More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MCAP_0375 on replicon NC_007633
Organism: Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007633  MCAP_0375  ribosome recycling factor  100 
 
 		 182 aa  361  4e-99  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl555  ribosome recycling factor  57.22 
 
 		 181 aa  212  1.9999999999999998e-54  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  0.862763  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0528  ribosome recycling factor  44.32 
 
 		 185 aa  163  1.0000000000000001e-39  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0581  ribosome recycling factor  45.56 
 
 		 184 aa  161  5.0000000000000005e-39  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0261  ribosome recycling factor  44.83 
 
 		 195 aa  160  1e-38  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1556  ribosome recycling factor  47.03 
 
 		 185 aa  159  2e-38  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.188026  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1951  ribosome recycling factor  42.54 
 
 		 185 aa  158  4e-38  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1669  ribosome recycling factor  42.54 
 
 		 185 aa  158  4e-38  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.17061  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1860  ribosome recycling factor  44.32 
 
 		 185 aa  157  6e-38  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.747676  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1843  ribosome recycling factor  44.2 
 
 		 185 aa  157  6e-38  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.773787 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3647  ribosome recycling factor  43.24 
 
 		 185 aa  157  1e-37  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0174734  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1422  ribosome recycling factor  43.5 
 
 		 187 aa  156  1e-37  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0768793  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2345  ribosome recycling factor  42.62 
 
 		 185 aa  156  2e-37  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.082368  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3865  ribosome recycling factor  43.24 
 
 		 185 aa  155  2e-37  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00928808  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3565  ribosome recycling factor  43.24 
 
 		 185 aa  156  2e-37  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.603259  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3583  ribosome recycling factor  43.24 
 
 		 185 aa  156  2e-37  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3871  ribosome recycling factor  43.24 
 
 		 185 aa  155  2e-37  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0168076  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1918  ribosome recycling factor  42.7 
 
 		 185 aa  155  2e-37  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  6.36169e-22  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1321  ribosome recycling factor  43.24 
 
 		 185 aa  155  2e-37  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.198825  hitchhiker  0.00000000000000123018 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3836  ribosome recycling factor  43.24 
 
 		 185 aa  156  2e-37  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  3.64109e-62 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2036  ribosome recycling factor  42.16 
 
 		 186 aa  155  3e-37  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1196  ribosome recycling factor  43.5 
 
 		 181 aa  155  3e-37  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  unclonable  0.00000300081  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2476  ribosome recycling factor  44.62 
 
 		 185 aa  155  4e-37  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000697706  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3675  ribosome recycling factor  43.24 
 
 		 185 aa  154  5.0000000000000005e-37  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.979275  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3962  ribosome recycling factor  43.24 
 
 		 185 aa  154  5.0000000000000005e-37  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.60954  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3922  ribosome recycling factor  42.7 
 
 		 185 aa  154  6e-37  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0969461  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1658  ribosome recycling factor  43.78 
 
 		 184 aa  153  1e-36  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.375108  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2594  ribosome recycling factor  42.16 
 
 		 187 aa  153  1e-36  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.00709219  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1407  ribosome recycling factor  39.78 
 
 		 186 aa  152  2e-36  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2387  ribosome recycling factor  41.21 
 
 		 186 aa  152  2e-36  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.164667  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1438  ribosome recycling factor  39.11 
 
 		 186 aa  152  2e-36  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.389466  hitchhiker  0.000418835 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1517  ribosome recycling factor  42.16 
 
 		 185 aa  151  4e-36  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4637  ribosome recycling factor  43.33 
 
 		 182 aa  152  4e-36  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.138932  normal  0.818253 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1144  ribosome recycling factor  43.24 
 
 		 185 aa  151  5.9999999999999996e-36  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000279866  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0507  ribosome recycling factor  42.39 
 
 		 182 aa  150  8.999999999999999e-36  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0629  ribosome recycling factor  43.33 
 
 		 187 aa  150  1e-35  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.418172 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1670  ribosome recycling factor  42.16 
 
 		 185 aa  149  2e-35  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1878  ribosome recycling factor  39.66 
 
 		 186 aa  149  2e-35  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.556612  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2802  ribosome recycling factor  44.32 
 
 		 188 aa  149  2e-35  Caulobacter sp. K31  Bacteria  hitchhiker  0.00257577  normal  0.633294 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1035  ribosome recycling factor  40.88 
 
 		 185 aa  149  2e-35  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000462528  unclonable  0.0000000105333 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1975  ribosome recycling factor  40.22 
 
 		 184 aa  149  2e-35  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.552095  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1676  ribosome recycling factor  42.16 
 
 		 185 aa  149  3e-35  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1275  ribosome recycling factor  42.16 
 
 		 185 aa  148  3e-35  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  decreased coverage  0.00110727  normal  0.535196 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3706  ribosome recycling factor  41.08 
 
 		 185 aa  148  4e-35  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0497206  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2016  ribosome recycling factor  40.54 
 
 		 185 aa  148  4e-35  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00367889 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1345  ribosome recycling factor  41.44 
 
 		 186 aa  148  4e-35  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0459515  normal  0.505766 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0116  ribosome recycling factor  41.71 
 
 		 187 aa  147  5e-35  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0477  ribosome recycling factor  39.46 
 
 		 185 aa  148  5e-35  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0474478  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4958  ribosome recycling factor  41.44 
 
 		 192 aa  147  6e-35  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.759908  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0944  ribosome recycling factor  42.62 
 
 		 185 aa  147  7e-35  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.00317572  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1813  ribosome recycling factor  43.5 
 
 		 184 aa  147  8e-35  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000182094  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2919  ribosome recycling factor  39.34 
 
 		 186 aa  147  9e-35  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.174611 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3546  ribosome recycling factor  45.81 
 
 		 181 aa  147  1.0000000000000001e-34  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1281  ribosome recycling factor  40.33 
 
 		 186 aa  147  1.0000000000000001e-34  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.208847 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3357  ribosome recycling factor  43.17 
 
 		 185 aa  147  1.0000000000000001e-34  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.229017  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23610  ribosome recycling factor  39.23 
 
 		 184 aa  146  1.0000000000000001e-34  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.093506 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0010  ribosome recycling factor  40.66 
 
 		 192 aa  147  1.0000000000000001e-34  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0696052  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3928  ribosome recycling factor  39.46 
 
 		 185 aa  147  1.0000000000000001e-34  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.887062  normal  0.119713 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2112  ribosome recycling factor  39.78 
 
 		 186 aa  146  2.0000000000000003e-34  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2560  ribosome recycling factor  45.81 
 
 		 181 aa  146  2.0000000000000003e-34  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1512  ribosome recycling factor  40.54 
 
 		 185 aa  145  2.0000000000000003e-34  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  decreased coverage  0.00300903  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1200  ribosome recycling factor  41.67 
 
 		 185 aa  145  2.0000000000000003e-34  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0000906097  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0374  ribosome recycling factor  41.08 
 
 		 185 aa  145  3e-34  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1335  ribosome recycling factor  40.33 
 
 		 186 aa  145  3e-34  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.43872  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1783  ribosome recycling factor  41.28 
 
 		 185 aa  145  3e-34  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00108157  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0065  ribosome recycling factor  40.56 
 
 		 182 aa  145  3e-34  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.759475  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1351  ribosome recycling factor  38.92 
 
 		 185 aa  145  4.0000000000000006e-34  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0000000717676  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3162  ribosome recycling factor  41.53 
 
 		 185 aa  145  4.0000000000000006e-34  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0860569  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1260  ribosome recycling factor  40.88 
 
 		 186 aa  145  4.0000000000000006e-34  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.194359  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0362  ribosome recycling factor  42.7 
 
 		 190 aa  144  5e-34  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0327  ribosome recycling factor  42.7 
 
 		 190 aa  144  5e-34  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2379  ribosome recycling factor  43.1 
 
 		 184 aa  144  5e-34  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2111  ribosome recycling factor  37.3 
 
 		 185 aa  144  6e-34  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3730  ribosome recycling factor  40 
 
 		 185 aa  144  6e-34  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000000151569  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1162  ribosome recycling factor  40.54 
 
 		 185 aa  144  7.0000000000000006e-34  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_318  ribosome recycling factor  40.54 
 
 		 185 aa  144  8.000000000000001e-34  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.108452  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2978  ribosome recycling factor  40.98 
 
 		 185 aa  144  8.000000000000001e-34  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1632  ribosome recycling factor  38.67 
 
 		 185 aa  144  9e-34  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1552  ribosome recycling factor  39.23 
 
 		 186 aa  144  9e-34  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2580  ribosome recycling factor  39.23 
 
 		 186 aa  144  9e-34  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2490  ribosome recycling factor  39.23 
 
 		 186 aa  144  9e-34  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1325  ribosome recycling factor  39.23 
 
 		 186 aa  144  9e-34  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0289556  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3258  ribosome recycling factor  39.23 
 
 		 186 aa  144  9e-34  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.797404  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2053  ribosome recycling factor  39.23 
 
 		 186 aa  144  9e-34  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2434  ribosome recycling factor  39.23 
 
 		 186 aa  144  9e-34  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0313731  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01128  ribosome recycling factor  43.09 
 
 		 185 aa  143  1e-33  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.291437  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0574  ribosome recycling factor  39.13 
 
 		 184 aa  143  1e-33  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.165551  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1142  ribosome recycling factor  39.46 
 
 		 185 aa  143  1e-33  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.0000869669  normal  0.111417 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1918  ribosome recycling factor  39.78 
 
 		 186 aa  142  2e-33  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.415446 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1484  ribosome recycling factor  38.38 
 
 		 185 aa  142  2e-33  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.0000000709639  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2036  ribosome recycling factor  39.78 
 
 		 186 aa  142  2e-33  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.605835  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1745  ribosome recycling factor  40.56 
 
 		 198 aa  142  2e-33  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2030  ribosome recycling factor  39.78 
 
 		 186 aa  142  2e-33  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1527  ribosome recycling factor  40.11 
 
 		 185 aa  142  2e-33  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00139576  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2899  ribosome recycling factor  38.38 
 
 		 185 aa  143  2e-33  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000932331  normal  0.103531 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2049  ribosome recycling factor  39.78 
 
 		 186 aa  142  2e-33  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.360804  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2291  ribosome recycling factor  38.92 
 
 		 185 aa  142  2e-33  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  decreased coverage  0.000106212  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2016  ribosome recycling factor  39.78 
 
 		 186 aa  142  2e-33  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1448  ribosome recycling factor  38.38 
 
 		 185 aa  142  2e-33  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000214173  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2812  ribosome recycling factor  38.67 
 
 		 185 aa  143  2e-33  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.0000000100926  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>