More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oant_2934 on replicon NC_009668
Organism: Ochrobactrum anthropi ATCC 49188



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009668  Oant_2934  putative methylisocitrate lyase  100 
 
 		 288 aa  588  1e-167  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1029  2,3-dimethylmalate lyase  72.03 
 
 		 287 aa  431  1e-120  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.114621  normal  0.155549 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2154  carboxyvinyl-carboxyphosphonate phosphorylmutase  43.51 
 
 		 289 aa  271  8.000000000000001e-72  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.908949 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4268  2,3-dimethylmalate lyase  38.81 
 
 		 291 aa  230  2e-59  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.485286  normal  0.877406 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0256  putative methylisocitrate lyase  36.62 
 
 		 288 aa  223  3e-57  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.764901 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0864  2,3-dimethylmalate lyase  38.46 
 
 		 289 aa  219  3.9999999999999997e-56  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.0000979692  hitchhiker  0.000000949403 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4757  2,3-dimethylmalate lyase  37.41 
 
 		 287 aa  214  9.999999999999999e-55  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000491467  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0509  carboxyvinyl-carboxyphosphonate phosphorylmutase  40.14 
 
 		 289 aa  209  4e-53  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1459  carboxyvinyl-carboxyphosphonate phosphorylmutase  41.29 
 
 		 278 aa  206  4e-52  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5166  putative carboxyvinyl-carboxyphosphonate phosphorylmutase  35.56 
 
 		 292 aa  201  9.999999999999999e-51  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.919323  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0783  methylisocitrate lyase  36.19 
 
 		 312 aa  199  3.9999999999999996e-50  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.649003 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1130  2,3-dimethylmalate lyase  37.28 
 
 		 287 aa  198  9e-50  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1092  carboxyvinyl-carboxyphosphonatephosphorylmutase  36.86 
 
 		 293 aa  198  1.0000000000000001e-49  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.301564  normal  0.346372 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7954  carboxyvinyl-carboxyphosphonate phosphorylmutase  37.54 
 
 		 288 aa  196  3e-49  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_14150  methylisocitrate lyase  36.2 
 
 		 312 aa  194  1e-48  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2317  methylisocitrate lyase  35.84 
 
 		 302 aa  193  2e-48  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2127  carboxyvinyl-carboxyphosphonate phosphorylmutase  35.84 
 
 		 302 aa  193  3e-48  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2113  carboxyvinyl-carboxyphosphonate phosphorylmutase  35.84 
 
 		 302 aa  193  3e-48  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2452  methylisocitrate lyase  35.84 
 
 		 302 aa  193  3e-48  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.344607  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2369  methylisocitrate lyase  35.84 
 
 		 302 aa  193  3e-48  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3008  methylisocitrate lyase  35.84 
 
 		 302 aa  192  4e-48  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.62358 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4025  isocitrate lyase family protein  34.74 
 
 		 284 aa  192  4e-48  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2190  carboxyvinyl-carboxyphosphonate phosphorylmutase  35.84 
 
 		 302 aa  192  5e-48  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2350  carboxyvinyl-carboxyphosphonate phosphorylmutase  35.84 
 
 		 302 aa  192  5e-48  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2378  carboxyvinyl-carboxyphosphonate phosphorylmutase  35.84 
 
 		 302 aa  192  6e-48  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.628231  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4051  isocitrate lyase family protein  34.38 
 
 		 287 aa  192  6e-48  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0624  2,3-dimethylmalate lyase  34.74 
 
 		 306 aa  192  7e-48  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0396  methylisocitrate lyase  35.36 
 
 		 285 aa  191  1e-47  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0696555  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2158  methylisocitrate lyase  35.48 
 
 		 302 aa  191  1e-47  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.081733  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4144  isocitrate lyase family protein  34.39 
 
 		 284 aa  191  1e-47  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1657  2,3-dimethylmalate lyase  35.34 
 
 		 306 aa  191  1e-47  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.106264  normal  0.68628 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3496  methylisocitrate lyase  36.23 
 
 		 314 aa  190  2e-47  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.146967  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0461  2,3-dimethylmalate lyase  34.62 
 
 		 301 aa  191  2e-47  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1054  isocitrate lyase family protein  36.17 
 
 		 282 aa  189  4e-47  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.138813  normal  0.876203 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0108  methylisocitrate lyase  36.96 
 
 		 302 aa  189  5e-47  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0279515  normal  0.0353052 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1702  methylisocitrate lyase  34.41 
 
 		 304 aa  188  7e-47  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.0394396 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3949  isocitrate lyase family protein  34.04 
 
 		 284 aa  188  9e-47  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1726  methylisocitrate lyase  33.69 
 
 		 302 aa  187  1e-46  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1614  2,3-dimethylmalate lyase  37.59 
 
 		 295 aa  187  2e-46  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.863287  normal  0.36405 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2775  2,3-dimethylmalate lyase  36.43 
 
 		 287 aa  187  2e-46  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1524  2,3-dimethylmalate lyase  36.23 
 
 		 301 aa  186  4e-46  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0781  methylisocitrate lyase  33.45 
 
 		 311 aa  185  6e-46  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0800  methylisocitrate lyase  36.04 
 
 		 307 aa  185  1.0000000000000001e-45  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0629223  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4841  2,3-dimethylmalate lyase  36.52 
 
 		 284 aa  185  1.0000000000000001e-45  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0101  methylisocitrate lyase  34.64 
 
 		 308 aa  185  1.0000000000000001e-45  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.248963  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0279  2,3-dimethylmalate lyase  35.85 
 
 		 274 aa  183  2.0000000000000003e-45  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.577564  normal  0.130845 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2513  2,3-dimethylmalate lyase  35.11 
 
 		 293 aa  182  5.0000000000000004e-45  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1524  methylisocitrate lyase  35.14 
 
 		 301 aa  181  1e-44  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000427671 
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_40267  predicted protein  36.55 
 
 		 323 aa  180  2e-44  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.158521  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0141  2-methylisocitrate lyase  35.56 
 
 		 297 aa  179  4.999999999999999e-44  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.758126  normal  0.590891 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4755  2-methylisocitrate lyase  35.56 
 
 		 297 aa  177  1e-43  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.730915  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5344  2-methylisocitrate lyase  35.56 
 
 		 297 aa  177  1e-43  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0562563  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5517  2-methylisocitrate lyase  35.56 
 
 		 297 aa  177  1e-43  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.36505  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1203  2,3-dimethylmalate lyase  34.21 
 
 		 293 aa  177  2e-43  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00337991  normal  0.996052 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4291  2,3-dimethylmalate lyase  34.72 
 
 		 295 aa  177  2e-43  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.268229 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5405  putative carboxyvinyl-carboxyphosphonate phosphorylmutase  34.21 
 
 		 293 aa  176  3e-43  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00321329  normal  0.260192 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3287  2-methylisocitrate lyase  34.44 
 
 		 297 aa  176  6e-43  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.179718  normal  0.0341449 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2479  methylisocitrate lyase  34.41 
 
 		 304 aa  175  9e-43  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0974909  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_09369  conserved hypothetical protein  33.69 
 
 		 454 aa  174  1.9999999999999998e-42  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.925933  hitchhiker  0.00486144 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0054  2-methylisocitrate lyase  30.82 
 
 		 297 aa  173  2.9999999999999996e-42  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0052  2-methylisocitrate lyase  30.47 
 
 		 297 aa  173  3.9999999999999995e-42  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0568  methylisocitrate lyase  35.48 
 
 		 298 aa  172  5e-42  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_12030  methylisocitrate lyase  32.01 
 
 		 312 aa  171  1e-41  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.55917  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06882  carboxyvinyl-carboxyphosphonate phosphorylmutase (AFU_orthologue; AFUA_2G00120)  33.68 
 
 		 334 aa  171  2e-41  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.463581  normal  0.914555 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0204  2,3-dimethylmalate lyase  38.46 
 
 		 325 aa  171  2e-41  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_23210  2-methylisocitrate lyase  34.84 
 
 		 295 aa  170  2e-41  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3975  2-methylisocitrate lyase  34.92 
 
 		 298 aa  169  3e-41  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.583072 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3861  2-methylisocitrate lyase  34.92 
 
 		 298 aa  169  3e-41  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.376669 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3767  2,3-dimethylmalate lyase  33.1 
 
 		 289 aa  170  3e-41  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0661  2,3-dimethylmalate lyase  30.82 
 
 		 310 aa  169  4e-41  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.428755 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2648  methylisocitrate lyase  35.02 
 
 		 305 aa  169  6e-41  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.843725  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2400  2-methylisocitrate lyase  33.21 
 
 		 311 aa  169  7e-41  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.951557  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3579  PEP phosphonomutase  34.78 
 
 		 286 aa  168  8e-41  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  decreased coverage  0.00948814  hitchhiker  0.00984431 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1857  2-methylisocitrate lyase  32.39 
 
 		 292 aa  168  9e-41  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1820  2-methylisocitrate lyase  33.22 
 
 		 292 aa  168  9e-41  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4722  2-methylisocitrate lyase  34.15 
 
 		 298 aa  167  1e-40  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1764  2-methylisocitrate lyase  34.28 
 
 		 296 aa  168  1e-40  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.662627  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_53940  2-methylisocitrate lyase  34.15 
 
 		 298 aa  167  1e-40  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3362  isocitrate lyase and phosphorylmutase  33.89 
 
 		 345 aa  167  2e-40  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.145198  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp0122  2-methylisocitrate lyase  35.96 
 
 		 298 aa  167  2e-40  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.528863  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0622  methylisocitrate lyase  33.57 
 
 		 304 aa  167  2e-40  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2189  2-methylisocitrate lyase  35.12 
 
 		 297 aa  167  2.9999999999999998e-40  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5389  2-methylisocitrate lyase  35.93 
 
 		 297 aa  166  4e-40  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.36576  normal  0.795706 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2085  2-methylisocitrate lyase  33.92 
 
 		 297 aa  166  5e-40  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.36601  hitchhiker  0.00432704 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0689  methylisocitrate lyase  40.37 
 
 		 292 aa  166  5e-40  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.106645  normal  1 
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_18345  predicted protein  35.64 
 
 		 348 aa  166  5e-40  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0806  isocitrate lyase family protein  33.33 
 
 		 287 aa  166  5e-40  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4842  2-methylisocitrate lyase  35.93 
 
 		 297 aa  165  5.9999999999999996e-40  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2334  2-methylisocitrate lyase  33.92 
 
 		 296 aa  165  6.9999999999999995e-40  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.474392  hitchhiker  0.0000364152 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2287  methylisocitrate lyase  33.33 
 
 		 297 aa  165  6.9999999999999995e-40  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.298126  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1935  2-methylisocitrate lyase  34.28 
 
 		 294 aa  165  8e-40  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.146073  hitchhiker  0.00000021306 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3436  2-methylisocitrate lyase  33.92 
 
 		 296 aa  165  9e-40  Pseudomonas putida F1  Bacteria  decreased coverage  0.00574123  normal  0.104863 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1916  isocitrate lyase family protein  32.16 
 
 		 287 aa  165  9e-40  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.0326533 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1072  2-methylisocitrate lyase  32.84 
 
 		 301 aa  164  1.0000000000000001e-39  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.765825  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0458  2,3-dimethylmalate lyase  35.9 
 
 		 296 aa  165  1.0000000000000001e-39  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4474  2,3-dimethylmalate lyase  31.95 
 
 		 294 aa  164  2.0000000000000002e-39  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.787404  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1775  2-methylisocitrate lyase  33.57 
 
 		 296 aa  163  3e-39  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.367112  hitchhiker  0.000175442 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4356  2-methylisocitrate lyase  35.82 
 
 		 303 aa  163  3e-39  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5990  2,3-dimethylmalate lyase  37.72 
 
 		 292 aa  163  3e-39  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0792782 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0283  putative methylisocitrate lyase  34.8 
 
 		 289 aa  163  3e-39  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.548186  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>