71 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene P9303_07951 on replicon NC_008820
Organism: Prochlorococcus marinus str. MIT 9303



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007577  PMT9312_0545  light-independent protochlorophyllide reductase subunit N  72.42 
 
 		 418 aa  635    Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1873  light-independent protochlorophyllide reductase subunit N  76.5 
 
 		 418 aa  678    Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_06011  light-independent protochlorophyllide reductase subunit N  74.34 
 
 		 418 aa  649    Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_05981  light-independent protochlorophyllide reductase subunit N  77.62 
 
 		 419 aa  679    Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.926498 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_07951  light-independent protochlorophyllide reductase subunit N  100 
 
 		 418 aa  846    Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0747  light-independent protochlorophyllide reductase subunit N  78.83 
 
 		 425 aa  659    Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.957633  normal  0.357282 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_05471  light-independent protochlorophyllide reductase subunit N  79.43 
 
 		 418 aa  697    Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1619  light-independent protochlorophyllide reductase subunit N  78.4 
 
 		 416 aa  660    Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.43602  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_05711  light-independent protochlorophyllide reductase subunit N  72.9 
 
 		 418 aa  640    Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.847677  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_06091  light-independent protochlorophyllide reductase subunit N  71.94 
 
 		 418 aa  630  1e-179  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6417  light-independent protochlorophyllide reductase subunit N  67.65 
 
 		 428 aa  551  1e-155  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.577987  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1313  light-independent protochlorophyllide reductase subunit N  66.33 
 
 		 428 aa  547  1e-154  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.29904 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3981  light-independent protochlorophyllide reductase subunit N  64.37 
 
 		 428 aa  540  9.999999999999999e-153  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.120682 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1730  light-independent protochlorophyllide reductase subunit N  64.13 
 
 		 429 aa  540  9.999999999999999e-153  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2042  light-independent protochlorophyllide reductase subunit N  64.55 
 
 		 426 aa  529  1e-149  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.147701 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1848  light-independent protochlorophyllide reductase subunit N  63.2 
 
 		 424 aa  521  1e-147  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00937776 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3736  light-independent protochlorophyllide reductase subunit N  64.13 
 
 		 428 aa  521  1e-147  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.255529  hitchhiker  0.00206765 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5283  light-independent protochlorophyllide reductase subunit N  62.87 
 
 		 422 aa  520  1e-146  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4816  light-independent protochlorophyllide reductase subunit N  62.47 
 
 		 422 aa  515  1.0000000000000001e-145  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.596165  normal  0.0186172 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3718  light-independent protochlorophyllide reductase subunit N  65.51 
 
 		 420 aa  514  1.0000000000000001e-145  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.834431  normal  0.0122696 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5361  light-independent protochlorophyllide reductase subunit N  62.62 
 
 		 422 aa  511  1e-144  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.752323  normal  0.24577 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1637  light-independent protochlorophyllide reductase subunit N  62.01 
 
 		 424 aa  505  9.999999999999999e-143  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0623  light-independent protochlorophyllide reductase subunit N  62.47 
 
 		 440 aa  500  1e-140  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.957648  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0161  light-independent protochlorophyllide reductase subunit N  59.41 
 
 		 427 aa  493  9.999999999999999e-139  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1928  light-independent protochlorophyllide reductase subunit N  59.12 
 
 		 428 aa  477  1e-133  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.472722  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0285  light-independent protochlorophyllide reductase subunit N  59.12 
 
 		 428 aa  477  1e-133  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3534  light-independent protochlorophyllide reductase subunit N  58.44 
 
 		 427 aa  474  1e-132  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1010  light-independent protochlorophyllide reductase subunit N  58.58 
 
 		 428 aa  471  1e-132  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.398895  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1910  light-independent protochlorophyllide reductase subunit N  39.52 
 
 		 415 aa  288  2e-76  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.902944  hitchhiker  0.00090668 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1536  light-independent protochlorophyllide reductase subunit N  38.46 
 
 		 414 aa  275  2.0000000000000002e-72  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.120446  hitchhiker  0.00259667 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0817  light-independent protochlorophyllide reductase subunit N  34.23 
 
 		 466 aa  269  5.9999999999999995e-71  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0125392  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0789  light-independent protochlorophyllide reductase subunit N  34.23 
 
 		 466 aa  268  8.999999999999999e-71  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1530  light-independent protochlorophyllide reductase subunit N  33.92 
 
 		 465 aa  266  4e-70  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0646926 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2304  light-independent protochlorophyllide reductase subunit N  34.52 
 
 		 467 aa  266  5e-70  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2373  light-independent protochlorophyllide reductase subunit N  34 
 
 		 466 aa  265  1e-69  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2330  light-independent protochlorophyllide reductase subunit N  34.08 
 
 		 467 aa  263  4e-69  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2260  light-independent protochlorophyllide reductase subunit N  36.41 
 
 		 420 aa  261  2e-68  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.307743 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3941  light-independent protochlorophyllide reductase subunit N  34.07 
 
 		 468 aa  261  2e-68  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.620591  normal  0.804646 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0215  light-independent protochlorophyllide reductase subunit N  37.05 
 
 		 420 aa  261  2e-68  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2388  light-independent protochlorophyllide reductase subunit N  36.45 
 
 		 420 aa  259  6e-68  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1420  light-independent protochlorophyllide reductase subunit N  33.56 
 
 		 466 aa  257  2e-67  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.172263  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1815  light-independent protochlorophyllide reductase subunit N  35.77 
 
 		 427 aa  256  4e-67  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2194  light-independent protochlorophyllide reductase subunit N  36.54 
 
 		 420 aa  255  9e-67  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0324  light-independent protochlorophyllide reductase subunit N  35.35 
 
 		 420 aa  255  1.0000000000000001e-66  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.754207  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3481  light-independent protochlorophyllide reductase subunit N  35.27 
 
 		 425 aa  253  3e-66  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2029  light-independent protochlorophyllide reductase subunit N  35.9 
 
 		 420 aa  248  1e-64  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.0292807 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0605  hypothetical protein  32.76 
 
 		 447 aa  111  3e-23  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2703  nitrogen fixation protein NifH/NifE  24.48 
 
 		 746 aa  61.6  0.00000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.15509 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1863  chlorophyllide reductase subunit Y  23.24 
 
 		 415 aa  58.5  0.0000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3027  bifunctional nitrogenase molybdenum-cofactor biosynthesis protein NifE/NifN  24.29 
 
 		 917 aa  57.8  0.0000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2411  chlorophyllide reductase subunit Y  22.79 
 
 		 411 aa  55.8  0.000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2035  chlorophyllide reductase subunit Y  23.55 
 
 		 412 aa  55.1  0.000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2062  chlorophyllide reductase subunit Y  23.17 
 
 		 422 aa  53.9  0.000005  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.730736  normal  0.0621767 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3698  chlorophyllide reductase subunit Y  24.73 
 
 		 516 aa  52.4  0.00002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.465391  hitchhiker  0.00482074 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0342  chlorophyllide reductase subunit Y  21.87 
 
 		 418 aa  51.6  0.00003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.680799  normal  0.193791 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3206  bifunctional nitrogenase molybdenum-cofactor biosynthesis protein NifE/NifN  24.42 
 
 		 918 aa  50.1  0.00008  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0404  NifH/frxC-family protein  21.77 
 
 		 731 aa  48.9  0.0001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.394931 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0324  chlorophyllide reductase subunit Y  21.32 
 
 		 412 aa  49.7  0.0001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0325  light-independent protochlorophyllide reductase subunit B  24.93 
 
 		 535 aa  47.8  0.0003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00842285  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6436  bacteriochlorophyllide reductase subunit  23.17 
 
 		 512 aa  47.8  0.0004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2075  chlorophyllide reductase subunit Y  21.81 
 
 		 412 aa  47.4  0.0004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.027568  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0280  NifH/frxC  23.73 
 
 		 728 aa  47.8  0.0004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.359044  normal  0.513981 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1427  nitrogenase  14.57 
 
 		 469 aa  47.4  0.0005  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3744  chlorophyllide reductase subunit Y  21.84 
 
 		 422 aa  45.8  0.001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000125918 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1905  chlorophyllide reductase subunit Y  26.21 
 
 		 502 aa  45.4  0.002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.381986 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0261  chlorophyllide reductase, BchY subunit  24.63 
 
 		 502 aa  45.1  0.002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_48970  Fe-only nitrogenase, beta subunit  20.99 
 
 		 462 aa  44.3  0.004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.12057  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2273  nitrogenase associated protein N  19.38 
 
 		 446 aa  44.3  0.004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.1891 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0148  nitrogenase  23.5 
 
 		 459 aa  43.9  0.006  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1817  oxidoreductase/nitrogenase component 1  26.83 
 
 		 410 aa  43.5  0.006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0178  chlorophyllide reductase subunit Y  24.14 
 
 		 521 aa  43.1  0.01  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>