70 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cagg_3481 on replicon NC_011831
Organism: Chloroflexus aggregans DSM 9485



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011831  Cagg_3481  light-independent protochlorophyllide reductase subunit N  100 
 
 
425 aa  870    Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1910  light-independent protochlorophyllide reductase subunit N  72.57 
 
 
415 aa  640    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.902944  hitchhiker  0.00090668 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1536  light-independent protochlorophyllide reductase subunit N  71.6 
 
 
414 aa  632  1e-180  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.120446  hitchhiker  0.00259667 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0324  light-independent protochlorophyllide reductase subunit N  63.5 
 
 
420 aa  562  1.0000000000000001e-159  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.754207  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2029  light-independent protochlorophyllide reductase subunit N  64.39 
 
 
420 aa  561  1.0000000000000001e-159  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.0292807 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2260  light-independent protochlorophyllide reductase subunit N  62.44 
 
 
420 aa  555  1e-157  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.307743 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2388  light-independent protochlorophyllide reductase subunit N  63.41 
 
 
420 aa  557  1e-157  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0215  light-independent protochlorophyllide reductase subunit N  62.2 
 
 
420 aa  551  1e-156  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1815  light-independent protochlorophyllide reductase subunit N  60.1 
 
 
427 aa  548  1e-155  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2194  light-independent protochlorophyllide reductase subunit N  61.71 
 
 
420 aa  545  1e-154  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2304  light-independent protochlorophyllide reductase subunit N  39.91 
 
 
467 aa  335  5.999999999999999e-91  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2330  light-independent protochlorophyllide reductase subunit N  39.46 
 
 
467 aa  330  4e-89  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1420  light-independent protochlorophyllide reductase subunit N  39.09 
 
 
466 aa  328  9e-89  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.172263  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2373  light-independent protochlorophyllide reductase subunit N  39.1 
 
 
466 aa  328  2.0000000000000001e-88  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1530  light-independent protochlorophyllide reductase subunit N  38.29 
 
 
465 aa  322  7e-87  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.0646926 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0817  light-independent protochlorophyllide reductase subunit N  38.43 
 
 
466 aa  320  3e-86  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0125392  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0789  light-independent protochlorophyllide reductase subunit N  38.43 
 
 
466 aa  320  3e-86  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3941  light-independent protochlorophyllide reductase subunit N  38.55 
 
 
468 aa  316  4e-85  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.620591  normal  0.804646 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1619  light-independent protochlorophyllide reductase subunit N  37.77 
 
 
416 aa  273  6e-72  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.43602  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1873  light-independent protochlorophyllide reductase subunit N  36.87 
 
 
418 aa  270  5e-71  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_05981  light-independent protochlorophyllide reductase subunit N  36.63 
 
 
419 aa  267  2e-70  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.926498 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6417  light-independent protochlorophyllide reductase subunit N  37.56 
 
 
428 aa  259  5.0000000000000005e-68  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.577987  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_05471  light-independent protochlorophyllide reductase subunit N  36.39 
 
 
418 aa  259  8e-68  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0747  light-independent protochlorophyllide reductase subunit N  36.04 
 
 
425 aa  258  2e-67  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.957633  normal  0.357282 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1313  light-independent protochlorophyllide reductase subunit N  37.44 
 
 
428 aa  253  4.0000000000000004e-66  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.29904 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_07951  light-independent protochlorophyllide reductase subunit N  35.27 
 
 
418 aa  253  4.0000000000000004e-66  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1637  light-independent protochlorophyllide reductase subunit N  37.84 
 
 
424 aa  252  9.000000000000001e-66  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5283  light-independent protochlorophyllide reductase subunit N  38.01 
 
 
422 aa  249  5e-65  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4816  light-independent protochlorophyllide reductase subunit N  37.77 
 
 
422 aa  249  5e-65  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.596165  normal  0.0186172 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3718  light-independent protochlorophyllide reductase subunit N  37.71 
 
 
420 aa  249  7e-65  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.834431  normal  0.0122696 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0545  light-independent protochlorophyllide reductase subunit N  34.62 
 
 
418 aa  248  1e-64  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5361  light-independent protochlorophyllide reductase subunit N  37.16 
 
 
422 aa  248  2e-64  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.752323  normal  0.24577 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_06091  light-independent protochlorophyllide reductase subunit N  35.1 
 
 
418 aa  246  4.9999999999999997e-64  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3981  light-independent protochlorophyllide reductase subunit N  36.7 
 
 
428 aa  243  6e-63  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.120682 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0623  light-independent protochlorophyllide reductase subunit N  37.65 
 
 
440 aa  241  2e-62  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.957648  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1848  light-independent protochlorophyllide reductase subunit N  36.76 
 
 
424 aa  241  2e-62  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00937776 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_06011  light-independent protochlorophyllide reductase subunit N  34.62 
 
 
418 aa  239  6.999999999999999e-62  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2042  light-independent protochlorophyllide reductase subunit N  35.66 
 
 
426 aa  239  9e-62  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.147701 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_05711  light-independent protochlorophyllide reductase subunit N  34.13 
 
 
418 aa  238  2e-61  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.847677  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3736  light-independent protochlorophyllide reductase subunit N  36.76 
 
 
428 aa  236  6e-61  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.255529  hitchhiker  0.00206765 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0161  light-independent protochlorophyllide reductase subunit N  34.15 
 
 
427 aa  234  2.0000000000000002e-60  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1730  light-independent protochlorophyllide reductase subunit N  35.14 
 
 
429 aa  232  9e-60  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0285  light-independent protochlorophyllide reductase subunit N  35.05 
 
 
428 aa  230  3e-59  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3534  light-independent protochlorophyllide reductase subunit N  34.56 
 
 
427 aa  228  1e-58  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1928  light-independent protochlorophyllide reductase subunit N  34.72 
 
 
428 aa  228  1e-58  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.472722  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1010  light-independent protochlorophyllide reductase subunit N  33.57 
 
 
428 aa  227  3e-58  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.398895  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0605  hypothetical protein  29.21 
 
 
447 aa  157  3e-37  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3744  chlorophyllide reductase subunit Y  30.21 
 
 
422 aa  70.1  0.00000000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000125918 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2411  chlorophyllide reductase subunit Y  22.89 
 
 
411 aa  57.8  0.0000004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3257  chlorophyllide reductase subunit Y  29.49 
 
 
422 aa  53.9  0.000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0212884 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4000  chlorophyllide reductase subunit Y  23.8 
 
 
533 aa  50.8  0.00004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.130756  hitchhiker  0.00873228 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2035  chlorophyllide reductase subunit Y  23.69 
 
 
412 aa  51.2  0.00004  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2062  chlorophyllide reductase subunit Y  23.16 
 
 
422 aa  49.7  0.00009  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.730736  normal  0.0621767 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6436  bacteriochlorophyllide reductase subunit  21.86 
 
 
512 aa  49.3  0.0001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2082  oxidoreductase/nitrogenase, component 1  25.29 
 
 
347 aa  49.7  0.0001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0342  chlorophyllide reductase subunit Y  23.1 
 
 
418 aa  48.5  0.0002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.680799  normal  0.193791 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4029  oxidoreductase/nitrogenase, component 1  22.33 
 
 
466 aa  48.1  0.0003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.522703 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1711  chlorophyllide reductase subunit Y  22.57 
 
 
528 aa  47  0.0006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2075  chlorophyllide reductase subunit Y  24.42 
 
 
412 aa  47.4  0.0006  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.027568  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0324  chlorophyllide reductase subunit Y  24.4 
 
 
412 aa  45.8  0.001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3755  chlorophyllide reductase subunit Y  23.51 
 
 
540 aa  46.2  0.001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00652475 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1863  chlorophyllide reductase subunit Y  22.19 
 
 
415 aa  45.4  0.002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1816  oxidoreductase/nitrogenase component 1  23.66 
 
 
453 aa  45.1  0.002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0850  chlorophyllide reductase subunit Y  26.05 
 
 
438 aa  45.4  0.002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.053677  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0280  NifH/frxC  22.36 
 
 
728 aa  45.8  0.002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.359044  normal  0.513981 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1294  chlorophyllide reductase subunit Y  22 
 
 
535 aa  44.7  0.003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1797  nitrogenase  22.38 
 
 
458 aa  44.3  0.004  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.561613  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0178  chlorophyllide reductase subunit Y  22.7 
 
 
521 aa  43.9  0.005  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0093  Nitrogenase  24.11 
 
 
511 aa  43.5  0.006  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.061617 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2004  nitrogenase  24.24 
 
 
515 aa  43.5  0.007  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.811675 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>