More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mfl182 on replicon NC_006055
Organism: Mesoplasma florum L1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_006055  Mfl182  putative amino acid ABC transporter ATP-binding component  100 
 
 
431 aa  841    Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  0.819355  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl646  putative multidrug ABC transporter ATP-binding component  36.64 
 
 
234 aa  130  4.0000000000000003e-29  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4201  ABC transporter related  25.82 
 
 
305 aa  98.2  3e-19  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2609  ABC transporter related protein  25.34 
 
 
303 aa  94.4  4e-18  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  unclonable  0.0000000000416385  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4025  ABC transporter related  28.04 
 
 
320 aa  94.4  4e-18  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.426784 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0340  ABC transporter related  31.28 
 
 
243 aa  94  5e-18  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0363  ABC transporter related  31.28 
 
 
243 aa  93.2  9e-18  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1380  ABC transporter related  26.69 
 
 
299 aa  91.3  3e-17  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00611293  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1407  ABC transporter related  26.69 
 
 
299 aa  91.3  3e-17  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.815122  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2548  ABC transporter related protein  26.9 
 
 
293 aa  91.7  3e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0653313  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0369  ABC transporter related protein  25.44 
 
 
568 aa  90.9  4e-17  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0671  ABC transporter related  29.52 
 
 
310 aa  90.9  4e-17  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0450645  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0992  ABC transporter related protein  31.34 
 
 
230 aa  90.5  5e-17  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_36180  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  25.38 
 
 
311 aa  88.6  2e-16  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1622  ABC transporter related  29.02 
 
 
252 aa  89  2e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.320946  normal  0.985195 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1568  ABC transporter related  30 
 
 
301 aa  87.8  3e-16  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.720654  hitchhiker  0.00000000000000702175 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0236  ABC transporter related protein  27.68 
 
 
247 aa  87.4  4e-16  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3480  ABC transporter-like protein  25.43 
 
 
319 aa  87.4  5e-16  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0113  ABC transporter related  28.19 
 
 
241 aa  86.7  7e-16  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1761  ABC transporter related  24.23 
 
 
350 aa  86.7  8e-16  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.298772 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2540  ABC transporter related  31.7 
 
 
241 aa  86.7  8e-16  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.656818  normal  0.632823 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0345  ABC transporter related  23.01 
 
 
302 aa  86.3  0.000000000000001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.0599235  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_21470  amino acid ABC transporter, ATP binding component  27.2 
 
 
269 aa  85.9  0.000000000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0707  ABC transporter related  28.12 
 
 
568 aa  85.9  0.000000000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.0149651 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3439  ABC transporter related  23.26 
 
 
322 aa  86.3  0.000000000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.57993  normal  0.145905 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2390  ABC transporter related  25.21 
 
 
243 aa  85.1  0.000000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0358  ABC transporter related  28.38 
 
 
270 aa  85.1  0.000000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.996244 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1112  ABC transporter related  28.79 
 
 
255 aa  84.7  0.000000000000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0959547  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1566  ABC transporter related  27.43 
 
 
240 aa  84.3  0.000000000000003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00000000343962  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0114  ABC transporter related  27.2 
 
 
258 aa  84.3  0.000000000000004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2490  glutamine ABC transporter ATP-binding protein  29.68 
 
 
240 aa  84.3  0.000000000000004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3748  ABC transporter related  22.87 
 
 
322 aa  84.3  0.000000000000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.26967  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1267  ABC transporter-like protein  24.55 
 
 
303 aa  84  0.000000000000005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.684433 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0672  ABC transporter related  26.25 
 
 
289 aa  83.6  0.000000000000006  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0422494  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0723  ABC transporter related  29 
 
 
420 aa  83.6  0.000000000000006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.643849  normal  0.703025 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2678  ABC transporter related protein  23.04 
 
 
301 aa  83.6  0.000000000000006  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.448412  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0482  ABC transporter related  25.33 
 
 
322 aa  83.6  0.000000000000006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1530  ABC transporter related  28.44 
 
 
304 aa  83.6  0.000000000000007  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.653437  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3449  ABC transporter related protein  28.16 
 
 
325 aa  83.2  0.000000000000008  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.102969 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5891  ABC transporter related  28.43 
 
 
418 aa  83.2  0.000000000000008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.559875 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3635  ABC transporter related  24.27 
 
 
322 aa  83.2  0.000000000000009  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.501994  normal  0.045877 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1582  glutamine ABC transporter ATP-binding protein  28.38 
 
 
240 aa  83.2  0.000000000000009  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.42936  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2644  ABC transporter related  21.7 
 
 
334 aa  82.4  0.00000000000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1759  ABC transporter related  25.11 
 
 
229 aa  82.4  0.00000000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.0946099 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5204  bacitracin export ATP-binding protein BceA  24.58 
 
 
253 aa  82.4  0.00000000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0059  ABC transporter related  25.29 
 
 
287 aa  82.8  0.00000000000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1779  lipopolysaccharide ABC export system, ATP-binding protein  26.98 
 
 
405 aa  82  0.00000000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0028065 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0254  ABC transporter related  26.41 
 
 
246 aa  82  0.00000000000002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.0374649  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5406  ABC transporter related  27.9 
 
 
259 aa  82  0.00000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1477  glutamine ABC transporter ATP-binding protein  28.57 
 
 
240 aa  82  0.00000000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2880  glutamine ABC transporter ATP-binding protein  27.93 
 
 
240 aa  81.6  0.00000000000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.37937  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4659  ABC transporter related  26.29 
 
 
253 aa  82  0.00000000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010578  Bind_3893  ABC transporter related  29.91 
 
 
242 aa  81.6  0.00000000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6010  copper ABC transporter, ATP-binding protein NosF  24.43 
 
 
306 aa  82  0.00000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  decreased coverage  0.00601626  normal  0.07018 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2504  putative amino-acid ABC transporter ATP-binding protein YecC  27.83 
 
 
250 aa  82  0.00000000000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.020525  normal  0.777652 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3150  ABC transporter related  27.8 
 
 
247 aa  82  0.00000000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0089  ABC transporter related  22.42 
 
 
307 aa  81.3  0.00000000000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4255  ABC transporter related  25 
 
 
312 aa  81.6  0.00000000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7658  putative ABC transporter, ATP-binding protein  27.88 
 
 
241 aa  81.3  0.00000000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.133914  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19730  ABC transporter related  23.45 
 
 
252 aa  80.9  0.00000000000004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0284  ABC transporter, ATPase subunit  26.07 
 
 
310 aa  81.3  0.00000000000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2014  ABC transporter related  25.89 
 
 
309 aa  80.9  0.00000000000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2077  ABC transporter related  26.23 
 
 
275 aa  80.9  0.00000000000004  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1526  ABC transporter related protein  28.46 
 
 
254 aa  80.9  0.00000000000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1421  cell division ATP-binding protein FtsE  27.59 
 
 
228 aa  80.5  0.00000000000005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2003  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  27.8 
 
 
243 aa  80.5  0.00000000000005  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4318  ABC transporter related  27.91 
 
 
456 aa  80.5  0.00000000000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.976448 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1633  ABC transporter related  29.3 
 
 
500 aa  80.5  0.00000000000005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1222  ABC transporter related  26.27 
 
 
258 aa  80.5  0.00000000000005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.757141  hitchhiker  0.00582014 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0163  ABC transporter, ATP-binding protein  23.56 
 
 
306 aa  80.5  0.00000000000005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.138257  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0342  ABC transporter related  23.56 
 
 
306 aa  80.5  0.00000000000005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.568895  normal  0.812009 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1236  ABC transporter related  25 
 
 
310 aa  80.5  0.00000000000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.143778  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1510  ABC transporter related  25.81 
 
 
229 aa  80.5  0.00000000000005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4576  ABC transporter related  25.81 
 
 
253 aa  80.5  0.00000000000006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2175  ABC transporter related protein  27.63 
 
 
274 aa  80.1  0.00000000000006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5221  ABC transporter related  27.12 
 
 
259 aa  80.5  0.00000000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.59712  normal  0.146567 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0195  ABC transporter related  26.27 
 
 
263 aa  80.1  0.00000000000006  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.61853  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1549  ABC transporter related  26.54 
 
 
319 aa  80.5  0.00000000000006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.819341  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0955  glutamine ABC transporter ATP-binding protein  27.27 
 
 
240 aa  80.1  0.00000000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.170507  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0892  glutamine ABC transporter ATP-binding protein  27.27 
 
 
240 aa  80.1  0.00000000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0239276  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5319  ABC transporter related  25.29 
 
 
498 aa  80.1  0.00000000000007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.783601  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0864  glutamine ABC transporter ATP-binding protein  27.27 
 
 
240 aa  80.1  0.00000000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0976  glutamine ABC transporter ATP-binding protein  27.27 
 
 
240 aa  80.1  0.00000000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.345768  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0923  glutamine ABC transporter ATP-binding protein  27.27 
 
 
240 aa  80.1  0.00000000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0351202  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1109  ABC transporter related  26.6 
 
 
303 aa  80.1  0.00000000000008  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0123  ABC transporter related  25 
 
 
255 aa  80.1  0.00000000000008  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4022  ABC transporter, ATPase subunit  28.81 
 
 
259 aa  79.7  0.00000000000008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.91478  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0053  ABC transporter related  28.84 
 
 
244 aa  79.7  0.00000000000008  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000214  amino acid ABC transporter ATP-binding protein  29.17 
 
 
244 aa  79.7  0.00000000000009  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0651  ABC polysaccharide efflux pump, ATPase subunit  25.99 
 
 
472 aa  79.7  0.00000000000009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.601465  normal  0.274396 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2942  ABC transporter related protein  28.38 
 
 
251 aa  79.7  0.00000000000009  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4751  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  24.3 
 
 
269 aa  79  0.0000000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  hitchhiker  0.00318924  hitchhiker  0.00202738 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3163  ABC transporter related  26.38 
 
 
272 aa  79.7  0.0000000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.816893  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2635  ABC transporter related  23.72 
 
 
303 aa  79.3  0.0000000000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.304041  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0129  ABC transporter related  27.03 
 
 
264 aa  79.7  0.0000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0187  ABC transporter related  23.53 
 
 
299 aa  79  0.0000000000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.852326  normal  0.850223 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1229  ABC transporter related  26.78 
 
 
243 aa  79.7  0.0000000000001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0176  ABC transporter related  28.77 
 
 
292 aa  79  0.0000000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00793  hypothetical protein  26.61 
 
 
240 aa  79.3  0.0000000000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0519  ABC transporter related  26.99 
 
 
247 aa  79  0.0000000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>