More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene OSTLU_40267 on replicon NC_009355
Organism: Ostreococcus lucimarinus CCE9901



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009355  OSTLU_40267  predicted protein  100 
 
 		 323 aa  650    Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.158521  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1092  carboxyvinyl-carboxyphosphonatephosphorylmutase  50.87 
 
 		 293 aa  268  1e-70  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.301564  normal  0.346372 
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_18345  predicted protein  44.44 
 
 		 348 aa  231  1e-59  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_09369  conserved hypothetical protein  45.88 
 
 		 454 aa  215  9.999999999999999e-55  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.925933  hitchhiker  0.00486144 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4757  2,3-dimethylmalate lyase  40.07 
 
 		 287 aa  213  2.9999999999999995e-54  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000491467  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2154  carboxyvinyl-carboxyphosphonate phosphorylmutase  39.71 
 
 		 289 aa  210  2e-53  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.908949 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4268  2,3-dimethylmalate lyase  39.93 
 
 		 291 aa  197  1.0000000000000001e-49  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.485286  normal  0.877406 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2775  2,3-dimethylmalate lyase  37.98 
 
 		 287 aa  193  3e-48  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4841  2,3-dimethylmalate lyase  38.49 
 
 		 284 aa  192  8e-48  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1029  2,3-dimethylmalate lyase  40.38 
 
 		 287 aa  191  1e-47  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.114621  normal  0.155549 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06882  carboxyvinyl-carboxyphosphonate phosphorylmutase (AFU_orthologue; AFUA_2G00120)  42.55 
 
 		 334 aa  191  2e-47  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.463581  normal  0.914555 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0283  putative methylisocitrate lyase  43.62 
 
 		 289 aa  191  2e-47  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.548186  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0864  2,3-dimethylmalate lyase  37.02 
 
 		 289 aa  189  4e-47  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.0000979692  hitchhiker  0.000000949403 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0256  putative methylisocitrate lyase  41.02 
 
 		 288 aa  189  4e-47  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.764901 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5166  putative carboxyvinyl-carboxyphosphonate phosphorylmutase  39.78 
 
 		 292 aa  185  1.0000000000000001e-45  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.919323  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2479  methylisocitrate lyase  41.64 
 
 		 304 aa  185  1.0000000000000001e-45  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0974909  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0458  2,3-dimethylmalate lyase  39.02 
 
 		 296 aa  185  1.0000000000000001e-45  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1130  2,3-dimethylmalate lyase  36.14 
 
 		 287 aa  184  2.0000000000000003e-45  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2934  putative methylisocitrate lyase  36.55 
 
 		 288 aa  180  2.9999999999999997e-44  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2513  2,3-dimethylmalate lyase  40.44 
 
 		 293 aa  180  2.9999999999999997e-44  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0661  2,3-dimethylmalate lyase  36.55 
 
 		 310 aa  180  4e-44  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.428755 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3767  2,3-dimethylmalate lyase  36.93 
 
 		 289 aa  177  2e-43  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1726  methylisocitrate lyase  36.56 
 
 		 302 aa  176  5e-43  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0279  2,3-dimethylmalate lyase  40 
 
 		 274 aa  176  5e-43  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.577564  normal  0.130845 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1702  methylisocitrate lyase  38.13 
 
 		 304 aa  176  5e-43  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.0394396 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0624  2,3-dimethylmalate lyase  37.35 
 
 		 306 aa  173  2.9999999999999996e-42  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0101  methylisocitrate lyase  40.08 
 
 		 308 aa  173  2.9999999999999996e-42  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.248963  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2452  methylisocitrate lyase  35.74 
 
 		 302 aa  171  1e-41  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.344607  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2378  carboxyvinyl-carboxyphosphonate phosphorylmutase  36.2 
 
 		 302 aa  171  1e-41  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.628231  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4325  2,3-dimethylmalate lyase  41.4 
 
 		 285 aa  171  1e-41  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0108  methylisocitrate lyase  39.25 
 
 		 302 aa  171  1e-41  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0279515  normal  0.0353052 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3008  methylisocitrate lyase  36.2 
 
 		 302 aa  171  2e-41  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.62358 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2317  methylisocitrate lyase  36.2 
 
 		 302 aa  170  2e-41  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2369  methylisocitrate lyase  36.2 
 
 		 302 aa  170  3e-41  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2127  carboxyvinyl-carboxyphosphonate phosphorylmutase  36.2 
 
 		 302 aa  170  3e-41  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2113  carboxyvinyl-carboxyphosphonate phosphorylmutase  36.2 
 
 		 302 aa  170  3e-41  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5990  2,3-dimethylmalate lyase  36.33 
 
 		 292 aa  169  4e-41  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0792782 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_12030  methylisocitrate lyase  40.69 
 
 		 312 aa  169  7e-41  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.55917  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0781  methylisocitrate lyase  36.68 
 
 		 311 aa  169  9e-41  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2158  methylisocitrate lyase  35.84 
 
 		 302 aa  168  9e-41  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.081733  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0806  isocitrate lyase family protein  37.55 
 
 		 287 aa  169  9e-41  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2190  carboxyvinyl-carboxyphosphonate phosphorylmutase  35.84 
 
 		 302 aa  167  2e-40  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2350  carboxyvinyl-carboxyphosphonate phosphorylmutase  35.84 
 
 		 302 aa  167  2e-40  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0689  methylisocitrate lyase  40.71 
 
 		 292 aa  166  5e-40  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.106645  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0622  methylisocitrate lyase  36.11 
 
 		 304 aa  166  5e-40  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7954  carboxyvinyl-carboxyphosphonate phosphorylmutase  39.1 
 
 		 288 aa  166  5.9999999999999996e-40  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0396  methylisocitrate lyase  37.4 
 
 		 285 aa  166  6.9999999999999995e-40  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0696555  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3510  methylisocitrate lyase  37.81 
 
 		 306 aa  165  1.0000000000000001e-39  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.120815  normal  0.0535493 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1933  isocitrate lyase family protein  35.19 
 
 		 299 aa  165  1.0000000000000001e-39  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1054  isocitrate lyase family protein  36.4 
 
 		 282 aa  164  1.0000000000000001e-39  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.138813  normal  0.876203 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0204  2,3-dimethylmalate lyase  36.63 
 
 		 325 aa  164  2.0000000000000002e-39  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3496  methylisocitrate lyase  38.65 
 
 		 314 aa  164  2.0000000000000002e-39  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.146967  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1916  isocitrate lyase family protein  39.74 
 
 		 287 aa  164  3e-39  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.0326533 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0783  methylisocitrate lyase  37.01 
 
 		 312 aa  162  6e-39  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.649003 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_14150  methylisocitrate lyase  38.73 
 
 		 312 aa  162  7e-39  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0800  methylisocitrate lyase  33.68 
 
 		 307 aa  162  9e-39  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0629223  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1072  2-methylisocitrate lyase  38.13 
 
 		 301 aa  161  1e-38  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.765825  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1657  2,3-dimethylmalate lyase  39.44 
 
 		 306 aa  161  1e-38  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.106264  normal  0.68628 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2082  2,3-dimethylmalate lyase  35.89 
 
 		 286 aa  160  2e-38  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.218009  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0568  methylisocitrate lyase  41.67 
 
 		 298 aa  160  2e-38  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1632  2,3-dimethylmalate lyase  35.89 
 
 		 286 aa  160  3e-38  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.171622 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0509  carboxyvinyl-carboxyphosphonate phosphorylmutase  39.44 
 
 		 289 aa  159  4e-38  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4791  2,3-dimethylmalate lyase  36.27 
 
 		 307 aa  159  6e-38  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.147274  normal  0.246336 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5405  putative carboxyvinyl-carboxyphosphonate phosphorylmutase  36.82 
 
 		 293 aa  159  7e-38  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00321329  normal  0.260192 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2320  2,3-dimethylmalate lyase  35.69 
 
 		 306 aa  158  1e-37  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0895569  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1203  2,3-dimethylmalate lyase  36.82 
 
 		 293 aa  158  1e-37  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00337991  normal  0.996052 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3579  PEP phosphonomutase  34.27 
 
 		 286 aa  158  1e-37  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  decreased coverage  0.00948814  hitchhiker  0.00984431 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4474  2,3-dimethylmalate lyase  35.87 
 
 		 294 aa  156  5.0000000000000005e-37  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.787404  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0408  2-methylisocitrate lyase  37.5 
 
 		 295 aa  153  2.9999999999999998e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000002587 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0420  2-methylisocitrate lyase  37.5 
 
 		 295 aa  153  2.9999999999999998e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.0232158 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4291  2,3-dimethylmalate lyase  34.19 
 
 		 295 aa  154  2.9999999999999998e-36  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.268229 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2605  2-methylisocitrate lyase  36.12 
 
 		 293 aa  153  2.9999999999999998e-36  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.221019  hitchhiker  0.000512853 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0462  2-methylisocitrate lyase  37.5 
 
 		 295 aa  153  4e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.237337  hitchhiker  0.00000000745318 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0400  2-methylisocitrate lyase  37.5 
 
 		 295 aa  153  4e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0664462  hitchhiker  0.000000000169441 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0402  2-methylisocitrate lyase  37.5 
 
 		 295 aa  152  5.9999999999999996e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1459  carboxyvinyl-carboxyphosphonate phosphorylmutase  41.81 
 
 		 278 aa  152  8e-36  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2822  2-methylisocitrate lyase  35.71 
 
 		 296 aa  152  8e-36  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1524  2,3-dimethylmalate lyase  38.75 
 
 		 301 aa  152  8.999999999999999e-36  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1524  methylisocitrate lyase  37.41 
 
 		 301 aa  151  1e-35  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000427671 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00286  2-methylisocitrate lyase  35.94 
 
 		 296 aa  150  2e-35  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4051  isocitrate lyase family protein  32.68 
 
 		 287 aa  151  2e-35  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0356  2-methylisocitrate lyase  36.04 
 
 		 296 aa  151  2e-35  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2085  2-methylisocitrate lyase  36.43 
 
 		 297 aa  150  2e-35  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.36601  hitchhiker  0.00432704 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0650  methylisocitrate lyase  35.07 
 
 		 304 aa  150  2e-35  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.133389 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00290  hypothetical protein  35.94 
 
 		 296 aa  150  2e-35  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0397  2-methylisocitrate lyase  35.94 
 
 		 296 aa  150  2e-35  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3825  2-methylisocitrate lyase  32.97 
 
 		 292 aa  150  2e-35  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0315  2-methylisocitrate lyase  32.97 
 
 		 292 aa  150  2e-35  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0403  2-methylisocitrate lyase  35.94 
 
 		 296 aa  150  3e-35  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1775  2-methylisocitrate lyase  35.48 
 
 		 296 aa  150  3e-35  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.367112  hitchhiker  0.000175442 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0363  2-methylisocitrate lyase  35.94 
 
 		 296 aa  150  3e-35  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3293  2-methylisocitrate lyase  35.94 
 
 		 296 aa  150  3e-35  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1587  2-methylisocitrate lyase  36.06 
 
 		 302 aa  150  3e-35  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000235696  normal  0.470108 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2287  methylisocitrate lyase  36.43 
 
 		 297 aa  150  4e-35  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.298126  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1808  2-methylisocitrate lyase  36.43 
 
 		 302 aa  149  5e-35  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.988873  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4144  isocitrate lyase family protein  30.88 
 
 		 284 aa  149  5e-35  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0461  2,3-dimethylmalate lyase  33.78 
 
 		 301 aa  149  5e-35  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1110  2-methylisocitrate lyase  35.93 
 
 		 296 aa  149  6e-35  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.452189 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4025  isocitrate lyase family protein  30.88 
 
 		 284 aa  149  6e-35  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3629  2-methylisocitrate lyase  32.97 
 
 		 292 aa  149  7e-35  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>