57 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rsph17025_1010 on replicon NC_009428
Organism: Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009952  Dshi_3534  light-independent protochlorophyllide reductase subunit N  81.38 
 
 		 427 aa  654    Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0285  light-independent protochlorophyllide reductase subunit N  93.46 
 
 		 428 aa  775    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1010  light-independent protochlorophyllide reductase subunit N  100 
 
 		 428 aa  854    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.398895  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1928  light-independent protochlorophyllide reductase subunit N  93.22 
 
 		 428 aa  773    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.472722  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0161  light-independent protochlorophyllide reductase subunit N  80.95 
 
 		 427 aa  668    Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1313  light-independent protochlorophyllide reductase subunit N  66.58 
 
 		 428 aa  536  1e-151  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.29904 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3981  light-independent protochlorophyllide reductase subunit N  65.14 
 
 		 428 aa  535  1e-151  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.120682 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5361  light-independent protochlorophyllide reductase subunit N  66.67 
 
 		 422 aa  535  1e-151  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.752323  normal  0.24577 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1730  light-independent protochlorophyllide reductase subunit N  66.67 
 
 		 429 aa  536  1e-151  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5283  light-independent protochlorophyllide reductase subunit N  67.47 
 
 		 422 aa  537  1e-151  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2042  light-independent protochlorophyllide reductase subunit N  65.54 
 
 		 426 aa  531  1e-150  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.147701 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0623  light-independent protochlorophyllide reductase subunit N  65.64 
 
 		 440 aa  528  1e-149  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.957648  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4816  light-independent protochlorophyllide reductase subunit N  67.15 
 
 		 422 aa  530  1e-149  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.596165  normal  0.0186172 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3736  light-independent protochlorophyllide reductase subunit N  67.16 
 
 		 428 aa  529  1e-149  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.255529  hitchhiker  0.00206765 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3718  light-independent protochlorophyllide reductase subunit N  68.26 
 
 		 420 aa  526  1e-148  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.834431  normal  0.0122696 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1848  light-independent protochlorophyllide reductase subunit N  66.11 
 
 		 424 aa  521  1e-147  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00937776 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6417  light-independent protochlorophyllide reductase subunit N  67.65 
 
 		 428 aa  518  1.0000000000000001e-145  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.577987  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0747  light-independent protochlorophyllide reductase subunit N  61.82 
 
 		 425 aa  495  1e-139  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.957633  normal  0.357282 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_05471  light-independent protochlorophyllide reductase subunit N  59.11 
 
 		 418 aa  493  9.999999999999999e-139  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1619  light-independent protochlorophyllide reductase subunit N  60.99 
 
 		 416 aa  494  9.999999999999999e-139  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.43602  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_05981  light-independent protochlorophyllide reductase subunit N  57.64 
 
 		 419 aa  489  1e-137  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.926498 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0545  light-independent protochlorophyllide reductase subunit N  59.55 
 
 		 418 aa  489  1e-137  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1873  light-independent protochlorophyllide reductase subunit N  58.13 
 
 		 418 aa  491  1e-137  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_06011  light-independent protochlorophyllide reductase subunit N  58.06 
 
 		 418 aa  481  1e-135  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_07951  light-independent protochlorophyllide reductase subunit N  58.58 
 
 		 418 aa  482  1e-135  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_06091  light-independent protochlorophyllide reductase subunit N  58.37 
 
 		 418 aa  481  1e-134  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_05711  light-independent protochlorophyllide reductase subunit N  58.06 
 
 		 418 aa  479  1e-134  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.847677  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1637  light-independent protochlorophyllide reductase subunit N  60.73 
 
 		 424 aa  475  1e-133  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3941  light-independent protochlorophyllide reductase subunit N  36.3 
 
 		 468 aa  261  2e-68  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.620591  normal  0.804646 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2330  light-independent protochlorophyllide reductase subunit N  35.71 
 
 		 467 aa  257  2e-67  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2373  light-independent protochlorophyllide reductase subunit N  34.89 
 
 		 466 aa  258  2e-67  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1530  light-independent protochlorophyllide reductase subunit N  35.04 
 
 		 465 aa  256  4e-67  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0646926 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2304  light-independent protochlorophyllide reductase subunit N  35.49 
 
 		 467 aa  254  2.0000000000000002e-66  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0817  light-independent protochlorophyllide reductase subunit N  34.3 
 
 		 466 aa  253  3e-66  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0125392  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0789  light-independent protochlorophyllide reductase subunit N  34.3 
 
 		 466 aa  253  5.000000000000001e-66  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1910  light-independent protochlorophyllide reductase subunit N  36.41 
 
 		 415 aa  253  7e-66  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.902944  hitchhiker  0.00090668 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2194  light-independent protochlorophyllide reductase subunit N  36.27 
 
 		 420 aa  250  4e-65  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0215  light-independent protochlorophyllide reductase subunit N  35.84 
 
 		 420 aa  248  1e-64  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1420  light-independent protochlorophyllide reductase subunit N  34 
 
 		 466 aa  245  9.999999999999999e-64  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.172263  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1536  light-independent protochlorophyllide reductase subunit N  36.8 
 
 		 414 aa  244  1.9999999999999999e-63  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.120446  hitchhiker  0.00259667 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2388  light-independent protochlorophyllide reductase subunit N  35.42 
 
 		 420 aa  243  6e-63  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0324  light-independent protochlorophyllide reductase subunit N  35.04 
 
 		 420 aa  241  2e-62  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.754207  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1815  light-independent protochlorophyllide reductase subunit N  34.47 
 
 		 427 aa  241  2e-62  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2029  light-independent protochlorophyllide reductase subunit N  35.54 
 
 		 420 aa  239  5e-62  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.0292807 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2260  light-independent protochlorophyllide reductase subunit N  35.71 
 
 		 420 aa  238  1e-61  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.307743 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3481  light-independent protochlorophyllide reductase subunit N  34.38 
 
 		 425 aa  233  4.0000000000000004e-60  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0605  hypothetical protein  31.63 
 
 		 447 aa  82.8  0.00000000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0773  nitrogenase  28.73 
 
 		 487 aa  47.8  0.0004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1817  oxidoreductase/nitrogenase component 1  25.95 
 
 		 410 aa  47.8  0.0004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1863  chlorophyllide reductase subunit Y  21.73 
 
 		 415 aa  45.8  0.001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2062  chlorophyllide reductase subunit Y  22.12 
 
 		 422 aa  45.8  0.001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.730736  normal  0.0621767 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2607  Nitrogenase  28 
 
 		 501 aa  45.4  0.002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0234589  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0216  light-independent protochlorophyllide reductase subunit B  26.67 
 
 		 525 aa  45.1  0.002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0404  NifH/frxC-family protein  23.69 
 
 		 731 aa  44.7  0.004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.394931 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2075  chlorophyllide reductase subunit Y  21.45 
 
 		 412 aa  43.9  0.006  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.027568  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0794  nitrogenase  25.83 
 
 		 511 aa  43.5  0.006  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2193  light-independent protochlorophyllide reductase subunit B  31.28 
 
 		 535 aa  43.1  0.01  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>