More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bpro_5289 on replicon NC_007950
Organism: Polaromonas sp. JS666



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007950  Bpro_5289  inner-membrane translocator  100 
 
 		 357 aa  701    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.975087  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1156  inner-membrane translocator  39.89 
 
 		 354 aa  251  1e-65  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.412429  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0217  inner-membrane translocator  39.94 
 
 		 358 aa  246  3e-64  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3362  inner-membrane translocator  38.76 
 
 		 358 aa  243  3e-63  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.324406  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2722  inner-membrane translocator  39.39 
 
 		 358 aa  242  6e-63  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.285208  normal  0.425385 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0252  inner-membrane translocator  38.83 
 
 		 358 aa  240  2.9999999999999997e-62  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.231195  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0601  inner-membrane translocator  38.89 
 
 		 358 aa  239  8e-62  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.828078  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0263  inner-membrane translocator  38.27 
 
 		 358 aa  238  1e-61  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3610  inner-membrane translocator  38.4 
 
 		 358 aa  237  3e-61  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.963885  normal  0.413755 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5009  inner-membrane translocator  39.66 
 
 		 354 aa  235  7e-61  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3539  inner-membrane translocator  38.27 
 
 		 358 aa  235  8e-61  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.17747  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0467  inner-membrane translocator  39.17 
 
 		 358 aa  233  4.0000000000000004e-60  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.193008  normal  0.0775893 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0458  inner-membrane translocator  38.95 
 
 		 358 aa  233  5e-60  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.441083  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0784  inner-membrane translocator  39.89 
 
 		 354 aa  228  2e-58  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3437  inner-membrane translocator  39.11 
 
 		 354 aa  217  2.9999999999999998e-55  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00193702 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0051  inner-membrane translocator  38.67 
 
 		 368 aa  216  5e-55  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.702732 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0379  high-affinity branched-chain amino acid transport system permease protein livM  38.74 
 
 		 358 aa  211  1e-53  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.192974  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1595  inner-membrane translocator  41.22 
 
 		 355 aa  208  1e-52  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0543  inner-membrane translocator  36.8 
 
 		 352 aa  205  1e-51  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2276  branched chain amino acid ABC transporter inner membrane protein  36.09 
 
 		 358 aa  197  3e-49  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.158559  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0951  inner-membrane translocator  36.09 
 
 		 358 aa  197  3e-49  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4005  inner-membrane translocator  36.61 
 
 		 384 aa  196  4.0000000000000005e-49  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0118  inner-membrane translocator  35.54 
 
 		 358 aa  196  4.0000000000000005e-49  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.301625  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2358  inner-membrane translocator  37.75 
 
 		 348 aa  196  8.000000000000001e-49  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.165636  normal  0.556674 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2220  inner-membrane translocator  37.6 
 
 		 358 aa  195  9e-49  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.120044  normal  0.964416 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_5036  inner-membrane translocator  37.98 
 
 		 362 aa  195  1e-48  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0551  inner-membrane translocator  37.22 
 
 		 355 aa  194  2e-48  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.340472  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_43520  amino acid ABC transporter-like protein  37.82 
 
 		 355 aa  194  2e-48  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  decreased coverage  0.00847282  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2426  inner-membrane translocator  36.41 
 
 		 352 aa  194  2e-48  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3840  inner-membrane translocator  36.02 
 
 		 349 aa  194  2e-48  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0125888  normal  0.96964 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0625  inner-membrane translocator  35.85 
 
 		 352 aa  194  2e-48  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.580095  normal  0.15639 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2284  inner-membrane translocator  35.39 
 
 		 349 aa  193  5e-48  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.98813  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0944  high-affinity branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein, putative  32.96 
 
 		 350 aa  181  1e-44  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.223424  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2988  branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  37.43 
 
 		 355 aa  182  1e-44  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.475714  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0030  inner-membrane translocator  40.69 
 
 		 345 aa  182  1e-44  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0403  inner-membrane translocator  34.87 
 
 		 346 aa  181  1e-44  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5148  ABC transporter membrane spanning protein (branched chain amino acid)  37.85 
 
 		 351 aa  181  2e-44  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_815  ABC-type branched-chain amino acid transport system, permease component  32.68 
 
 		 350 aa  179  4.999999999999999e-44  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.488573  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4064  inner-membrane translocator  38.97 
 
 		 345 aa  174  1.9999999999999998e-42  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0828  inner-membrane translocator  31.84 
 
 		 350 aa  172  5.999999999999999e-42  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3003  inner-membrane translocator  36.61 
 
 		 354 aa  172  1e-41  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0138  inner-membrane translocator  36.31 
 
 		 358 aa  172  1e-41  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4096  inner-membrane translocator  34.58 
 
 		 358 aa  171  3e-41  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.949458  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2750  branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein, putative  36.01 
 
 		 354 aa  168  1e-40  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0595138  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3500  inner-membrane translocator  33.24 
 
 		 358 aa  168  1e-40  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.674248  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4939  inner-membrane translocator  36.23 
 
 		 358 aa  166  5.9999999999999996e-40  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.408733  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2608  inner-membrane translocator  33.7 
 
 		 357 aa  164  2.0000000000000002e-39  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3507  inner-membrane translocator  30.69 
 
 		 373 aa  162  6e-39  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2440  inner-membrane translocator  35.92 
 
 		 356 aa  162  6e-39  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3134  inner-membrane translocator  33.98 
 
 		 357 aa  162  7e-39  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.628981  normal  0.885727 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7158  ABC transporter membrane spanning protein (branched chain amino acid)  38.03 
 
 		 350 aa  160  2e-38  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.258104  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3414  putative branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  32.78 
 
 		 357 aa  160  3e-38  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2374  inner-membrane translocator  35.92 
 
 		 356 aa  160  4e-38  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1545  inner-membrane translocator  37.25 
 
 		 358 aa  159  5e-38  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.137578  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1863  inner-membrane translocator  32.12 
 
 		 356 aa  159  7e-38  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_43760  LivM family inner-membrane translocator  38.14 
 
 		 352 aa  159  7e-38  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.205767  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3801  inner-membrane translocator  35.92 
 
 		 347 aa  159  9e-38  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.444925  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0299  inner-membrane translocator  33.15 
 
 		 357 aa  158  1e-37  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.658484  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2546  putative branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  33.68 
 
 		 365 aa  159  1e-37  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4178  inner-membrane translocator  33.05 
 
 		 357 aa  156  4e-37  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.983484  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2306  inner-membrane translocator  32.01 
 
 		 357 aa  153  4e-36  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.88354  normal  0.0196621 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5717  putative high-affinity branched-chain amino acid transport system permease protein  32.22 
 
 		 357 aa  152  1e-35  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0890739  normal  0.936934 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4296  putative branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  36.66 
 
 		 351 aa  151  1e-35  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.258747  decreased coverage  0.00201809 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3493  inner-membrane translocator  36.25 
 
 		 347 aa  150  2e-35  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000401  branched-chain amino acid transport system permease protein livM  31.74 
 
 		 355 aa  150  2e-35  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.241122  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3875  inner-membrane translocator  35.92 
 
 		 347 aa  150  3e-35  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.165994 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1834  inner-membrane translocator  31.92 
 
 		 357 aa  149  9e-35  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.519151  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1424  inner-membrane translocator  31.58 
 
 		 381 aa  147  2.0000000000000003e-34  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.132982  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2985  inner-membrane translocator  37.43 
 
 		 355 aa  147  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.538372  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4574  inner-membrane translocator  33.61 
 
 		 357 aa  139  7e-32  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2754  branched chain amino acid ABC transporter inner membrane protein  34.84 
 
 		 325 aa  139  7.999999999999999e-32  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.129032  normal  0.265528 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1436  inner-membrane translocator  36.96 
 
 		 344 aa  135  9.999999999999999e-31  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.476305  hitchhiker  0.00000379274 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2769  branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein, putative  36.03 
 
 		 329 aa  133  6e-30  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.387381  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1567  inner-membrane translocator  31.84 
 
 		 357 aa  132  1.0000000000000001e-29  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.394848  normal  0.43203 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1673  inner-membrane translocator  35.69 
 
 		 319 aa  129  5.0000000000000004e-29  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1407  inner-membrane translocator  31.08 
 
 		 332 aa  129  9.000000000000001e-29  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.14353  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3011  inner-membrane translocator  32.12 
 
 		 370 aa  127  4.0000000000000003e-28  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000152809  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0527  inner-membrane translocator  31.23 
 
 		 562 aa  124  3e-27  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.142697  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1557  inner-membrane translocator  32.59 
 
 		 357 aa  123  6e-27  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.505429  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1090  inner-membrane translocator  33.1 
 
 		 359 aa  122  7e-27  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.538994  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2128  inner-membrane translocator  32.38 
 
 		 337 aa  122  9.999999999999999e-27  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1004  inner-membrane translocator  33.67 
 
 		 333 aa  121  1.9999999999999998e-26  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6116  branched chain amino acid ABC transporter permease  36.44 
 
 		 332 aa  121  1.9999999999999998e-26  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.661138  normal  0.287958 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3688  inner-membrane translocator  33.47 
 
 		 330 aa  120  3.9999999999999996e-26  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3820  inner-membrane translocator  29.24 
 
 		 328 aa  119  6e-26  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0270491  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1821  inner-membrane translocator  32.36 
 
 		 328 aa  119  7e-26  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2738  inner-membrane translocator  28.97 
 
 		 360 aa  119  9.999999999999999e-26  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0999  branched chain amino acid ABC transporter inner membrane protein  36.55 
 
 		 328 aa  116  5e-25  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.203493  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0351  inner-membrane translocator  33.2 
 
 		 345 aa  116  6e-25  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0132915  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1652  inner-membrane translocator  30.5 
 
 		 336 aa  114  2.0000000000000002e-24  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4551  inner-membrane translocator  35.95 
 
 		 314 aa  114  4.0000000000000004e-24  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1863  inner-membrane translocator  33.08 
 
 		 321 aa  113  4.0000000000000004e-24  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3393  branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  30.66 
 
 		 307 aa  113  5e-24  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1722  inner-membrane translocator  31.38 
 
 		 300 aa  113  5e-24  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0174624  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1482  inner-membrane translocator  28.88 
 
 		 360 aa  113  6e-24  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2238  inner-membrane translocator  30.77 
 
 		 326 aa  112  7.000000000000001e-24  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1944  inner-membrane translocator  30.56 
 
 		 297 aa  112  8.000000000000001e-24  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1850  inner-membrane translocator  29.79 
 
 		 340 aa  112  9e-24  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.2267  normal  0.119632 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1463  inner-membrane translocator  34.33 
 
 		 358 aa  111  1.0000000000000001e-23  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5684  inner-membrane translocator  32.52 
 
 		 477 aa  111  2.0000000000000002e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>