More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mfl555 on replicon NC_006055
Organism: Mesoplasma florum L1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_006055  Mfl555  ribosome recycling factor  100 
 
 		 181 aa  359  9e-99  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  0.862763  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0375  ribosome recycling factor  57.22 
 
 		 182 aa  212  1.9999999999999998e-54  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1512  ribosome recycling factor  48.35 
 
 		 185 aa  181  4.0000000000000006e-45  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  decreased coverage  0.00300903  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3675  ribosome recycling factor  51.1 
 
 		 185 aa  179  2e-44  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.979275  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3962  ribosome recycling factor  51.1 
 
 		 185 aa  179  2e-44  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.60954  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3565  ribosome recycling factor  51.1 
 
 		 185 aa  178  4e-44  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.603259  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3583  ribosome recycling factor  51.1 
 
 		 185 aa  178  4e-44  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3836  ribosome recycling factor  51.1 
 
 		 185 aa  178  4e-44  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  3.64109e-62 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3871  ribosome recycling factor  51.1 
 
 		 185 aa  177  4.999999999999999e-44  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0168076  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3865  ribosome recycling factor  51.1 
 
 		 185 aa  177  4.999999999999999e-44  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00928808  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3647  ribosome recycling factor  51.1 
 
 		 185 aa  177  4.999999999999999e-44  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0174734  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2291  ribosome recycling factor  45.9 
 
 		 185 aa  177  4.999999999999999e-44  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  decreased coverage  0.000106212  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1321  ribosome recycling factor  50.55 
 
 		 185 aa  177  1e-43  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.198825  hitchhiker  0.00000000000000123018 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3922  ribosome recycling factor  50.55 
 
 		 185 aa  176  1e-43  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0969461  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2919  ribosome recycling factor  49.46 
 
 		 186 aa  176  2e-43  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.174611 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2476  ribosome recycling factor  51.43 
 
 		 185 aa  174  5e-43  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000697706  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2112  ribosome recycling factor  46.74 
 
 		 186 aa  174  6e-43  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2345  ribosome recycling factor  48.9 
 
 		 185 aa  172  2.9999999999999996e-42  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.082368  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0581  ribosome recycling factor  47.83 
 
 		 184 aa  171  3.9999999999999995e-42  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1813  ribosome recycling factor  46.74 
 
 		 184 aa  170  7.999999999999999e-42  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000182094  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0885  ribosome recycling factor  49.45 
 
 		 185 aa  170  9e-42  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.0000000127588  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1196  ribosome recycling factor  49.43 
 
 		 181 aa  170  1e-41  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  unclonable  0.00000300081  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3706  ribosome recycling factor  49.46 
 
 		 185 aa  169  2e-41  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0497206  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1144  ribosome recycling factor  48.35 
 
 		 185 aa  168  3e-41  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000279866  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1035  ribosome recycling factor  46.74 
 
 		 185 aa  167  7e-41  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000462528  unclonable  0.0000000105333 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1658  ribosome recycling factor  47.83 
 
 		 184 aa  166  2e-40  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.375108  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23610  ribosome recycling factor  44.57 
 
 		 184 aa  166  2e-40  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.093506 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1975  ribosome recycling factor  47.51 
 
 		 184 aa  165  2.9999999999999998e-40  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.552095  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1951  ribosome recycling factor  46.89 
 
 		 185 aa  165  4e-40  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1669  ribosome recycling factor  46.89 
 
 		 185 aa  165  4e-40  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.17061  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1003  ribosome recycling factor  45.65 
 
 		 183 aa  164  5e-40  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000000111257  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2560  ribosome recycling factor  49.43 
 
 		 181 aa  164  5.9999999999999996e-40  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1944  ribosome recycling factor  46.2 
 
 		 184 aa  164  5.9999999999999996e-40  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.757618 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3546  ribosome recycling factor  49.43 
 
 		 181 aa  164  6.9999999999999995e-40  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2036  ribosome recycling factor  48.02 
 
 		 186 aa  164  6.9999999999999995e-40  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1128  ribosome recycling factor  44.57 
 
 		 184 aa  163  1.0000000000000001e-39  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.440044  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0477  ribosome recycling factor  45.45 
 
 		 185 aa  162  2.0000000000000002e-39  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0474478  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1422  ribosome recycling factor  44.26 
 
 		 187 aa  162  2.0000000000000002e-39  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0768793  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_10920  ribosome recycling factor  43.48 
 
 		 186 aa  162  2.0000000000000002e-39  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0728725  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3730  ribosome recycling factor  45.4 
 
 		 185 aa  163  2.0000000000000002e-39  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000000151569  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2472  ribosome recycling factor  43.48 
 
 		 185 aa  162  3e-39  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3210  ribosome recycling factor  49.45 
 
 		 185 aa  161  5.0000000000000005e-39  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000000238814  hitchhiker  0.0000000602253 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2111  ribosome recycling factor  44.02 
 
 		 185 aa  161  6e-39  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0261  ribosome recycling factor  44.83 
 
 		 195 aa  160  6e-39  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0475  ribosome recycling factor  46.33 
 
 		 185 aa  161  6e-39  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.840836  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01128  ribosome recycling factor  48.59 
 
 		 185 aa  160  8.000000000000001e-39  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.291437  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1918  ribosome recycling factor  45.76 
 
 		 185 aa  160  1e-38  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  6.36169e-22  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0519  ribosome recycling factor  45.65 
 
 		 186 aa  159  3e-38  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0528  ribosome recycling factor  44.89 
 
 		 185 aa  158  5e-38  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0826  ribosome recycling factor  44.57 
 
 		 184 aa  156  1e-37  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.000458151  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1016  ribosome recycling factor  48.35 
 
 		 185 aa  156  1e-37  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000122168  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1069  ribosome recycling factor  48.35 
 
 		 185 aa  156  1e-37  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00702897  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3432  ribosome recycling factor  48.35 
 
 		 185 aa  156  1e-37  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000874312  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3273  ribosome recycling factor  41.99 
 
 		 186 aa  157  1e-37  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0116  ribosome recycling factor  42.61 
 
 		 187 aa  155  3e-37  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1674  ribosome recycling factor  43.48 
 
 		 185 aa  155  3e-37  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1252  ribosome recycling factor  46.74 
 
 		 185 aa  155  3e-37  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.538826  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2802  ribosome recycling factor  46.96 
 
 		 188 aa  155  4e-37  Caulobacter sp. K31  Bacteria  hitchhiker  0.00257577  normal  0.633294 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1783  ribosome recycling factor  41.62 
 
 		 185 aa  154  5.0000000000000005e-37  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00108157  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1539  ribosome recycling factor  41.85 
 
 		 185 aa  154  6e-37  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.34519 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2711  ribosome recycling factor  45.98 
 
 		 185 aa  154  7e-37  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0873966  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0445  ribosome recycling factor  42.61 
 
 		 185 aa  154  8e-37  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00199228  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0281  ribosome recycling factor  43.17 
 
 		 188 aa  154  8e-37  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09920  ribosome recycling factor  40.76 
 
 		 185 aa  153  1e-36  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.95344  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1556  ribosome recycling factor  47.83 
 
 		 185 aa  153  1e-36  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.188026  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0292  ribosome recycling factor  46.3 
 
 		 188 aa  153  1e-36  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1319  ribosome recycling factor  44.02 
 
 		 184 aa  153  1e-36  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.362878  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1345  ribosome recycling factor  44.02 
 
 		 184 aa  153  1e-36  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00867514  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2379  ribosome recycling factor  45.4 
 
 		 184 aa  153  1e-36  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0303  ribosome recycling factor  46.3 
 
 		 188 aa  153  2e-36  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0609  ribosome recycling factor  44.83 
 
 		 174 aa  153  2e-36  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.000570491  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1275  ribosome recycling factor  44.02 
 
 		 185 aa  152  2.9999999999999998e-36  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  decreased coverage  0.00110727  normal  0.535196 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1162  ribosome recycling factor  45.2 
 
 		 185 aa  152  2.9999999999999998e-36  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2753  ribosome recycling factor  43.1 
 
 		 185 aa  152  2.9999999999999998e-36  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.63878  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2632  ribosome recycling factor  44.02 
 
 		 185 aa  151  4e-36  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.00000000751677  normal  0.363086 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0077  ribosome recycling factor  43.48 
 
 		 185 aa  152  4e-36  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.010398  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1676  ribosome recycling factor  43.48 
 
 		 185 aa  151  5e-36  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1856  ribosome recycling factor  43.43 
 
 		 187 aa  151  5e-36  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.791714  normal  0.0290341 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0629  ribosome recycling factor  45.2 
 
 		 187 aa  151  5e-36  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.418172 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07680  ribosome recycling factor  44.94 
 
 		 185 aa  151  5.9999999999999996e-36  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.029169  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1670  ribosome recycling factor  43.48 
 
 		 185 aa  150  7e-36  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011690  PHATRDRAFT_40048  predicted protein  45.76 
 
 		 225 aa  150  7e-36  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  hitchhiker  0.00311694  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1713  ribosome recycling factor  44.63 
 
 		 184 aa  150  7e-36  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.634528  normal  0.959645 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1351  ribosome recycling factor  44.63 
 
 		 185 aa  150  7e-36  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0000000717676  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1843  ribosome recycling factor  43.75 
 
 		 185 aa  150  8e-36  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.773787 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1848  ribosome recycling factor  44.02 
 
 		 185 aa  150  8e-36  Vibrio cholerae O395  Bacteria  unclonable  0.00000000000000201497  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03234  ribosome recycling factor  45.2 
 
 		 185 aa  150  8.999999999999999e-36  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_12187  predicted protein  41.71 
 
 		 176 aa  150  8.999999999999999e-36  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.17047  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3778  ribosome recycling factor  42.37 
 
 		 182 aa  150  8.999999999999999e-36  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.343725 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0687  ribosome recycling factor  43.33 
 
 		 187 aa  150  8.999999999999999e-36  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000279104  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2899  ribosome recycling factor  44.07 
 
 		 185 aa  150  1e-35  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000932331  normal  0.103531 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1448  ribosome recycling factor  44.07 
 
 		 185 aa  150  1e-35  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000214173  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0216  ribosome recycling factor  43.68 
 
 		 185 aa  149  1e-35  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1430  ribosome recycling factor  43.24 
 
 		 184 aa  149  1e-35  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00121871  normal  0.0745134 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0710  ribosome recycling factor  46.86 
 
 		 185 aa  150  1e-35  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0332878  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3162  ribosome recycling factor  46.15 
 
 		 185 aa  150  1e-35  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0860569  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1273  ribosome recycling factor  41.85 
 
 		 185 aa  150  1e-35  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0235676  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4514  ribosome recycling factor  42.29 
 
 		 187 aa  150  1e-35  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.167395  normal  0.721299 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2221  ribosome recycling factor  41.3 
 
 		 185 aa  150  1e-35  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0750591  normal  0.159368 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1453  ribosome recycling factor  44.07 
 
 		 185 aa  150  1e-35  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000049819  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>