More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpet_1384 on replicon NC_009486
Organism: Thermotoga petrophila RKU-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009486  Tpet_1384  ribosome recycling factor  100 
 
 		 185 aa  360  9e-99  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.0000000000556086  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1430  ribosome recycling factor  95.68 
 
 		 185 aa  347  8e-95  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.792469  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1278  ribosome recycling factor  69.19 
 
 		 185 aa  273  1.0000000000000001e-72  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1502  ribosome recycling factor  66.49 
 
 		 184 aa  239  2e-62  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0616  ribosome recycling factor  61.24 
 
 		 187 aa  222  2e-57  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1200  ribosome recycling factor  54.19 
 
 		 185 aa  191  5e-48  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0000906097  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0581  ribosome recycling factor  52.22 
 
 		 184 aa  189  1e-47  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1975  ribosome recycling factor  49.73 
 
 		 184 aa  187  5.999999999999999e-47  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.552095  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0885  ribosome recycling factor  50.81 
 
 		 185 aa  187  8e-47  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.0000000127588  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1003  ribosome recycling factor  54.75 
 
 		 183 aa  187  1e-46  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000000111257  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1128  ribosome recycling factor  48.09 
 
 		 184 aa  186  2e-46  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.440044  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3210  ribosome recycling factor  49.73 
 
 		 185 aa  186  2e-46  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000000238814  hitchhiker  0.0000000602253 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2472  ribosome recycling factor  47.57 
 
 		 185 aa  185  3e-46  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2919  ribosome recycling factor  46.74 
 
 		 186 aa  182  2.0000000000000003e-45  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.174611 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1813  ribosome recycling factor  50 
 
 		 184 aa  182  3e-45  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000182094  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2036  ribosome recycling factor  49.19 
 
 		 186 aa  181  5.0000000000000004e-45  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0519  ribosome recycling factor  46.2 
 
 		 186 aa  181  7e-45  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0708  ribosome recycling factor  49.15 
 
 		 181 aa  180  1e-44  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.0000756586  unclonable  0.0000000210923 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3706  ribosome recycling factor  47.57 
 
 		 185 aa  179  2e-44  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0497206  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_10920  ribosome recycling factor  45.65 
 
 		 186 aa  178  4e-44  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0728725  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0445  ribosome recycling factor  50.29 
 
 		 185 aa  178  4e-44  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00199228  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0804  ribosome recycling factor  45.65 
 
 		 185 aa  178  4e-44  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000144692  hitchhiker  0.0000000000784009 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1144  ribosome recycling factor  49.19 
 
 		 185 aa  177  7e-44  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000279866  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2291  ribosome recycling factor  44.86 
 
 		 185 aa  177  7e-44  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  decreased coverage  0.000106212  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1944  ribosome recycling factor  48.07 
 
 		 184 aa  177  8e-44  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.757618 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1422  ribosome recycling factor  44.86 
 
 		 187 aa  177  1e-43  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0768793  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1035  ribosome recycling factor  48.11 
 
 		 185 aa  177  1e-43  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000462528  unclonable  0.0000000105333 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1486  ribosome recycling factor  44.81 
 
 		 185 aa  176  2e-43  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0107069  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1658  ribosome recycling factor  52.22 
 
 		 184 aa  176  2e-43  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.375108  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1783  ribosome recycling factor  47.54 
 
 		 185 aa  176  2e-43  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00108157  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07680  ribosome recycling factor  49.73 
 
 		 185 aa  176  2e-43  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.029169  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0609  ribosome recycling factor  49.43 
 
 		 174 aa  174  4e-43  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.000570491  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3730  ribosome recycling factor  44.86 
 
 		 185 aa  174  5e-43  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000000151569  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0374  ribosome recycling factor  46.7 
 
 		 185 aa  174  7e-43  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3514  ribosome recycling factor  46.2 
 
 		 185 aa  174  7e-43  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.763665  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17100  ribosome recycling factor  44.26 
 
 		 185 aa  174  7e-43  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23610  ribosome recycling factor  44.2 
 
 		 184 aa  174  9e-43  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.093506 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2379  ribosome recycling factor  44.69 
 
 		 184 aa  173  9.999999999999999e-43  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_318  ribosome recycling factor  47.25 
 
 		 185 aa  173  9.999999999999999e-43  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.108452  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2476  ribosome recycling factor  47.83 
 
 		 185 aa  172  1.9999999999999998e-42  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000697706  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1512  ribosome recycling factor  45.65 
 
 		 185 aa  172  2.9999999999999996e-42  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  decreased coverage  0.00300903  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1781  ribosome recycling factor  43.78 
 
 		 185 aa  172  2.9999999999999996e-42  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2112  ribosome recycling factor  43.65 
 
 		 186 aa  172  2.9999999999999996e-42  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1517  ribosome recycling factor  44.26 
 
 		 185 aa  171  3.9999999999999995e-42  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2345  ribosome recycling factor  47.28 
 
 		 185 aa  171  5e-42  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.082368  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3565  ribosome recycling factor  47.28 
 
 		 185 aa  171  5e-42  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.603259  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3583  ribosome recycling factor  47.28 
 
 		 185 aa  171  5e-42  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3836  ribosome recycling factor  47.28 
 
 		 185 aa  171  5e-42  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  3.64109e-62 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0477  ribosome recycling factor  45.95 
 
 		 185 aa  171  5e-42  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0474478  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3647  ribosome recycling factor  47.28 
 
 		 185 aa  171  5.999999999999999e-42  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0174734  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1321  ribosome recycling factor  47.28 
 
 		 185 aa  171  5.999999999999999e-42  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.198825  hitchhiker  0.00000000000000123018 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1951  ribosome recycling factor  46.49 
 
 		 185 aa  171  5.999999999999999e-42  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1669  ribosome recycling factor  46.49 
 
 		 185 aa  171  5.999999999999999e-42  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.17061  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1275  ribosome recycling factor  43.24 
 
 		 185 aa  171  5.999999999999999e-42  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  decreased coverage  0.00110727  normal  0.535196 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3865  ribosome recycling factor  47.28 
 
 		 185 aa  171  6.999999999999999e-42  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00928808  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3871  ribosome recycling factor  47.28 
 
 		 185 aa  171  6.999999999999999e-42  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0168076  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4958  ribosome recycling factor  44.57 
 
 		 192 aa  170  7.999999999999999e-42  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.759908  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0706  ribosome recycling factor  45.05 
 
 		 187 aa  171  7.999999999999999e-42  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000000018395 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3675  ribosome recycling factor  47.28 
 
 		 185 aa  170  1e-41  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.979275  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1676  ribosome recycling factor  43.78 
 
 		 185 aa  170  1e-41  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1670  ribosome recycling factor  43.78 
 
 		 185 aa  170  1e-41  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3962  ribosome recycling factor  47.28 
 
 		 185 aa  170  1e-41  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.60954  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1196  ribosome recycling factor  47.19 
 
 		 181 aa  170  1e-41  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  unclonable  0.00000300081  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0389  ribosome recycling factor  49.16 
 
 		 187 aa  170  1e-41  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0303033 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3922  ribosome recycling factor  46.74 
 
 		 185 aa  169  2e-41  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0969461  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1016  ribosome recycling factor  43.24 
 
 		 185 aa  169  3e-41  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000122168  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2632  ribosome recycling factor  42.16 
 
 		 185 aa  168  3e-41  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.00000000751677  normal  0.363086 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3432  ribosome recycling factor  43.24 
 
 		 185 aa  169  3e-41  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000874312  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1069  ribosome recycling factor  43.24 
 
 		 185 aa  169  3e-41  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00702897  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0010  ribosome recycling factor  44.2 
 
 		 192 aa  168  3e-41  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0696052  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1282  ribosome recycling factor  42.16 
 
 		 185 aa  168  3e-41  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  unclonable  0.00000000000000366075  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1539  ribosome recycling factor  42.39 
 
 		 185 aa  168  4e-41  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.34519 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1963  ribosome recycling factor  46.45 
 
 		 185 aa  168  5e-41  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.566814  normal  0.0766357 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2424  ribosome recycling factor  45.95 
 
 		 185 aa  168  5e-41  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.00108894  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0826  ribosome recycling factor  45.86 
 
 		 184 aa  167  6e-41  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.000458151  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38960  ribosome recycling factor  43.17 
 
 		 185 aa  167  6e-41  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0077  ribosome recycling factor  44.51 
 
 		 185 aa  167  6e-41  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.010398  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1007  ribosome recycling factor  43.48 
 
 		 185 aa  167  8e-41  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0475  ribosome recycling factor  47.54 
 
 		 185 aa  167  8e-41  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.840836  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2882  ribosome recycling factor  41.62 
 
 		 185 aa  167  9e-41  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.000000000396733  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1918  ribosome recycling factor  43.78 
 
 		 185 aa  167  9e-41  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  6.36169e-22  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2016  ribosome recycling factor  43.78 
 
 		 185 aa  167  1e-40  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00367889 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3787  ribosome recycling factor  43.24 
 
 		 185 aa  166  1e-40  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00158477 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1430  ribosome recycling factor  48.37 
 
 		 184 aa  167  1e-40  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00121871  normal  0.0745134 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1801  ribosome recycling factor  43.48 
 
 		 184 aa  166  1e-40  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0761482  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0806  ribosome recycling factor  45.11 
 
 		 184 aa  167  1e-40  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0745  ribosome recycling factor  46.07 
 
 		 185 aa  166  2e-40  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.000000436383  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1918  ribosome recycling factor  43.78 
 
 		 185 aa  165  2.9999999999999998e-40  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3050  ribosome recycling factor  43.72 
 
 		 185 aa  165  2.9999999999999998e-40  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.672962  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2812  ribosome recycling factor  40.22 
 
 		 185 aa  165  2.9999999999999998e-40  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.0000000100926  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2638  ribosome recycling factor  40.22 
 
 		 185 aa  165  4e-40  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.00000000456907  normal  0.10147 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2705  ribosome recycling factor  40.22 
 
 		 185 aa  165  4e-40  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.00000841959  hitchhiker  0.00246061 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1162  ribosome recycling factor  44.86 
 
 		 185 aa  164  5e-40  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1252  ribosome recycling factor  44.02 
 
 		 185 aa  164  5e-40  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.538826  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1632  ribosome recycling factor  40.22 
 
 		 185 aa  164  5.9999999999999996e-40  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0679  ribosome recycling factor  42.39 
 
 		 185 aa  164  6.9999999999999995e-40  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.445733  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3778  ribosome recycling factor  41.81 
 
 		 182 aa  164  6.9999999999999995e-40  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.343725 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1494  ribosome recycling factor  41.08 
 
 		 185 aa  164  6.9999999999999995e-40  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3928  ribosome recycling factor  42.16 
 
 		 185 aa  164  8e-40  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.887062  normal  0.119713 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2753  ribosome recycling factor  43.78 
 
 		 185 aa  164  8e-40  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.63878  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>