68 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plut_0215 on replicon NC_007512
Organism: Chlorobium luteolum DSM 273



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011060  Ppha_0324  light-independent protochlorophyllide reductase subunit N  85.48 
 
 		 420 aa  758    Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.754207  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2260  light-independent protochlorophyllide reductase subunit N  80.95 
 
 		 420 aa  717    Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.307743 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2194  light-independent protochlorophyllide reductase subunit N  87.62 
 
 		 420 aa  779    Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2388  light-independent protochlorophyllide reductase subunit N  88.1 
 
 		 420 aa  786    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1815  light-independent protochlorophyllide reductase subunit N  85.02 
 
 		 427 aa  747    Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0215  light-independent protochlorophyllide reductase subunit N  100 
 
 		 420 aa  862    Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2029  light-independent protochlorophyllide reductase subunit N  79.52 
 
 		 420 aa  716    Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.0292807 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1910  light-independent protochlorophyllide reductase subunit N  66.1 
 
 		 415 aa  581  1.0000000000000001e-165  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.902944  hitchhiker  0.00090668 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1536  light-independent protochlorophyllide reductase subunit N  64.88 
 
 		 414 aa  571  1.0000000000000001e-162  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.120446  hitchhiker  0.00259667 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3481  light-independent protochlorophyllide reductase subunit N  62.2 
 
 		 425 aa  551  1e-156  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2304  light-independent protochlorophyllide reductase subunit N  36.7 
 
 		 467 aa  300  2e-80  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2373  light-independent protochlorophyllide reductase subunit N  36.78 
 
 		 466 aa  300  2e-80  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0817  light-independent protochlorophyllide reductase subunit N  36.16 
 
 		 466 aa  300  4e-80  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0125392  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1420  light-independent protochlorophyllide reductase subunit N  35.82 
 
 		 466 aa  300  4e-80  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.172263  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0789  light-independent protochlorophyllide reductase subunit N  36.16 
 
 		 466 aa  300  4e-80  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2330  light-independent protochlorophyllide reductase subunit N  36.98 
 
 		 467 aa  296  6e-79  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1530  light-independent protochlorophyllide reductase subunit N  36.82 
 
 		 465 aa  294  2e-78  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0646926 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3941  light-independent protochlorophyllide reductase subunit N  37.27 
 
 		 468 aa  291  1e-77  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.620591  normal  0.804646 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0623  light-independent protochlorophyllide reductase subunit N  40.29 
 
 		 440 aa  268  8.999999999999999e-71  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.957648  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6417  light-independent protochlorophyllide reductase subunit N  38.78 
 
 		 428 aa  266  7e-70  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.577987  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2042  light-independent protochlorophyllide reductase subunit N  38.94 
 
 		 426 aa  262  1e-68  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.147701 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_07951  light-independent protochlorophyllide reductase subunit N  37.05 
 
 		 418 aa  261  2e-68  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1619  light-independent protochlorophyllide reductase subunit N  37.14 
 
 		 416 aa  258  1e-67  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.43602  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1313  light-independent protochlorophyllide reductase subunit N  36.86 
 
 		 428 aa  256  6e-67  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.29904 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1848  light-independent protochlorophyllide reductase subunit N  39.13 
 
 		 424 aa  256  7e-67  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00937776 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3981  light-independent protochlorophyllide reductase subunit N  36.34 
 
 		 428 aa  254  2.0000000000000002e-66  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.120682 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3534  light-independent protochlorophyllide reductase subunit N  35.77 
 
 		 427 aa  254  2.0000000000000002e-66  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5283  light-independent protochlorophyllide reductase subunit N  38.93 
 
 		 422 aa  252  9.000000000000001e-66  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0161  light-independent protochlorophyllide reductase subunit N  35.04 
 
 		 427 aa  251  1e-65  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1730  light-independent protochlorophyllide reductase subunit N  36.41 
 
 		 429 aa  252  1e-65  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4816  light-independent protochlorophyllide reductase subunit N  38.2 
 
 		 422 aa  250  3e-65  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.596165  normal  0.0186172 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0747  light-independent protochlorophyllide reductase subunit N  36.59 
 
 		 425 aa  250  3e-65  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.957633  normal  0.357282 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1873  light-independent protochlorophyllide reductase subunit N  35.78 
 
 		 418 aa  250  3e-65  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_05471  light-independent protochlorophyllide reductase subunit N  35.45 
 
 		 418 aa  249  6e-65  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3718  light-independent protochlorophyllide reductase subunit N  37.75 
 
 		 420 aa  249  7e-65  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.834431  normal  0.0122696 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_05981  light-independent protochlorophyllide reductase subunit N  35.77 
 
 		 419 aa  249  8e-65  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.926498 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1637  light-independent protochlorophyllide reductase subunit N  37.07 
 
 		 424 aa  249  9e-65  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5361  light-independent protochlorophyllide reductase subunit N  37.9 
 
 		 422 aa  248  2e-64  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.752323  normal  0.24577 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3736  light-independent protochlorophyllide reductase subunit N  35.42 
 
 		 428 aa  246  6e-64  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.255529  hitchhiker  0.00206765 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0285  light-independent protochlorophyllide reductase subunit N  35.52 
 
 		 428 aa  243  6e-63  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1010  light-independent protochlorophyllide reductase subunit N  34.84 
 
 		 428 aa  242  1e-62  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.398895  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1928  light-independent protochlorophyllide reductase subunit N  35.04 
 
 		 428 aa  241  2e-62  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.472722  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0545  light-independent protochlorophyllide reductase subunit N  33.41 
 
 		 418 aa  230  4e-59  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_06011  light-independent protochlorophyllide reductase subunit N  33.57 
 
 		 418 aa  227  4e-58  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_05711  light-independent protochlorophyllide reductase subunit N  32.85 
 
 		 418 aa  226  8e-58  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.847677  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_06091  light-independent protochlorophyllide reductase subunit N  32.69 
 
 		 418 aa  224  2e-57  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0605  hypothetical protein  26.41 
 
 		 447 aa  145  1e-33  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0280  NifH/frxC  22.1 
 
 		 728 aa  57.8  0.0000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.359044  normal  0.513981 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0093  Nitrogenase  24.11 
 
 		 511 aa  57  0.0000007  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.061617 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3744  chlorophyllide reductase subunit Y  25.65 
 
 		 422 aa  54.7  0.000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000125918 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1938  oxidoreductase/nitrogenase, component 1  24.68 
 
 		 355 aa  52.8  0.00001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2082  oxidoreductase/nitrogenase, component 1  24.51 
 
 		 347 aa  50.1  0.00007  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0178  chlorophyllide reductase subunit Y  22.07 
 
 		 521 aa  48.9  0.0001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2273  nitrogenase associated protein N  22.67 
 
 		 446 aa  47.4  0.0005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.1891 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2004  nitrogenase  25.74 
 
 		 515 aa  46.6  0.0009  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.811675 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3531  light-independent protochlorophyllide reductase subunit B  23.85 
 
 		 508 aa  46.2  0.001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2607  Nitrogenase  23.94 
 
 		 501 aa  46.2  0.001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0234589  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1009  light-independent protochlorophyllide reductase subunit B  25 
 
 		 522 aa  45.1  0.002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1817  oxidoreductase/nitrogenase component 1  28.12 
 
 		 410 aa  45.8  0.002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4000  chlorophyllide reductase subunit Y  23.66 
 
 		 533 aa  44.7  0.003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.130756  hitchhiker  0.00873228 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2731  chlorophyllide reductase subunit Y  23.56 
 
 		 508 aa  44.3  0.004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2958  chlorophyllide reductase subunit Y  23.82 
 
 		 508 aa  44.3  0.004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.124011 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2028  light-independent protochlorophyllide reductase subunit B  20.67 
 
 		 533 aa  43.5  0.007  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.0312494 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1929  light-independent protochlorophyllide reductase subunit B  27.21 
 
 		 534 aa  43.5  0.007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.86894  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0160  light-independent protochlorophyllide reductase subunit B  23.47 
 
 		 519 aa  43.5  0.007  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0286  light-independent protochlorophyllide reductase subunit B  27.21 
 
 		 534 aa  43.5  0.007  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3466  light-independent protochlorophyllide reductase subunit B  23.66 
 
 		 508 aa  43.1  0.009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4249  nitrogenase molybdenum-iron protein beta chain  26.98 
 
 		 512 aa  43.1  0.01  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>