More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BMA2440 on replicon NC_006348
Organism: Burkholderia mallei ATCC 23344



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009074  BURPS668_3399  LysR family transcriptional regulator  100 
 
 		 316 aa  639    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2440  LysR family transcriptional regulator  100 
 
 		 316 aa  639    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3434  LysR family transcriptional regulator  100 
 
 		 316 aa  639    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3436  LysR family transcriptional regulator  99.68 
 
 		 316 aa  637    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.205588  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0355  LysR family transcriptional regulator  100 
 
 		 316 aa  639    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2625  LysR family transcriptional regulator  100 
 
 		 316 aa  639    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1214  LysR family transcriptional regulator  100 
 
 		 316 aa  639    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1223  LysR family transcriptional regulator  96.84 
 
 		 330 aa  622  1e-177  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3753  LysR family transcriptional regulator  89.87 
 
 		 317 aa  581  1.0000000000000001e-165  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0588  LysR family transcriptional regulator  89.24 
 
 		 317 aa  576  1.0000000000000001e-163  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.350686 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2716  LysR family transcriptional regulator  90.38 
 
 		 317 aa  575  1.0000000000000001e-163  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0184  LysR family transcriptional regulator  89.21 
 
 		 359 aa  572  1.0000000000000001e-162  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.444951  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0562  LysR family transcriptional regulator  88.92 
 
 		 317 aa  573  1.0000000000000001e-162  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0667  LysR family transcriptional regulator  89.21 
 
 		 321 aa  572  1.0000000000000001e-162  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.716633  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0634  LysR family transcriptional regulator  89.21 
 
 		 321 aa  572  1.0000000000000001e-162  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.759495  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2575  LysR family transcriptional regulator  84.03 
 
 		 318 aa  538  9.999999999999999e-153  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00210172 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0595  LysR family transcriptional regulator  82.02 
 
 		 318 aa  530  1e-150  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.458693 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3364  transcriptional regulator, LysR family  82.11 
 
 		 318 aa  523  1e-147  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.454528  hitchhiker  0.000000907817 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0479  putative transcription regulator protein  63.49 
 
 		 314 aa  394  1e-109  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0455  LysR family transcriptional regulator  65.42 
 
 		 315 aa  394  1e-109  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0355  transcriptional regulator, LysR family  63.61 
 
 		 314 aa  391  1e-108  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0397  LysR family transcriptional regulator  64.1 
 
 		 329 aa  394  1e-108  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0365942 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0370  transcriptional regulator, LysR family  63.92 
 
 		 314 aa  392  1e-108  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1363  LysR family transcriptional regulator  58.2 
 
 		 314 aa  362  6e-99  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0586  transcriptional regulator, LysR family  56.87 
 
 		 315 aa  360  1e-98  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0607  LysR family transcriptional regulator  56.87 
 
 		 312 aa  360  2e-98  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4075  LysR family transcriptional regulator  59.02 
 
 		 312 aa  356  2.9999999999999997e-97  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3905  LysR family transcriptional regulator  54.95 
 
 		 320 aa  346  3e-94  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.00200094  normal  0.196603 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3459  LysR family transcriptional regulator  56.66 
 
 		 325 aa  338  7e-92  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3465  LysR family transcriptional regulator  55.21 
 
 		 332 aa  333  2e-90  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.570257  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0826  transcriptional regulator, LysR family  54.98 
 
 		 329 aa  328  6e-89  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4025  LysR family transcriptional regulator  54.17 
 
 		 316 aa  320  1.9999999999999998e-86  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000302708 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0442  LysR family transcriptional regulator  53.55 
 
 		 323 aa  311  5.999999999999999e-84  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.288033  normal  0.291183 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1334  transcriptional regulator, LysR family  55.36 
 
 		 301 aa  305  6e-82  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.452121  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4001  LysR family transcriptional regulator  48.26 
 
 		 330 aa  273  3e-72  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.371452  normal  0.240792 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3416  LysR family transcriptional regulator  47.22 
 
 		 331 aa  270  2e-71  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.489103  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4259  LysR family transcriptional regulator  47.22 
 
 		 331 aa  270  2e-71  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.352311  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3518  LysR family transcriptional regulator  47.92 
 
 		 330 aa  270  2e-71  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4107  LysR family transcriptional regulator  47.22 
 
 		 331 aa  270  2e-71  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.318015  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1937  LysR family transcriptional regulator  47.06 
 
 		 332 aa  270  2.9999999999999997e-71  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.601207  normal  0.697041 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5636  LysR family transcriptional regulator  40.45 
 
 		 304 aa  250  2e-65  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.960553  normal  0.170882 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5942  LysR family transcriptional regulator  42.26 
 
 		 304 aa  250  2e-65  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6215  LysR family transcriptional regulator  41.94 
 
 		 321 aa  249  6e-65  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6424  LysR family transcriptional regulator  39.94 
 
 		 314 aa  240  2e-62  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.398194 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6136  LysR family transcriptional regulator  42.71 
 
 		 314 aa  239  2.9999999999999997e-62  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2742  transcriptional regulator, LysR family  46.21 
 
 		 300 aa  234  1.0000000000000001e-60  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1836  LysR family transcriptional regulator  42.91 
 
 		 306 aa  223  4e-57  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4294  LysR family transcriptional regulator  46.15 
 
 		 283 aa  216  4e-55  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.917981  normal  0.0102714 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6430  LysR family transcriptional regulator  44.64 
 
 		 299 aa  216  5.9999999999999996e-55  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2073  transcriptional regulator, LysR family  43.15 
 
 		 299 aa  213  3.9999999999999995e-54  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0127  LysR family transcriptional regulator  41.64 
 
 		 300 aa  210  2e-53  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0123  LysR family transcriptional regulator  40.33 
 
 		 300 aa  206  5e-52  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.797255 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5624  LysR family transcriptional regulator  40.33 
 
 		 303 aa  203  2e-51  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0317302  normal  0.218372 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0136  LysR family transcriptional regulator  40.98 
 
 		 305 aa  203  3e-51  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.123398  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5498  transcriptional regulator, LysR family  40.33 
 
 		 303 aa  199  7e-50  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5050  regulatory protein, LysR:LysR, substrate-binding  39.67 
 
 		 315 aa  197  2.0000000000000003e-49  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.22828 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3095  LysR family transcriptional regulator  41.72 
 
 		 313 aa  197  2.0000000000000003e-49  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5337  LysR family transcriptional regulator  39.02 
 
 		 305 aa  196  3e-49  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000417223 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5246  LysR family transcriptional regulator  39.02 
 
 		 308 aa  196  3e-49  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.214588  normal  0.158327 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5386  LysR family transcriptional regulator  39.02 
 
 		 310 aa  195  8.000000000000001e-49  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.110061 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6216  putative transcriptional regulator  37.78 
 
 		 302 aa  194  1e-48  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.795893  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_71640  LysR family transcriptional regulator  37.78 
 
 		 302 aa  193  3e-48  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.182655  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0987  LysR family transcriptional regulator  38.11 
 
 		 306 aa  193  4e-48  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0940  LysR family transcriptional regulator  38.26 
 
 		 298 aa  192  8e-48  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.146114  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0428  transcriptional regulator, LysR family  37.54 
 
 		 307 aa  189  5.999999999999999e-47  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.354645  hitchhiker  0.0000121787 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0441  transcriptional regulator, LysR family  37.54 
 
 		 307 aa  188  8e-47  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0317691  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3563  LysR family transcriptional regulator  37.2 
 
 		 309 aa  184  1.0000000000000001e-45  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0535  transcriptional regulator, LysR family  37.11 
 
 		 301 aa  181  1e-44  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.32739  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3447  LysR family transcriptional regulator  37.07 
 
 		 350 aa  180  2.9999999999999997e-44  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3456  LysR family transcriptional regulator  35.62 
 
 		 305 aa  177  2e-43  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.684664 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3404  transcriptional regulator, LysR family  39.79 
 
 		 298 aa  176  4e-43  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3603  LysR family transcriptional regulator  38.51 
 
 		 312 aa  174  1.9999999999999998e-42  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0844  LysR family transcriptional regulator  36.05 
 
 		 301 aa  173  3.9999999999999995e-42  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.165909  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3099  LysR family transcriptional regulator  33.79 
 
 		 300 aa  173  3.9999999999999995e-42  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.605921  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0461  regulatory protein LysR  34.42 
 
 		 310 aa  168  9e-41  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1392  LysR family transcriptional regulator  36.96 
 
 		 326 aa  165  6.9999999999999995e-40  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1643  transcriptional regulator, LysR family  33.79 
 
 		 299 aa  164  2.0000000000000002e-39  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.492229  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3059  transcriptional regulator, LysR family  36.77 
 
 		 330 aa  164  2.0000000000000002e-39  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5675  transcriptional regulator, LysR family  35.76 
 
 		 308 aa  163  3e-39  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.716061  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7601  LysR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 302 aa  164  3e-39  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5169  LysR family transcriptional regulator  36.78 
 
 		 313 aa  162  6e-39  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.733103  normal  0.458682 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1681  LysR family transcriptional regulator  29.81 
 
 		 311 aa  160  3e-38  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5287  transcriptional regulator, LysR family  33.68 
 
 		 305 aa  159  7e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2775  LysR family transcriptional regulator  35.07 
 
 		 290 aa  157  3e-37  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3343  LysR family transcriptional regulator  36.22 
 
 		 331 aa  155  6e-37  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.186487  normal  0.534398 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3685  transcriptional regulator, LysR family  35.25 
 
 		 318 aa  154  2.9999999999999998e-36  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5155  LysR family transcriptional regulator  33.68 
 
 		 297 aa  153  4e-36  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0454  LysR family transcriptional regulator  34.47 
 
 		 301 aa  152  5.9999999999999996e-36  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1868  LysR family transcriptional regulator  33.68 
 
 		 306 aa  152  7e-36  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.7479  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04196  predicted DNA-binding transcriptional regulator  35.45 
 
 		 303 aa  150  2e-35  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3669  transcriptional regulator, LysR family  35.45 
 
 		 303 aa  150  2e-35  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00272496  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4915  putative DNA-binding transcriptional regulator  34.59 
 
 		 302 aa  151  2e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4842  putative DNA-binding transcriptional regulator  34.59 
 
 		 302 aa  151  2e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4866  putative DNA-binding transcriptional regulator  34.59 
 
 		 302 aa  151  2e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.424188  normal  0.514626 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4767  putative DNA-binding transcriptional regulator  34.59 
 
 		 302 aa  151  2e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4555  putative DNA-binding transcriptional regulator  35.45 
 
 		 303 aa  150  2e-35  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04158  hypothetical protein  35.45 
 
 		 303 aa  150  2e-35  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3737  putative DNA-binding transcriptional regulator  35.45 
 
 		 303 aa  150  2e-35  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.422137  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4870  putative DNA-binding transcriptional regulator  35.45 
 
 		 303 aa  150  3e-35  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4925  putative DNA-binding transcriptional regulator  35.45 
 
 		 303 aa  150  3e-35  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>