54 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rxyl_0605 on replicon NC_008148
Organism: Rubrobacter xylanophilus DSM 9941



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008148  Rxyl_0605  hypothetical protein  100 
 
 		 447 aa  833    Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1910  light-independent protochlorophyllide reductase subunit N  31.99 
 
 		 415 aa  169  1e-40  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.902944  hitchhiker  0.00090668 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1536  light-independent protochlorophyllide reductase subunit N  31.54 
 
 		 414 aa  166  1.0000000000000001e-39  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.120446  hitchhiker  0.00259667 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3481  light-independent protochlorophyllide reductase subunit N  29.66 
 
 		 425 aa  157  3e-37  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0324  light-independent protochlorophyllide reductase subunit N  26.58 
 
 		 420 aa  148  2.0000000000000003e-34  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.754207  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2330  light-independent protochlorophyllide reductase subunit N  34.95 
 
 		 467 aa  147  5e-34  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3941  light-independent protochlorophyllide reductase subunit N  34.94 
 
 		 468 aa  146  7.0000000000000006e-34  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.620591  normal  0.804646 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2260  light-independent protochlorophyllide reductase subunit N  26.86 
 
 		 420 aa  146  7.0000000000000006e-34  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.307743 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1420  light-independent protochlorophyllide reductase subunit N  34.41 
 
 		 466 aa  145  2e-33  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.172263  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0215  light-independent protochlorophyllide reductase subunit N  26.74 
 
 		 420 aa  144  3e-33  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2304  light-independent protochlorophyllide reductase subunit N  33.97 
 
 		 467 aa  144  4e-33  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1530  light-independent protochlorophyllide reductase subunit N  33.55 
 
 		 465 aa  144  4e-33  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0646926 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2194  light-independent protochlorophyllide reductase subunit N  26.64 
 
 		 420 aa  143  5e-33  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0817  light-independent protochlorophyllide reductase subunit N  33.23 
 
 		 466 aa  141  1.9999999999999998e-32  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0125392  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0789  light-independent protochlorophyllide reductase subunit N  33.23 
 
 		 466 aa  142  1.9999999999999998e-32  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2388  light-independent protochlorophyllide reductase subunit N  26.29 
 
 		 420 aa  142  1.9999999999999998e-32  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1815  light-independent protochlorophyllide reductase subunit N  26.64 
 
 		 427 aa  141  3e-32  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2373  light-independent protochlorophyllide reductase subunit N  31.82 
 
 		 466 aa  137  3.0000000000000003e-31  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2029  light-independent protochlorophyllide reductase subunit N  26.64 
 
 		 420 aa  131  3e-29  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.0292807 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1873  light-independent protochlorophyllide reductase subunit N  27.65 
 
 		 418 aa  118  1.9999999999999998e-25  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_05981  light-independent protochlorophyllide reductase subunit N  27.1 
 
 		 419 aa  117  3.9999999999999997e-25  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.926498 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0747  light-independent protochlorophyllide reductase subunit N  28.6 
 
 		 425 aa  112  1.0000000000000001e-23  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.957633  normal  0.357282 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_07951  light-independent protochlorophyllide reductase subunit N  32.76 
 
 		 418 aa  110  6e-23  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_06091  light-independent protochlorophyllide reductase subunit N  33.33 
 
 		 418 aa  110  7.000000000000001e-23  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1313  light-independent protochlorophyllide reductase subunit N  35.81 
 
 		 428 aa  107  6e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.29904 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_05471  light-independent protochlorophyllide reductase subunit N  30.47 
 
 		 418 aa  107  6e-22  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0545  light-independent protochlorophyllide reductase subunit N  32.34 
 
 		 418 aa  106  1e-21  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1619  light-independent protochlorophyllide reductase subunit N  27.63 
 
 		 416 aa  102  9e-21  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.43602  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1637  light-independent protochlorophyllide reductase subunit N  36.65 
 
 		 424 aa  102  2e-20  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_06011  light-independent protochlorophyllide reductase subunit N  30.21 
 
 		 418 aa  100  6e-20  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_05711  light-independent protochlorophyllide reductase subunit N  29.79 
 
 		 418 aa  99.4  1e-19  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.847677  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1730  light-independent protochlorophyllide reductase subunit N  34.23 
 
 		 429 aa  99  1e-19  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3981  light-independent protochlorophyllide reductase subunit N  34.88 
 
 		 428 aa  95.1  2e-18  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.120682 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5361  light-independent protochlorophyllide reductase subunit N  35.02 
 
 		 422 aa  93.6  6e-18  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.752323  normal  0.24577 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4816  light-independent protochlorophyllide reductase subunit N  34.76 
 
 		 422 aa  91.7  3e-17  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.596165  normal  0.0186172 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3736  light-independent protochlorophyllide reductase subunit N  33.18 
 
 		 428 aa  91.3  3e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.255529  hitchhiker  0.00206765 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1848  light-independent protochlorophyllide reductase subunit N  36.41 
 
 		 424 aa  90.5  5e-17  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00937776 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5283  light-independent protochlorophyllide reductase subunit N  34.76 
 
 		 422 aa  90.5  5e-17  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2042  light-independent protochlorophyllide reductase subunit N  34.84 
 
 		 426 aa  90.5  6e-17  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.147701 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0623  light-independent protochlorophyllide reductase subunit N  34.22 
 
 		 440 aa  89.4  1e-16  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.957648  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6417  light-independent protochlorophyllide reductase subunit N  33.78 
 
 		 428 aa  85.1  0.000000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.577987  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0161  light-independent protochlorophyllide reductase subunit N  29.46 
 
 		 427 aa  82.4  0.00000000000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3534  light-independent protochlorophyllide reductase subunit N  31.1 
 
 		 427 aa  81.3  0.00000000000004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1928  light-independent protochlorophyllide reductase subunit N  31.25 
 
 		 428 aa  79.7  0.00000000000009  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.472722  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0285  light-independent protochlorophyllide reductase subunit N  31.25 
 
 		 428 aa  79.7  0.00000000000009  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3718  light-independent protochlorophyllide reductase subunit N  35.57 
 
 		 420 aa  79.7  0.00000000000009  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.834431  normal  0.0122696 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1010  light-independent protochlorophyllide reductase subunit N  30.32 
 
 		 428 aa  78.6  0.0000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.398895  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2035  chlorophyllide reductase subunit Y  27.39 
 
 		 412 aa  49.7  0.0001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2411  chlorophyllide reductase subunit Y  25.78 
 
 		 411 aa  45.8  0.001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1314  light-independent protochlorophyllide reductase subunit B  30.53 
 
 		 530 aa  46.6  0.001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.190808 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0681  nitrogenase molybdenum-iron protein beta chain  24.65 
 
 		 459 aa  45.1  0.002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.746204  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1532  nitrogenase molybdenum-iron protein beta chain  28.04 
 
 		 459 aa  45.8  0.002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0324  chlorophyllide reductase subunit Y  26.5 
 
 		 412 aa  44.3  0.004  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2062  chlorophyllide reductase subunit Y  27.59 
 
 		 422 aa  43.9  0.006  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.730736  normal  0.0621767 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>