62 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphamn1_2260 on replicon NC_010831
Organism: Chlorobium phaeobacteroides BS1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008639  Cpha266_2388  light-independent protochlorophyllide reductase subunit N  80.24 
 
 		 420 aa  714    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2194  light-independent protochlorophyllide reductase subunit N  80 
 
 		 420 aa  712    Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0215  light-independent protochlorophyllide reductase subunit N  80.95 
 
 		 420 aa  717    Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2260  light-independent protochlorophyllide reductase subunit N  100 
 
 		 420 aa  865    Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.307743 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1815  light-independent protochlorophyllide reductase subunit N  79.66 
 
 		 427 aa  706    Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2029  light-independent protochlorophyllide reductase subunit N  87.14 
 
 		 420 aa  769    Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.0292807 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0324  light-independent protochlorophyllide reductase subunit N  83.1 
 
 		 420 aa  737    Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.754207  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1910  light-independent protochlorophyllide reductase subunit N  65.85 
 
 		 415 aa  586  1e-166  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.902944  hitchhiker  0.00090668 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1536  light-independent protochlorophyllide reductase subunit N  64.49 
 
 		 414 aa  578  1e-164  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.120446  hitchhiker  0.00259667 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3481  light-independent protochlorophyllide reductase subunit N  62.44 
 
 		 425 aa  555  1e-157  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2304  light-independent protochlorophyllide reductase subunit N  37.84 
 
 		 467 aa  310  2e-83  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0817  light-independent protochlorophyllide reductase subunit N  35.71 
 
 		 466 aa  305  9.000000000000001e-82  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0125392  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0789  light-independent protochlorophyllide reductase subunit N  35.71 
 
 		 466 aa  305  1.0000000000000001e-81  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2373  light-independent protochlorophyllide reductase subunit N  36.38 
 
 		 466 aa  305  1.0000000000000001e-81  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2330  light-independent protochlorophyllide reductase subunit N  37.61 
 
 		 467 aa  305  1.0000000000000001e-81  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1420  light-independent protochlorophyllide reductase subunit N  36.59 
 
 		 466 aa  303  5.000000000000001e-81  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.172263  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3941  light-independent protochlorophyllide reductase subunit N  36.82 
 
 		 468 aa  300  4e-80  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.620591  normal  0.804646 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1530  light-independent protochlorophyllide reductase subunit N  36.41 
 
 		 465 aa  298  1e-79  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0646926 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_07951  light-independent protochlorophyllide reductase subunit N  36.41 
 
 		 418 aa  261  2e-68  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_05471  light-independent protochlorophyllide reductase subunit N  36.03 
 
 		 418 aa  258  2e-67  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1873  light-independent protochlorophyllide reductase subunit N  36.1 
 
 		 418 aa  253  3e-66  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0747  light-independent protochlorophyllide reductase subunit N  36.43 
 
 		 425 aa  253  6e-66  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.957633  normal  0.357282 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_05981  light-independent protochlorophyllide reductase subunit N  36.56 
 
 		 419 aa  252  8.000000000000001e-66  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.926498 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1619  light-independent protochlorophyllide reductase subunit N  36.5 
 
 		 416 aa  252  9.000000000000001e-66  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.43602  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1637  light-independent protochlorophyllide reductase subunit N  36.3 
 
 		 424 aa  250  4e-65  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6417  light-independent protochlorophyllide reductase subunit N  36.56 
 
 		 428 aa  249  5e-65  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.577987  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1313  light-independent protochlorophyllide reductase subunit N  36.63 
 
 		 428 aa  248  2e-64  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.29904 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0623  light-independent protochlorophyllide reductase subunit N  37.92 
 
 		 440 aa  244  9.999999999999999e-64  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.957648  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2042  light-independent protochlorophyllide reductase subunit N  36.54 
 
 		 426 aa  243  3.9999999999999997e-63  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.147701 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3534  light-independent protochlorophyllide reductase subunit N  34.88 
 
 		 427 aa  243  3.9999999999999997e-63  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3981  light-independent protochlorophyllide reductase subunit N  37.29 
 
 		 428 aa  243  5e-63  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.120682 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1730  light-independent protochlorophyllide reductase subunit N  36.32 
 
 		 429 aa  242  1e-62  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0285  light-independent protochlorophyllide reductase subunit N  34.47 
 
 		 428 aa  237  2e-61  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5283  light-independent protochlorophyllide reductase subunit N  38.15 
 
 		 422 aa  237  2e-61  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0161  light-independent protochlorophyllide reductase subunit N  34.64 
 
 		 427 aa  238  2e-61  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3736  light-independent protochlorophyllide reductase subunit N  35 
 
 		 428 aa  236  4e-61  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.255529  hitchhiker  0.00206765 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_06011  light-independent protochlorophyllide reductase subunit N  35.1 
 
 		 418 aa  236  6e-61  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1928  light-independent protochlorophyllide reductase subunit N  34.22 
 
 		 428 aa  235  1.0000000000000001e-60  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.472722  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4816  light-independent protochlorophyllide reductase subunit N  37.66 
 
 		 422 aa  235  1.0000000000000001e-60  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.596165  normal  0.0186172 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_05711  light-independent protochlorophyllide reductase subunit N  34.72 
 
 		 418 aa  235  1.0000000000000001e-60  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.847677  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3718  light-independent protochlorophyllide reductase subunit N  35.65 
 
 		 420 aa  234  2.0000000000000002e-60  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.834431  normal  0.0122696 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1848  light-independent protochlorophyllide reductase subunit N  37.32 
 
 		 424 aa  234  3e-60  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00937776 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0545  light-independent protochlorophyllide reductase subunit N  35.25 
 
 		 418 aa  234  3e-60  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1010  light-independent protochlorophyllide reductase subunit N  34.47 
 
 		 428 aa  232  7.000000000000001e-60  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.398895  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5361  light-independent protochlorophyllide reductase subunit N  36.68 
 
 		 422 aa  232  1e-59  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.752323  normal  0.24577 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_06091  light-independent protochlorophyllide reductase subunit N  34.78 
 
 		 418 aa  231  2e-59  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0605  hypothetical protein  26.41 
 
 		 447 aa  146  5e-34  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3744  chlorophyllide reductase subunit Y  31.94 
 
 		 422 aa  72  0.00000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000125918 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3257  chlorophyllide reductase subunit Y  31.08 
 
 		 422 aa  58.9  0.0000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0212884 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0280  NifH/frxC  21.74 
 
 		 728 aa  55.1  0.000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.359044  normal  0.513981 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1863  chlorophyllide reductase subunit Y  23.36 
 
 		 415 aa  54.3  0.000004  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2411  chlorophyllide reductase subunit Y  22.16 
 
 		 411 aa  52.8  0.00001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2035  chlorophyllide reductase subunit Y  20.24 
 
 		 412 aa  47.8  0.0004  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0059  nitrogenase  21.41 
 
 		 458 aa  47.4  0.0005  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.148206  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0093  Nitrogenase  23.98 
 
 		 511 aa  47  0.0007  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.061617 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2607  Nitrogenase  20.98 
 
 		 501 aa  45.8  0.001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0234589  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2082  oxidoreductase/nitrogenase, component 1  23.37 
 
 		 347 aa  46.2  0.001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2075  chlorophyllide reductase subunit Y  21.73 
 
 		 412 aa  45.8  0.001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.027568  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0324  chlorophyllide reductase subunit Y  19.83 
 
 		 412 aa  45.1  0.002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6416  light-independent protochlorophyllide reductase subunit B  23.71 
 
 		 517 aa  45.4  0.002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4029  oxidoreductase/nitrogenase, component 1  23.27 
 
 		 466 aa  43.9  0.005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.522703 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2273  nitrogenase associated protein N  21.89 
 
 		 446 aa  43.9  0.005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.1891 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>