99 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mchl_5283 on replicon NC_011757
Organism: Methylobacterium chloromethanicum CM4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010725  Mpop_5361  light-independent protochlorophyllide reductase subunit N  89.57 
 
 		 422 aa  761    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.752323  normal  0.24577 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5283  light-independent protochlorophyllide reductase subunit N  100 
 
 		 422 aa  835    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4816  light-independent protochlorophyllide reductase subunit N  97.39 
 
 		 422 aa  813    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.596165  normal  0.0186172 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1848  light-independent protochlorophyllide reductase subunit N  82.86 
 
 		 424 aa  676    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00937776 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3718  light-independent protochlorophyllide reductase subunit N  80.85 
 
 		 420 aa  633  1e-180  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.834431  normal  0.0122696 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1730  light-independent protochlorophyllide reductase subunit N  74.69 
 
 		 429 aa  625  1e-178  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3981  light-independent protochlorophyllide reductase subunit N  73.22 
 
 		 428 aa  613  9.999999999999999e-175  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.120682 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1313  light-independent protochlorophyllide reductase subunit N  72.53 
 
 		 428 aa  613  9.999999999999999e-175  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.29904 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3736  light-independent protochlorophyllide reductase subunit N  74.45 
 
 		 428 aa  609  1e-173  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.255529  hitchhiker  0.00206765 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6417  light-independent protochlorophyllide reductase subunit N  74.31 
 
 		 428 aa  600  1e-170  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.577987  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2042  light-independent protochlorophyllide reductase subunit N  72.54 
 
 		 426 aa  593  1e-168  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.147701 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0623  light-independent protochlorophyllide reductase subunit N  71.99 
 
 		 440 aa  568  1e-161  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.957648  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0161  light-independent protochlorophyllide reductase subunit N  65.09 
 
 		 427 aa  531  1e-150  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1010  light-independent protochlorophyllide reductase subunit N  67.47 
 
 		 428 aa  525  1e-148  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.398895  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3534  light-independent protochlorophyllide reductase subunit N  66.04 
 
 		 427 aa  523  1e-147  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_07951  light-independent protochlorophyllide reductase subunit N  62.87 
 
 		 418 aa  520  1e-146  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1619  light-independent protochlorophyllide reductase subunit N  63.08 
 
 		 416 aa  515  1.0000000000000001e-145  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.43602  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1928  light-independent protochlorophyllide reductase subunit N  67.47 
 
 		 428 aa  515  1.0000000000000001e-145  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.472722  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0747  light-independent protochlorophyllide reductase subunit N  64.04 
 
 		 425 aa  512  1e-144  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.957633  normal  0.357282 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0285  light-independent protochlorophyllide reductase subunit N  67.47 
 
 		 428 aa  514  1e-144  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1873  light-independent protochlorophyllide reductase subunit N  59.11 
 
 		 418 aa  504  9.999999999999999e-143  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_05471  light-independent protochlorophyllide reductase subunit N  59.37 
 
 		 418 aa  503  1e-141  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0545  light-independent protochlorophyllide reductase subunit N  59.56 
 
 		 418 aa  503  1e-141  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_05981  light-independent protochlorophyllide reductase subunit N  58.62 
 
 		 419 aa  504  1e-141  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.926498 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_05711  light-independent protochlorophyllide reductase subunit N  58.33 
 
 		 418 aa  501  1e-140  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.847677  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_06091  light-independent protochlorophyllide reductase subunit N  59.31 
 
 		 418 aa  498  1e-140  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_06011  light-independent protochlorophyllide reductase subunit N  58.09 
 
 		 418 aa  499  1e-140  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1637  light-independent protochlorophyllide reductase subunit N  63.79 
 
 		 424 aa  489  1e-137  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1910  light-independent protochlorophyllide reductase subunit N  40.96 
 
 		 415 aa  270  2.9999999999999997e-71  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.902944  hitchhiker  0.00090668 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1536  light-independent protochlorophyllide reductase subunit N  40.68 
 
 		 414 aa  266  5.999999999999999e-70  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.120446  hitchhiker  0.00259667 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0215  light-independent protochlorophyllide reductase subunit N  38.93 
 
 		 420 aa  252  9.000000000000001e-66  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0817  light-independent protochlorophyllide reductase subunit N  33.11 
 
 		 466 aa  250  4e-65  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0125392  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3481  light-independent protochlorophyllide reductase subunit N  38.01 
 
 		 425 aa  249  5e-65  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0789  light-independent protochlorophyllide reductase subunit N  33.11 
 
 		 466 aa  249  7e-65  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2373  light-independent protochlorophyllide reductase subunit N  33.78 
 
 		 466 aa  249  9e-65  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2304  light-independent protochlorophyllide reductase subunit N  33.19 
 
 		 467 aa  248  1e-64  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2194  light-independent protochlorophyllide reductase subunit N  38.56 
 
 		 420 aa  246  4e-64  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0324  light-independent protochlorophyllide reductase subunit N  37.2 
 
 		 420 aa  245  9e-64  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.754207  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3941  light-independent protochlorophyllide reductase subunit N  33.7 
 
 		 468 aa  244  1.9999999999999999e-63  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.620591  normal  0.804646 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1530  light-independent protochlorophyllide reductase subunit N  33.11 
 
 		 465 aa  244  1.9999999999999999e-63  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0646926 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1815  light-independent protochlorophyllide reductase subunit N  39.25 
 
 		 427 aa  244  1.9999999999999999e-63  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2330  light-independent protochlorophyllide reductase subunit N  33.41 
 
 		 467 aa  243  3e-63  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1420  light-independent protochlorophyllide reductase subunit N  33.56 
 
 		 466 aa  242  1e-62  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.172263  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2388  light-independent protochlorophyllide reductase subunit N  37.2 
 
 		 420 aa  241  2e-62  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2029  light-independent protochlorophyllide reductase subunit N  37.69 
 
 		 420 aa  239  9e-62  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.0292807 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2260  light-independent protochlorophyllide reductase subunit N  38.15 
 
 		 420 aa  237  2e-61  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.307743 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0605  hypothetical protein  34.76 
 
 		 447 aa  92  2e-17  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2035  chlorophyllide reductase subunit Y  30.65 
 
 		 500 aa  63.2  0.000000008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.201918  normal  0.260715 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0261  chlorophyllide reductase, BchY subunit  30 
 
 		 502 aa  58.5  0.0000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2082  oxidoreductase/nitrogenase, component 1  24.14 
 
 		 347 aa  58.5  0.0000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4027  oxidoreductase/nitrogenase, component 1  22.71 
 
 		 463 aa  58.2  0.0000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.762261 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1817  oxidoreductase/nitrogenase component 1  24.36 
 
 		 410 aa  57.4  0.0000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0164  hypothetical protein  26.12 
 
 		 339 aa  57.8  0.0000004  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1905  chlorophyllide reductase subunit Y  29.5 
 
 		 502 aa  56.6  0.0000008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.381986 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0216  light-independent protochlorophyllide reductase subunit B  26.65 
 
 		 525 aa  56.6  0.0000009  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0280  NifH/frxC  21.52 
 
 		 728 aa  55.8  0.000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.359044  normal  0.513981 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1909  light-independent protochlorophyllide reductase subunit B  24.92 
 
 		 568 aa  54.7  0.000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000998915 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0404  NifH/frxC-family protein  22.42 
 
 		 731 aa  54.7  0.000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.394931 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2817  chlorophyllide reductase subunit Y  30.5 
 
 		 509 aa  55.1  0.000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0774355  normal  0.429495 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2703  nitrogen fixation protein NifH/NifE  25.07 
 
 		 746 aa  53.1  0.000008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.15509 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1622  nitrogenase alpha chain  22.49 
 
 		 522 aa  52.8  0.00001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0325  light-independent protochlorophyllide reductase subunit B  25.46 
 
 		 535 aa  52.4  0.00002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00842285  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2411  chlorophyllide reductase subunit Y  23.93 
 
 		 411 aa  52  0.00002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1863  chlorophyllide reductase subunit Y  23.93 
 
 		 415 aa  50.8  0.00004  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1394  nitrogenase iron-iron protein, alpha chain  21.11 
 
 		 519 aa  50.8  0.00004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2035  chlorophyllide reductase subunit Y  23.91 
 
 		 412 aa  51.2  0.00004  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1553  nitrogenase, subunit D  20.34 
 
 		 530 aa  49.7  0.0001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0324  chlorophyllide reductase subunit Y  23.56 
 
 		 412 aa  49.7  0.0001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2193  light-independent protochlorophyllide reductase subunit B  25.15 
 
 		 535 aa  48.5  0.0002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4815  light-independent protochlorophyllide reductase subunit B  34.27 
 
 		 531 aa  48.5  0.0002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.427716  normal  0.0343 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2075  chlorophyllide reductase subunit Y  24.69 
 
 		 412 aa  48.5  0.0002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.027568  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2607  Nitrogenase  26.14 
 
 		 501 aa  47.8  0.0003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0234589  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1537  light-independent protochlorophyllide reductase subunit B  23.55 
 
 		 563 aa  48.1  0.0003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.61403  hitchhiker  0.000999524 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4041  nitrogenase component I, alpha chain  23.47 
 
 		 476 aa  47.8  0.0004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00949178 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_48990  nitrogenase iron-iron protein, alpha chain  25.86 
 
 		 518 aa  47.8  0.0004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.546352  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1938  oxidoreductase/nitrogenase, component 1  22.89 
 
 		 355 aa  47.4  0.0004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1614  oxidoreductase/nitrogenase component 1  22.54 
 
 		 425 aa  47.4  0.0005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5282  light-independent protochlorophyllide reductase subunit B  28.23 
 
 		 531 aa  47.4  0.0005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3531  light-independent protochlorophyllide reductase subunit B  22.89 
 
 		 508 aa  47  0.0006  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3698  chlorophyllide reductase subunit Y  30.5 
 
 		 516 aa  47  0.0006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.465391  hitchhiker  0.00482074 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0622  light-independent protochlorophyllide reductase subunit B  33.91 
 
 		 546 aa  47  0.0006  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4029  oxidoreductase/nitrogenase, component 1  21.17 
 
 		 466 aa  46.6  0.0008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.522703 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2387  light-independent protochlorophyllide reductase subunit B  25.22 
 
 		 535 aa  46.6  0.0008  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1847  light-independent protochlorophyllide reductase subunit B  30 
 
 		 532 aa  45.8  0.001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.756784  normal  0.0103216 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2053  chlorophyllide reductase subunit Y  28.5 
 
 		 513 aa  46.2  0.001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0326514 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3744  chlorophyllide reductase subunit Y  25.93 
 
 		 422 aa  45.4  0.002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000125918 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0551  nitrogenase component I, alpha chain  28.8 
 
 		 486 aa  44.7  0.003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.39708  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3666  light-independent protochlorophyllide reductase subunit B  22.34 
 
 		 507 aa  44.7  0.003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2009  nitrogenase  23.26 
 
 		 516 aa  44.7  0.003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0918882  normal  0.238149 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3204  light-independent protochlorophyllide reductase subunit B  23.76 
 
 		 508 aa  44.3  0.004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2611  nitrogenase alpha chain  21.14 
 
 		 523 aa  43.9  0.005  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.718725  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1814  light-independent protochlorophyllide reductase subunit B  23.74 
 
 		 540 aa  43.5  0.006  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2958  chlorophyllide reductase subunit Y  28.5 
 
 		 508 aa  43.9  0.006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.124011 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6416  light-independent protochlorophyllide reductase subunit B  32.35 
 
 		 517 aa  43.5  0.007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4683  nitrogenase alpha chain  24 
 
 		 524 aa  43.5  0.007  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0850  chlorophyllide reductase subunit Y  29.02 
 
 		 438 aa  43.5  0.008  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.053677  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0794  nitrogenase  26.09 
 
 		 511 aa  43.5  0.008  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2731  chlorophyllide reductase subunit Y  28 
 
 		 508 aa  43.1  0.009  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3466  light-independent protochlorophyllide reductase subunit B  23.94 
 
 		 508 aa  43.1  0.01  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>