74 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrad2831_1848 on replicon NC_010505
Organism: Methylobacterium radiotolerans JCM 2831



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010725  Mpop_5361  light-independent protochlorophyllide reductase subunit N  82.59 
 
 		 422 aa  669    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.752323  normal  0.24577 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5283  light-independent protochlorophyllide reductase subunit N  82.86 
 
 		 422 aa  685    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4816  light-independent protochlorophyllide reductase subunit N  82.35 
 
 		 422 aa  677    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.596165  normal  0.0186172 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1848  light-independent protochlorophyllide reductase subunit N  100 
 
 		 424 aa  839    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00937776 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3718  light-independent protochlorophyllide reductase subunit N  81.47 
 
 		 420 aa  637    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.834431  normal  0.0122696 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1730  light-independent protochlorophyllide reductase subunit N  74.57 
 
 		 429 aa  624  1e-178  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3981  light-independent protochlorophyllide reductase subunit N  74.75 
 
 		 428 aa  624  1e-178  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.120682 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1313  light-independent protochlorophyllide reductase subunit N  72.36 
 
 		 428 aa  610  1e-173  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.29904 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3736  light-independent protochlorophyllide reductase subunit N  75.31 
 
 		 428 aa  607  9.999999999999999e-173  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.255529  hitchhiker  0.00206765 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6417  light-independent protochlorophyllide reductase subunit N  75.49 
 
 		 428 aa  597  1e-169  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.577987  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0623  light-independent protochlorophyllide reductase subunit N  72.53 
 
 		 440 aa  587  1e-166  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.957648  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2042  light-independent protochlorophyllide reductase subunit N  70.66 
 
 		 426 aa  576  1.0000000000000001e-163  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.147701 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3534  light-independent protochlorophyllide reductase subunit N  66.9 
 
 		 427 aa  536  1e-151  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0161  light-independent protochlorophyllide reductase subunit N  64.79 
 
 		 427 aa  529  1e-149  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_07951  light-independent protochlorophyllide reductase subunit N  63.2 
 
 		 418 aa  525  1e-148  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1619  light-independent protochlorophyllide reductase subunit N  64.49 
 
 		 416 aa  526  1e-148  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.43602  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1010  light-independent protochlorophyllide reductase subunit N  66.11 
 
 		 428 aa  520  1e-146  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.398895  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1928  light-independent protochlorophyllide reductase subunit N  66.59 
 
 		 428 aa  519  1e-146  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.472722  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0747  light-independent protochlorophyllide reductase subunit N  65.21 
 
 		 425 aa  518  1e-146  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.957633  normal  0.357282 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0285  light-independent protochlorophyllide reductase subunit N  66.35 
 
 		 428 aa  518  1.0000000000000001e-145  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_05981  light-independent protochlorophyllide reductase subunit N  59.32 
 
 		 419 aa  509  1e-143  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.926498 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1873  light-independent protochlorophyllide reductase subunit N  59.32 
 
 		 418 aa  506  9.999999999999999e-143  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1637  light-independent protochlorophyllide reductase subunit N  64.59 
 
 		 424 aa  505  9.999999999999999e-143  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_05471  light-independent protochlorophyllide reductase subunit N  59.18 
 
 		 418 aa  499  1e-140  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_06011  light-independent protochlorophyllide reductase subunit N  58.29 
 
 		 418 aa  496  1e-139  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_05711  light-independent protochlorophyllide reductase subunit N  58.05 
 
 		 418 aa  497  1e-139  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.847677  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0545  light-independent protochlorophyllide reductase subunit N  58.64 
 
 		 418 aa  491  1e-137  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_06091  light-independent protochlorophyllide reductase subunit N  57.56 
 
 		 418 aa  486  1e-136  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1910  light-independent protochlorophyllide reductase subunit N  38.97 
 
 		 415 aa  265  8e-70  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.902944  hitchhiker  0.00090668 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0215  light-independent protochlorophyllide reductase subunit N  39.13 
 
 		 420 aa  263  4e-69  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1536  light-independent protochlorophyllide reductase subunit N  39.22 
 
 		 414 aa  262  8.999999999999999e-69  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.120446  hitchhiker  0.00259667 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2194  light-independent protochlorophyllide reductase subunit N  38.74 
 
 		 420 aa  261  2e-68  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2388  light-independent protochlorophyllide reductase subunit N  38.26 
 
 		 420 aa  260  3e-68  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2330  light-independent protochlorophyllide reductase subunit N  34.08 
 
 		 467 aa  254  2.0000000000000002e-66  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1420  light-independent protochlorophyllide reductase subunit N  33.41 
 
 		 466 aa  254  3e-66  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.172263  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0324  light-independent protochlorophyllide reductase subunit N  36.96 
 
 		 420 aa  253  5.000000000000001e-66  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.754207  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2304  light-independent protochlorophyllide reductase subunit N  32.96 
 
 		 467 aa  251  1e-65  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2373  light-independent protochlorophyllide reductase subunit N  31.64 
 
 		 466 aa  251  2e-65  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1815  light-independent protochlorophyllide reductase subunit N  38.05 
 
 		 427 aa  251  2e-65  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0817  light-independent protochlorophyllide reductase subunit N  31.56 
 
 		 466 aa  251  2e-65  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0125392  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0789  light-independent protochlorophyllide reductase subunit N  31.56 
 
 		 466 aa  250  3e-65  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3941  light-independent protochlorophyllide reductase subunit N  33.48 
 
 		 468 aa  249  6e-65  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.620591  normal  0.804646 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3481  light-independent protochlorophyllide reductase subunit N  36.76 
 
 		 425 aa  248  1e-64  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1530  light-independent protochlorophyllide reductase subunit N  32.21 
 
 		 465 aa  247  2e-64  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0646926 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2029  light-independent protochlorophyllide reductase subunit N  36.89 
 
 		 420 aa  246  6.999999999999999e-64  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.0292807 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2260  light-independent protochlorophyllide reductase subunit N  37.32 
 
 		 420 aa  246  6.999999999999999e-64  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.307743 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0605  hypothetical protein  37.2 
 
 		 447 aa  97.8  3e-19  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0325  light-independent protochlorophyllide reductase subunit B  27.25 
 
 		 535 aa  57.8  0.0000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00842285  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0261  chlorophyllide reductase, BchY subunit  31.44 
 
 		 502 aa  56.6  0.0000008  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1537  light-independent protochlorophyllide reductase subunit B  26.28 
 
 		 563 aa  55.8  0.000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.61403  hitchhiker  0.000999524 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1817  oxidoreductase/nitrogenase component 1  24.65 
 
 		 410 aa  56.2  0.000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0404  NifH/frxC-family protein  23.75 
 
 		 731 aa  55.1  0.000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.394931 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1909  light-independent protochlorophyllide reductase subunit B  26.92 
 
 		 568 aa  53.5  0.000007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000998915 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2035  chlorophyllide reductase subunit Y  29.08 
 
 		 500 aa  53.5  0.000007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.201918  normal  0.260715 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2009  nitrogenase  25 
 
 		 516 aa  52.8  0.00001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0918882  normal  0.238149 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1905  chlorophyllide reductase subunit Y  29.63 
 
 		 502 aa  52.8  0.00001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.381986 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0216  light-independent protochlorophyllide reductase subunit B  26.55 
 
 		 525 aa  52  0.00002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2082  oxidoreductase/nitrogenase, component 1  24.41 
 
 		 347 aa  50.8  0.00005  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0178  chlorophyllide reductase subunit Y  27.15 
 
 		 521 aa  50.4  0.00005  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2817  chlorophyllide reductase subunit Y  29.9 
 
 		 509 aa  50.1  0.00008  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0774355  normal  0.429495 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0164  hypothetical protein  25 
 
 		 339 aa  50.1  0.00008  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3518  bacteriachlorophyllide reductase iron protein subunit Y  26.58 
 
 		 534 aa  47.4  0.0005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.292352 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2035  chlorophyllide reductase subunit Y  25.44 
 
 		 412 aa  47  0.0006  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0850  chlorophyllide reductase subunit Y  29.96 
 
 		 438 aa  46.6  0.0008  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.053677  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2607  Nitrogenase  25 
 
 		 501 aa  46.2  0.001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0234589  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0794  nitrogenase  26.67 
 
 		 511 aa  45.8  0.001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0280  NifH/frxC  20.73 
 
 		 728 aa  45.8  0.001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.359044  normal  0.513981 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2387  light-independent protochlorophyllide reductase subunit B  27.14 
 
 		 535 aa  46.2  0.001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2703  nitrogen fixation protein NifH/NifE  22.4 
 
 		 746 aa  45.4  0.002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.15509 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2053  chlorophyllide reductase subunit Y  25.4 
 
 		 513 aa  45.4  0.002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0326514 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3698  chlorophyllide reductase subunit Y  25.78 
 
 		 516 aa  45.1  0.003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.465391  hitchhiker  0.00482074 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1838  light-independent protochlorophyllide reductase subunit B  23.97 
 
 		 508 aa  44.3  0.004  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.0579609 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1863  chlorophyllide reductase subunit Y  22.52 
 
 		 415 aa  44.3  0.004  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5282  light-independent protochlorophyllide reductase subunit B  26.36 
 
 		 531 aa  43.1  0.008  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>