More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_3033 on replicon NC_011894
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011894  Mnod_3033  two component transcriptional regulator, winged helix family  100 
 
 		 235 aa  451  1.0000000000000001e-126  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.219709  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3373  two component transcriptional regulator  42.54 
 
 		 238 aa  160  2e-38  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.584151  normal  0.399207 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3356  DNA-binding transcriptional regulator TorR  36.48 
 
 		 236 aa  152  4e-36  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3217  DNA-binding transcriptional regulator TorR  36.48 
 
 		 236 aa  152  4e-36  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1150  DNA-binding transcriptional regulator TorR  36.48 
 
 		 236 aa  152  4e-36  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.202106 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1255  two component transcriptional regulator, winged helix family  43.48 
 
 		 246 aa  152  4e-36  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3217  DNA-binding transcriptional regulator TorR  36.48 
 
 		 236 aa  152  5e-36  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1998  two component transcriptional regulator  43.91 
 
 		 240 aa  152  5e-36  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0541046  normal  0.0777049 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1813  two component transcriptional regulator, winged helix family  38.84 
 
 		 236 aa  149  5e-35  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.106078  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2223  DNA-binding response regulator  40.99 
 
 		 230 aa  149  5e-35  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.375792  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2643  two component transcriptional regulator  41.44 
 
 		 236 aa  149  5e-35  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2032  response regulator receiver:transcriptional regulatory protein, C-terminal  40.99 
 
 		 259 aa  148  6e-35  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1299  two component transcriptional regulator, winged helix family  41.63 
 
 		 242 aa  148  8e-35  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0317425  normal  0.569469 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0772  DNA-binding response regulator  40.79 
 
 		 243 aa  147  1.0000000000000001e-34  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1228  DNA-binding transcriptional regulator TorR  35.19 
 
 		 236 aa  145  4.0000000000000006e-34  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4197  two component transcriptional regulator  40.44 
 
 		 242 aa  145  5e-34  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.865203  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04421  two-component system regulatory protein  38.96 
 
 		 230 aa  145  7.0000000000000006e-34  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0634  two component transcriptional regulator  39.66 
 
 		 255 aa  144  9e-34  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.823943  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3029  two component transcriptional regulator  39.91 
 
 		 238 aa  144  1e-33  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.452516  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1648  osmolarity response regulator  40.38 
 
 		 240 aa  143  2e-33  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.446623 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5277  two component transcriptional regulator, winged helix family  40 
 
 		 246 aa  143  2e-33  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0094  two component transcriptional regulator  40.43 
 
 		 246 aa  143  2e-33  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1569  osmolarity response regulator  40.38 
 
 		 240 aa  143  2e-33  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.306137  normal  0.101265 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1898  osmolarity response regulator  40.38 
 
 		 240 aa  143  2e-33  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.065084  normal  0.515659 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3683  two component transcriptional regulator  40.59 
 
 		 246 aa  143  3e-33  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.801848  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3367  DNA-binding transcriptional regulator TorR  35.34 
 
 		 236 aa  142  3e-33  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1047  DNA-binding transcriptional regulator TorR  35.62 
 
 		 236 aa  142  3e-33  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.499715  normal  0.229032 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1112  DNA-binding transcriptional regulator TorR  35.62 
 
 		 236 aa  143  3e-33  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1051  DNA-binding transcriptional regulator TorR  35.62 
 
 		 236 aa  143  3e-33  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.44318 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0655  two component transcriptional regulator  36.36 
 
 		 242 aa  142  4e-33  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.379452 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1990  DNA-binding transcriptional regulator TorR  34.33 
 
 		 241 aa  142  4e-33  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.697946  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1839  two component transcriptional regulator  39.47 
 
 		 255 aa  142  5e-33  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.1183  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3403  two component transcriptional regulator  37.89 
 
 		 236 aa  142  6e-33  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2008  two component transcriptional regulator  38.33 
 
 		 246 aa  142  6e-33  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.574198  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3637  osmolarity response regulator  36.4 
 
 		 241 aa  141  7e-33  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2546  osmolarity response regulator  37.12 
 
 		 245 aa  141  9e-33  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.16006 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1587  two component transcriptional regulator  39.48 
 
 		 261 aa  140  9.999999999999999e-33  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.367759  normal  0.752499 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2403  winged helix family two component transcriptional regulator  37.71 
 
 		 246 aa  140  9.999999999999999e-33  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1980  osmolarity response regulator  36.4 
 
 		 243 aa  140  9.999999999999999e-33  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.431202  normal  0.459947 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3347  DNA-binding transcriptional regulator TorR  34.76 
 
 		 236 aa  141  9.999999999999999e-33  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.000384276  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1909  two component transcriptional regulator  37.71 
 
 		 246 aa  141  9.999999999999999e-33  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.596265  normal  0.171962 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0994  two-component response regulator  37.71 
 
 		 246 aa  140  9.999999999999999e-33  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46550  response regulator  39.3 
 
 		 267 aa  140  9.999999999999999e-33  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0203573  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3292  two component transcriptional regulator  37.71 
 
 		 246 aa  140  9.999999999999999e-33  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0983  DNA-binding transcriptional regulator TorR  36.05 
 
 		 236 aa  140  9.999999999999999e-33  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.291581 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3564  two component transcriptional regulator  39.27 
 
 		 230 aa  140  1.9999999999999998e-32  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.153344  normal  0.125376 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1368  osmolarity response regulator  39.91 
 
 		 240 aa  140  1.9999999999999998e-32  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2703  two component transcriptional regulator  36.52 
 
 		 241 aa  140  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.790666  normal  0.110517 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0398  two component transcriptional regulator  40.26 
 
 		 246 aa  140  1.9999999999999998e-32  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.761758 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4376  winged helix family two component transcriptional regulator  39.41 
 
 		 247 aa  140  1.9999999999999998e-32  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2803  DNA-binding transcriptional regulator TorR  34.33 
 
 		 241 aa  140  1.9999999999999998e-32  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00131566 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0710  two component transcriptional regulator  38.4 
 
 		 248 aa  139  3e-32  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4357  two component transcriptional regulator  40.44 
 
 		 252 aa  139  3e-32  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4667  two component transcriptional regulator  39.41 
 
 		 247 aa  139  3e-32  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0516  response regulator receiver  39.39 
 
 		 247 aa  139  3e-32  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.62167  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1947  osmolarity response regulator  39.91 
 
 		 240 aa  139  3e-32  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0735  two component transcriptional regulator  41.63 
 
 		 235 aa  139  3e-32  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5142  two component transcriptional regulator  39.83 
 
 		 246 aa  139  3e-32  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0161802  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4614  two component transcriptional regulator  39.83 
 
 		 246 aa  139  3e-32  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2051  two component transcriptional regulator, winged helix family  38.1 
 
 		 246 aa  139  3e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0474711  normal  0.959624 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2086  two component transcriptional regulator  37.39 
 
 		 246 aa  139  3.9999999999999997e-32  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4017  osmolarity response regulator  36.4 
 
 		 241 aa  139  3.9999999999999997e-32  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2107  two-component response regulator  37.77 
 
 		 245 aa  139  4.999999999999999e-32  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_14041  two-component response regulator  40.35 
 
 		 241 aa  138  6e-32  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.117879 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2160  two component transcriptional regulator  42.11 
 
 		 241 aa  138  6e-32  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.71041  hitchhiker  0.000000282055 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1485  osmolarity response regulator  38.03 
 
 		 241 aa  138  7e-32  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.021777  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2507  osmolarity response regulator  38.03 
 
 		 241 aa  138  7e-32  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.734124  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1971  two component transcriptional regulator  40.26 
 
 		 232 aa  138  7e-32  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.999465  normal  0.0504331 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5704  two component transcriptional regulator  36.97 
 
 		 246 aa  138  7e-32  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.140603  normal  0.300283 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5249  osmolarity response regulator  38.03 
 
 		 244 aa  138  7e-32  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.204246  normal  0.745504 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2094  osmolarity response regulator  38.03 
 
 		 241 aa  138  7e-32  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2352  osmolarity response regulator  38.03 
 
 		 244 aa  138  7e-32  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.260389  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3325  osmolarity response regulator  38.03 
 
 		 244 aa  138  7e-32  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.000316731  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1853  osmolarity response regulator  38.03 
 
 		 244 aa  138  7e-32  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.00101518  hitchhiker  0.0000149756 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1253  osmolarity response regulator  38.03 
 
 		 244 aa  138  7e-32  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.512472  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1980  osmolarity response regulator  38.03 
 
 		 244 aa  138  7e-32  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0224779  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1962  osmolarity response regulator  38.03 
 
 		 244 aa  138  7e-32  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.187967  normal  0.0634815 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6141  osmolarity response regulator  38.03 
 
 		 244 aa  138  7e-32  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.120853  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1926  osmolarity response regulator  38.03 
 
 		 244 aa  138  7e-32  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0250147  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1938  osmolarity response regulator  38.03 
 
 		 244 aa  138  7e-32  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0280828  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1333  osmolarity response regulator  38.03 
 
 		 244 aa  138  7e-32  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.00265076  decreased coverage  0.0000710625 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2395  osmolarity response regulator  38.03 
 
 		 244 aa  138  7e-32  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.479905  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1375  two component transcriptional regulator, winged helix family protein  34.65 
 
 		 236 aa  138  7.999999999999999e-32  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1288  two component transcriptional regulator  34.55 
 
 		 228 aa  137  1e-31  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.00000000128008  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1003  osmolarity response regulator  38.03 
 
 		 244 aa  137  1e-31  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0710839  normal  0.39184 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2307  osmolarity response regulator  38.03 
 
 		 244 aa  137  1e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0713504  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1879  osmolarity response regulator  38.03 
 
 		 244 aa  137  1e-31  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.276509  normal  0.342548 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0758  two component transcriptional regulator  40.52 
 
 		 244 aa  137  1e-31  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.885545  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4604  two component transcriptional regulator, winged helix family  40.69 
 
 		 246 aa  137  2e-31  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3459  two component transcriptional regulator  39.83 
 
 		 246 aa  137  2e-31  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.368834  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0168  osmolarity response regulator  35.53 
 
 		 241 aa  137  2e-31  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2732  osmolarity response regulator  38.43 
 
 		 243 aa  136  2e-31  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.744063  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3846  osmolarity response regulator  35.96 
 
 		 241 aa  136  2e-31  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0815  two component transcriptional regulator, winged helix family  36.8 
 
 		 246 aa  136  2e-31  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.404408  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2269  two component transcriptional regulator  41.96 
 
 		 243 aa  137  2e-31  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3477  two component transcriptional regulator  40.09 
 
 		 261 aa  137  2e-31  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3534  DNA-binding transcriptional regulator TorR  32.92 
 
 		 243 aa  137  2e-31  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.176306 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4017  osmolarity response regulator  35.53 
 
 		 241 aa  137  2e-31  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4633  osmolarity response regulator  35.53 
 
 		 241 aa  136  3.0000000000000003e-31  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3538  osmolarity response regulator  35.53 
 
 		 240 aa  136  3.0000000000000003e-31  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000279148  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>