66 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Syncc9902_1619 on replicon NC_007513
Organism: Synechococcus sp. CC9902



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007335  PMN2A_1873  light-independent protochlorophyllide reductase subunit N  75.37 
 
 		 418 aa  647    Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0747  light-independent protochlorophyllide reductase subunit N  85.61 
 
 		 425 aa  706    Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.957633  normal  0.357282 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_05981  light-independent protochlorophyllide reductase subunit N  75.85 
 
 		 419 aa  651    Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.926498 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1619  light-independent protochlorophyllide reductase subunit N  100 
 
 		 416 aa  835    Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.43602  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_07951  light-independent protochlorophyllide reductase subunit N  78.4 
 
 		 418 aa  660    Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_05471  light-independent protochlorophyllide reductase subunit N  75.85 
 
 		 418 aa  650    Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_06011  light-independent protochlorophyllide reductase subunit N  72.02 
 
 		 418 aa  622  1e-177  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_05711  light-independent protochlorophyllide reductase subunit N  71.29 
 
 		 418 aa  619  1e-176  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.847677  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0545  light-independent protochlorophyllide reductase subunit N  70.07 
 
 		 418 aa  608  1e-173  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_06091  light-independent protochlorophyllide reductase subunit N  70.73 
 
 		 418 aa  608  1e-173  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6417  light-independent protochlorophyllide reductase subunit N  66.01 
 
 		 428 aa  536  1e-151  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.577987  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3981  light-independent protochlorophyllide reductase subunit N  63.55 
 
 		 428 aa  527  1e-148  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.120682 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5361  light-independent protochlorophyllide reductase subunit N  64.96 
 
 		 422 aa  526  1e-148  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.752323  normal  0.24577 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1313  light-independent protochlorophyllide reductase subunit N  64.53 
 
 		 428 aa  525  1e-148  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.29904 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1848  light-independent protochlorophyllide reductase subunit N  64.49 
 
 		 424 aa  520  1e-146  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00937776 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3718  light-independent protochlorophyllide reductase subunit N  65.94 
 
 		 420 aa  518  1e-146  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.834431  normal  0.0122696 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5283  light-independent protochlorophyllide reductase subunit N  63.08 
 
 		 422 aa  515  1.0000000000000001e-145  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3736  light-independent protochlorophyllide reductase subunit N  65.02 
 
 		 428 aa  517  1.0000000000000001e-145  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.255529  hitchhiker  0.00206765 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1730  light-independent protochlorophyllide reductase subunit N  63.05 
 
 		 429 aa  518  1.0000000000000001e-145  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2042  light-independent protochlorophyllide reductase subunit N  64.2 
 
 		 426 aa  512  1e-144  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.147701 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1637  light-independent protochlorophyllide reductase subunit N  64.37 
 
 		 424 aa  509  1e-143  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0623  light-independent protochlorophyllide reductase subunit N  64.95 
 
 		 440 aa  508  1e-143  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.957648  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4816  light-independent protochlorophyllide reductase subunit N  62.59 
 
 		 422 aa  509  1e-143  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.596165  normal  0.0186172 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0161  light-independent protochlorophyllide reductase subunit N  58.19 
 
 		 427 aa  489  1e-137  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1010  light-independent protochlorophyllide reductase subunit N  60.99 
 
 		 428 aa  485  1e-136  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.398895  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3534  light-independent protochlorophyllide reductase subunit N  59.01 
 
 		 427 aa  480  1e-134  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0285  light-independent protochlorophyllide reductase subunit N  60.74 
 
 		 428 aa  479  1e-134  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1928  light-independent protochlorophyllide reductase subunit N  60.74 
 
 		 428 aa  480  1e-134  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.472722  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1910  light-independent protochlorophyllide reductase subunit N  40.14 
 
 		 415 aa  289  8e-77  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.902944  hitchhiker  0.00090668 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1536  light-independent protochlorophyllide reductase subunit N  40.24 
 
 		 414 aa  284  2.0000000000000002e-75  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.120446  hitchhiker  0.00259667 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3481  light-independent protochlorophyllide reductase subunit N  37.77 
 
 		 425 aa  273  6e-72  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2373  light-independent protochlorophyllide reductase subunit N  33.93 
 
 		 466 aa  263  4.999999999999999e-69  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2330  light-independent protochlorophyllide reductase subunit N  35.23 
 
 		 467 aa  261  1e-68  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0817  light-independent protochlorophyllide reductase subunit N  34.14 
 
 		 466 aa  261  2e-68  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0125392  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1420  light-independent protochlorophyllide reductase subunit N  34.83 
 
 		 466 aa  260  3e-68  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.172263  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0789  light-independent protochlorophyllide reductase subunit N  34.14 
 
 		 466 aa  260  3e-68  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0215  light-independent protochlorophyllide reductase subunit N  37.14 
 
 		 420 aa  258  1e-67  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2304  light-independent protochlorophyllide reductase subunit N  34.3 
 
 		 467 aa  257  3e-67  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3941  light-independent protochlorophyllide reductase subunit N  35.1 
 
 		 468 aa  255  9e-67  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.620591  normal  0.804646 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2388  light-independent protochlorophyllide reductase subunit N  36.65 
 
 		 420 aa  252  8.000000000000001e-66  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2260  light-independent protochlorophyllide reductase subunit N  36.5 
 
 		 420 aa  252  9.000000000000001e-66  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.307743 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1530  light-independent protochlorophyllide reductase subunit N  32.81 
 
 		 465 aa  250  3e-65  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0646926 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0324  light-independent protochlorophyllide reductase subunit N  36.01 
 
 		 420 aa  249  9e-65  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.754207  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2029  light-independent protochlorophyllide reductase subunit N  36.25 
 
 		 420 aa  247  3e-64  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.0292807 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2194  light-independent protochlorophyllide reductase subunit N  35.95 
 
 		 420 aa  247  3e-64  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1815  light-independent protochlorophyllide reductase subunit N  35.92 
 
 		 427 aa  246  6.999999999999999e-64  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0605  hypothetical protein  26.81 
 
 		 447 aa  103  5e-21  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3744  chlorophyllide reductase subunit Y  25.58 
 
 		 422 aa  64.3  0.000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000125918 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1863  chlorophyllide reductase subunit Y  24.1 
 
 		 415 aa  64.3  0.000000004  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1817  oxidoreductase/nitrogenase component 1  26.53 
 
 		 410 aa  60.1  0.00000006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2411  chlorophyllide reductase subunit Y  23.65 
 
 		 411 aa  59.7  0.00000009  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0324  chlorophyllide reductase subunit Y  22.33 
 
 		 412 aa  57.8  0.0000003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2035  chlorophyllide reductase subunit Y  24.31 
 
 		 412 aa  57.8  0.0000004  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1427  nitrogenase  17.59 
 
 		 469 aa  55.8  0.000001  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2075  chlorophyllide reductase subunit Y  22.95 
 
 		 412 aa  54.7  0.000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.027568  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2062  chlorophyllide reductase subunit Y  24.19 
 
 		 422 aa  53.5  0.000007  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.730736  normal  0.0621767 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4029  oxidoreductase/nitrogenase, component 1  22.16 
 
 		 466 aa  51.6  0.00002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.522703 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3257  chlorophyllide reductase subunit Y  25 
 
 		 422 aa  52  0.00002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0212884 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2703  nitrogen fixation protein NifH/NifE  23.17 
 
 		 746 aa  50.4  0.00005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.15509 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6436  bacteriochlorophyllide reductase subunit  25.2 
 
 		 512 aa  48.9  0.0001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0280  NifH/frxC  22.3 
 
 		 728 aa  48.9  0.0002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.359044  normal  0.513981 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0342  chlorophyllide reductase subunit Y  21.97 
 
 		 418 aa  47.8  0.0004  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.680799  normal  0.193791 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2053  chlorophyllide reductase subunit Y  25.19 
 
 		 513 aa  45.4  0.002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0326514 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3027  bifunctional nitrogenase molybdenum-cofactor biosynthesis protein NifE/NifN  23.45 
 
 		 917 aa  43.9  0.005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3698  chlorophyllide reductase subunit Y  25.81 
 
 		 516 aa  43.1  0.008  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.465391  hitchhiker  0.00482074 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2607  Nitrogenase  26.61 
 
 		 501 aa  43.1  0.009  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0234589  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>