More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amuc_1318 on replicon NC_010655
Organism: Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010655  Amuc_1318  ribosome recycling factor  100 
 
 		 188 aa  375  1e-103  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.0899133 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3928  ribosome recycling factor  44.81 
 
 		 185 aa  167  1e-40  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.887062  normal  0.119713 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2016  ribosome recycling factor  44.26 
 
 		 185 aa  166  2.9999999999999998e-40  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00367889 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1401  ribosome recycling factor  44.51 
 
 		 186 aa  165  4e-40  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.100309  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0528  ribosome recycling factor  46.11 
 
 		 185 aa  163  1.0000000000000001e-39  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1517  ribosome recycling factor  43.17 
 
 		 185 aa  159  2e-38  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4958  ribosome recycling factor  43.09 
 
 		 192 aa  158  4e-38  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.759908  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1658  ribosome recycling factor  46.93 
 
 		 184 aa  156  1e-37  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.375108  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0574  ribosome recycling factor  46.49 
 
 		 184 aa  156  2e-37  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.165551  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0581  ribosome recycling factor  46.02 
 
 		 184 aa  155  3e-37  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2802  ribosome recycling factor  43.72 
 
 		 188 aa  155  3e-37  Caulobacter sp. K31  Bacteria  hitchhiker  0.00257577  normal  0.633294 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1813  ribosome recycling factor  44.13 
 
 		 184 aa  154  6e-37  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000182094  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1783  ribosome recycling factor  42.54 
 
 		 185 aa  154  8e-37  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00108157  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4514  ribosome recycling factor  46.7 
 
 		 187 aa  153  1e-36  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.167395  normal  0.721299 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1273  ribosome recycling factor  40.54 
 
 		 185 aa  153  1e-36  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0235676  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1557  ribosome recycling factor  41.08 
 
 		 185 aa  152  2.9999999999999998e-36  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000000135969  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2919  ribosome recycling factor  44.15 
 
 		 186 aa  152  2.9999999999999998e-36  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.174611 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1512  ribosome recycling factor  48.19 
 
 		 185 aa  151  4e-36  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  decreased coverage  0.00300903  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3706  ribosome recycling factor  43.72 
 
 		 185 aa  151  5e-36  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0497206  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3210  ribosome recycling factor  45.9 
 
 		 185 aa  151  7e-36  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000000238814  hitchhiker  0.0000000602253 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2692  ribosome recycling factor  42.46 
 
 		 186 aa  150  8.999999999999999e-36  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.272144  normal  0.54123 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3546  ribosome recycling factor  44.81 
 
 		 181 aa  150  1e-35  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3265  ribosome recycling factor  45.56 
 
 		 186 aa  150  1e-35  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1200  ribosome recycling factor  43.89 
 
 		 185 aa  150  1e-35  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0000906097  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0609  ribosome recycling factor  44.89 
 
 		 174 aa  149  2e-35  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.000570491  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3778  ribosome recycling factor  44.51 
 
 		 182 aa  149  2e-35  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.343725 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1537  ribosome recycling factor  40.66 
 
 		 187 aa  149  2e-35  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2560  ribosome recycling factor  44.81 
 
 		 181 aa  149  2e-35  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2112  ribosome recycling factor  44.15 
 
 		 186 aa  149  2e-35  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1422  ribosome recycling factor  42.16 
 
 		 187 aa  148  4e-35  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0768793  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0507  ribosome recycling factor  43.96 
 
 		 182 aa  148  5e-35  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1975  ribosome recycling factor  43.72 
 
 		 184 aa  148  5e-35  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.552095  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1963  ribosome recycling factor  43.09 
 
 		 185 aa  148  6e-35  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.566814  normal  0.0766357 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1951  ribosome recycling factor  43.17 
 
 		 185 aa  147  7e-35  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1669  ribosome recycling factor  43.17 
 
 		 185 aa  147  7e-35  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.17061  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0632  ribosome recycling factor  40.66 
 
 		 187 aa  147  8e-35  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.330477  hitchhiker  0.00509823 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2554  ribosome recycling factor  41.71 
 
 		 188 aa  147  1.0000000000000001e-34  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3647  ribosome recycling factor  44.09 
 
 		 185 aa  146  1.0000000000000001e-34  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0174734  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09920  ribosome recycling factor  41.76 
 
 		 185 aa  146  1.0000000000000001e-34  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.95344  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1407  ribosome recycling factor  42.7 
 
 		 186 aa  146  2.0000000000000003e-34  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3565  ribosome recycling factor  44.09 
 
 		 185 aa  146  2.0000000000000003e-34  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.603259  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3583  ribosome recycling factor  44.09 
 
 		 185 aa  146  2.0000000000000003e-34  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1321  ribosome recycling factor  44.09 
 
 		 185 aa  146  2.0000000000000003e-34  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.198825  hitchhiker  0.00000000000000123018 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0586  ribosome recycling factor  40.43 
 
 		 186 aa  146  2.0000000000000003e-34  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.138909  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4152  ribosome recycling factor  41.94 
 
 		 181 aa  146  2.0000000000000003e-34  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0904163  normal  0.106363 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0519  ribosome recycling factor  42.02 
 
 		 186 aa  146  2.0000000000000003e-34  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3836  ribosome recycling factor  44.09 
 
 		 185 aa  146  2.0000000000000003e-34  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  3.64109e-62 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2698  ribosome recycling factor  43.41 
 
 		 182 aa  146  2.0000000000000003e-34  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1438  ribosome recycling factor  43.26 
 
 		 186 aa  145  3e-34  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.389466  hitchhiker  0.000418835 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0065  ribosome recycling factor  43.41 
 
 		 182 aa  145  3e-34  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.759475  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3675  ribosome recycling factor  44.09 
 
 		 185 aa  145  4.0000000000000006e-34  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.979275  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0629  ribosome recycling factor  45.05 
 
 		 187 aa  145  4.0000000000000006e-34  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.418172 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3962  ribosome recycling factor  44.09 
 
 		 185 aa  145  4.0000000000000006e-34  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.60954  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2439  ribosome recycling factor  43.89 
 
 		 187 aa  145  4.0000000000000006e-34  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.66949  normal  0.174209 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1345  ribosome recycling factor  43.82 
 
 		 186 aa  144  5e-34  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0459515  normal  0.505766 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1918  ribosome recycling factor  46.02 
 
 		 185 aa  145  5e-34  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  6.36169e-22  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3446  ribosome recycling factor  42.86 
 
 		 187 aa  144  5e-34  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0960945  normal  0.455289 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3922  ribosome recycling factor  43.55 
 
 		 185 aa  145  5e-34  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0969461  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1196  ribosome recycling factor  45.6 
 
 		 181 aa  144  5e-34  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  unclonable  0.00000300081  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1453  ribosome recycling factor  38.92 
 
 		 185 aa  144  6e-34  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000049819  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2899  ribosome recycling factor  38.92 
 
 		 185 aa  144  6e-34  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000932331  normal  0.103531 
 
 
-
 
NC_004310  BR1159  ribosome recycling factor  41.14 
 
 		 186 aa  144  6e-34  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.87156  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3193  ribosome recycling factor  41.11 
 
 		 187 aa  144  6e-34  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1116  ribosome recycling factor  41.14 
 
 		 186 aa  144  6e-34  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1901  ribosome recycling factor  42.55 
 
 		 186 aa  144  7.0000000000000006e-34  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.782843 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1856  ribosome recycling factor  44.57 
 
 		 187 aa  144  7.0000000000000006e-34  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.791714  normal  0.0290341 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0261  ribosome recycling factor  42.29 
 
 		 195 aa  144  7.0000000000000006e-34  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1484  ribosome recycling factor  38.38 
 
 		 185 aa  144  8.000000000000001e-34  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.0000000709639  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3865  ribosome recycling factor  43.55 
 
 		 185 aa  144  8.000000000000001e-34  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00928808  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1632  ribosome recycling factor  39.44 
 
 		 185 aa  144  8.000000000000001e-34  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1448  ribosome recycling factor  38.38 
 
 		 185 aa  144  8.000000000000001e-34  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000214173  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4637  ribosome recycling factor  44.51 
 
 		 182 aa  144  8.000000000000001e-34  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.138932  normal  0.818253 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1539  ribosome recycling factor  41.21 
 
 		 185 aa  144  8.000000000000001e-34  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.34519 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3871  ribosome recycling factor  43.55 
 
 		 185 aa  144  8.000000000000001e-34  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0168076  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2825  ribosome recycling factor  42.86 
 
 		 187 aa  144  9e-34  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.496262 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1351  ribosome recycling factor  38.92 
 
 		 185 aa  143  1e-33  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0000000717676  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2032  ribosome recycling factor  40 
 
 		 186 aa  143  1e-33  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0010  ribosome recycling factor  41.08 
 
 		 192 aa  144  1e-33  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0696052  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1944  ribosome recycling factor  42.16 
 
 		 184 aa  143  1e-33  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.757618 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1697  ribosome recycling factor  43.89 
 
 		 194 aa  144  1e-33  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1957  ribosome recycling factor  43.18 
 
 		 184 aa  143  1e-33  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1142  ribosome recycling factor  40.56 
 
 		 185 aa  143  1e-33  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.0000869669  normal  0.111417 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2452  ribosome recycling factor  42.7 
 
 		 186 aa  143  1e-33  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.26871  hitchhiker  0.00149746 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2847  ribosome recycling factor  43.02 
 
 		 186 aa  143  2e-33  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006055  Mfl555  ribosome recycling factor  42.08 
 
 		 181 aa  143  2e-33  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  0.862763  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0510  ribosome recycling factor  40.43 
 
 		 186 aa  143  2e-33  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.0317856  normal  0.376064 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1878  ribosome recycling factor  43.26 
 
 		 186 aa  143  2e-33  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.556612  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1281  ribosome recycling factor  42.7 
 
 		 186 aa  143  2e-33  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.208847 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1183  ribosome recycling factor  41.21 
 
 		 185 aa  143  2e-33  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2854  ribosome recycling factor  42.78 
 
 		 187 aa  143  2e-33  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.144432  normal  0.265175 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2882  ribosome recycling factor  42.77 
 
 		 185 aa  143  2e-33  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.000000000396733  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0370  ribosome recycling factor  39.57 
 
 		 188 aa  142  2e-33  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0210399  normal  0.193594 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2111  ribosome recycling factor  40.11 
 
 		 185 aa  142  3e-33  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_10920  ribosome recycling factor  42.02 
 
 		 186 aa  142  3e-33  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0728725  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1448  ribosome recycling factor  38.83 
 
 		 186 aa  142  3e-33  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1383  ribosome recycling factor  41.14 
 
 		 186 aa  142  3e-33  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.103554  normal  0.0434538 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2345  ribosome recycling factor  43.5 
 
 		 185 aa  142  4e-33  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.082368  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1430  ribosome recycling factor  41.62 
 
 		 184 aa  141  4e-33  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00121871  normal  0.0745134 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1527  ribosome recycling factor  40.45 
 
 		 185 aa  142  4e-33  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00139576  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2638  ribosome recycling factor  38.89 
 
 		 185 aa  142  4e-33  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.00000000456907  normal  0.10147 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>