69 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cyan7425_3941 on replicon NC_011884
Organism: Cyanothece sp. PCC 7425



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014248  Aazo_2304  light-independent protochlorophyllide reductase subunit N  85.93 
 
 		 467 aa  833    'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2330  light-independent protochlorophyllide reductase subunit N  87.26 
 
 		 467 aa  844    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0817  light-independent protochlorophyllide reductase subunit N  85.9 
 
 		 466 aa  845    Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0125392  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3941  light-independent protochlorophyllide reductase subunit N  100 
 
 		 468 aa  970    Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.620591  normal  0.804646 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1420  light-independent protochlorophyllide reductase subunit N  79.87 
 
 		 466 aa  771    Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.172263  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1530  light-independent protochlorophyllide reductase subunit N  86.55 
 
 		 465 aa  842    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0646926 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0789  light-independent protochlorophyllide reductase subunit N  85.68 
 
 		 466 aa  843    Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2373  light-independent protochlorophyllide reductase subunit N  86.42 
 
 		 466 aa  847    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1910  light-independent protochlorophyllide reductase subunit N  40 
 
 		 415 aa  327  3e-88  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.902944  hitchhiker  0.00090668 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1536  light-independent protochlorophyllide reductase subunit N  39.32 
 
 		 414 aa  320  5e-86  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.120446  hitchhiker  0.00259667 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3481  light-independent protochlorophyllide reductase subunit N  38.55 
 
 		 425 aa  316  5e-85  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0324  light-independent protochlorophyllide reductase subunit N  37.07 
 
 		 420 aa  303  5.000000000000001e-81  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.754207  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2029  light-independent protochlorophyllide reductase subunit N  38.19 
 
 		 420 aa  301  2e-80  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.0292807 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2388  light-independent protochlorophyllide reductase subunit N  37.73 
 
 		 420 aa  301  2e-80  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2260  light-independent protochlorophyllide reductase subunit N  36.82 
 
 		 420 aa  300  5e-80  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.307743 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2194  light-independent protochlorophyllide reductase subunit N  37.27 
 
 		 420 aa  298  1e-79  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0215  light-independent protochlorophyllide reductase subunit N  37.27 
 
 		 420 aa  291  1e-77  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1815  light-independent protochlorophyllide reductase subunit N  36.11 
 
 		 427 aa  289  8e-77  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0747  light-independent protochlorophyllide reductase subunit N  34.59 
 
 		 425 aa  263  6.999999999999999e-69  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.957633  normal  0.357282 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_07951  light-independent protochlorophyllide reductase subunit N  34.07 
 
 		 418 aa  261  3e-68  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1010  light-independent protochlorophyllide reductase subunit N  36.08 
 
 		 428 aa  256  9e-67  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.398895  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1619  light-independent protochlorophyllide reductase subunit N  35.1 
 
 		 416 aa  255  1.0000000000000001e-66  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.43602  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0623  light-independent protochlorophyllide reductase subunit N  37.25 
 
 		 440 aa  253  5.000000000000001e-66  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.957648  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0161  light-independent protochlorophyllide reductase subunit N  36 
 
 		 427 aa  252  8.000000000000001e-66  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_05471  light-independent protochlorophyllide reductase subunit N  34.15 
 
 		 418 aa  252  1e-65  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6417  light-independent protochlorophyllide reductase subunit N  36.1 
 
 		 428 aa  252  1e-65  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.577987  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_05981  light-independent protochlorophyllide reductase subunit N  33.56 
 
 		 419 aa  251  1e-65  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.926498 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1873  light-independent protochlorophyllide reductase subunit N  33.78 
 
 		 418 aa  250  3e-65  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_06091  light-independent protochlorophyllide reductase subunit N  34.59 
 
 		 418 aa  249  5e-65  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0545  light-independent protochlorophyllide reductase subunit N  35.2 
 
 		 418 aa  249  6e-65  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2042  light-independent protochlorophyllide reductase subunit N  34.45 
 
 		 426 aa  249  8e-65  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.147701 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0285  light-independent protochlorophyllide reductase subunit N  35.41 
 
 		 428 aa  248  1e-64  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1928  light-independent protochlorophyllide reductase subunit N  35.41 
 
 		 428 aa  248  1e-64  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.472722  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_06011  light-independent protochlorophyllide reductase subunit N  33.56 
 
 		 418 aa  247  3e-64  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1848  light-independent protochlorophyllide reductase subunit N  33.93 
 
 		 424 aa  246  6.999999999999999e-64  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00937776 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_05711  light-independent protochlorophyllide reductase subunit N  33.33 
 
 		 418 aa  245  9.999999999999999e-64  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.847677  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5361  light-independent protochlorophyllide reductase subunit N  33.56 
 
 		 422 aa  244  1.9999999999999999e-63  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.752323  normal  0.24577 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5283  light-independent protochlorophyllide reductase subunit N  33.7 
 
 		 422 aa  244  1.9999999999999999e-63  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1730  light-independent protochlorophyllide reductase subunit N  33.04 
 
 		 429 aa  244  3e-63  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1637  light-independent protochlorophyllide reductase subunit N  34.68 
 
 		 424 aa  243  3.9999999999999997e-63  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1313  light-independent protochlorophyllide reductase subunit N  33.48 
 
 		 428 aa  243  6e-63  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.29904 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3534  light-independent protochlorophyllide reductase subunit N  34.52 
 
 		 427 aa  240  4e-62  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4816  light-independent protochlorophyllide reductase subunit N  33.85 
 
 		 422 aa  240  4e-62  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.596165  normal  0.0186172 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3981  light-independent protochlorophyllide reductase subunit N  32.89 
 
 		 428 aa  237  4e-61  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.120682 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3718  light-independent protochlorophyllide reductase subunit N  33.19 
 
 		 420 aa  236  7e-61  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.834431  normal  0.0122696 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3736  light-independent protochlorophyllide reductase subunit N  33.11 
 
 		 428 aa  233  4.0000000000000004e-60  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.255529  hitchhiker  0.00206765 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0605  hypothetical protein  34.2 
 
 		 447 aa  137  3.0000000000000003e-31  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0178  chlorophyllide reductase subunit Y  25.23 
 
 		 521 aa  54.7  0.000004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3518  bacteriachlorophyllide reductase iron protein subunit Y  26.77 
 
 		 534 aa  54.3  0.000005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.292352 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2035  chlorophyllide reductase subunit Y  26.05 
 
 		 500 aa  52.8  0.00001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.201918  normal  0.260715 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1905  chlorophyllide reductase subunit Y  26.17 
 
 		 502 aa  51.6  0.00003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.381986 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1711  chlorophyllide reductase subunit Y  26.11 
 
 		 528 aa  50.4  0.00006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2958  chlorophyllide reductase subunit Y  24.8 
 
 		 508 aa  50.4  0.00007  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.124011 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6436  bacteriochlorophyllide reductase subunit  22.76 
 
 		 512 aa  50.1  0.00009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4029  oxidoreductase/nitrogenase, component 1  21 
 
 		 466 aa  49.7  0.0001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.522703 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3755  chlorophyllide reductase subunit Y  26.7 
 
 		 540 aa  49.3  0.0002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00652475 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0261  chlorophyllide reductase, BchY subunit  25.7 
 
 		 502 aa  48.9  0.0002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1294  chlorophyllide reductase subunit Y  25.62 
 
 		 535 aa  49.3  0.0002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2853  chlorophyllide reductase subunit Y  26.37 
 
 		 508 aa  48.5  0.0003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.922563 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0794  nitrogenase  22.32 
 
 		 511 aa  48.1  0.0003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4000  chlorophyllide reductase subunit Y  24.63 
 
 		 533 aa  47.4  0.0006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.130756  hitchhiker  0.00873228 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2731  chlorophyllide reductase subunit Y  25.37 
 
 		 508 aa  46.6  0.001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2817  chlorophyllide reductase subunit Y  25.89 
 
 		 509 aa  46.2  0.001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0774355  normal  0.429495 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2607  Nitrogenase  25 
 
 		 501 aa  44.7  0.003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0234589  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2276  nitrogenase, subunit beta  22.56 
 
 		 461 aa  44.7  0.004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.665587  normal  0.115682 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1631  nitrogenase molybdenum-iron protein beta chain  24.44 
 
 		 460 aa  44.3  0.005  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  decreased coverage  0.0000877058  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2908  Nitrogenase  24.44 
 
 		 502 aa  43.9  0.006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0557  nitrogenase molybdenum-iron protein beta chain  22.4 
 
 		 455 aa  43.9  0.006  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0151336  normal  0.228475 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0850  chlorophyllide reductase subunit Y  24.07 
 
 		 438 aa  43.5  0.008  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.053677  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>