67 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Synpcc7942_1420 on replicon NC_007604
Organism: Synechococcus elongatus PCC 7942



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007413  Ava_2330  light-independent protochlorophyllide reductase subunit N  79.53 
 
 		 467 aa  771    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2304  light-independent protochlorophyllide reductase subunit N  79.53 
 
 		 467 aa  764    'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0817  light-independent protochlorophyllide reductase subunit N  78.62 
 
 		 466 aa  772    Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0125392  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3941  light-independent protochlorophyllide reductase subunit N  79.87 
 
 		 468 aa  771    Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.620591  normal  0.804646 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2373  light-independent protochlorophyllide reductase subunit N  78.62 
 
 		 466 aa  770    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0789  light-independent protochlorophyllide reductase subunit N  78.4 
 
 		 466 aa  770    Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1530  light-independent protochlorophyllide reductase subunit N  80.13 
 
 		 465 aa  775    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0646926 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1420  light-independent protochlorophyllide reductase subunit N  100 
 
 		 466 aa  960    Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.172263  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1910  light-independent protochlorophyllide reductase subunit N  38.85 
 
 		 415 aa  328  1.0000000000000001e-88  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.902944  hitchhiker  0.00090668 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3481  light-independent protochlorophyllide reductase subunit N  39.09 
 
 		 425 aa  328  1.0000000000000001e-88  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1536  light-independent protochlorophyllide reductase subunit N  39.18 
 
 		 414 aa  323  6e-87  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.120446  hitchhiker  0.00259667 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2194  light-independent protochlorophyllide reductase subunit N  36.01 
 
 		 420 aa  308  1.0000000000000001e-82  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2029  light-independent protochlorophyllide reductase subunit N  37.53 
 
 		 420 aa  307  3e-82  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.0292807 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0324  light-independent protochlorophyllide reductase subunit N  35.14 
 
 		 420 aa  304  2.0000000000000002e-81  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.754207  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2388  light-independent protochlorophyllide reductase subunit N  35.57 
 
 		 420 aa  304  2.0000000000000002e-81  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2260  light-independent protochlorophyllide reductase subunit N  36.59 
 
 		 420 aa  303  6.000000000000001e-81  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.307743 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0215  light-independent protochlorophyllide reductase subunit N  35.82 
 
 		 420 aa  300  5e-80  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1815  light-independent protochlorophyllide reductase subunit N  35.48 
 
 		 427 aa  294  2e-78  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0747  light-independent protochlorophyllide reductase subunit N  35.2 
 
 		 425 aa  271  2e-71  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.957633  normal  0.357282 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0623  light-independent protochlorophyllide reductase subunit N  37.08 
 
 		 440 aa  261  2e-68  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.957648  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1619  light-independent protochlorophyllide reductase subunit N  34.83 
 
 		 416 aa  260  3e-68  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.43602  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6417  light-independent protochlorophyllide reductase subunit N  35.57 
 
 		 428 aa  258  1e-67  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.577987  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_07951  light-independent protochlorophyllide reductase subunit N  33.56 
 
 		 418 aa  257  3e-67  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_05471  light-independent protochlorophyllide reductase subunit N  34.42 
 
 		 418 aa  255  1.0000000000000001e-66  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1313  light-independent protochlorophyllide reductase subunit N  33.78 
 
 		 428 aa  253  5.000000000000001e-66  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.29904 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_06011  light-independent protochlorophyllide reductase subunit N  33.33 
 
 		 418 aa  253  6e-66  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0545  light-independent protochlorophyllide reductase subunit N  33.71 
 
 		 418 aa  252  8.000000000000001e-66  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2042  light-independent protochlorophyllide reductase subunit N  34.83 
 
 		 426 aa  252  9.000000000000001e-66  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.147701 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1873  light-independent protochlorophyllide reductase subunit N  34.38 
 
 		 418 aa  251  2e-65  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_05981  light-independent protochlorophyllide reductase subunit N  33.94 
 
 		 419 aa  251  2e-65  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.926498 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_06091  light-independent protochlorophyllide reductase subunit N  33.48 
 
 		 418 aa  250  3e-65  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1848  light-independent protochlorophyllide reductase subunit N  33.41 
 
 		 424 aa  250  4e-65  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00937776 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_05711  light-independent protochlorophyllide reductase subunit N  33.11 
 
 		 418 aa  249  9e-65  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.847677  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5361  light-independent protochlorophyllide reductase subunit N  33.26 
 
 		 422 aa  248  1e-64  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.752323  normal  0.24577 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1730  light-independent protochlorophyllide reductase subunit N  32.43 
 
 		 429 aa  245  9.999999999999999e-64  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3981  light-independent protochlorophyllide reductase subunit N  33.04 
 
 		 428 aa  244  3e-63  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.120682 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0161  light-independent protochlorophyllide reductase subunit N  34.82 
 
 		 427 aa  243  5e-63  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5283  light-independent protochlorophyllide reductase subunit N  33.56 
 
 		 422 aa  242  1e-62  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3736  light-independent protochlorophyllide reductase subunit N  33.33 
 
 		 428 aa  240  2.9999999999999997e-62  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.255529  hitchhiker  0.00206765 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1010  light-independent protochlorophyllide reductase subunit N  34 
 
 		 428 aa  240  4e-62  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.398895  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1637  light-independent protochlorophyllide reductase subunit N  34.16 
 
 		 424 aa  238  1e-61  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4816  light-independent protochlorophyllide reductase subunit N  32.52 
 
 		 422 aa  238  2e-61  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.596165  normal  0.0186172 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1928  light-independent protochlorophyllide reductase subunit N  33.93 
 
 		 428 aa  238  2e-61  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.472722  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0285  light-independent protochlorophyllide reductase subunit N  33.93 
 
 		 428 aa  237  3e-61  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3534  light-independent protochlorophyllide reductase subunit N  33.11 
 
 		 427 aa  227  4e-58  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3718  light-independent protochlorophyllide reductase subunit N  31.82 
 
 		 420 aa  225  2e-57  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.834431  normal  0.0122696 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0605  hypothetical protein  33.33 
 
 		 447 aa  138  2e-31  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0794  nitrogenase  22.45 
 
 		 511 aa  50.4  0.00007  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0557  nitrogenase molybdenum-iron protein beta chain  23.1 
 
 		 455 aa  48.9  0.0002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0151336  normal  0.228475 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3744  chlorophyllide reductase subunit Y  23.74 
 
 		 422 aa  48.1  0.0003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000125918 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2887  oxidoreductase/nitrogenase component 1  22.14 
 
 		 452 aa  47  0.0007  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.513277  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0850  chlorophyllide reductase subunit Y  28.57 
 
 		 438 aa  45.8  0.002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.053677  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0648  nitrogenase molybdenum-iron protein beta chain  20.96 
 
 		 489 aa  45.1  0.003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0104  nitrogenase  19.09 
 
 		 458 aa  45.1  0.003  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.294919  normal  0.143181 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1532  nitrogenase molybdenum-iron protein beta chain  22.69 
 
 		 459 aa  45.1  0.003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2411  chlorophyllide reductase subunit Y  25.32 
 
 		 411 aa  45.1  0.003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2817  nitrogenase molybdenum-iron protein beta chain  22.9 
 
 		 463 aa  44.7  0.004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1631  nitrogenase molybdenum-iron protein beta chain  21.96 
 
 		 460 aa  44.7  0.004  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  decreased coverage  0.0000877058  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3257  chlorophyllide reductase subunit Y  27.46 
 
 		 422 aa  44.3  0.005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0212884 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1146  nitrogenase molybdenum-iron protein beta chain  21.8 
 
 		 455 aa  43.9  0.006  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.101192  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2035  chlorophyllide reductase subunit Y  26.62 
 
 		 412 aa  43.9  0.006  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2908  Nitrogenase  22.33 
 
 		 502 aa  43.9  0.006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1248  nitrogenase molybdenum-iron protein beta chain  22.73 
 
 		 485 aa  43.9  0.007  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.36292  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2041  light-independent protochlorophyllide reductase subunit B  24.1 
 
 		 508 aa  43.5  0.008  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.133297 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0059  nitrogenase  20.31 
 
 		 458 aa  43.5  0.009  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.148206  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0664  nitrogenase  19.43 
 
 		 458 aa  43.1  0.01  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.683559  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2607  Nitrogenase  21.67 
 
 		 501 aa  43.1  0.01  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0234589  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>