More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Htur_1319 on replicon NC_013743
Organism: Haloterrigena turkmenica DSM 5511



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013743  Htur_1319  inner-membrane translocator  100 
 
 		 372 aa  724    Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2301  inner-membrane translocator  33 
 
 		 328 aa  133  3.9999999999999996e-30  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.281867 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4091  putative branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  35.71 
 
 		 309 aa  124  2e-27  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.082194  normal  0.0443848 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4764  inner-membrane translocator  32.95 
 
 		 308 aa  123  6e-27  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.498502 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0527  inner-membrane translocator  33.21 
 
 		 562 aa  122  9.999999999999999e-27  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.142697  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3806  inner-membrane translocator  32.25 
 
 		 386 aa  120  4.9999999999999996e-26  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.868336  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3576  ABC transporter related  34.07 
 
 		 838 aa  118  9.999999999999999e-26  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0944  high-affinity branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein, putative  34.62 
 
 		 350 aa  117  1.9999999999999998e-25  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.223424  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0115  inner-membrane translocator  31.32 
 
 		 325 aa  118  1.9999999999999998e-25  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0138  inner-membrane translocator  30.41 
 
 		 358 aa  117  3e-25  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0897  inner-membrane translocator  32.95 
 
 		 357 aa  117  3.9999999999999997e-25  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_815  ABC-type branched-chain amino acid transport system, permease component  34.19 
 
 		 350 aa  117  5e-25  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.488573  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1839  inner-membrane translocator  32.33 
 
 		 350 aa  116  6.9999999999999995e-25  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0484  inner-membrane translocator  32.24 
 
 		 306 aa  115  1.0000000000000001e-24  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1939  inner-membrane translocator  34.13 
 
 		 307 aa  115  1.0000000000000001e-24  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.491739  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3838  inner-membrane translocator  31.47 
 
 		 315 aa  115  1.0000000000000001e-24  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.242692  normal  0.204744 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1618  ABC transporter related  33.21 
 
 		 616 aa  114  2.0000000000000002e-24  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.103337  normal  1 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4183  inner-membrane translocator  33.65 
 
 		 358 aa  114  2.0000000000000002e-24  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.708738  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0312  inner-membrane translocator  31.45 
 
 		 326 aa  114  2.0000000000000002e-24  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.950676  normal  0.481983 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0066  inner-membrane translocator  32.82 
 
 		 308 aa  114  3e-24  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1582  inner-membrane translocator  30.8 
 
 		 313 aa  114  3e-24  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0006  inner-membrane translocator  29.29 
 
 		 344 aa  113  5e-24  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.273042  hitchhiker  0.0000215345 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0828  inner-membrane translocator  33.47 
 
 		 350 aa  112  1.0000000000000001e-23  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2032  inner-membrane translocator  32.49 
 
 		 318 aa  111  2.0000000000000002e-23  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1679  inner-membrane translocator  30.88 
 
 		 317 aa  111  2.0000000000000002e-23  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1817  inner-membrane translocator  32.28 
 
 		 306 aa  110  3e-23  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.536801  normal  0.0200073 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1545  inner-membrane translocator  34.52 
 
 		 358 aa  110  3e-23  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.137578  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1090  inner-membrane translocator  33.45 
 
 		 359 aa  109  6e-23  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.538994  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2283  inner-membrane translocator  30 
 
 		 318 aa  109  9.000000000000001e-23  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0997  inner-membrane translocator  33.21 
 
 		 321 aa  108  2e-22  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.915307  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3675  putative branched-chain amino acid transport system ATP-binding protein  30.25 
 
 		 632 aa  108  2e-22  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3270  ABC transporter related  32.61 
 
 		 313 aa  108  2e-22  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1754  ABC transporter related  30.36 
 
 		 621 aa  107  3e-22  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2284  inner-membrane translocator  35.52 
 
 		 349 aa  106  6e-22  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.98813  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2899  ABC transporter related  33.89 
 
 		 852 aa  106  7e-22  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2738  inner-membrane translocator  29.77 
 
 		 360 aa  106  7e-22  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1595  inner-membrane translocator  34.3 
 
 		 355 aa  106  8e-22  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0337  branched-chain amino acid ABC transporter, permease/ATP-binding protein  31.39 
 
 		 609 aa  105  1e-21  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1708  inner-membrane translocator  31.35 
 
 		 348 aa  105  1e-21  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.550604  normal  0.0112984 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0625  inner-membrane translocator  37.07 
 
 		 352 aa  105  1e-21  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.580095  normal  0.15639 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1620  inner-membrane translocator  34.19 
 
 		 368 aa  105  1e-21  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.779012 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2865  inner-membrane translocator  31.17 
 
 		 384 aa  105  1e-21  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.267921  normal  0.620309 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3556  inner-membrane translocator  33.33 
 
 		 340 aa  104  2e-21  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0669576  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0851  branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  31 
 
 		 333 aa  104  2e-21  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.589569  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3840  inner-membrane translocator  31.91 
 
 		 349 aa  105  2e-21  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0125888  normal  0.96964 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4441  ABC transporter related  28.29 
 
 		 603 aa  105  2e-21  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2530  inner-membrane translocator  34.05 
 
 		 398 aa  105  2e-21  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.104634  normal  0.427798 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2111  branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  30.69 
 
 		 298 aa  104  2e-21  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0657  inner-membrane translocator  34.18 
 
 		 339 aa  103  3e-21  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.558006  normal  0.165436 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0617  inner-membrane translocator  34.18 
 
 		 339 aa  103  3e-21  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2439  amino-acid transmembrane ABC transporter protein  31.25 
 
 		 378 aa  103  3e-21  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.703384  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1480  inner-membrane translocator  29.21 
 
 		 407 aa  103  3e-21  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2083  inner-membrane translocator ABC transporter  33.73 
 
 		 832 aa  103  4e-21  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.27241 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0934  inner-membrane translocator  29.93 
 
 		 327 aa  103  5e-21  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000000511533  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2395  inner-membrane translocator  29.8 
 
 		 407 aa  103  5e-21  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1837  leucine/isoleucine/valine transporter permease subunit  29.62 
 
 		 423 aa  103  6e-21  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.53398  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2473  inner-membrane translocator  30.66 
 
 		 373 aa  103  6e-21  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0078  inner-membrane translocator  32 
 
 		 324 aa  103  6e-21  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0089  inner-membrane translocator  32 
 
 		 324 aa  103  6e-21  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.828472 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0734  putative branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  28.57 
 
 		 315 aa  102  8e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1482  inner-membrane translocator  30.53 
 
 		 360 aa  102  1e-20  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0543  inner-membrane translocator  35.78 
 
 		 352 aa  102  1e-20  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3507  inner-membrane translocator  30 
 
 		 373 aa  102  1e-20  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0567  inner-membrane translocator  29.76 
 
 		 443 aa  102  1e-20  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.856247  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0504  inner-membrane translocator  33.48 
 
 		 571 aa  102  1e-20  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.92013  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3535  inner-membrane translocator  32.36 
 
 		 334 aa  102  1e-20  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0298292 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2609  inner-membrane translocator  30.82 
 
 		 415 aa  102  1e-20  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1863  inner-membrane translocator  29.25 
 
 		 356 aa  101  2e-20  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0010  inner-membrane translocator  31.99 
 
 		 309 aa  101  2e-20  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00370487 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3772  inner-membrane translocator  28.12 
 
 		 372 aa  101  2e-20  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  decreased coverage  0.00496124  hitchhiker  0.00284039 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3750  ABC transporter related  29.56 
 
 		 603 aa  100  3e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.408417  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4209  inner-membrane translocator  32.14 
 
 		 346 aa  100  3e-20  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0640071  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2426  inner-membrane translocator  34.33 
 
 		 352 aa  100  3e-20  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2987  inner-membrane translocator  32.89 
 
 		 340 aa  100  3e-20  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.465915  normal  0.488268 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2235  inner-membrane translocator  31.35 
 
 		 327 aa  100  3e-20  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.344649  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2707  inner-membrane translocator  28.57 
 
 		 375 aa  100  4e-20  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.990048  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2317  inner-membrane translocator  28.57 
 
 		 375 aa  100  4e-20  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.156371  hitchhiker  0.00287138 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3735  putative branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  32.14 
 
 		 333 aa  100  4e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6413  inner-membrane translocator  30.74 
 
 		 389 aa  100  4e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_2919  inner-membrane translocator  33.22 
 
 		 332 aa  100  5e-20  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0264  hydrophobic amino acid ABC transporter permease/ATP-binding protein  28.57 
 
 		 389 aa  100  5e-20  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  hitchhiker  0.00136517  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2358  inner-membrane translocator  32.71 
 
 		 348 aa  99.8  6e-20  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.165636  normal  0.556674 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1448  inner-membrane translocator  32.54 
 
 		 337 aa  100  6e-20  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  decreased coverage  0.00412694  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1084  inner-membrane translocator  31.01 
 
 		 435 aa  100  6e-20  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0450701  normal  0.660313 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1286  inner-membrane translocator  32.54 
 
 		 337 aa  100  6e-20  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.20936  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3143  inner-membrane translocator  28.81 
 
 		 389 aa  99.8  8e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00426099  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2365  high-affinity branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  25.93 
 
 		 339 aa  99.4  9e-20  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.554509  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3911  inner-membrane translocator  33.33 
 
 		 323 aa  99.4  9e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.658147  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0021  branched chain amino acid ABC transporter inner membrane protein  33.2 
 
 		 323 aa  99.4  9e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.901563  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3647  inner-membrane translocator  33.77 
 
 		 315 aa  99.4  9e-20  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0606167  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1944  inner-membrane translocator  29.51 
 
 		 297 aa  99.4  9e-20  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0403  inner-membrane translocator  31.5 
 
 		 346 aa  99.4  1e-19  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2318  ABC transporter related protein  29.79 
 
 		 589 aa  98.6  2e-19  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1972  branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  28.29 
 
 		 389 aa  98.6  2e-19  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  hitchhiker  0.00171417  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1144  branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  28.29 
 
 		 389 aa  98.6  2e-19  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00400001  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0984  hydrophobic amino acid ABC transporter permease/ATP-binding protein  28.29 
 
 		 389 aa  98.6  2e-19  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0667832  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1424  inner-membrane translocator  30.95 
 
 		 381 aa  98.2  2e-19  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.132982  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3800  inner-membrane translocator  36.08 
 
 		 343 aa  98.6  2e-19  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0823  branched chain amino acid ABC transporter inner membrane protein  29.02 
 
 		 389 aa  98.6  2e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.196198  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1893  branched-chain amino acid ABC transporter permease  28.07 
 
 		 362 aa  98.2  2e-19  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  decreased coverage  0.00991478  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>