More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrad2831_4294 on replicon NC_010505
Organism: Methylobacterium radiotolerans JCM 2831



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010505  Mrad2831_4294  LysR family transcriptional regulator  100 
 
 
283 aa  551  1e-156  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.917981  normal  0.0102714 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2742  transcriptional regulator, LysR family  68.73 
 
 
300 aa  381  1e-105  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2073  transcriptional regulator, LysR family  56.06 
 
 
299 aa  293  2e-78  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6430  LysR family transcriptional regulator  55.44 
 
 
299 aa  292  5e-78  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0940  LysR family transcriptional regulator  51.72 
 
 
298 aa  265  8.999999999999999e-70  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.146114  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3416  LysR family transcriptional regulator  45.61 
 
 
331 aa  229  4e-59  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.489103  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4259  LysR family transcriptional regulator  45.61 
 
 
331 aa  229  4e-59  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.352311  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4107  LysR family transcriptional regulator  45.61 
 
 
331 aa  229  4e-59  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.318015  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1937  LysR family transcriptional regulator  44.75 
 
 
332 aa  224  1e-57  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.601207  normal  0.697041 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3518  LysR family transcriptional regulator  44.27 
 
 
330 aa  224  1e-57  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4001  LysR family transcriptional regulator  45.08 
 
 
330 aa  223  2e-57  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.371452  normal  0.240792 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5942  LysR family transcriptional regulator  42.32 
 
 
304 aa  222  6e-57  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6215  LysR family transcriptional regulator  42.32 
 
 
321 aa  222  6e-57  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1363  LysR family transcriptional regulator  47 
 
 
314 aa  220  1.9999999999999999e-56  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2575  LysR family transcriptional regulator  42.86 
 
 
318 aa  219  3e-56  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00210172 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0355  LysR family transcriptional regulator  46.15 
 
 
316 aa  219  3.9999999999999997e-56  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3399  LysR family transcriptional regulator  46.15 
 
 
316 aa  219  3.9999999999999997e-56  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2440  LysR family transcriptional regulator  46.15 
 
 
316 aa  219  3.9999999999999997e-56  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3436  LysR family transcriptional regulator  46.15 
 
 
316 aa  219  3.9999999999999997e-56  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.205588  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1214  LysR family transcriptional regulator  46.15 
 
 
316 aa  219  3.9999999999999997e-56  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3434  LysR family transcriptional regulator  46.15 
 
 
316 aa  219  3.9999999999999997e-56  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2625  LysR family transcriptional regulator  46.15 
 
 
316 aa  219  3.9999999999999997e-56  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0595  LysR family transcriptional regulator  45.64 
 
 
318 aa  219  5e-56  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.458693 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1223  LysR family transcriptional regulator  46.15 
 
 
330 aa  215  5e-55  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3364  transcriptional regulator, LysR family  45.3 
 
 
318 aa  215  8e-55  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.454528  hitchhiker  0.000000907817 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0370  transcriptional regulator, LysR family  45.52 
 
 
314 aa  214  9e-55  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0355  transcriptional regulator, LysR family  45.17 
 
 
314 aa  214  9.999999999999999e-55  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0479  putative transcription regulator protein  45.17 
 
 
314 aa  213  1.9999999999999998e-54  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5636  LysR family transcriptional regulator  39.93 
 
 
304 aa  213  1.9999999999999998e-54  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.960553  normal  0.170882 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4075  LysR family transcriptional regulator  45.33 
 
 
312 aa  213  3.9999999999999995e-54  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0586  transcriptional regulator, LysR family  44.88 
 
 
315 aa  212  3.9999999999999995e-54  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0607  LysR family transcriptional regulator  44.88 
 
 
312 aa  212  4.9999999999999996e-54  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0455  LysR family transcriptional regulator  44.83 
 
 
315 aa  211  1e-53  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3563  LysR family transcriptional regulator  43.58 
 
 
309 aa  210  2e-53  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3753  LysR family transcriptional regulator  44.56 
 
 
317 aa  209  3e-53  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0588  LysR family transcriptional regulator  44.56 
 
 
317 aa  209  4e-53  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.350686 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0826  transcriptional regulator, LysR family  44.52 
 
 
329 aa  209  5e-53  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0397  LysR family transcriptional regulator  43.82 
 
 
329 aa  208  6e-53  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0365942 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0634  LysR family transcriptional regulator  44.56 
 
 
321 aa  208  9e-53  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.759495  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1334  transcriptional regulator, LysR family  45.97 
 
 
301 aa  208  9e-53  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.452121  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0667  LysR family transcriptional regulator  44.56 
 
 
321 aa  208  9e-53  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.716633  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2716  LysR family transcriptional regulator  44.21 
 
 
317 aa  207  1e-52  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0184  LysR family transcriptional regulator  44.56 
 
 
359 aa  207  1e-52  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.444951  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4025  LysR family transcriptional regulator  42.9 
 
 
316 aa  207  1e-52  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000302708 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0562  LysR family transcriptional regulator  44.21 
 
 
317 aa  206  4e-52  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3905  LysR family transcriptional regulator  42.76 
 
 
320 aa  205  6e-52  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.00200094  normal  0.196603 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3459  LysR family transcriptional regulator  43.37 
 
 
325 aa  204  1e-51  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3465  LysR family transcriptional regulator  42.05 
 
 
332 aa  200  3e-50  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.570257  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0535  transcriptional regulator, LysR family  38.74 
 
 
301 aa  199  3.9999999999999996e-50  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.32739  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1836  LysR family transcriptional regulator  43.93 
 
 
306 aa  197  1.0000000000000001e-49  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0442  LysR family transcriptional regulator  43.16 
 
 
323 aa  197  2.0000000000000003e-49  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.288033  normal  0.291183 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0987  LysR family transcriptional regulator  41.39 
 
 
306 aa  194  1e-48  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5169  LysR family transcriptional regulator  40.78 
 
 
313 aa  193  2e-48  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.733103  normal  0.458682 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3456  LysR family transcriptional regulator  41.3 
 
 
305 aa  187  2e-46  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.684664 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6424  LysR family transcriptional regulator  39.53 
 
 
314 aa  187  2e-46  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.398194 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6136  LysR family transcriptional regulator  39.53 
 
 
314 aa  186  3e-46  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0127  LysR family transcriptional regulator  42.21 
 
 
300 aa  186  4e-46  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3095  LysR family transcriptional regulator  37.54 
 
 
313 aa  183  3e-45  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5624  LysR family transcriptional regulator  41.52 
 
 
303 aa  177  2e-43  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0317302  normal  0.218372 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0844  LysR family transcriptional regulator  41.08 
 
 
301 aa  176  4e-43  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.165909  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5498  transcriptional regulator, LysR family  41.87 
 
 
303 aa  174  1.9999999999999998e-42  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5050  regulatory protein, LysR:LysR, substrate-binding  41.52 
 
 
315 aa  173  2.9999999999999996e-42  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.22828 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2775  LysR family transcriptional regulator  40.42 
 
 
290 aa  173  3.9999999999999995e-42  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3099  LysR family transcriptional regulator  37.46 
 
 
300 aa  172  3.9999999999999995e-42  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.605921  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6216  putative transcriptional regulator  40.14 
 
 
302 aa  172  5.999999999999999e-42  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.795893  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_71640  LysR family transcriptional regulator  40.14 
 
 
302 aa  172  6.999999999999999e-42  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.182655  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5155  LysR family transcriptional regulator  40 
 
 
297 aa  171  1e-41  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0136  LysR family transcriptional regulator  40.83 
 
 
305 aa  170  3e-41  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.123398  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4061  transcriptional regulator, LysR family  39.45 
 
 
291 aa  169  5e-41  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1392  LysR family transcriptional regulator  38.11 
 
 
326 aa  167  2e-40  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3685  transcriptional regulator, LysR family  40.4 
 
 
318 aa  166  2.9999999999999998e-40  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3343  LysR family transcriptional regulator  37.05 
 
 
331 aa  166  4e-40  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.186487  normal  0.534398 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5675  transcriptional regulator, LysR family  39.86 
 
 
308 aa  166  5e-40  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.716061  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5246  LysR family transcriptional regulator  40.48 
 
 
308 aa  164  1.0000000000000001e-39  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.214588  normal  0.158327 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5337  LysR family transcriptional regulator  40.48 
 
 
305 aa  164  1.0000000000000001e-39  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000417223 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5386  LysR family transcriptional regulator  40.48 
 
 
310 aa  164  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.110061 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0461  regulatory protein LysR  37.33 
 
 
310 aa  161  1e-38  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3059  transcriptional regulator, LysR family  37.62 
 
 
330 aa  160  2e-38  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0123  LysR family transcriptional regulator  38.16 
 
 
300 aa  159  4e-38  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.797255 
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4540  LysR family transcriptional regulator  36.64 
 
 
310 aa  159  4e-38  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1643  transcriptional regulator, LysR family  37.25 
 
 
299 aa  158  8e-38  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.492229  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3498  LysR family transcriptional regulator  40.97 
 
 
304 aa  154  2e-36  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00636184 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3436  LysR family transcriptional regulator  40 
 
 
313 aa  153  2.9999999999999998e-36  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.143261  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1681  LysR family transcriptional regulator  32.01 
 
 
311 aa  152  8.999999999999999e-36  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0428  transcriptional regulator, LysR family  37.16 
 
 
307 aa  149  5e-35  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.354645  hitchhiker  0.0000121787 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3404  transcriptional regulator, LysR family  38.85 
 
 
298 aa  149  7e-35  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1440  transcriptional regulator  35.37 
 
 
310 aa  148  9e-35  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.820273 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0441  transcriptional regulator, LysR family  36.49 
 
 
307 aa  147  2.0000000000000003e-34  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0317691  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0828  transcriptional regulator  33.33 
 
 
308 aa  145  5e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0891  transcriptional regulator  33.33 
 
 
315 aa  145  6e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.234523  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0800  transcriptional regulator  33.33 
 
 
315 aa  145  6e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0859  transcriptional regulator  33.33 
 
 
315 aa  145  8.000000000000001e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.362505  normal 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5287  transcriptional regulator, LysR family  35.71 
 
 
305 aa  145  9e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3447  LysR family transcriptional regulator  36.54 
 
 
350 aa  143  3e-33  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7601  LysR family transcriptional regulator  34.92 
 
 
302 aa  140  3e-32  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2006  HTH-type transcriptional regulator, LysR family  32.64 
 
 
293 aa  139  4.999999999999999e-32  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3603  LysR family transcriptional regulator  35.84 
 
 
312 aa  138  8.999999999999999e-32  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0823  LysR family transcriptional regulator  35.67 
 
 
301 aa  136  4e-31  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3161  LysR family transcriptional regulator  34.51 
 
 
311 aa  134  1.9999999999999998e-30  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.897758  hitchhiker  0.00000774077 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0454  LysR family transcriptional regulator  33.68 
 
 
301 aa  130  3e-29  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>