More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene NSE_0783 on replicon NC_007798
Organism: Neorickettsia sennetsu str. Miyayama



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007798  NSE_0783  major facilitator family transporter  100 
 
 		 415 aa  808    Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0168  major facilitator family transporter  43.18 
 
 		 415 aa  335  7e-91  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0130  general substrate transporter  42.12 
 
 		 441 aa  312  9e-84  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.471024  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0193  major facilitator family transporter  40.31 
 
 		 422 aa  301  1e-80  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3666  major facilitator transporter  33.5 
 
 		 444 aa  237  3e-61  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.262449 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3304  General substrate transporter  33.25 
 
 		 456 aa  237  3e-61  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2063  major facilitator transporter  33.25 
 
 		 444 aa  236  6e-61  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.667333  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2233  general substrate transporter  33.5 
 
 		 444 aa  235  1.0000000000000001e-60  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.527639 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2237  general substrate transporter  33.25 
 
 		 444 aa  232  8.000000000000001e-60  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0866984  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0467  general substrate transporter  34.16 
 
 		 434 aa  229  5e-59  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.000495817  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3029  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  33.99 
 
 		 435 aa  229  7e-59  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.086434  normal  0.0267794 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1693  major facilitator transporter  32.74 
 
 		 444 aa  228  1e-58  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1015  major facilitator transporter  32.67 
 
 		 438 aa  226  5.0000000000000005e-58  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.210146  normal  0.25422 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2384  major facilitator superfamily MFS_1  34.18 
 
 		 443 aa  226  8e-58  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.210469  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0407  major facilitator superfamily MFS_1  35.99 
 
 		 435 aa  225  9e-58  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.051048  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_56470  putative MFS transporter  35.1 
 
 		 439 aa  225  1e-57  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2752  major facilitator transporter  31.54 
 
 		 436 aa  225  1e-57  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.419621  normal  0.295162 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0889  major facilitator transporter  33.74 
 
 		 447 aa  224  2e-57  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.242663  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3727  major facilitator transporter  34.41 
 
 		 467 aa  224  2e-57  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.140818  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2610  major facilitator transporter  31.54 
 
 		 436 aa  224  2e-57  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.241341 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3056  major facilitator superfamily protein superfamily  35.21 
 
 		 485 aa  224  3e-57  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.150401  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2818  general substrate transporter  34.96 
 
 		 483 aa  223  4e-57  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.139895  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3055  major facilitator family transporter  34.96 
 
 		 485 aa  223  4e-57  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2807  major facilitator family transporter  34.96 
 
 		 485 aa  223  4.9999999999999996e-57  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2757  glycine betaine/L-proline ABC transporter, permease  34.96 
 
 		 485 aa  223  4.9999999999999996e-57  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000489566  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3018  major facilitator family transporter  35.21 
 
 		 485 aa  223  4.9999999999999996e-57  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3020  major facilitator family transporter  34.96 
 
 		 485 aa  223  4.9999999999999996e-57  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3017  major facilitator family transporter  34.96 
 
 		 485 aa  223  4.9999999999999996e-57  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.352179 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2222  major facilitator family transporter  34.96 
 
 		 485 aa  223  7e-57  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000000297213 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3365  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  32.21 
 
 		 433 aa  222  8e-57  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00021546  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2738  glycine betaine/L-proline ABC transporter, permease  34.72 
 
 		 485 aa  221  9.999999999999999e-57  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3935  major facilitator transporter  32.41 
 
 		 440 aa  221  1.9999999999999999e-56  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0952  General substrate transporter  36.53 
 
 		 430 aa  221  1.9999999999999999e-56  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.328435  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1160  major facilitator transporter  33.17 
 
 		 440 aa  220  5e-56  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1453  general substrate transporter  34.13 
 
 		 482 aa  218  1e-55  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0358051  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_10171  putative proline/betaine transporter, MFS family protein  32.41 
 
 		 420 aa  218  1e-55  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.643051 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1292  general substrate transporter  30.62 
 
 		 436 aa  218  1e-55  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0857643  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2550  major facilitator transporter  31.05 
 
 		 436 aa  217  2e-55  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4939  General substrate transporter  33.25 
 
 		 493 aa  216  4e-55  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.506822  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2791  major facilitator superfamily MFS_1  33.42 
 
 		 443 aa  215  9e-55  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3403  major facilitator transporter  33.42 
 
 		 461 aa  215  9.999999999999999e-55  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0146  General substrate transporter  31.71 
 
 		 431 aa  214  1.9999999999999998e-54  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4576  proline/glycine betaine transporter  31.3 
 
 		 500 aa  214  1.9999999999999998e-54  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3742  major facilitator transporter  31.77 
 
 		 438 aa  214  2.9999999999999995e-54  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0201656 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2353  major facilitator transporter  32.01 
 
 		 438 aa  214  2.9999999999999995e-54  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4621  major facilitator transporter  31.77 
 
 		 438 aa  214  2.9999999999999995e-54  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3781  major facilitator transporter  31.77 
 
 		 438 aa  214  2.9999999999999995e-54  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.243933  decreased coverage  0.00125466 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1103  major facilitator transporter  32.83 
 
 		 452 aa  213  3.9999999999999995e-54  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1907  general substrate transporter  31.98 
 
 		 454 aa  213  3.9999999999999995e-54  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0522136  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3801  major facilitator family transporter  37.56 
 
 		 445 aa  213  4.9999999999999996e-54  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0763  major facilitator transporter  32.35 
 
 		 422 aa  213  4.9999999999999996e-54  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000770218  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5889  general substrate transporter  33.42 
 
 		 489 aa  213  5.999999999999999e-54  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2695  major facilitator transporter  31.5 
 
 		 442 aa  212  7.999999999999999e-54  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2869  proline/glycine betaine transporter  30.83 
 
 		 500 aa  212  7.999999999999999e-54  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.779862 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1420  proline/glycine betaine transporter  29.88 
 
 		 500 aa  212  7.999999999999999e-54  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  decreased coverage  0.00160587  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2038  general substrate transporter  33.59 
 
 		 527 aa  212  7.999999999999999e-54  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1159  general substrate transporter  33.59 
 
 		 493 aa  212  9e-54  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.95972  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03982  proline/glycine betaine transporter  31.05 
 
 		 500 aa  212  1e-53  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3881  metabolite/H+ symporter, major facilitator superfamily (MFS)  31.05 
 
 		 500 aa  212  1e-53  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03943  hypothetical protein  31.05 
 
 		 500 aa  212  1e-53  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5624  proline/glycine betaine transporter  31.05 
 
 		 500 aa  212  1e-53  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3916  proline/glycine betaine transporter  31.05 
 
 		 500 aa  212  1e-53  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.382911  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1509  major facilitator superfamily proline/betaine transporter  32.7 
 
 		 503 aa  212  1e-53  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.224519 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1708  General substrate transporter  34.1 
 
 		 430 aa  212  1e-53  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1171  general substrate transporter  33.84 
 
 		 491 aa  212  1e-53  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0956509  normal  0.0980355 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1520  General substrate transporter  33.65 
 
 		 453 aa  212  1e-53  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.817393  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0013  putative permease  30.19 
 
 		 446 aa  211  2e-53  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4149  general substrate transporter  32.59 
 
 		 433 aa  211  2e-53  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.65199  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4351  proline/glycine betaine transporter  30.81 
 
 		 500 aa  210  3e-53  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4665  proline/glycine betaine transporter  30.81 
 
 		 500 aa  210  3e-53  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2153  proline/betaine transporter  33.09 
 
 		 443 aa  211  3e-53  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.877482  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1253  general substrate transporter  32.32 
 
 		 496 aa  211  3e-53  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.425201  normal  0.218881 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5664  major facilitator transporter  33.16 
 
 		 431 aa  210  4e-53  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2914  proline/glycine betaine transporter  30.08 
 
 		 500 aa  209  5e-53  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.839203 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0025  major facilitator family transporter  33.09 
 
 		 438 aa  210  5e-53  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2112  proline/glycine betaine transporter  30.58 
 
 		 500 aa  209  5e-53  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6155  general substrate transporter  33.6 
 
 		 531 aa  210  5e-53  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2798  metabolite/H+ symporter, major facilitator superfamily (MFS)  31.75 
 
 		 437 aa  209  6e-53  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.606232  normal  0.0553764 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2777  proline/glycine betaine transporter  30.08 
 
 		 500 aa  209  6e-53  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.426081  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6280  major facilitator transporter  31.63 
 
 		 458 aa  209  7e-53  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.190534  normal  0.556482 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1158  General substrate transporter  32.13 
 
 		 436 aa  209  7e-53  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4636  proline/glycine betaine transporter  30.56 
 
 		 500 aa  209  7e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4552  proline/glycine betaine transporter  30.56 
 
 		 500 aa  209  7e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4636  proline/glycine betaine transporter  30.56 
 
 		 500 aa  209  7e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4424  major facilitator transporter  33.33 
 
 		 495 aa  209  8e-53  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.133248  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3438  major facilitator transporter  36.32 
 
 		 448 aa  209  8e-53  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0315  proline/glycine betaine transporter  30.32 
 
 		 500 aa  209  9e-53  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0135583 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4545  proline/glycine betaine transporter  30.56 
 
 		 500 aa  209  9e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.829312  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4727  major facilitator transporter  33.91 
 
 		 428 aa  208  1e-52  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.192951  normal  0.740754 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4913  MFS family transporter  32.06 
 
 		 439 aa  209  1e-52  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5260  major facilitator transporter  36.32 
 
 		 448 aa  208  1e-52  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0336827  normal  0.340557 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4107  General substrate transporter  32.19 
 
 		 447 aa  208  2e-52  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1281  general substrate transporter  32.58 
 
 		 496 aa  207  2e-52  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0545029  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3917  major facilitator superfamily MFS_1  32.48 
 
 		 446 aa  208  2e-52  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.981496  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1521  major facilitator family transporter  33 
 
 		 448 aa  207  3e-52  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.537503  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1677  major facilitator transporter  36.48 
 
 		 445 aa  207  3e-52  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.119827  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7406  major facilitator transporter  33.42 
 
 		 489 aa  207  3e-52  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0800  general substrate transporter  33.6 
 
 		 452 aa  207  3e-52  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2045  major facilitator transporter  33.33 
 
 		 445 aa  207  4e-52  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.817358 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1270  proline/betaine transporter  33.16 
 
 		 495 aa  207  4e-52  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0643397  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>