59 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene P9515_06091 on replicon NC_008817
Organism: Prochlorococcus marinus str. MIT 9515



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007335  PMN2A_1873  light-independent protochlorophyllide reductase subunit N  76.74 
 
 		 418 aa  659    Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_05711  light-independent protochlorophyllide reductase subunit N  89.23 
 
 		 418 aa  774    Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.847677  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_05981  light-independent protochlorophyllide reductase subunit N  76.32 
 
 		 419 aa  657    Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.926498 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_06091  light-independent protochlorophyllide reductase subunit N  100 
 
 		 418 aa  858    Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_06011  light-independent protochlorophyllide reductase subunit N  89.23 
 
 		 418 aa  778    Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0545  light-independent protochlorophyllide reductase subunit N  94.26 
 
 		 418 aa  809    Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_05471  light-independent protochlorophyllide reductase subunit N  75.54 
 
 		 418 aa  651    Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_07951  light-independent protochlorophyllide reductase subunit N  71.94 
 
 		 418 aa  630  1e-179  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0747  light-independent protochlorophyllide reductase subunit N  71.22 
 
 		 425 aa  620  1e-176  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.957633  normal  0.357282 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1619  light-independent protochlorophyllide reductase subunit N  70.73 
 
 		 416 aa  608  1e-173  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.43602  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1730  light-independent protochlorophyllide reductase subunit N  61.95 
 
 		 429 aa  530  1e-149  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3981  light-independent protochlorophyllide reductase subunit N  62.07 
 
 		 428 aa  524  1e-147  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.120682 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6417  light-independent protochlorophyllide reductase subunit N  62.9 
 
 		 428 aa  520  1e-146  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.577987  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1313  light-independent protochlorophyllide reductase subunit N  61.58 
 
 		 428 aa  514  1.0000000000000001e-145  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.29904 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3736  light-independent protochlorophyllide reductase subunit N  61.95 
 
 		 428 aa  514  1e-144  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.255529  hitchhiker  0.00206765 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5361  light-independent protochlorophyllide reductase subunit N  59.8 
 
 		 422 aa  499  1e-140  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.752323  normal  0.24577 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5283  light-independent protochlorophyllide reductase subunit N  59.31 
 
 		 422 aa  498  1e-140  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4816  light-independent protochlorophyllide reductase subunit N  59.07 
 
 		 422 aa  493  9.999999999999999e-139  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.596165  normal  0.0186172 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2042  light-independent protochlorophyllide reductase subunit N  60.3 
 
 		 426 aa  491  9.999999999999999e-139  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.147701 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0623  light-independent protochlorophyllide reductase subunit N  60.1 
 
 		 440 aa  488  1e-137  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.957648  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3718  light-independent protochlorophyllide reductase subunit N  60.25 
 
 		 420 aa  488  1e-136  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.834431  normal  0.0122696 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1637  light-independent protochlorophyllide reductase subunit N  57.39 
 
 		 424 aa  484  1e-135  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1848  light-independent protochlorophyllide reductase subunit N  57.56 
 
 		 424 aa  479  1e-134  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00937776 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0161  light-independent protochlorophyllide reductase subunit N  58.56 
 
 		 427 aa  472  1e-132  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1010  light-independent protochlorophyllide reductase subunit N  58.37 
 
 		 428 aa  469  1.0000000000000001e-131  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.398895  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0285  light-independent protochlorophyllide reductase subunit N  58.06 
 
 		 428 aa  461  1e-129  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1928  light-independent protochlorophyllide reductase subunit N  58.06 
 
 		 428 aa  461  1e-129  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.472722  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3534  light-independent protochlorophyllide reductase subunit N  57.32 
 
 		 427 aa  456  1e-127  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1910  light-independent protochlorophyllide reductase subunit N  37.23 
 
 		 415 aa  261  1e-68  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.902944  hitchhiker  0.00090668 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1536  light-independent protochlorophyllide reductase subunit N  37.01 
 
 		 414 aa  257  2e-67  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.120446  hitchhiker  0.00259667 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2373  light-independent protochlorophyllide reductase subunit N  34.22 
 
 		 466 aa  253  5.000000000000001e-66  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0817  light-independent protochlorophyllide reductase subunit N  34.07 
 
 		 466 aa  253  5.000000000000001e-66  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0125392  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0789  light-independent protochlorophyllide reductase subunit N  34.07 
 
 		 466 aa  252  9.000000000000001e-66  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2304  light-independent protochlorophyllide reductase subunit N  34.22 
 
 		 467 aa  251  1e-65  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1420  light-independent protochlorophyllide reductase subunit N  33.48 
 
 		 466 aa  250  3e-65  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.172263  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3941  light-independent protochlorophyllide reductase subunit N  34.59 
 
 		 468 aa  249  5e-65  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.620591  normal  0.804646 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2330  light-independent protochlorophyllide reductase subunit N  33.55 
 
 		 467 aa  249  7e-65  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1530  light-independent protochlorophyllide reductase subunit N  34.68 
 
 		 465 aa  248  1e-64  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0646926 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3481  light-independent protochlorophyllide reductase subunit N  35.1 
 
 		 425 aa  246  4.9999999999999997e-64  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2260  light-independent protochlorophyllide reductase subunit N  34.78 
 
 		 420 aa  231  2e-59  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.307743 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2029  light-independent protochlorophyllide reductase subunit N  34.72 
 
 		 420 aa  228  1e-58  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.0292807 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0324  light-independent protochlorophyllide reductase subunit N  32.77 
 
 		 420 aa  227  3e-58  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.754207  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2388  light-independent protochlorophyllide reductase subunit N  33.25 
 
 		 420 aa  226  6e-58  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0215  light-independent protochlorophyllide reductase subunit N  32.69 
 
 		 420 aa  224  2e-57  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2194  light-independent protochlorophyllide reductase subunit N  33.01 
 
 		 420 aa  219  5e-56  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1815  light-independent protochlorophyllide reductase subunit N  33.08 
 
 		 427 aa  218  2e-55  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0605  hypothetical protein  33.33 
 
 		 447 aa  110  4.0000000000000004e-23  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4029  oxidoreductase/nitrogenase, component 1  23.53 
 
 		 466 aa  56.6  0.0000008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.522703 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1863  chlorophyllide reductase subunit Y  22.69 
 
 		 415 aa  52.8  0.00001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2703  nitrogen fixation protein NifH/NifE  24.47 
 
 		 746 aa  52.8  0.00001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.15509 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2411  chlorophyllide reductase subunit Y  23.49 
 
 		 411 aa  51.6  0.00003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0324  chlorophyllide reductase subunit Y  22.26 
 
 		 412 aa  50.8  0.00005  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2035  chlorophyllide reductase subunit Y  21.05 
 
 		 412 aa  48.5  0.0002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2273  nitrogenase associated protein N  20.7 
 
 		 446 aa  46.2  0.001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.1891 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2075  chlorophyllide reductase subunit Y  21.41 
 
 		 412 aa  44.7  0.003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.027568  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0164  hypothetical protein  23.55 
 
 		 339 aa  43.9  0.005  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_48970  Fe-only nitrogenase, beta subunit  26.53 
 
 		 462 aa  43.5  0.008  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.12057  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1427  nitrogenase  19.7 
 
 		 469 aa  43.5  0.008  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1614  oxidoreductase/nitrogenase component 1  20.33 
 
 		 425 aa  43.1  0.009  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>