More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrad2831_1817 on replicon NC_010505
Organism: Methylobacterium radiotolerans JCM 2831



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010505  Mrad2831_1817  inner-membrane translocator  100 
 
 		 306 aa  575  1.0000000000000001e-163  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.536801  normal  0.0200073 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4764  inner-membrane translocator  76.72 
 
 		 308 aa  436  1e-121  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.498502 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0066  inner-membrane translocator  77.78 
 
 		 308 aa  428  1e-119  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1939  inner-membrane translocator  69.93 
 
 		 307 aa  399  9.999999999999999e-111  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.491739  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4091  putative branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  69.67 
 
 		 309 aa  371  1e-102  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.082194  normal  0.0443848 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0484  inner-membrane translocator  63.58 
 
 		 306 aa  342  5e-93  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1618  ABC transporter related  30.32 
 
 		 616 aa  118  9.999999999999999e-26  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.103337  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1319  inner-membrane translocator  32.08 
 
 		 372 aa  114  1.0000000000000001e-24  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2301  inner-membrane translocator  32.59 
 
 		 328 aa  115  1.0000000000000001e-24  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.281867 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3519  ABC transporter related  33.57 
 
 		 643 aa  115  1.0000000000000001e-24  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.971696  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3647  inner-membrane translocator  32.4 
 
 		 315 aa  113  5e-24  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0606167  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2365  high-affinity branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  27.56 
 
 		 339 aa  111  1.0000000000000001e-23  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.554509  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1480  inner-membrane translocator  30.16 
 
 		 407 aa  111  2.0000000000000002e-23  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0610  ABC transporter related  33.96 
 
 		 647 aa  109  7.000000000000001e-23  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0913  ABC transporter related  30.08 
 
 		 646 aa  108  1e-22  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3708  branched chain amino acid ABC transporter ATPase/inner membrane protein  30.08 
 
 		 646 aa  108  1e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.400523  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2283  inner-membrane translocator  30.62 
 
 		 318 aa  108  2e-22  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1828  inner-membrane translocator  27.79 
 
 		 331 aa  106  4e-22  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000769607  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4055  ABC transporter related  33.1 
 
 		 663 aa  105  1e-21  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3840  inner-membrane translocator  31.21 
 
 		 349 aa  104  2e-21  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0125888  normal  0.96964 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1582  inner-membrane translocator  28.88 
 
 		 313 aa  102  5e-21  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3838  inner-membrane translocator  29.29 
 
 		 315 aa  102  7e-21  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.242692  normal  0.204744 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0357  ABC transporter related  29.01 
 
 		 643 aa  101  1e-20  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3806  inner-membrane translocator  34.8 
 
 		 386 aa  101  1e-20  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.868336  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1684  ABC transporter related  34.02 
 
 		 629 aa  101  2e-20  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0459583  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1424  inner-membrane translocator  30.04 
 
 		 381 aa  100  4e-20  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.132982  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5640  inner-membrane translocator  29.54 
 
 		 317 aa  100  4e-20  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5859  inner-membrane translocator  31.77 
 
 		 342 aa  100  4e-20  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0455278 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3531  inner-membrane translocator  32.25 
 
 		 340 aa  99.8  5e-20  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.696528 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0143  inner-membrane translocator  29.14 
 
 		 311 aa  98.2  1e-19  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2358  inner-membrane translocator  30.47 
 
 		 348 aa  97.8  2e-19  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.165636  normal  0.556674 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3659  inner-membrane translocator  27.4 
 
 		 341 aa  97.8  2e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0500  branched chain amino acid ABC transporter inner membrane protein  32.46 
 
 		 314 aa  98.2  2e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0771469  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS01987  amino-acid transmembrane ABC transporter protein  30.99 
 
 		 299 aa  97.4  3e-19  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.130303  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2238  inner-membrane translocator  29.69 
 
 		 326 aa  97.1  3e-19  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2609  inner-membrane translocator  29.13 
 
 		 415 aa  96.3  5e-19  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0052  inner-membrane translocator  33.57 
 
 		 346 aa  95.9  8e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.460999  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3820  inner-membrane translocator  32.32 
 
 		 328 aa  95.1  1e-18  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0270491  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0851  branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  26.54 
 
 		 333 aa  95.1  1e-18  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.589569  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1836  ABC transporter related  29.05 
 
 		 648 aa  95.5  1e-18  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0483035  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3553  inner-membrane translocator  32.45 
 
 		 331 aa  95.5  1e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3556  inner-membrane translocator  31.88 
 
 		 340 aa  94.4  2e-18  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0669576  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2032  inner-membrane translocator  32.16 
 
 		 318 aa  94.7  2e-18  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0115  inner-membrane translocator  28.41 
 
 		 325 aa  93.6  4e-18  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0858  inner-membrane translocator  27.3 
 
 		 345 aa  93.6  4e-18  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1675  inner-membrane translocator  32.45 
 
 		 314 aa  92.8  6e-18  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.675221  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4441  ABC transporter related  28.16 
 
 		 603 aa  92.8  6e-18  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2422  inner-membrane translocator  30.55 
 
 		 355 aa  92.8  7e-18  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.892613  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0403  inner-membrane translocator  28.57 
 
 		 346 aa  92.4  9e-18  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0828  inner-membrane translocator  27.68 
 
 		 350 aa  91.7  1e-17  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0065  inner-membrane translocator  31.35 
 
 		 282 aa  92  1e-17  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.123483 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1079  inner-membrane translocator  30.71 
 
 		 333 aa  92  1e-17  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.710188  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1663  inner-membrane translocator  26.69 
 
 		 326 aa  91.7  1e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_6025  inner-membrane translocator  29.67 
 
 		 333 aa  92  1e-17  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0462  inner-membrane translocator  25 
 
 		 331 aa  91.3  2e-17  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0261  inner-membrane translocator  26.91 
 
 		 324 aa  90.9  2e-17  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1407  inner-membrane translocator  30.21 
 
 		 332 aa  90.9  2e-17  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.14353  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3206  inner-membrane translocator  25.95 
 
 		 318 aa  91.3  2e-17  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3618  inner-membrane translocator  27.55 
 
 		 328 aa  91.3  2e-17  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.466346  normal  0.345258 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4071  inner-membrane translocator  27.21 
 
 		 327 aa  91.3  2e-17  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.23992 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1487  inner-membrane translocator  30.74 
 
 		 307 aa  90.9  2e-17  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0944  high-affinity branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein, putative  28.04 
 
 		 350 aa  90.5  3e-17  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.223424  n/a   
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3458  inner-membrane translocator  34.21 
 
 		 328 aa  90.5  3e-17  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.494334  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3507  inner-membrane translocator  25.17 
 
 		 373 aa  90.1  4e-17  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2025  inner-membrane translocator  31.45 
 
 		 339 aa  89.7  5e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_815  ABC-type branched-chain amino acid transport system, permease component  27.68 
 
 		 350 aa  89.7  6e-17  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.488573  n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_2919  inner-membrane translocator  28.78 
 
 		 332 aa  89.7  6e-17  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0527  inner-membrane translocator  24.83 
 
 		 562 aa  89.4  7e-17  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.142697  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0366  inner-membrane translocator  27.84 
 
 		 310 aa  89.4  7e-17  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00000392686  unclonable  0.0000000558621 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1050  inner-membrane translocator  33.83 
 
 		 328 aa  89.4  7e-17  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1583  inner-membrane translocator  31 
 
 		 319 aa  89.4  7e-17  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3500  inner-membrane translocator  31.6 
 
 		 358 aa  89.4  7e-17  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.674248  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4096  inner-membrane translocator  29.97 
 
 		 358 aa  89.4  7e-17  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.949458  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1863  inner-membrane translocator  30.11 
 
 		 321 aa  89.4  8e-17  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0260  branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  27.02 
 
 		 322 aa  89.4  8e-17  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2754  branched chain amino acid ABC transporter inner membrane protein  28.42 
 
 		 325 aa  89  8e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.129032  normal  0.265528 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0836  inner-membrane translocator  26.64 
 
 		 318 aa  89  8e-17  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.997362 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1162  ABC transporter related  30.34 
 
 		 678 aa  89  9e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0982828  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0312  inner-membrane translocator  26.95 
 
 		 326 aa  89  9e-17  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.950676  normal  0.481983 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0612  inner-membrane translocator  28.89 
 
 		 347 aa  89  9e-17  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3307  inner-membrane translocator  27.64 
 
 		 314 aa  88.6  1e-16  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4183  inner-membrane translocator  28.75 
 
 		 358 aa  89  1e-16  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.708738  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3750  ABC transporter related  29.03 
 
 		 603 aa  88.2  1e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.408417  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3819  inner-membrane translocator  29.65 
 
 		 362 aa  89  1e-16  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1849  inner-membrane translocator  27.05 
 
 		 328 aa  88.6  1e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.200349 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1893  branched-chain amino acid ABC transporter permease  28.77 
 
 		 362 aa  89  1e-16  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  decreased coverage  0.00991478  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3055  inner-membrane translocator  26.43 
 
 		 324 aa  88.6  1e-16  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4270  inner-membrane translocator  29.89 
 
 		 325 aa  88.6  1e-16  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1287  urea ABC transporter, permease protein UrtC  29.66 
 
 		 373 aa  87.8  2e-16  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6116  branched chain amino acid ABC transporter permease  28.41 
 
 		 332 aa  87.8  2e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.661138  normal  0.287958 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3535  inner-membrane translocator  32.28 
 
 		 334 aa  87.8  2e-16  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0298292 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4079  inner-membrane translocator  30.43 
 
 		 323 aa  88.2  2e-16  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3483  inner-membrane translocator  32.89 
 
 		 328 aa  87.8  2e-16  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.742895  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1796  ABC transporter related  28.89 
 
 		 679 aa  87.4  3e-16  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.210384 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0547  inner-membrane translocator  30.3 
 
 		 337 aa  87.4  3e-16  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1090  inner-membrane translocator  27.89 
 
 		 359 aa  86.7  4e-16  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.538994  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0835  inner-membrane translocator  30.34 
 
 		 335 aa  87  4e-16  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0400978  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A1097  branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  31.1 
 
 		 315 aa  86.7  4e-16  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.701299  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4477  branched-chain amino acid inner-membrane translocator  31.18 
 
 		 332 aa  87  4e-16  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0364038  normal  0.0227687 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3407  branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  24.91 
 
 		 298 aa  87  4e-16  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000473911 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>