More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_C0659 on replicon NC_007953
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007953  Bxe_C0659  2,3-dimethylmalate lyase  100 
 
 		 322 aa  655    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.858206 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0661  2,3-dimethylmalate lyase  47.18 
 
 		 310 aa  288  1e-76  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.428755 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2082  2,3-dimethylmalate lyase  39.24 
 
 		 286 aa  207  2e-52  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.218009  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1632  2,3-dimethylmalate lyase  39.24 
 
 		 286 aa  206  3e-52  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.171622 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0781  methylisocitrate lyase  38.33 
 
 		 311 aa  199  6e-50  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1702  methylisocitrate lyase  38.49 
 
 		 304 aa  198  9e-50  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.0394396 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4025  isocitrate lyase family protein  40.93 
 
 		 284 aa  196  4.0000000000000005e-49  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2154  carboxyvinyl-carboxyphosphonate phosphorylmutase  36.82 
 
 		 289 aa  195  8.000000000000001e-49  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.908949 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0101  methylisocitrate lyase  40.64 
 
 		 308 aa  194  1e-48  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.248963  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4841  2,3-dimethylmalate lyase  39.78 
 
 		 284 aa  195  1e-48  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4144  isocitrate lyase family protein  40.54 
 
 		 284 aa  194  1e-48  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0624  2,3-dimethylmalate lyase  37.28 
 
 		 306 aa  194  2e-48  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3579  PEP phosphonomutase  37.15 
 
 		 286 aa  194  2e-48  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  decreased coverage  0.00948814  hitchhiker  0.00984431 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4051  isocitrate lyase family protein  40.54 
 
 		 287 aa  194  2e-48  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0783  methylisocitrate lyase  40.5 
 
 		 312 aa  193  3e-48  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.649003 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1054  isocitrate lyase family protein  44.4 
 
 		 282 aa  193  3e-48  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.138813  normal  0.876203 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0396  methylisocitrate lyase  38.19 
 
 		 285 aa  193  4e-48  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0696555  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1657  2,3-dimethylmalate lyase  44.72 
 
 		 306 aa  192  5e-48  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.106264  normal  0.68628 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3949  isocitrate lyase family protein  40.54 
 
 		 284 aa  192  5e-48  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0071  2-methylisocitrate lyase  38.91 
 
 		 296 aa  191  2e-47  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7954  carboxyvinyl-carboxyphosphonate phosphorylmutase  40.83 
 
 		 288 aa  188  8e-47  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0509  carboxyvinyl-carboxyphosphonate phosphorylmutase  39.04 
 
 		 289 aa  188  1e-46  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3496  methylisocitrate lyase  39.24 
 
 		 314 aa  188  1e-46  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.146967  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0279  2,3-dimethylmalate lyase  38.35 
 
 		 274 aa  187  2e-46  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.577564  normal  0.130845 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4757  2,3-dimethylmalate lyase  38.62 
 
 		 287 aa  185  7e-46  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000491467  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3975  2-methylisocitrate lyase  38.41 
 
 		 298 aa  184  2.0000000000000003e-45  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.583072 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3861  2-methylisocitrate lyase  38.41 
 
 		 298 aa  184  2.0000000000000003e-45  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.376669 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4291  2,3-dimethylmalate lyase  37.59 
 
 		 295 aa  183  3e-45  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.268229 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2209  2-methylisocitrate lyase  38.64 
 
 		 294 aa  183  4.0000000000000006e-45  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.629465  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4268  2,3-dimethylmalate lyase  37.93 
 
 		 291 aa  182  6e-45  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.485286  normal  0.877406 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0256  putative methylisocitrate lyase  34.65 
 
 		 288 aa  182  7e-45  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.764901 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0864  2,3-dimethylmalate lyase  38.46 
 
 		 289 aa  181  1e-44  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.0000979692  hitchhiker  0.000000949403 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0141  2-methylisocitrate lyase  38.23 
 
 		 297 aa  181  1e-44  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.758126  normal  0.590891 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0122  2-methylisocitrate lyase  39.78 
 
 		 298 aa  180  2.9999999999999997e-44  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.528863  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2189  2-methylisocitrate lyase  40.22 
 
 		 297 aa  180  2.9999999999999997e-44  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5517  2-methylisocitrate lyase  40.22 
 
 		 297 aa  180  4e-44  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.36505  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1130  2,3-dimethylmalate lyase  37.41 
 
 		 287 aa  180  4e-44  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4755  2-methylisocitrate lyase  40.22 
 
 		 297 aa  180  4e-44  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.730915  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5344  2-methylisocitrate lyase  40.22 
 
 		 297 aa  180  4e-44  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0562563  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4474  2,3-dimethylmalate lyase  35.76 
 
 		 294 aa  179  4.999999999999999e-44  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.787404  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2513  2,3-dimethylmalate lyase  35.69 
 
 		 293 aa  179  5.999999999999999e-44  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2479  methylisocitrate lyase  38.06 
 
 		 304 aa  179  7e-44  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0974909  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2655  2,3-dimethylmalate lyase  45.26 
 
 		 292 aa  178  9e-44  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.147366  normal  0.299253 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3287  2-methylisocitrate lyase  39.48 
 
 		 297 aa  178  1e-43  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.179718  normal  0.0341449 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1203  2,3-dimethylmalate lyase  37.68 
 
 		 293 aa  177  2e-43  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00337991  normal  0.996052 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5405  putative carboxyvinyl-carboxyphosphonate phosphorylmutase  37.5 
 
 		 293 aa  177  2e-43  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00321329  normal  0.260192 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2822  2-methylisocitrate lyase  37.24 
 
 		 296 aa  177  3e-43  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1614  2,3-dimethylmalate lyase  37.54 
 
 		 295 aa  176  3e-43  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.863287  normal  0.36405 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0806  isocitrate lyase family protein  37.11 
 
 		 287 aa  177  3e-43  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2400  2-methylisocitrate lyase  38.64 
 
 		 311 aa  176  4e-43  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.951557  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1509  2-methylisocitrate lyase  40.52 
 
 		 299 aa  176  5e-43  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.265222  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1029  2,3-dimethylmalate lyase  36.33 
 
 		 287 aa  176  6e-43  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.114621  normal  0.155549 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3825  2-methylisocitrate lyase  36.21 
 
 		 292 aa  176  6e-43  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0315  2-methylisocitrate lyase  36.21 
 
 		 292 aa  176  6e-43  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4140  2-methylisocitrate lyase  36.21 
 
 		 292 aa  175  9e-43  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5990  2,3-dimethylmalate lyase  41.59 
 
 		 292 aa  175  9e-43  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0792782 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3644  2-methylisocitrate lyase  36.21 
 
 		 292 aa  175  9e-43  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3294  2-methylisocitrate lyase  35.69 
 
 		 294 aa  175  9e-43  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.203078 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0345  2-methylisocitrate lyase  35.86 
 
 		 292 aa  174  9.999999999999999e-43  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3945  2-methylisocitrate lyase  35.86 
 
 		 292 aa  175  9.999999999999999e-43  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4047  2-methylisocitrate lyase  35.86 
 
 		 292 aa  175  9.999999999999999e-43  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4021  2-methylisocitrate lyase  35.86 
 
 		 292 aa  175  9.999999999999999e-43  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1110  2-methylisocitrate lyase  34.94 
 
 		 296 aa  174  1.9999999999999998e-42  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.452189 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1311  2-methylisocitrate lyase  34.94 
 
 		 296 aa  174  1.9999999999999998e-42  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0110415  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3629  2-methylisocitrate lyase  35.86 
 
 		 292 aa  173  2.9999999999999996e-42  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5166  putative carboxyvinyl-carboxyphosphonate phosphorylmutase  35.82 
 
 		 292 aa  173  3.9999999999999995e-42  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.919323  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2322  2-methylisocitrate lyase  34.74 
 
 		 292 aa  173  3.9999999999999995e-42  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.458801  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0925  2-methylisocitrate lyase  36 
 
 		 292 aa  172  6.999999999999999e-42  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2605  2-methylisocitrate lyase  35.56 
 
 		 293 aa  172  6.999999999999999e-42  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.221019  hitchhiker  0.000512853 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1820  2-methylisocitrate lyase  34.58 
 
 		 292 aa  172  7.999999999999999e-42  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0865  2-methylisocitrate lyase  41.27 
 
 		 299 aa  172  9e-42  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.698029  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1072  2-methylisocitrate lyase  37.5 
 
 		 301 aa  171  1e-41  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.765825  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1933  isocitrate lyase family protein  37.37 
 
 		 299 aa  171  1e-41  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0054  2-methylisocitrate lyase  34.68 
 
 		 297 aa  171  1e-41  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2775  2,3-dimethylmalate lyase  36.49 
 
 		 287 aa  171  1e-41  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1857  2-methylisocitrate lyase  34.92 
 
 		 292 aa  171  1e-41  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2111  2-methylisocitrate lyase  35.05 
 
 		 292 aa  171  2e-41  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.12913  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0052  2-methylisocitrate lyase  34.34 
 
 		 297 aa  171  2e-41  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1666  2-methylisocitrate lyase  36.06 
 
 		 295 aa  171  2e-41  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1197  2-methylisocitrate lyase  34.18 
 
 		 297 aa  170  3e-41  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0108  methylisocitrate lyase  40.98 
 
 		 302 aa  170  4e-41  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0279515  normal  0.0353052 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1524  methylisocitrate lyase  38.49 
 
 		 301 aa  169  5e-41  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000427671 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2499  2-methylisocitrate lyase  35.05 
 
 		 292 aa  169  5e-41  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.741837  normal  0.047618 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0568  methylisocitrate lyase  39.3 
 
 		 298 aa  169  5e-41  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1916  isocitrate lyase family protein  44.78 
 
 		 287 aa  169  7e-41  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.0326533 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1664  2-methylisocitrate lyase  35.05 
 
 		 292 aa  169  7e-41  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1419  2-methylisocitrate lyase  35.05 
 
 		 292 aa  168  9e-41  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_12030  methylisocitrate lyase  39.04 
 
 		 312 aa  167  2e-40  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.55917  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1524  2,3-dimethylmalate lyase  38.91 
 
 		 301 aa  167  2e-40  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3767  2,3-dimethylmalate lyase  35 
 
 		 289 aa  166  4e-40  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3293  2-methylisocitrate lyase  35.91 
 
 		 296 aa  166  5e-40  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0689  methylisocitrate lyase  39.92 
 
 		 292 aa  166  5.9999999999999996e-40  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.106645  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00286  2-methylisocitrate lyase  35.91 
 
 		 296 aa  164  1.0000000000000001e-39  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00290  hypothetical protein  35.91 
 
 		 296 aa  164  1.0000000000000001e-39  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0397  2-methylisocitrate lyase  37.14 
 
 		 296 aa  164  1.0000000000000001e-39  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2334  2-methylisocitrate lyase  35.52 
 
 		 296 aa  164  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.474392  hitchhiker  0.0000364152 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0458  2,3-dimethylmalate lyase  35.05 
 
 		 296 aa  164  2.0000000000000002e-39  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0356  2-methylisocitrate lyase  37.14 
 
 		 296 aa  164  2.0000000000000002e-39  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0403  2-methylisocitrate lyase  37.14 
 
 		 296 aa  164  2.0000000000000002e-39  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0363  2-methylisocitrate lyase  38.26 
 
 		 296 aa  164  2.0000000000000002e-39  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>