75 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Clim_2035 on replicon NC_010803
Organism: Chlorobium limicola DSM 245



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008639  Cpha266_2075  chlorophyllide reductase subunit Y  82 
 
 		 412 aa  704    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.027568  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2035  chlorophyllide reductase subunit Y  100 
 
 		 412 aa  841    Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0324  chlorophyllide reductase subunit Y  80.49 
 
 		 412 aa  694    Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2062  chlorophyllide reductase subunit Y  76.34 
 
 		 422 aa  635    Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.730736  normal  0.0621767 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1863  chlorophyllide reductase subunit Y  75.37 
 
 		 415 aa  647    Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2411  chlorophyllide reductase subunit Y  83.9 
 
 		 411 aa  713    Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0342  chlorophyllide reductase subunit Y  75.61 
 
 		 418 aa  631  1e-180  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.680799  normal  0.193791 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3744  chlorophyllide reductase subunit Y  48.76 
 
 		 422 aa  406  1.0000000000000001e-112  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000125918 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3257  chlorophyllide reductase subunit Y  49.88 
 
 		 422 aa  384  1e-105  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0212884 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0850  chlorophyllide reductase subunit Y  48.05 
 
 		 438 aa  363  4e-99  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.053677  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2817  chlorophyllide reductase subunit Y  37.38 
 
 		 509 aa  272  1e-71  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0774355  normal  0.429495 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3698  chlorophyllide reductase subunit Y  36.32 
 
 		 516 aa  262  1e-68  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.465391  hitchhiker  0.00482074 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2853  chlorophyllide reductase subunit Y  36.65 
 
 		 508 aa  261  1e-68  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.922563 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2958  chlorophyllide reductase subunit Y  36.41 
 
 		 508 aa  261  2e-68  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.124011 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2731  chlorophyllide reductase subunit Y  36.41 
 
 		 508 aa  261  2e-68  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2053  chlorophyllide reductase subunit Y  35.68 
 
 		 513 aa  257  3e-67  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0326514 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4000  chlorophyllide reductase subunit Y  34.47 
 
 		 533 aa  253  3e-66  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.130756  hitchhiker  0.00873228 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1609  chlorophyllide reductase subunit Y  34.2 
 
 		 455 aa  253  5.000000000000001e-66  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1711  chlorophyllide reductase subunit Y  33.98 
 
 		 528 aa  252  7e-66  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0178  chlorophyllide reductase subunit Y  35.11 
 
 		 521 aa  252  7e-66  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2979  chlorophyllide reductase subunit Y  35.35 
 
 		 468 aa  251  2e-65  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.927182  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3518  bacteriachlorophyllide reductase iron protein subunit Y  34.15 
 
 		 534 aa  249  5e-65  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.292352 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1294  chlorophyllide reductase subunit Y  33.74 
 
 		 535 aa  249  8e-65  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3755  chlorophyllide reductase subunit Y  33.98 
 
 		 540 aa  248  2e-64  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00652475 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6436  bacteriochlorophyllide reductase subunit  35.35 
 
 		 512 aa  247  3e-64  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2035  chlorophyllide reductase subunit Y  34.31 
 
 		 500 aa  241  1e-62  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.201918  normal  0.260715 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0261  chlorophyllide reductase, BchY subunit  34.31 
 
 		 502 aa  241  2e-62  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1905  chlorophyllide reductase subunit Y  33.82 
 
 		 502 aa  236  4e-61  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.381986 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1910  light-independent protochlorophyllide reductase subunit N  23.94 
 
 		 415 aa  63.2  0.000000009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.902944  hitchhiker  0.00090668 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_05471  light-independent protochlorophyllide reductase subunit N  22.22 
 
 		 418 aa  61.2  0.00000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0747  light-independent protochlorophyllide reductase subunit N  25 
 
 		 425 aa  60.5  0.00000005  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.957633  normal  0.357282 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2815  nitrogenase  24.57 
 
 		 479 aa  60.5  0.00000005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1313  light-independent protochlorophyllide reductase subunit N  26.2 
 
 		 428 aa  58.9  0.0000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.29904 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1619  light-independent protochlorophyllide reductase subunit N  24.31 
 
 		 416 aa  57.8  0.0000004  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.43602  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_05981  light-independent protochlorophyllide reductase subunit N  21.37 
 
 		 419 aa  57  0.0000006  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.926498 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1536  light-independent protochlorophyllide reductase subunit N  24.32 
 
 		 414 aa  56.6  0.0000008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.120446  hitchhiker  0.00259667 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0059  nitrogenase  20.74 
 
 		 458 aa  56.6  0.0000009  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.148206  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1873  light-independent protochlorophyllide reductase subunit N  21.33 
 
 		 418 aa  55.5  0.000002  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_07951  light-independent protochlorophyllide reductase subunit N  23.55 
 
 		 418 aa  55.1  0.000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0664  nitrogenase  22.04 
 
 		 458 aa  55.1  0.000003  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.683559  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1730  light-independent protochlorophyllide reductase subunit N  24.18 
 
 		 429 aa  55.1  0.000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1797  nitrogenase  25.39 
 
 		 458 aa  53.5  0.000006  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.561613  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0545  light-independent protochlorophyllide reductase subunit N  20.76 
 
 		 418 aa  52.4  0.00002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3481  light-independent protochlorophyllide reductase subunit N  23.69 
 
 		 425 aa  51.2  0.00003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5283  light-independent protochlorophyllide reductase subunit N  23.91 
 
 		 422 aa  51.2  0.00004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0324  light-independent protochlorophyllide reductase subunit N  22.61 
 
 		 420 aa  50.8  0.00004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.754207  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2194  light-independent protochlorophyllide reductase subunit N  24.21 
 
 		 420 aa  50.4  0.00005  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5361  light-independent protochlorophyllide reductase subunit N  27.65 
 
 		 422 aa  50.4  0.00006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.752323  normal  0.24577 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0104  nitrogenase  24.87 
 
 		 458 aa  49.3  0.0001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.294919  normal  0.143181 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_06091  light-independent protochlorophyllide reductase subunit N  21.05 
 
 		 418 aa  48.5  0.0002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1354  Nitrogenase  22.49 
 
 		 444 aa  47.8  0.0003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00134984  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5360  light-independent protochlorophyllide reductase subunit B  27.08 
 
 		 530 aa  48.1  0.0003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0246686  normal  0.191395 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2260  light-independent protochlorophyllide reductase subunit N  20.24 
 
 		 420 aa  47.8  0.0004  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.307743 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_05711  light-independent protochlorophyllide reductase subunit N  20.43 
 
 		 418 aa  47  0.0006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.847677  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2388  light-independent protochlorophyllide reductase subunit N  23.43 
 
 		 420 aa  47  0.0006  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0605  hypothetical protein  26.79 
 
 		 447 aa  47  0.0007  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_06011  light-independent protochlorophyllide reductase subunit N  19.88 
 
 		 418 aa  47  0.0007  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3719  light-independent protochlorophyllide reductase subunit B  23.68 
 
 		 506 aa  46.6  0.0008  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.38806  hitchhiker  0.00209828 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4027  oxidoreductase/nitrogenase, component 1  24.41 
 
 		 463 aa  45.8  0.001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.762261 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1815  light-independent protochlorophyllide reductase subunit N  19.47 
 
 		 427 aa  45.1  0.002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0161  light-independent protochlorophyllide reductase subunit N  22.63 
 
 		 427 aa  45.4  0.002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4816  light-independent protochlorophyllide reductase subunit N  23.59 
 
 		 422 aa  44.7  0.003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.596165  normal  0.0186172 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1198  nitrogenase  23.08 
 
 		 475 aa  44.7  0.003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.403437  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3718  light-independent protochlorophyllide reductase subunit N  25.17 
 
 		 420 aa  44.7  0.003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.834431  normal  0.0122696 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2042  light-independent protochlorophyllide reductase subunit N  26.19 
 
 		 426 aa  44.3  0.004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.147701 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1848  light-independent protochlorophyllide reductase subunit N  25.44 
 
 		 424 aa  44.3  0.004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00937776 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0740  nitrogenase molybdenum-iron protein beta chain  21.89 
 
 		 459 aa  44.3  0.004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1420  light-independent protochlorophyllide reductase subunit N  26.62 
 
 		 466 aa  43.9  0.005  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.172263  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3981  light-independent protochlorophyllide reductase subunit N  23.67 
 
 		 428 aa  43.9  0.005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.120682 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1953  nitrogenase molybdenum-iron protein beta chain  20.49 
 
 		 460 aa  43.9  0.006  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.119434  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1847  light-independent protochlorophyllide reductase subunit B  24.03 
 
 		 532 aa  43.5  0.007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.756784  normal  0.0103216 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3736  light-independent protochlorophyllide reductase subunit N  24.41 
 
 		 428 aa  43.5  0.007  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.255529  hitchhiker  0.00206765 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1355  Nitrogenase  22.88 
 
 		 505 aa  43.5  0.007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0527028  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2304  light-independent protochlorophyllide reductase subunit N  22.92 
 
 		 467 aa  43.1  0.008  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2702  nitrogenase-related protein  30.28 
 
 		 431 aa  43.1  0.009  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00973436  normal  0.117239 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>