More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Namu_4835 on replicon NC_013235
Organism: Nakamurella multipartita DSM 44233



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013235  Namu_4835  response regulator receiver protein  100 
 
 		 212 aa  412  1e-114  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1090  two component transcriptional regulator, LuxR family  41.61 
 
 		 224 aa  100  2e-20  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  hitchhiker  0.00274111  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2216  two component LuxR family transcriptional regulator  40.1 
 
 		 211 aa  95.9  4e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  hitchhiker  0.00683516  normal  0.0356101 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0049  two component transcriptional regulator, LuxR family  38.79 
 
 		 233 aa  91.7  8e-18  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0384611  normal  0.0476146 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0928  response regulator receiver protein  35.29 
 
 		 207 aa  82.4  0.000000000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0707495  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5512  two component LuxR family transcriptional regulator  32.42 
 
 		 250 aa  73.9  0.000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.631776 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1123  two component transcriptional regulator, LuxR family  30.41 
 
 		 242 aa  73.6  0.000000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0782  two component LuxR family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 248 aa  73.2  0.000000000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1680  two component LuxR family transcriptional regulator  35.86 
 
 		 229 aa  72.8  0.000000000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.128873  normal  0.734397 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0346  two component transcriptional regulator, LuxR family  35.48 
 
 		 210 aa  72.4  0.000000000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0205277  normal  0.823307 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1122  two component transcriptional regulator, LuxR family  28.86 
 
 		 234 aa  72  0.000000000006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.752968  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1039  two component LuxR family transcriptional regulator  31.69 
 
 		 238 aa  70.9  0.00000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.135118 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4744  response regulator receiver protein  33.16 
 
 		 209 aa  71.2  0.00000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.620464  normal  0.690137 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0606  two component transcriptional regulator, LuxR family  33.69 
 
 		 212 aa  70.1  0.00000000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1071  two component LuxR family transcriptional regulator  34.55 
 
 		 209 aa  70.1  0.00000000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4606  two component transcriptional regulator, LuxR family  37.43 
 
 		 207 aa  69.7  0.00000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.296562 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003136  transcriptional regulator LuxR family protein  27.51 
 
 		 212 aa  69.3  0.00000000004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.12843  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0851  two component transcriptional regulator, LuxR family  30.5 
 
 		 232 aa  69.3  0.00000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1684  response regulator receiver protein  34.78 
 
 		 207 aa  68.6  0.00000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.966789 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1051  two component transcriptional regulator, LuxR family  32.81 
 
 		 211 aa  67.8  0.0000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0337978 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5474  two component LuxR family transcriptional regulator  35.52 
 
 		 212 aa  67.4  0.0000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.344108  normal  0.73382 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2227  two component transcriptional regulator, LuxR family  30.77 
 
 		 217 aa  65.9  0.0000000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.632961  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3380  two component transcriptional regulator, LuxR family  33.49 
 
 		 222 aa  65.5  0.0000000005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3486  hypothetical protein  33.86 
 
 		 206 aa  65.9  0.0000000005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_00310  response regulator containing a CheY-like receiver domain and an HTH DNA-binding domain  31.28 
 
 		 213 aa  63.9  0.000000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1936  response regulator receiver protein  35 
 
 		 205 aa  63.9  0.000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5451  two component LuxR family transcriptional regulator  28.11 
 
 		 223 aa  63.2  0.000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.761649  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1784  two component LuxR family transcriptional regulator  31.61 
 
 		 224 aa  63.2  0.000000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  hitchhiker  0.000422915  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1267  two component LuxR family transcriptional regulator  26.37 
 
 		 216 aa  62.4  0.000000005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1551  two component LuxR family transcriptional regulator  27.37 
 
 		 229 aa  62  0.000000006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.460798 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1708  two component LuxR family transcriptional regulator  31.63 
 
 		 221 aa  61.6  0.000000008  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.685529 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2629  two component LuxR family transcriptional regulator  34.25 
 
 		 232 aa  61.6  0.000000009  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.312922  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4344  two component LuxR family transcriptional regulator  28.8 
 
 		 219 aa  61.6  0.000000009  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.218307 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03853  transcriptional regulator NarL  26.56 
 
 		 217 aa  60.8  0.00000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.0000020037  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_18530  response regulator containing a CheY-like receiver domain and an HTH DNA-binding domain  36.59 
 
 		 209 aa  61.2  0.00000001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0745  two component LuxR family transcriptional regulator  28.87 
 
 		 212 aa  61.2  0.00000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2722  two component LuxR family transcriptional regulator  29.38 
 
 		 214 aa  61.2  0.00000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.378798 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1981  two component transcriptional regulator, LuxR family  37.89 
 
 		 222 aa  61.2  0.00000001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0896  LuxR family transcriptional regulator  27.23 
 
 		 216 aa  60.8  0.00000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0175  two component transcriptional regulator, LuxR family  32.5 
 
 		 222 aa  60.1  0.00000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0242  two component LuxR family transcriptional regulator  32.64 
 
 		 211 aa  60.5  0.00000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000159114 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2683  two component transcriptional regulator, LuxR family  33.86 
 
 		 209 aa  60.5  0.00000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5633  two component transcriptional regulator, LuxR family  31.35 
 
 		 203 aa  60.8  0.00000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.603295  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2482  two component transcriptional regulator, LuxR family  36.26 
 
 		 208 aa  60.5  0.00000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0211915  normal  0.642006 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0970  two component LuxR family transcriptional regulator  28.04 
 
 		 209 aa  59.7  0.00000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0307407  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3982  DNA-binding nitrate/nitrite response regulator  28.9 
 
 		 209 aa  59.7  0.00000004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0516  two component transcriptional regulator, LuxR family  27.27 
 
 		 231 aa  59.3  0.00000004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5322  two component LuxR family transcriptional regulator  30.98 
 
 		 220 aa  59.3  0.00000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.929677 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_20460  response regulator containing a CheY-like receiver domain and an HTH DNA-binding domain  30.24 
 
 		 229 aa  59.3  0.00000004  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0212792  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1229  transcriptional regulator NarL  29.63 
 
 		 219 aa  58.9  0.00000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4942  two component transcriptional regulator, LuxR family  34.76 
 
 		 222 aa  58.9  0.00000005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_21900  response regulator containing a CheY-like receiver domain and an HTH DNA-binding domain  30.41 
 
 		 230 aa  58.9  0.00000005  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  hitchhiker  0.00486265  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3523  two component LuxR family transcriptional regulator  34.56 
 
 		 224 aa  58.9  0.00000005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_13730  transcriptional regulator NarL  29.63 
 
 		 219 aa  58.5  0.00000007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.817999 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3239  two component LuxR family transcriptional regulator  29.83 
 
 		 274 aa  58.5  0.00000008  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3632  two component transcriptional regulator, LuxR family  35.29 
 
 		 209 aa  58.2  0.00000008  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00835522  normal  0.0174868 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4250  two component LuxR family transcriptional regulator  28.29 
 
 		 246 aa  58.2  0.00000009  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.59923 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5205  two component LuxR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 215 aa  58.2  0.00000009  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1020  response regulator receiver  30.9 
 
 		 218 aa  58.2  0.00000009  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.648692  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1406  DNA-binding response regulator  26.63 
 
 		 215 aa  57.8  0.0000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.253896  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0602  nitrate/nitrite response regulator  27.92 
 
 		 219 aa  57.4  0.0000001  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.790372  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1284  two component LuxR family transcriptional regulator  32.31 
 
 		 209 aa  57.4  0.0000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.479266  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3654  two component transcriptional regulator, LuxR family  30.06 
 
 		 209 aa  57.4  0.0000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.000000000464283  hitchhiker  0.00000781977 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3713  two component LuxR family transcriptional regulator  30.06 
 
 		 209 aa  57.8  0.0000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000000000161759  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0620  two component transcriptional regulator, LuxR family protein  26.73 
 
 		 209 aa  57.8  0.0000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  unclonable  0.000000000275655  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0967  DNA-binding response regulator  30.68 
 
 		 209 aa  57.8  0.0000001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.598364  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0646  response regulator receiver protein  29.56 
 
 		 209 aa  58.2  0.0000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0492071  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0043  two component LuxR family transcriptional regulator  25.85 
 
 		 234 aa  58.2  0.0000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.14113 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3836  two component LuxR family transcriptional regulator  30.06 
 
 		 209 aa  57.8  0.0000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00000136397  normal  0.0231387 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2917  two component transcriptional regulator, LuxR family  30.73 
 
 		 216 aa  57.4  0.0000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0792  two component LuxR family transcriptional regulator  30.06 
 
 		 209 aa  57.8  0.0000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000000151034  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02120  DNA-binding response regulator in two-component regulatory system with NarQ or NarX  28.87 
 
 		 215 aa  57  0.0000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1030  two component transcriptional regulator, LuxR family  34.04 
 
 		 212 aa  56.6  0.0000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0748  transcriptional regulator NarP  28.87 
 
 		 215 aa  57  0.0000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.251733  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3393  two component LuxR family transcriptional regulator  31.4 
 
 		 224 aa  57  0.0000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0944476 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0340  two component transcriptional regulator, LuxR family  30.69 
 
 		 217 aa  57  0.0000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00614189  hitchhiker  0.00317709 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2341  transcriptional regulator NarP  28.87 
 
 		 215 aa  57  0.0000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.277554 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1457  transcriptional regulator NarP  28.87 
 
 		 215 aa  57  0.0000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.956805 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1903  two component transcriptional regulator, LuxR family  30.34 
 
 		 225 aa  57  0.0000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.202425  normal  0.182857 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0929  two component LuxR family transcriptional regulator  27.36 
 
 		 209 aa  57.4  0.0000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.0000000567962  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2335  LuxR family DNA-binding response regulator  30.18 
 
 		 215 aa  57  0.0000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2492  transcriptional regulator NarP  28.87 
 
 		 215 aa  57  0.0000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2331  transcriptional regulator NarP  28.87 
 
 		 215 aa  57  0.0000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2486  two component LuxR family transcriptional regulator  33.16 
 
 		 208 aa  56.6  0.0000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0315  two component LuxR family transcriptional regulator  30.32 
 
 		 214 aa  57  0.0000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0084678 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02079  hypothetical protein  28.87 
 
 		 215 aa  57  0.0000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3330  transcriptional regulator NarP  28.87 
 
 		 215 aa  57  0.0000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6980  two component transcriptional regulator, LuxR family  30.53 
 
 		 213 aa  56.6  0.0000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.999676 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1390  two component LuxR family transcriptional regulator  33.53 
 
 		 225 aa  56.6  0.0000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6211  response regulator receiver protein  30.69 
 
 		 239 aa  56.6  0.0000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.377169 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_16250  response regulator containing a CheY-like receiver domain and an HTH DNA-binding domain  36.5 
 
 		 224 aa  57  0.0000002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.216822  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0555  two component transcriptional regulator, LuxR family  27.23 
 
 		 227 aa  57.4  0.0000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.401942  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0663  two component LuxR family transcriptional regulator  30.2 
 
 		 219 aa  57  0.0000002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5404  transcriptional regulator, LuxR family  30.2 
 
 		 208 aa  57  0.0000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.803003  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5540  DNA-binding response regulator  28.57 
 
 		 215 aa  56.2  0.0000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5091  response regulator  28.57 
 
 		 215 aa  56.6  0.0000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5108  response regulator  28.57 
 
 		 215 aa  56.6  0.0000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.00235048  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2881  response regulator receiver  32.97 
 
 		 220 aa  56.6  0.0000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  decreased coverage  0.00126066  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5661  DNA-binding response regulator  28.57 
 
 		 215 aa  56.6  0.0000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0728  two component LuxR family transcriptional regulator  25.95 
 
 		 217 aa  56.2  0.0000003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>