More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_1459 on replicon NC_011894
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011894  Mnod_1459  carboxyvinyl-carboxyphosphonate phosphorylmutase  100 
 
 		 278 aa  560  1.0000000000000001e-159  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2154  carboxyvinyl-carboxyphosphonate phosphorylmutase  49.45 
 
 		 289 aa  278  9e-74  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.908949 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4268  2,3-dimethylmalate lyase  42.86 
 
 		 291 aa  227  2e-58  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.485286  normal  0.877406 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2934  putative methylisocitrate lyase  41.29 
 
 		 288 aa  223  2e-57  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1029  2,3-dimethylmalate lyase  41.45 
 
 		 287 aa  223  2e-57  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.114621  normal  0.155549 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4841  2,3-dimethylmalate lyase  43.33 
 
 		 284 aa  218  8.999999999999998e-56  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0864  2,3-dimethylmalate lyase  42.86 
 
 		 289 aa  216  2e-55  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.0000979692  hitchhiker  0.000000949403 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4757  2,3-dimethylmalate lyase  42.86 
 
 		 287 aa  216  2e-55  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000491467  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0624  2,3-dimethylmalate lyase  41.09 
 
 		 306 aa  212  4.9999999999999996e-54  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0256  putative methylisocitrate lyase  39.19 
 
 		 288 aa  208  6e-53  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.764901 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1702  methylisocitrate lyase  41.09 
 
 		 304 aa  209  6e-53  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.0394396 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0783  methylisocitrate lyase  41.09 
 
 		 312 aa  206  3e-52  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.649003 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0461  2,3-dimethylmalate lyase  41.01 
 
 		 301 aa  205  6e-52  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0781  methylisocitrate lyase  41.45 
 
 		 311 aa  205  8e-52  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5166  putative carboxyvinyl-carboxyphosphonate phosphorylmutase  39.78 
 
 		 292 aa  204  1e-51  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.919323  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2775  2,3-dimethylmalate lyase  42.22 
 
 		 287 aa  199  3e-50  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0509  carboxyvinyl-carboxyphosphonate phosphorylmutase  48.85 
 
 		 289 aa  197  2.0000000000000003e-49  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4051  isocitrate lyase family protein  37.41 
 
 		 287 aa  195  7e-49  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4144  isocitrate lyase family protein  37.05 
 
 		 284 aa  194  1e-48  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4025  isocitrate lyase family protein  37.05 
 
 		 284 aa  194  1e-48  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0661  2,3-dimethylmalate lyase  40.07 
 
 		 310 aa  192  5e-48  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.428755 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1130  2,3-dimethylmalate lyase  41.64 
 
 		 287 aa  192  6e-48  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1054  isocitrate lyase family protein  39.21 
 
 		 282 aa  191  9e-48  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.138813  normal  0.876203 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3949  isocitrate lyase family protein  36.69 
 
 		 284 aa  191  9e-48  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0283  putative methylisocitrate lyase  43.59 
 
 		 289 aa  191  1e-47  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.548186  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0396  methylisocitrate lyase  37.36 
 
 		 285 aa  188  7e-47  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0696555  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1933  isocitrate lyase family protein  39.85 
 
 		 299 aa  188  8e-47  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0101  methylisocitrate lyase  46.32 
 
 		 308 aa  186  3e-46  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.248963  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7954  carboxyvinyl-carboxyphosphonate phosphorylmutase  40.59 
 
 		 288 aa  185  6e-46  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0800  methylisocitrate lyase  40.4 
 
 		 307 aa  182  5.0000000000000004e-45  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0629223  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3975  2-methylisocitrate lyase  37.83 
 
 		 298 aa  182  7e-45  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.583072 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3861  2-methylisocitrate lyase  37.83 
 
 		 298 aa  182  7e-45  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.376669 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1092  carboxyvinyl-carboxyphosphonatephosphorylmutase  37.85 
 
 		 293 aa  179  2.9999999999999997e-44  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.301564  normal  0.346372 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1726  methylisocitrate lyase  38.21 
 
 		 302 aa  179  2.9999999999999997e-44  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3767  2,3-dimethylmalate lyase  41.27 
 
 		 289 aa  179  4.999999999999999e-44  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2317  methylisocitrate lyase  38.21 
 
 		 302 aa  179  4.999999999999999e-44  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5990  2,3-dimethylmalate lyase  40.15 
 
 		 292 aa  179  5.999999999999999e-44  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0792782 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0458  2,3-dimethylmalate lyase  37.77 
 
 		 296 aa  179  5.999999999999999e-44  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0122  2-methylisocitrate lyase  36.46 
 
 		 298 aa  178  8e-44  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.528863  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3008  methylisocitrate lyase  37.86 
 
 		 302 aa  177  1e-43  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.62358 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2452  methylisocitrate lyase  37.86 
 
 		 302 aa  177  1e-43  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.344607  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2127  carboxyvinyl-carboxyphosphonate phosphorylmutase  37.86 
 
 		 302 aa  177  2e-43  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2113  carboxyvinyl-carboxyphosphonate phosphorylmutase  37.86 
 
 		 302 aa  177  2e-43  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2158  methylisocitrate lyase  37.86 
 
 		 302 aa  177  2e-43  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.081733  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2369  methylisocitrate lyase  37.86 
 
 		 302 aa  177  2e-43  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2378  carboxyvinyl-carboxyphosphonate phosphorylmutase  37.86 
 
 		 302 aa  176  3e-43  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.628231  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2190  carboxyvinyl-carboxyphosphonate phosphorylmutase  37.86 
 
 		 302 aa  176  5e-43  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2350  carboxyvinyl-carboxyphosphonate phosphorylmutase  37.86 
 
 		 302 aa  176  5e-43  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1916  isocitrate lyase family protein  38.32 
 
 		 287 aa  175  6e-43  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.0326533 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1072  2-methylisocitrate lyase  37.79 
 
 		 301 aa  175  8e-43  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.765825  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0806  isocitrate lyase family protein  37.83 
 
 		 287 aa  175  9e-43  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3644  2-methylisocitrate lyase  35.04 
 
 		 292 aa  174  1.9999999999999998e-42  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0659  2,3-dimethylmalate lyase  38.75 
 
 		 322 aa  174  1.9999999999999998e-42  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.858206 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4140  2-methylisocitrate lyase  35.04 
 
 		 292 aa  174  1.9999999999999998e-42  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4021  2-methylisocitrate lyase  34.67 
 
 		 292 aa  173  2.9999999999999996e-42  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3945  2-methylisocitrate lyase  34.67 
 
 		 292 aa  173  2.9999999999999996e-42  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0141  2-methylisocitrate lyase  35.71 
 
 		 297 aa  173  2.9999999999999996e-42  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.758126  normal  0.590891 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4047  2-methylisocitrate lyase  34.67 
 
 		 292 aa  173  2.9999999999999996e-42  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0279  2,3-dimethylmalate lyase  39.08 
 
 		 274 aa  172  3.9999999999999995e-42  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.577564  normal  0.130845 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3825  2-methylisocitrate lyase  34.67 
 
 		 292 aa  172  5.999999999999999e-42  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2513  2,3-dimethylmalate lyase  37.94 
 
 		 293 aa  172  5.999999999999999e-42  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0315  2-methylisocitrate lyase  34.67 
 
 		 292 aa  172  5.999999999999999e-42  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0689  methylisocitrate lyase  39.62 
 
 		 292 aa  172  6.999999999999999e-42  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.106645  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2822  2-methylisocitrate lyase  35.46 
 
 		 296 aa  171  1e-41  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5517  2-methylisocitrate lyase  35.36 
 
 		 297 aa  171  1e-41  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.36505  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5344  2-methylisocitrate lyase  35.36 
 
 		 297 aa  171  1e-41  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0562563  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4755  2-methylisocitrate lyase  35.36 
 
 		 297 aa  171  1e-41  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.730915  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3287  2-methylisocitrate lyase  35.36 
 
 		 297 aa  171  2e-41  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.179718  normal  0.0341449 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4474  2,3-dimethylmalate lyase  39.5 
 
 		 294 aa  171  2e-41  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.787404  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3629  2-methylisocitrate lyase  34.31 
 
 		 292 aa  169  4e-41  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5405  putative carboxyvinyl-carboxyphosphonate phosphorylmutase  40.52 
 
 		 293 aa  169  5e-41  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00321329  normal  0.260192 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0108  methylisocitrate lyase  39.57 
 
 		 302 aa  169  5e-41  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0279515  normal  0.0353052 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1203  2,3-dimethylmalate lyase  40.52 
 
 		 293 aa  169  6e-41  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00337991  normal  0.996052 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0345  2-methylisocitrate lyase  33.94 
 
 		 292 aa  168  7e-41  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1657  2,3-dimethylmalate lyase  42.01 
 
 		 306 aa  168  7e-41  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.106264  normal  0.68628 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0054  2-methylisocitrate lyase  34.67 
 
 		 297 aa  167  1e-40  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_40267  predicted protein  41.3 
 
 		 323 aa  166  2.9999999999999998e-40  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.158521  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2189  2-methylisocitrate lyase  34.66 
 
 		 297 aa  166  4e-40  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2153  isocitrate lyase and phosphorylmutase  41 
 
 		 347 aa  165  6.9999999999999995e-40  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0855957  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0052  2-methylisocitrate lyase  34.31 
 
 		 297 aa  165  6.9999999999999995e-40  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3294  2-methylisocitrate lyase  35.11 
 
 		 294 aa  164  1.0000000000000001e-39  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.203078 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1346  methylisocitrate lyase  38.85 
 
 		 304 aa  164  2.0000000000000002e-39  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.183799  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4291  2,3-dimethylmalate lyase  40.09 
 
 		 295 aa  163  2.0000000000000002e-39  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.268229 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3362  isocitrate lyase and phosphorylmutase  41.03 
 
 		 345 aa  163  3e-39  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.145198  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1614  2,3-dimethylmalate lyase  37.88 
 
 		 295 aa  163  3e-39  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.863287  normal  0.36405 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2320  2,3-dimethylmalate lyase  37.86 
 
 		 306 aa  163  3e-39  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0895569  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03370  2-methylisocitrate lyase  33.33 
 
 		 291 aa  163  4.0000000000000004e-39  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2499  2-methylisocitrate lyase  32.98 
 
 		 292 aa  163  4.0000000000000004e-39  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.741837  normal  0.047618 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1820  2-methylisocitrate lyase  32.98 
 
 		 292 aa  162  5.0000000000000005e-39  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2400  2-methylisocitrate lyase  33.58 
 
 		 311 aa  162  5.0000000000000005e-39  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.951557  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0071  2-methylisocitrate lyase  36.47 
 
 		 296 aa  162  6e-39  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1857  2-methylisocitrate lyase  32.62 
 
 		 292 aa  162  6e-39  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3579  PEP phosphonomutase  39.17 
 
 		 286 aa  162  8.000000000000001e-39  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  decreased coverage  0.00948814  hitchhiker  0.00984431 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3496  methylisocitrate lyase  40.62 
 
 		 314 aa  161  9e-39  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.146967  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1666  2-methylisocitrate lyase  34.66 
 
 		 295 aa  161  9e-39  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0925  2-methylisocitrate lyase  33.94 
 
 		 292 aa  160  1e-38  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5389  2-methylisocitrate lyase  35.71 
 
 		 297 aa  161  1e-38  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.36576  normal  0.795706 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2605  2-methylisocitrate lyase  35.11 
 
 		 293 aa  161  1e-38  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.221019  hitchhiker  0.000512853 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_14150  methylisocitrate lyase  39.39 
 
 		 312 aa  160  2e-38  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4842  2-methylisocitrate lyase  35.71 
 
 		 297 aa  160  2e-38  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>