More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Meso_2106 on replicon NC_008254
Organism: Chelativorans sp. BNC1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008254  Meso_2106  diguanylate phosphodiesterase  100 
 
 		 290 aa  582  1.0000000000000001e-165  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3887  diguanylate phosphodiesterase  32.37 
 
 		 421 aa  117  1.9999999999999998e-25  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0192627  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0415  diguanylate phosphodiesterase  32.5 
 
 		 422 aa  110  3e-23  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.404943 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4292  diguanylate phosphodiesterase  32.5 
 
 		 425 aa  110  3e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.843441 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2035  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  31.45 
 
 		 790 aa  110  4.0000000000000004e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0244946 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2985  diguanylate phosphodiesterase  31.76 
 
 		 428 aa  105  8e-22  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6290  diguanylate phosphodiesterase  31.72 
 
 		 428 aa  104  2e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2848  diguanylate phosphodiesterase  31.76 
 
 		 428 aa  104  2e-21  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.423911  normal  0.493577 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2960  diguanylate phosphodiesterase  31.28 
 
 		 428 aa  103  3e-21  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.735556  normal  0.776936 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2938  diguanylate phosphodiesterase  31.28 
 
 		 428 aa  103  3e-21  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.200549  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2324  diguanylate phosphodiesterase  31.28 
 
 		 428 aa  103  3e-21  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  decreased coverage  0.00890506  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5831  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  31.69 
 
 		 777 aa  103  4e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.36212 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0140  diguanylate phosphodiesterase  30.8 
 
 		 424 aa  103  5e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.537566  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0380  cyclic diguanylate phosphodiesterase  30.84 
 
 		 464 aa  103  5e-21  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0400  cyclic diguanylate phosphodiesterase  30.84 
 
 		 464 aa  103  5e-21  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0565  EAL domain-containing protein  30.84 
 
 		 515 aa  102  6e-21  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0330  EAL domain-containing protein  30.4 
 
 		 429 aa  102  6e-21  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2792  diguanylate phosphodiesterase  28.62 
 
 		 427 aa  102  1e-20  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2662  EAL domain-containing protein  28.75 
 
 		 428 aa  100  2e-20  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.31527  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0993  diguanylate phosphodiesterase  29.66 
 
 		 441 aa  99.4  7e-20  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.457608  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3700  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  30.34 
 
 		 780 aa  98.6  1e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.973532 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0359  diguanylate phosphodiesterase  30.47 
 
 		 423 aa  96.7  4e-19  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.834381  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000198  EAL domain protein  29.72 
 
 		 262 aa  92.4  8e-18  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00000396049  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1176  diguanylate phosphodiesterase  28.57 
 
 		 411 aa  92.4  8e-18  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2288  diguanylate phosphodiesterase  29.96 
 
 		 419 aa  92.4  9e-18  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000327147  normal  0.604082 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3724  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  31 
 
 		 580 aa  90.9  2e-17  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0883602  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1394  EAL domain-containing protein  26.61 
 
 		 403 aa  90.1  3e-17  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3527  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  29.57 
 
 		 581 aa  90.1  3e-17  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1523  EAL domain-containing protein  26.61 
 
 		 427 aa  90.1  4e-17  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0470  hypothetical protein  31.47 
 
 		 288 aa  90.1  4e-17  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000000129901  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2214  diguanylate phosphodiesterase  30.04 
 
 		 428 aa  90.1  4e-17  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.706339  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1618  diguanylate phosphodiesterase  28.92 
 
 		 446 aa  89.7  5e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.991621  normal  0.575282 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0436  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  30.77 
 
 		 590 aa  89.7  6e-17  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1389  EAL domain-containing protein  26.18 
 
 		 403 aa  89.7  6e-17  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2834  diguanylate phosphodiesterase  28.33 
 
 		 440 aa  89  8e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3153  putative diguanylate phosphodiesterase  31.74 
 
 		 584 aa  88.2  1e-16  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.920716  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1766  EAL domain-containing protein  26.61 
 
 		 474 aa  87.8  2e-16  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.561967  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1192  EAL domain-containing protein  26.61 
 
 		 474 aa  87.8  2e-16  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.252573  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0677  EAL domain-containing protein  26.61 
 
 		 482 aa  88.2  2e-16  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0823154  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0770  diguanylate phosphodiesterase  27.38 
 
 		 414 aa  87.8  2e-16  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.294803  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1101  diguanylate phosphodiesterase  28.33 
 
 		 426 aa  87.4  2e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4326  diguanylate phosphodiesterase  27.9 
 
 		 426 aa  86.7  5e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0277437  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1744  diguanylate phosphodiesterase  28.23 
 
 		 424 aa  85.9  7e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.943154  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1101  diguanylate phosphodiesterase  27.9 
 
 		 426 aa  85.9  7e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0554  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  28.91 
 
 		 584 aa  85.1  0.000000000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0111263  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0612  diguanylate phosphodiesterase  33.14 
 
 		 197 aa  84.7  0.000000000000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.996724 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1033  diguanylate phosphodiesterase  28.45 
 
 		 413 aa  84.3  0.000000000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1191  diguanylate phosphodiesterase  27.47 
 
 		 447 aa  84.3  0.000000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0738047  normal  0.284826 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1218  diguanylate phosphodiesterase  27.47 
 
 		 426 aa  84  0.000000000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.048247  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0737  diguanylate phosphodiesterase  27.47 
 
 		 426 aa  84  0.000000000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0555  hypothetical protein  28.52 
 
 		 584 aa  83.2  0.000000000000004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3319  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  28.52 
 
 		 584 aa  83.6  0.000000000000004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.777593  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0469  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  27.53 
 
 		 764 aa  83.6  0.000000000000004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0514  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  29.57 
 
 		 585 aa  82.8  0.000000000000006  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00136052  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3754  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  28.79 
 
 		 585 aa  82.8  0.000000000000006  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00000868734  normal  0.0557959 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2992  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  30.28 
 
 		 746 aa  82.8  0.000000000000006  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.741297  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3936  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  28.79 
 
 		 585 aa  82.8  0.000000000000007  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.573208  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2085  diguanylate phosphodiesterase  27.63 
 
 		 423 aa  82.8  0.000000000000007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3810  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  28.79 
 
 		 585 aa  82  0.00000000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000137032  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0220  hypothetical protein  24.23 
 
 		 362 aa  81.6  0.00000000000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0751  EAL domain-containing protein  27.13 
 
 		 424 aa  82  0.00000000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4345  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  27.95 
 
 		 572 aa  82  0.00000000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0220  hypothetical protein  24.23 
 
 		 360 aa  81.6  0.00000000000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1094  EAL domain-containing protein  26.72 
 
 		 424 aa  80.9  0.00000000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.464012  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2872  cyclic diguanylate phosphodiesterase domain-containing protein  30.28 
 
 		 737 aa  81.3  0.00000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0943  cyclic diguanylate phosphodiesterase  26.72 
 
 		 422 aa  80.9  0.00000000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0939  EAL domain-containing protein  26.72 
 
 		 422 aa  80.9  0.00000000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.876817  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2763  hypothetical protein  30.28 
 
 		 737 aa  81.3  0.00000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2651  inner membrane protein YfgF  30.28 
 
 		 737 aa  81.3  0.00000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2699  inner membrane protein YfgF  30.28 
 
 		 737 aa  81.3  0.00000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.995527 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0555  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  29.07 
 
 		 583 aa  80.9  0.00000000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3475  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  29.07 
 
 		 583 aa  81.3  0.00000000000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3972  diguanylate phosphodiesterase  34.68 
 
 		 387 aa  80.1  0.00000000000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05954  hypothetical protein  27.27 
 
 		 272 aa  79.7  0.00000000000005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1718  diguanylate phosphodiesterase  34.07 
 
 		 379 aa  79.3  0.00000000000006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0187822  normal  0.029577 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3003  diguanylate phosphodiesterase  34.4 
 
 		 387 aa  79.7  0.00000000000006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000176635 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2741  inner membrane protein YfgF  29.58 
 
 		 737 aa  79.3  0.00000000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.306785 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0247  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  32.33 
 
 		 890 aa  79.3  0.00000000000006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2261  EAL domain-containing protein  26.72 
 
 		 424 aa  79.3  0.00000000000007  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.807134  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2848  EAL domain-containing protein  24.1 
 
 		 427 aa  79.3  0.00000000000007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.197533  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0558  cyclic diguanylate phosphodiesterase  26.72 
 
 		 422 aa  79  0.00000000000008  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2237  diguanylate phosphodiesterase  30.53 
 
 		 233 aa  79  0.00000000000008  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.162891  normal  0.294289 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2138  cyclic diguanylate phosphodiesterase  26.72 
 
 		 422 aa  79  0.00000000000008  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2902  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  30.91 
 
 		 885 aa  79  0.00000000000009  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2644  diguanylate cyclase  30.77 
 
 		 729 aa  79  0.00000000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2668  diguanylate cyclase  30.77 
 
 		 729 aa  78.6  0.0000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0705  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  28.35 
 
 		 590 aa  78.6  0.0000000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1320  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  29.57 
 
 		 584 aa  78.2  0.0000000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.00692574  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2602  diguanylate cyclase  30.77 
 
 		 729 aa  78.6  0.0000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.116026  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2553  diguanylate cyclase  30.77 
 
 		 729 aa  79  0.0000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000552391  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2774  cyclic diguanylate phosphodiesterase domain-containing protein  30.77 
 
 		 729 aa  78.6  0.0000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4001  diguanylate phosphodiesterase  34.07 
 
 		 357 aa  78.6  0.0000000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.00838727  normal  0.748991 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2455  diguanylate phosphodiesterase  26.72 
 
 		 424 aa  77.8  0.0000000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000463502 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5868  diguanylate phosphodiesterase  26.72 
 
 		 424 aa  77.8  0.0000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0145256  normal  0.285313 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1194  hypothetical protein  29.69 
 
 		 284 aa  77.8  0.0000000000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.603137  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2099  response regulator receiver modulated diguanylate phosphodiesterase  30.09 
 
 		 402 aa  78.2  0.0000000000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.316821 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2585  diguanylate phosphodiesterase  26.72 
 
 		 424 aa  77.8  0.0000000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0503461  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0758  diguanylate phosphodiesterase  26.72 
 
 		 424 aa  78.2  0.0000000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.121187  normal  0.125569 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1867  hypothetical protein  29.57 
 
 		 582 aa  77  0.0000000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.145916  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2771  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  34.56 
 
 		 860 aa  77  0.0000000000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>