  47.03 
 
 		 185 aa  168  5e-41  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1669  ribosome recycling factor  47.03 
 
 		 185 aa  168  5e-41  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.17061  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1658  ribosome recycling factor  51.09 
 
 		 184 aa  167  6e-41  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.375108  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0065  ribosome recycling factor  43.93 
 
 		 182 aa  167  7e-41  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.759475  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0745  ribosome recycling factor  47.54 
 
 		 185 aa  167  1e-40  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.000000436383  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1282  ribosome recycling factor  42.7 
 
 		 185 aa  166  1e-40  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  unclonable  0.00000000000000366075  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38960  ribosome recycling factor  43.72 
 
 		 185 aa  166  1e-40  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17100  ribosome recycling factor  42.08 
 
 		 185 aa  167  1e-40  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3706  ribosome recycling factor  46.49 
 
 		 185 aa  166  2e-40  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0497206  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2345  ribosome recycling factor  47.83 
 
 		 185 aa  166  2e-40  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.082368  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0611  ribosome recycling factor  45.9 
 
 		 185 aa  166  2e-40  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.106434  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1494  ribosome recycling factor  43.24 
 
 		 185 aa  166  2e-40  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2711  ribosome recycling factor  46.49 
 
 		 185 aa  166  2e-40  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0873966  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1253  ribosome recycling factor  46.2 
 
 		 185 aa  165  2.9999999999999998e-40  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000298645  hitchhiker  0.00105804 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1918  ribosome recycling factor  45.95 
 
 		 185 aa  165  4e-40  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  6.36169e-22  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0566  ribosome recycling factor  44.32 
 
 		 185 aa  165  4e-40  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.395524  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0507  ribosome recycling factor  45.4 
 
 		 182 aa  164  5e-40  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1162  ribosome recycling factor  44.86 
 
 		 185 aa  164  5e-40  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0609  ribosome recycling factor  48.85 
 
 		 174 aa  164  6.9999999999999995e-40  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.000570491  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3050  ribosome recycling factor  44.81 
 
 		 185 aa  164  6.9999999999999995e-40  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.672962  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2545  ribosome recycling factor  47.54 
 
 		 196 aa  164  8e-40  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011690  PHATRDRAFT_40048  predicted protein  47.7 
 
 		 225 aa  164  9e-40  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  hitchhiker  0.00311694  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23610  ribosome recycling factor  43.93 
 
 		 184 aa  163  1.0000000000000001e-39  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.093506 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2698  ribosome recycling factor  44.51 
 
 		 182 aa  163  1.0000000000000001e-39  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1781  ribosome recycling factor  43.78 
 
 		 185 aa  163  1.0000000000000001e-39  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0706  ribosome recycling factor  45.6 
 
 		 187 aa  163  2.0000000000000002e-39  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000000018395 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0389  ribosome recycling factor  44.69 
 
 		 187 aa  162  2.0000000000000002e-39  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0303033 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0356  ribosome recycling factor  44.12 
 
 		 173 aa  162  2.0000000000000002e-39  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.0472189  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1542  ribosome recycling factor  45.36 
 
 		 185 aa  162  2.0000000000000002e-39  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1401  ribosome recycling factor  43.33 
 
 		 186 aa  162  2.0000000000000002e-39  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.100309  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0986  ribosome recycling factor  43.24 
 
 		 185 aa  162  2.0000000000000002e-39  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.00114143  n/a   
 
 
-
 
NC_011696  PHATRDRAFT_41282  predicted protein  47.98 
 
 		 173 aa  162  3e-39  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  decreased coverage  0.000037701  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1539  ribosome recycling factor  44.86 
 
 		 185 aa  162  3e-39  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.34519 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0629  ribosome recycling factor  43.93 
 
 		 187 aa  161  4.0000000000000004e-39  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.418172 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1335  ribosome recycling factor  46.89 
 
 		 186 aa  162  4.0000000000000004e-39  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.43872  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1944  ribosome recycling factor  43.96 
 
 		 184 aa  161  5.0000000000000005e-39  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.757618 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2452  ribosome recycling factor  46.89 
 
 		 186 aa  161  5.0000000000000005e-39  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.26871  hitchhiker  0.00149746 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0077  ribosome recycling factor  43.41 
 
 		 185 aa  161  6e-39  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.010398  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1801  ribosome recycling factor  44.02 
 
 		 184 aa  161  6e-39  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0761482  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2560  ribosome recycling factor  45.98 
 
 		 181 aa  161  6e-39  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3928  ribosome recycling factor  42.7 
 
 		 185 aa  161  6e-39  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.887062  normal  0.119713 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>