79 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cag_0324 on replicon NC_007514
Organism: Chlorobium chlorochromatii CaD3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007512  Plut_0342  chlorophyllide reductase subunit Y  75.49 
 
 		 418 aa  640    Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.680799  normal  0.193791 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2035  chlorophyllide reductase subunit Y  80.49 
 
 		 412 aa  694    Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0324  chlorophyllide reductase subunit Y  100 
 
 		 412 aa  839    Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2075  chlorophyllide reductase subunit Y  80 
 
 		 412 aa  692    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.027568  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1863  chlorophyllide reductase subunit Y  75.91 
 
 		 415 aa  655    Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2411  chlorophyllide reductase subunit Y  83.17 
 
 		 411 aa  710    Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2062  chlorophyllide reductase subunit Y  74.08 
 
 		 422 aa  633  1e-180  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.730736  normal  0.0621767 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3744  chlorophyllide reductase subunit Y  48.78 
 
 		 422 aa  405  1.0000000000000001e-112  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000125918 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3257  chlorophyllide reductase subunit Y  48.54 
 
 		 422 aa  384  1e-105  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0212884 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0850  chlorophyllide reductase subunit Y  48.64 
 
 		 438 aa  379  1e-104  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.053677  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2817  chlorophyllide reductase subunit Y  37.53 
 
 		 509 aa  278  9e-74  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0774355  normal  0.429495 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2853  chlorophyllide reductase subunit Y  36.71 
 
 		 508 aa  269  5.9999999999999995e-71  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.922563 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2731  chlorophyllide reductase subunit Y  36.23 
 
 		 508 aa  269  8e-71  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2958  chlorophyllide reductase subunit Y  36.54 
 
 		 508 aa  268  1e-70  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.124011 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3698  chlorophyllide reductase subunit Y  34.78 
 
 		 516 aa  265  1e-69  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.465391  hitchhiker  0.00482074 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3518  bacteriachlorophyllide reductase iron protein subunit Y  34.46 
 
 		 534 aa  260  3e-68  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.292352 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1711  chlorophyllide reductase subunit Y  33.58 
 
 		 528 aa  259  5.0000000000000005e-68  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2053  chlorophyllide reductase subunit Y  34.95 
 
 		 513 aa  256  5e-67  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0326514 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4000  chlorophyllide reductase subunit Y  34.06 
 
 		 533 aa  256  5e-67  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.130756  hitchhiker  0.00873228 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2979  chlorophyllide reductase subunit Y  35.51 
 
 		 468 aa  255  1.0000000000000001e-66  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.927182  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6436  bacteriochlorophyllide reductase subunit  34.14 
 
 		 512 aa  254  1.0000000000000001e-66  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1294  chlorophyllide reductase subunit Y  33.5 
 
 		 535 aa  254  2.0000000000000002e-66  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0178  chlorophyllide reductase subunit Y  33.82 
 
 		 521 aa  254  2.0000000000000002e-66  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1609  chlorophyllide reductase subunit Y  34.52 
 
 		 455 aa  254  2.0000000000000002e-66  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3755  chlorophyllide reductase subunit Y  33.09 
 
 		 540 aa  251  1e-65  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00652475 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0261  chlorophyllide reductase, BchY subunit  34.14 
 
 		 502 aa  242  1e-62  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2035  chlorophyllide reductase subunit Y  34.14 
 
 		 500 aa  240  4e-62  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.201918  normal  0.260715 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1905  chlorophyllide reductase subunit Y  33.66 
 
 		 502 aa  237  2e-61  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.381986 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0747  light-independent protochlorophyllide reductase subunit N  24.4 
 
 		 425 aa  64.7  0.000000003  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.957633  normal  0.357282 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1619  light-independent protochlorophyllide reductase subunit N  22.33 
 
 		 416 aa  57.8  0.0000003  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.43602  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5360  light-independent protochlorophyllide reductase subunit B  27.08 
 
 		 530 aa  56.6  0.0000007  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0246686  normal  0.191395 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0545  light-independent protochlorophyllide reductase subunit N  22.26 
 
 		 418 aa  55.8  0.000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1146  nitrogenase molybdenum-iron protein beta chain  23.44 
 
 		 455 aa  55.1  0.000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.101192  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_06011  light-independent protochlorophyllide reductase subunit N  22.73 
 
 		 418 aa  54.7  0.000003  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1536  light-independent protochlorophyllide reductase subunit N  25.22 
 
 		 414 aa  54.3  0.000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.120446  hitchhiker  0.00259667 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1910  light-independent protochlorophyllide reductase subunit N  23.44 
 
 		 415 aa  54.3  0.000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.902944  hitchhiker  0.00090668 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_05711  light-independent protochlorophyllide reductase subunit N  22.16 
 
 		 418 aa  54.3  0.000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.847677  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_05471  light-independent protochlorophyllide reductase subunit N  21.05 
 
 		 418 aa  51.6  0.00003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0544  light-independent protochlorophyllide reductase subunit B  23.44 
 
 		 525 aa  51.6  0.00003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.846124  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0161  light-independent protochlorophyllide reductase subunit N  22.98 
 
 		 427 aa  50.8  0.00004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_06091  light-independent protochlorophyllide reductase subunit N  22.26 
 
 		 418 aa  50.8  0.00005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1730  light-independent protochlorophyllide reductase subunit N  22.88 
 
 		 429 aa  50.1  0.00008  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0324  light-independent protochlorophyllide reductase subunit N  23 
 
 		 420 aa  49.7  0.00009  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.754207  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5283  light-independent protochlorophyllide reductase subunit N  23.56 
 
 		 422 aa  49.7  0.0001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_07951  light-independent protochlorophyllide reductase subunit N  21.32 
 
 		 418 aa  49.7  0.0001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2273  nitrogenase associated protein N  23.89 
 
 		 446 aa  49.3  0.0001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.1891 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0622  light-independent protochlorophyllide reductase subunit B  25.98 
 
 		 546 aa  48.9  0.0002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_05981  light-independent protochlorophyllide reductase subunit N  20.66 
 
 		 419 aa  48.1  0.0002  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.926498 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2388  light-independent protochlorophyllide reductase subunit N  21.16 
 
 		 420 aa  48.5  0.0002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1355  Nitrogenase  25.46 
 
 		 505 aa  48.5  0.0002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0527028  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4816  light-independent protochlorophyllide reductase subunit N  23.6 
 
 		 422 aa  48.9  0.0002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.596165  normal  0.0186172 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0059  nitrogenase  21.1 
 
 		 458 aa  47  0.0006  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.148206  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4027  oxidoreductase/nitrogenase, component 1  25 
 
 		 463 aa  47  0.0006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.762261 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3719  light-independent protochlorophyllide reductase subunit B  24.31 
 
 		 506 aa  47  0.0006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.38806  hitchhiker  0.00209828 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1953  nitrogenase molybdenum-iron protein beta chain  20 
 
 		 460 aa  47  0.0006  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.119434  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2194  light-independent protochlorophyllide reductase subunit N  21.39 
 
 		 420 aa  47  0.0007  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1636  light-independent protochlorophyllide reductase subunit B  25.45 
 
 		 526 aa  46.6  0.0007  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1874  light-independent protochlorophyllide reductase subunit B  23.88 
 
 		 525 aa  46.6  0.0009  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3481  light-independent protochlorophyllide reductase subunit N  24.4 
 
 		 425 aa  45.8  0.001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1873  light-independent protochlorophyllide reductase subunit N  20.43 
 
 		 418 aa  46.6  0.001  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2815  nitrogenase  25.53 
 
 		 479 aa  45.8  0.001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5282  light-independent protochlorophyllide reductase subunit B  26.04 
 
 		 531 aa  46.2  0.001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_06081  light-independent protochlorophyllide reductase subunit B  23.08 
 
 		 526 aa  45.8  0.001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1430  nitrogenase  21.77 
 
 		 472 aa  45.4  0.002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1248  nitrogenase molybdenum-iron protein beta chain  20.13 
 
 		 485 aa  45.4  0.002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.36292  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2260  light-independent protochlorophyllide reductase subunit N  19.83 
 
 		 420 aa  45.1  0.002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.307743 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2259  light-independent protochlorophyllide reductase subunit B  27.46 
 
 		 532 aa  45.1  0.002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0202081  normal  0.326054 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0740  nitrogenase molybdenum-iron protein beta chain  20.73 
 
 		 459 aa  44.7  0.003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3981  light-independent protochlorophyllide reductase subunit N  22.09 
 
 		 428 aa  44.7  0.003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.120682 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_05991  light-independent protochlorophyllide reductase subunit B  23.62 
 
 		 525 aa  44.7  0.003  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.694309 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_05701  light-independent protochlorophyllide reductase subunit B  22.22 
 
 		 523 aa  44.7  0.003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1012  nitrogenase  24.21 
 
 		 454 aa  44.3  0.004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.430786  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1295  chlorophyllide reductase subunit Z  21.64 
 
 		 482 aa  44.3  0.004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1009  light-independent protochlorophyllide reductase subunit B  24.04 
 
 		 522 aa  44.3  0.005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3735  light-independent protochlorophyllide reductase subunit B  23.02 
 
 		 535 aa  43.9  0.006  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.334168  hitchhiker  0.00212976 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1815  light-independent protochlorophyllide reductase subunit N  19.88 
 
 		 427 aa  43.5  0.007  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2702  nitrogenase-related protein  30.28 
 
 		 431 aa  43.5  0.007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00973436  normal  0.117239 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2276  nitrogenase, subunit beta  21.91 
 
 		 461 aa  43.5  0.007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.665587  normal  0.115682 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0148  nitrogenase  23.23 
 
 		 459 aa  43.5  0.007  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>