More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Htur_3806 on replicon NC_013744
Organism: Haloterrigena turkmenica DSM 5511



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013744  Htur_3806  inner-membrane translocator  100 
 
 		 386 aa  770    Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.868336  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1090  inner-membrane translocator  34.01 
 
 		 359 aa  136  8e-31  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.538994  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1319  inner-membrane translocator  33.19 
 
 		 372 aa  134  3e-30  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0527  inner-membrane translocator  31.78 
 
 		 562 aa  125  1e-27  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.142697  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0112  inner-membrane translocator  29.97 
 
 		 327 aa  122  9.999999999999999e-27  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2283  inner-membrane translocator  34.29 
 
 		 318 aa  121  1.9999999999999998e-26  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_2919  inner-membrane translocator  29.37 
 
 		 332 aa  120  3.9999999999999996e-26  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1708  inner-membrane translocator  30.57 
 
 		 348 aa  119  9e-26  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.550604  normal  0.0112984 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0504  inner-membrane translocator  30.91 
 
 		 571 aa  119  9.999999999999999e-26  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.92013  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1618  ABC transporter related  30.48 
 
 		 616 aa  116  5e-25  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.103337  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1424  inner-membrane translocator  34.68 
 
 		 381 aa  117  5e-25  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.132982  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0484  inner-membrane translocator  35 
 
 		 306 aa  116  7.999999999999999e-25  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4764  inner-membrane translocator  32.19 
 
 		 308 aa  115  1.0000000000000001e-24  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.498502 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0897  inner-membrane translocator  28.79 
 
 		 357 aa  114  3e-24  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1482  inner-membrane translocator  28.12 
 
 		 360 aa  114  4.0000000000000004e-24  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1828  inner-membrane translocator  33.19 
 
 		 331 aa  111  2.0000000000000002e-23  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000769607  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1471  inner-membrane translocator  28.06 
 
 		 376 aa  110  4.0000000000000004e-23  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.959824  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1582  inner-membrane translocator  30.28 
 
 		 313 aa  110  5e-23  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3407  branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  27.06 
 
 		 298 aa  110  5e-23  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000473911 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1935  branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  27.6 
 
 		 333 aa  110  6e-23  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2318  ABC transporter related protein  31.23 
 
 		 589 aa  109  6e-23  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5537  inner-membrane translocator  28.97 
 
 		 385 aa  110  6e-23  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1939  inner-membrane translocator  33.47 
 
 		 307 aa  109  1e-22  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.491739  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2951  inner-membrane translocator  32.61 
 
 		 323 aa  109  1e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0213557  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0851  branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  31.76 
 
 		 333 aa  108  2e-22  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.589569  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0678  inner-membrane translocator  28.66 
 
 		 314 aa  107  3e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.297461  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1836  ABC transporter related  31.18 
 
 		 648 aa  107  4e-22  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0483035  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4055  ABC transporter related  32.05 
 
 		 663 aa  107  4e-22  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3911  inner-membrane translocator  31.32 
 
 		 323 aa  106  6e-22  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.658147  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3820  inner-membrane translocator  32.08 
 
 		 328 aa  106  7e-22  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0270491  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0021  branched chain amino acid ABC transporter inner membrane protein  30.96 
 
 		 323 aa  106  8e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.901563  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2083  inner-membrane translocator ABC transporter  35.98 
 
 		 832 aa  106  9e-22  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.27241 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2587  inner-membrane translocator  32.49 
 
 		 317 aa  106  9e-22  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.629922  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0957  branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  31.85 
 
 		 331 aa  105  1e-21  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.834531  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0587  inner-membrane translocator  28.86 
 
 		 398 aa  105  1e-21  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0010  inner-membrane translocator  31.67 
 
 		 309 aa  104  2e-21  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00370487 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2520  inner-membrane translocator  29.77 
 
 		 323 aa  104  2e-21  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0312  inner-membrane translocator  29.93 
 
 		 326 aa  104  3e-21  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.950676  normal  0.481983 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0997  inner-membrane translocator  29.43 
 
 		 321 aa  103  4e-21  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.915307  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2395  inner-membrane translocator  27.19 
 
 		 407 aa  103  4e-21  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0006  inner-membrane translocator  27.73 
 
 		 344 aa  103  4e-21  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.273042  hitchhiker  0.0000215345 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0066  inner-membrane translocator  32.76 
 
 		 308 aa  103  5e-21  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3519  ABC transporter related  33.46 
 
 		 643 aa  103  6e-21  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.971696  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2035  branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  27.65 
 
 		 333 aa  103  8e-21  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.226919  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1259  inner-membrane translocator  29.91 
 
 		 357 aa  102  1e-20  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0913  ABC transporter related  32.4 
 
 		 646 aa  102  1e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0462  inner-membrane translocator  32.17 
 
 		 331 aa  102  1e-20  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1863  inner-membrane translocator  30.85 
 
 		 321 aa  101  2e-20  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2886  putative ABC transporter permiase component  31.15 
 
 		 334 aa  101  2e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0441971 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1480  inner-membrane translocator  27.64 
 
 		 407 aa  100  3e-20  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1817  inner-membrane translocator  35.83 
 
 		 306 aa  100  3e-20  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.536801  normal  0.0200073 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3507  inner-membrane translocator  29.7 
 
 		 373 aa  100  3e-20  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1084  inner-membrane translocator  28.82 
 
 		 435 aa  101  3e-20  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0450701  normal  0.660313 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1673  inner-membrane translocator  31.4 
 
 		 319 aa  101  3e-20  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3708  branched chain amino acid ABC transporter ATPase/inner membrane protein  31.87 
 
 		 646 aa  100  4e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.400523  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4103  ABC transporter related  31.9 
 
 		 582 aa  100  4e-20  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0590  inner-membrane translocator  29.12 
 
 		 389 aa  100  5e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2609  inner-membrane translocator  28.32 
 
 		 415 aa  99.8  7e-20  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2014  branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  27.3 
 
 		 333 aa  99.8  8e-20  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.383431  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2284  inner-membrane translocator  30.43 
 
 		 349 aa  99.8  8e-20  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.98813  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0610  ABC transporter related  33.33 
 
 		 647 aa  99.4  9e-20  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5289  inner-membrane translocator  30.67 
 
 		 357 aa  99  1e-19  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.975087  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2501  inner-membrane translocator  28.43 
 
 		 345 aa  98.6  2e-19  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4756  inner-membrane translocator  28.49 
 
 		 389 aa  98.2  2e-19  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2738  inner-membrane translocator  28.01 
 
 		 360 aa  98.2  2e-19  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3164  inner-membrane translocator  30.07 
 
 		 324 aa  98.2  2e-19  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.317947  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3759  hypothetical protein  29.43 
 
 		 322 aa  98.2  2e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.232972  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1407  inner-membrane translocator  28.62 
 
 		 332 aa  98.6  2e-19  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.14353  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0337  branched-chain amino acid ABC transporter, permease/ATP-binding protein  24.09 
 
 		 609 aa  98.2  2e-19  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2500  inner-membrane translocator  32.56 
 
 		 407 aa  98.2  2e-19  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.62609  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0670  inner-membrane translocator  29.29 
 
 		 335 aa  98.2  2e-19  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1679  inner-membrane translocator  26.04 
 
 		 317 aa  98.6  2e-19  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2958  ABC-type branched-chain amino acid transport system permease component-like protein  28.24 
 
 		 389 aa  97.8  3e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1950  inner-membrane translocator  30.58 
 
 		 328 aa  97.4  3e-19  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3535  inner-membrane translocator  32.35 
 
 		 334 aa  97.8  3e-19  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0298292 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3772  inner-membrane translocator  28.07 
 
 		 372 aa  97.8  3e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  decreased coverage  0.00496124  hitchhiker  0.00284039 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3618  inner-membrane translocator  29.19 
 
 		 328 aa  97.8  3e-19  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.466346  normal  0.345258 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0328  inner-membrane translocator  30.34 
 
 		 325 aa  97.4  3e-19  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.286891  normal  0.171553 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1849  inner-membrane translocator  28.52 
 
 		 328 aa  97.4  3e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.200349 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4071  inner-membrane translocator  30.8 
 
 		 327 aa  97.4  3e-19  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.23992 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0823  branched chain amino acid ABC transporter inner membrane protein  29.38 
 
 		 389 aa  97.1  5e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.196198  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2032  inner-membrane translocator  30.86 
 
 		 318 aa  97.1  5e-19  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0617  inner-membrane translocator  29.91 
 
 		 339 aa  96.7  6e-19  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0657  inner-membrane translocator  29.91 
 
 		 339 aa  96.7  6e-19  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.558006  normal  0.165436 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2332  inner-membrane translocator  29.21 
 
 		 324 aa  96.7  6e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.404854  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5160  inner-membrane translocator  28.8 
 
 		 332 aa  96.7  6e-19  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.767449  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2128  inner-membrane translocator  31.4 
 
 		 344 aa  96.7  6e-19  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.212047  normal  0.208516 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1663  inner-membrane translocator  28.24 
 
 		 326 aa  96.7  7e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2754  branched chain amino acid ABC transporter inner membrane protein  31.74 
 
 		 325 aa  96.3  7e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.129032  normal  0.265528 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0078  inner-membrane translocator  31.62 
 
 		 324 aa  96.7  7e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1100  inner-membrane translocator  28.4 
 
 		 343 aa  96.3  9e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0111942  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2868  inner-membrane translocator  30.4 
 
 		 330 aa  96.3  9e-19  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1796  ABC transporter related  33.47 
 
 		 679 aa  96.3  9e-19  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.210384 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3750  ABC transporter related  25.33 
 
 		 603 aa  95.9  1e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.408417  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2530  inner-membrane translocator  30.2 
 
 		 398 aa  95.5  1e-18  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.104634  normal  0.427798 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5828  branched chain amino acid ABC transporter inner membrane protein  29.71 
 
 		 389 aa  95.9  1e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.944679  normal  0.156755 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3143  inner-membrane translocator  27.81 
 
 		 389 aa  95.9  1e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00426099  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0999  branched chain amino acid ABC transporter inner membrane protein  29.97 
 
 		 328 aa  95.9  1e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.203493  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0089  inner-membrane translocator  31.23 
 
 		 324 aa  94.7  2e-18  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.828472 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0835  inner-membrane translocator  30.74 
 
 		 335 aa  94.7  2e-18  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0400978  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>