More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hlac_2153 on replicon NC_012029
Organism: Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012029  Hlac_2153  isocitrate lyase and phosphorylmutase  100 
 
 		 347 aa  714    Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0855957  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3362  isocitrate lyase and phosphorylmutase  82.9 
 
 		 345 aa  612  9.999999999999999e-175  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.145198  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2154  carboxyvinyl-carboxyphosphonate phosphorylmutase  35.45 
 
 		 289 aa  187  3e-46  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.908949 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1702  methylisocitrate lyase  34.1 
 
 		 304 aa  174  1.9999999999999998e-42  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.0394396 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0781  methylisocitrate lyase  34.92 
 
 		 311 aa  173  3.9999999999999995e-42  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0624  2,3-dimethylmalate lyase  34.34 
 
 		 306 aa  168  1e-40  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0864  2,3-dimethylmalate lyase  33.66 
 
 		 289 aa  166  8e-40  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.0000979692  hitchhiker  0.000000949403 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1130  2,3-dimethylmalate lyase  38.43 
 
 		 287 aa  165  9e-40  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1054  isocitrate lyase family protein  38.75 
 
 		 282 aa  164  2.0000000000000002e-39  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.138813  normal  0.876203 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4268  2,3-dimethylmalate lyase  32.57 
 
 		 291 aa  163  5.0000000000000005e-39  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.485286  normal  0.877406 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4757  2,3-dimethylmalate lyase  31.65 
 
 		 287 aa  162  6e-39  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000491467  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0396  methylisocitrate lyase  32.85 
 
 		 285 aa  160  2e-38  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0696555  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2934  putative methylisocitrate lyase  36.64 
 
 		 288 aa  160  3e-38  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1029  2,3-dimethylmalate lyase  33.08 
 
 		 287 aa  159  5e-38  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.114621  normal  0.155549 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0509  carboxyvinyl-carboxyphosphonate phosphorylmutase  42.13 
 
 		 289 aa  159  9e-38  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4144  isocitrate lyase family protein  36.26 
 
 		 284 aa  158  1e-37  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5990  2,3-dimethylmalate lyase  35.52 
 
 		 292 aa  158  2e-37  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0792782 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4025  isocitrate lyase family protein  36.26 
 
 		 284 aa  158  2e-37  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4051  isocitrate lyase family protein  36.26 
 
 		 287 aa  157  3e-37  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3949  isocitrate lyase family protein  36.26 
 
 		 284 aa  156  4e-37  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0256  putative methylisocitrate lyase  41.85 
 
 		 288 aa  156  5.0000000000000005e-37  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.764901 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2513  2,3-dimethylmalate lyase  32.86 
 
 		 293 aa  154  2.9999999999999998e-36  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0461  2,3-dimethylmalate lyase  32.08 
 
 		 301 aa  153  5e-36  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0806  isocitrate lyase family protein  40.91 
 
 		 287 aa  151  1e-35  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0458  2,3-dimethylmalate lyase  39.36 
 
 		 296 aa  151  2e-35  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0279  2,3-dimethylmalate lyase  36.36 
 
 		 274 aa  150  2e-35  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.577564  normal  0.130845 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3294  2-methylisocitrate lyase  36.52 
 
 		 294 aa  149  6e-35  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.203078 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0101  methylisocitrate lyase  34.57 
 
 		 308 aa  149  8e-35  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.248963  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1666  2-methylisocitrate lyase  33.89 
 
 		 295 aa  149  9e-35  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1933  isocitrate lyase family protein  33.46 
 
 		 299 aa  149  9e-35  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0122  2-methylisocitrate lyase  41.85 
 
 		 298 aa  148  1.0000000000000001e-34  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.528863  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3861  2-methylisocitrate lyase  40.86 
 
 		 298 aa  149  1.0000000000000001e-34  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.376669 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1459  carboxyvinyl-carboxyphosphonate phosphorylmutase  41.1 
 
 		 278 aa  148  1.0000000000000001e-34  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1072  2-methylisocitrate lyase  41.94 
 
 		 301 aa  148  1.0000000000000001e-34  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.765825  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3975  2-methylisocitrate lyase  40.86 
 
 		 298 aa  149  1.0000000000000001e-34  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.583072 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2479  methylisocitrate lyase  42.86 
 
 		 304 aa  147  2.0000000000000003e-34  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0974909  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4474  2,3-dimethylmalate lyase  31.56 
 
 		 294 aa  147  2.0000000000000003e-34  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.787404  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3629  2-methylisocitrate lyase  40.43 
 
 		 292 aa  147  2.0000000000000003e-34  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0315  2-methylisocitrate lyase  40.43 
 
 		 292 aa  147  2.0000000000000003e-34  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3825  2-methylisocitrate lyase  40.43 
 
 		 292 aa  147  2.0000000000000003e-34  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5166  putative carboxyvinyl-carboxyphosphonate phosphorylmutase  34.38 
 
 		 292 aa  146  5e-34  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.919323  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4841  2,3-dimethylmalate lyase  35.59 
 
 		 284 aa  146  6e-34  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0345  2-methylisocitrate lyase  39.89 
 
 		 292 aa  145  8.000000000000001e-34  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0783  methylisocitrate lyase  33.7 
 
 		 312 aa  145  1e-33  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.649003 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0054  2-methylisocitrate lyase  33.83 
 
 		 297 aa  145  1e-33  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0052  2-methylisocitrate lyase  34.21 
 
 		 297 aa  144  2e-33  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0141  2-methylisocitrate lyase  41.3 
 
 		 297 aa  144  2e-33  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.758126  normal  0.590891 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03370  2-methylisocitrate lyase  32.75 
 
 		 291 aa  144  2e-33  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4047  2-methylisocitrate lyase  39.36 
 
 		 292 aa  144  3e-33  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4021  2-methylisocitrate lyase  39.36 
 
 		 292 aa  144  3e-33  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1916  isocitrate lyase family protein  41.21 
 
 		 287 aa  144  3e-33  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.0326533 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3945  2-methylisocitrate lyase  39.36 
 
 		 292 aa  144  3e-33  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2499  2-methylisocitrate lyase  33.21 
 
 		 292 aa  143  4e-33  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.741837  normal  0.047618 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0071  2-methylisocitrate lyase  39.68 
 
 		 296 aa  143  4e-33  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2189  2-methylisocitrate lyase  39.58 
 
 		 297 aa  143  4e-33  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0204  2,3-dimethylmalate lyase  35.63 
 
 		 325 aa  143  4e-33  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0925  2-methylisocitrate lyase  39.67 
 
 		 292 aa  143  5e-33  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4140  2-methylisocitrate lyase  39.36 
 
 		 292 aa  143  5e-33  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3644  2-methylisocitrate lyase  39.36 
 
 		 292 aa  143  5e-33  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2822  2-methylisocitrate lyase  33.33 
 
 		 296 aa  142  6e-33  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3579  PEP phosphonomutase  32.58 
 
 		 286 aa  142  7e-33  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  decreased coverage  0.00948814  hitchhiker  0.00984431 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2111  2-methylisocitrate lyase  32.06 
 
 		 292 aa  142  9e-33  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.12913  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2322  2-methylisocitrate lyase  32.84 
 
 		 292 aa  142  9.999999999999999e-33  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.458801  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1311  2-methylisocitrate lyase  34.24 
 
 		 296 aa  142  9.999999999999999e-33  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0110415  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6706  2-methylisocitrate lyase  40.76 
 
 		 297 aa  141  1.9999999999999998e-32  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0659  2,3-dimethylmalate lyase  32.93 
 
 		 322 aa  141  1.9999999999999998e-32  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.858206 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1197  2-methylisocitrate lyase  39.36 
 
 		 297 aa  141  1.9999999999999998e-32  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2400  2-methylisocitrate lyase  33 
 
 		 311 aa  141  1.9999999999999998e-32  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.951557  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3287  2-methylisocitrate lyase  39.67 
 
 		 297 aa  140  3e-32  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.179718  normal  0.0341449 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2317  methylisocitrate lyase  33.22 
 
 		 302 aa  140  3e-32  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5344  2-methylisocitrate lyase  40.22 
 
 		 297 aa  140  3e-32  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0562563  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4755  2-methylisocitrate lyase  40.22 
 
 		 297 aa  140  3e-32  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.730915  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5517  2-methylisocitrate lyase  40.22 
 
 		 297 aa  140  3e-32  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.36505  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0108  methylisocitrate lyase  34.24 
 
 		 302 aa  140  3.9999999999999997e-32  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0279515  normal  0.0353052 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2605  2-methylisocitrate lyase  32.33 
 
 		 293 aa  140  4.999999999999999e-32  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.221019  hitchhiker  0.000512853 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1110  2-methylisocitrate lyase  38.3 
 
 		 296 aa  139  8.999999999999999e-32  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.452189 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0689  methylisocitrate lyase  33.21 
 
 		 292 aa  139  1e-31  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.106645  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2127  carboxyvinyl-carboxyphosphonate phosphorylmutase  32.87 
 
 		 302 aa  138  1e-31  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2113  carboxyvinyl-carboxyphosphonate phosphorylmutase  32.87 
 
 		 302 aa  138  1e-31  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2452  methylisocitrate lyase  32.87 
 
 		 302 aa  139  1e-31  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.344607  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2369  methylisocitrate lyase  32.87 
 
 		 302 aa  138  1e-31  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1203  2,3-dimethylmalate lyase  38.42 
 
 		 293 aa  138  1e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00337991  normal  0.996052 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3008  methylisocitrate lyase  32.87 
 
 		 302 aa  139  1e-31  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.62358 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5405  putative carboxyvinyl-carboxyphosphonate phosphorylmutase  38.42 
 
 		 293 aa  138  1e-31  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00321329  normal  0.260192 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1820  2-methylisocitrate lyase  32.1 
 
 		 292 aa  138  1e-31  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1092  carboxyvinyl-carboxyphosphonatephosphorylmutase  33.33 
 
 		 293 aa  138  1e-31  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.301564  normal  0.346372 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2158  methylisocitrate lyase  32.87 
 
 		 302 aa  137  2e-31  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.081733  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2378  carboxyvinyl-carboxyphosphonate phosphorylmutase  32.87 
 
 		 302 aa  138  2e-31  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.628231  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2190  carboxyvinyl-carboxyphosphonate phosphorylmutase  32.87 
 
 		 302 aa  137  3.0000000000000003e-31  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2350  carboxyvinyl-carboxyphosphonate phosphorylmutase  32.87 
 
 		 302 aa  137  3.0000000000000003e-31  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0879  2-methylisocitrate lyase  39.67 
 
 		 308 aa  137  4e-31  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0865  2-methylisocitrate lyase  38.59 
 
 		 299 aa  136  4e-31  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.698029  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1857  2-methylisocitrate lyase  32.1 
 
 		 292 aa  136  4e-31  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0382  2-methylisocitrate lyase  39.67 
 
 		 297 aa  136  5e-31  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.332108  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1870  2-methylisocitrate lyase  39.67 
 
 		 297 aa  136  5e-31  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1735  2-methylisocitrate lyase  39.67 
 
 		 297 aa  136  5e-31  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0288  2-methylisocitrate lyase  39.67 
 
 		 297 aa  136  5e-31  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.804341  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1664  2-methylisocitrate lyase  31.71 
 
 		 292 aa  136  5e-31  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1166  2-methylisocitrate lyase  39.67 
 
 		 297 aa  136  5e-31  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2143  2-methylisocitrate lyase  39.67 
 
 		 297 aa  136  5e-31  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>