232 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Namu_2743 on replicon NC_013235
Organism: Nakamurella multipartita DSM 44233



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013235  Namu_2743  NLP/P60 protein  100 
 
 		 879 aa  1755    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.164483  hitchhiker  0.00858571 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2532  hypothetical protein  71.12 
 
 		 712 aa  920    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000887043  hitchhiker  0.000809588 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4933  NLP/P60 protein  50.56 
 
 		 986 aa  166  2.0000000000000002e-39  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11506  invasion protein  40.91 
 
 		 472 aa  83.2  0.00000000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.0747167 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2747  NLP/P60 protein  40 
 
 		 478 aa  74.7  0.000000000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.552726  normal  0.486637 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0792  NLP/P60 protein  33.33 
 
 		 535 aa  74.3  0.000000000009  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3663  NLP/P60 protein  40 
 
 		 479 aa  73.6  0.00000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.24038  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0643  cell wall-associated hydrolase  33.77 
 
 		 487 aa  72  0.00000000004  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  unclonable  0.0011775  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0895  NLP/P60 protein  39.5 
 
 		 469 aa  71.6  0.00000000006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2844  NLP/P60 protein  36.59 
 
 		 259 aa  70.5  0.0000000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5716  NLP/P60 protein  39.5 
 
 		 469 aa  70.5  0.0000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3656  NLP/P60 protein  38.66 
 
 		 469 aa  70.5  0.0000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5292  NLP/P60 protein  39.5 
 
 		 469 aa  70.5  0.0000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.308075  normal  0.186714 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3688  NLP/P60 protein  33.19 
 
 		 248 aa  69.7  0.0000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4511  NLP/P60 protein  37.5 
 
 		 388 aa  69.7  0.0000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.307006  n/a   
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5720  NLP/P60 protein  34.26 
 
 		 257 aa  69.3  0.0000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3652  NLP/P60 protein  34.26 
 
 		 257 aa  69.3  0.0000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.387493  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0902  NLP/P60 protein  34.26 
 
 		 256 aa  69.3  0.0000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5288  NLP/P60 protein  34.26 
 
 		 257 aa  69.3  0.0000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.181073 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30760  cell wall-associated hydrolase, invasion-associated protein  35.59 
 
 		 261 aa  68.9  0.0000000004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.787895  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4564  NLP/P60 protein  38.66 
 
 		 467 aa  68.6  0.0000000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.057013  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2077  NLP/P60 protein  39.37 
 
 		 498 aa  67.8  0.0000000008  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.798704  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4520  NLP/P60 protein  37.82 
 
 		 472 aa  67.8  0.0000000009  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1440  NLP/P60  28.88 
 
 		 467 aa  67.8  0.000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.51506  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_18950  cell wall-associated hydrolase, invasion-associated protein  41.67 
 
 		 556 aa  67.4  0.000000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.10475 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5687  NLP/P60 protein  33.05 
 
 		 256 aa  67.4  0.000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.444646 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1458  NLP/P60 protein  28.88 
 
 		 467 aa  67.8  0.000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.614878  normal  0.41084 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2333  NLP/P60 protein  39.02 
 
 		 432 aa  67.4  0.000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.554645  normal  0.0124113 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0773  NLP/P60 protein  34.96 
 
 		 256 aa  67.4  0.000000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2839  NLP/P60 protein  37.82 
 
 		 469 aa  67.4  0.000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.239503 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5324  NLP/P60 protein  33.05 
 
 		 256 aa  67.4  0.000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2140  NLP/P60 protein  40 
 
 		 427 aa  66.6  0.000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00000576124  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2403  NLP/P60 protein  38.4 
 
 		 505 aa  66.6  0.000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2843  NLP/P60 protein  33.49 
 
 		 256 aa  66.2  0.000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.676167 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_07830  cell wall-associated hydrolase, invasion-associated protein  35.1 
 
 		 372 aa  65.5  0.000000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2451  NLP/P60  35.29 
 
 		 475 aa  65.5  0.000000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.629046  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2496  NLP/P60 protein  35.29 
 
 		 475 aa  65.5  0.000000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2488  NLP/P60 protein  35.29 
 
 		 475 aa  65.5  0.000000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.402452  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4557  NLP/P60 protein  31.06 
 
 		 248 aa  64.7  0.000000007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2429  NLP/P60 protein  38.55 
 
 		 278 aa  64.3  0.000000009  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.328079 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2432  NLP/P60 protein  35.11 
 
 		 391 aa  64.3  0.000000009  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1506  NLP/P60 protein  37.29 
 
 		 524 aa  64.3  0.00000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.483483  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10740  cell wall-associated hydrolase, invasion-associated protein  34.59 
 
 		 332 aa  62.4  0.00000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1561  Cell wall-associated hydrolase (invasion- associated protein)-like protein  32.9 
 
 		 337 aa  62.8  0.00000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.308616  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0573  NLP/P60 protein  37.19 
 
 		 388 aa  62.4  0.00000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.774962  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0883  NLP/P60 protein  41.76 
 
 		 257 aa  62  0.00000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.201792 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1447  NLP/P60  33.49 
 
 		 256 aa  62  0.00000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.397182  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1465  NLP/P60 protein  33.49 
 
 		 256 aa  62  0.00000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.589531  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8534  Cell wall-associated hydrolase (invasion- associated protein)-like protein  35.21 
 
 		 438 aa  61.6  0.00000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0174309  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3662  NLP/P60 protein  42.06 
 
 		 228 aa  61.2  0.00000007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.286781  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1987  NLP/P60 protein  30.51 
 
 		 271 aa  60.5  0.0000001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2748  NLP/P60 protein  31.15 
 
 		 230 aa  60.5  0.0000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.46287  normal  0.819631 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1783  NLP/P60 protein  28.4 
 
 		 317 aa  60.1  0.0000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.114987  n/a   
 
 
-
 
NC_013531  Xcel_3442  Peptidase M23  33.08 
 
 		 546 aa  59.3  0.0000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2452  NLP/P60  39.8 
 
 		 241 aa  58.9  0.0000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2497  NLP/P60 protein  39.8 
 
 		 241 aa  58.9  0.0000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1008  cell wall-associated hydrolase  32.54 
 
 		 197 aa  58.5  0.0000005  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.000147737  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4529  NLP/P60 protein  39.81 
 
 		 239 aa  58.5  0.0000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.612016  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2085  NLP/P60 protein  35.07 
 
 		 447 aa  58.2  0.0000006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5167  NLP/P60 family lipoprotein  32.82 
 
 		 364 aa  58.2  0.0000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2489  NLP/P60 protein  39.8 
 
 		 221 aa  58.5  0.0000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0999493  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6213  NLP/P60  31.3 
 
 		 363 aa  58.2  0.0000007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.935456  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1866  NLP/P60 protein  31.3 
 
 		 363 aa  58.2  0.0000007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1890  NLP/P60 protein  31.3 
 
 		 363 aa  57.8  0.0000009  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.00780805  hitchhiker  0.0000000811276 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1407  NLP/P60 protein  32.06 
 
 		 369 aa  57.8  0.0000009  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.374528 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5092  NLP/P60 protein  31.21 
 
 		 207 aa  57.4  0.000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1776  NLP/P60 protein  32.06 
 
 		 353 aa  57.8  0.000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11507  invasion protein  39.36 
 
 		 253 aa  57.4  0.000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.116745 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4909  NLP/P60 protein  36.15 
 
 		 335 aa  57  0.000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2872  NLP/P60 protein  38.6 
 
 		 164 aa  57.4  0.000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4965  NLP/P60 protein  30.86 
 
 		 208 aa  57.4  0.000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0142  NLP/P60 protein  34.92 
 
 		 370 aa  56.6  0.000002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2683  NLP/P60 protein  35.66 
 
 		 348 aa  56.6  0.000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.468332  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6205  NLP/P60 protein  35.34 
 
 		 417 aa  56.6  0.000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0502801 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2393  putative transmembrane lipoprotein  30.53 
 
 		 404 aa  56.2  0.000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.951834  normal  0.103299 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0805  cell wall-associated hydrolase  30.4 
 
 		 395 aa  56.2  0.000002  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0271814  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0919  NLP/P60 protein  32.06 
 
 		 382 aa  56.6  0.000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0475791  normal  0.21921 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10024  hypothetical protein  31.3 
 
 		 281 aa  57  0.000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3095  NLP/P60 protein  34.59 
 
 		 452 aa  57  0.000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.378956 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5142  NLP/P60 protein  30.86 
 
 		 208 aa  57  0.000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0699781  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1804  NLP/P60 protein  31.3 
 
 		 354 aa  56.2  0.000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1266  NLP/P60 protein  29.88 
 
 		 362 aa  56.2  0.000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2273  NLP/P60 protein  30.54 
 
 		 333 aa  55.5  0.000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.543976  normal  0.489772 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4472  NLP/P60 protein  35.34 
 
 		 225 aa  55.8  0.000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.168401  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1794  NLP/P60 protein  30.53 
 
 		 418 aa  55.5  0.000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.435053  hitchhiker  0.00883906 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3235  NLP/P60 protein  36.8 
 
 		 446 aa  55.5  0.000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.177919  hitchhiker  0.000140663 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6442  NLP/P60 protein  34.11 
 
 		 392 aa  55.5  0.000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4593  NLP/P60 protein  36.94 
 
 		 269 aa  55.1  0.000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.00530725  hitchhiker  0.00160562 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2843  NLP/P60 protein  35.54 
 
 		 251 aa  54.7  0.000007  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0373  NLP/P60 protein  33.65 
 
 		 208 aa  54.7  0.000008  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8582  NLP/P60 protein  36.21 
 
 		 180 aa  54.3  0.000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0901428  normal  0.349112 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6095  NLP/P60 protein  31.17 
 
 		 366 aa  54.3  0.00001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0901691 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1029  putative secreted protein  33.04 
 
 		 331 aa  53.9  0.00001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.781321  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3287  NLP/P60  34.38 
 
 		 372 aa  53.9  0.00001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3349  NLP/P60 protein  34.38 
 
 		 372 aa  53.9  0.00001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0832432  normal  0.0310886 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_19600  hypothetical protein  35.71 
 
 		 411 aa  54.3  0.00001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.652812  hitchhiker  0.00117043 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3298  NLP/P60 protein  34.38 
 
 		 372 aa  53.9  0.00001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.382335  normal  0.154902 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4498  NLP/P60 protein  36.97 
 
 		 398 aa  54.3  0.00001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.055455  normal  0.0701003 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_13270  hypothetical protein  37.5 
 
 		 389 aa  53.5  0.00002  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.265233  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3552  NLP/P60 protein  35.82 
 
 		 378 aa  53.1  0.00002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>