57 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rru_A0623 on replicon NC_007643
Organism: Rhodospirillum rubrum ATCC 11170



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007643  Rru_A0623  light-independent protochlorophyllide reductase subunit N  100 
 
 		 440 aa  868    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.957648  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1730  light-independent protochlorophyllide reductase subunit N  72.93 
 
 		 429 aa  614  9.999999999999999e-175  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3981  light-independent protochlorophyllide reductase subunit N  72.93 
 
 		 428 aa  610  1e-173  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.120682 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1313  light-independent protochlorophyllide reductase subunit N  71.95 
 
 		 428 aa  606  9.999999999999999e-173  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.29904 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6417  light-independent protochlorophyllide reductase subunit N  74.88 
 
 		 428 aa  600  1e-170  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.577987  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3736  light-independent protochlorophyllide reductase subunit N  72.68 
 
 		 428 aa  592  1e-168  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.255529  hitchhiker  0.00206765 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5361  light-independent protochlorophyllide reductase subunit N  69.52 
 
 		 422 aa  585  1e-166  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.752323  normal  0.24577 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1848  light-independent protochlorophyllide reductase subunit N  72.53 
 
 		 424 aa  580  1e-164  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00937776 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2042  light-independent protochlorophyllide reductase subunit N  70.84 
 
 		 426 aa  575  1.0000000000000001e-163  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.147701 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4816  light-independent protochlorophyllide reductase subunit N  69.21 
 
 		 422 aa  577  1.0000000000000001e-163  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.596165  normal  0.0186172 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3718  light-independent protochlorophyllide reductase subunit N  74.52 
 
 		 420 aa  575  1.0000000000000001e-163  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.834431  normal  0.0122696 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5283  light-independent protochlorophyllide reductase subunit N  71.99 
 
 		 422 aa  577  1.0000000000000001e-163  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0161  light-independent protochlorophyllide reductase subunit N  66.35 
 
 		 427 aa  546  1e-154  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3534  light-independent protochlorophyllide reductase subunit N  66.99 
 
 		 427 aa  533  1e-150  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1010  light-independent protochlorophyllide reductase subunit N  65.64 
 
 		 428 aa  525  1e-148  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.398895  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0285  light-independent protochlorophyllide reductase subunit N  66.35 
 
 		 428 aa  521  1e-147  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1928  light-independent protochlorophyllide reductase subunit N  66.35 
 
 		 428 aa  521  1e-147  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.472722  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0747  light-independent protochlorophyllide reductase subunit N  66.26 
 
 		 425 aa  519  1e-146  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.957633  normal  0.357282 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1619  light-independent protochlorophyllide reductase subunit N  64.95 
 
 		 416 aa  518  1e-146  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.43602  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1637  light-independent protochlorophyllide reductase subunit N  64.51 
 
 		 424 aa  514  1e-144  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_07951  light-independent protochlorophyllide reductase subunit N  62.47 
 
 		 418 aa  510  1e-143  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_05981  light-independent protochlorophyllide reductase subunit N  60.39 
 
 		 419 aa  506  9.999999999999999e-143  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.926498 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1873  light-independent protochlorophyllide reductase subunit N  60.39 
 
 		 418 aa  501  1e-141  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_05471  light-independent protochlorophyllide reductase subunit N  61.46 
 
 		 418 aa  504  1e-141  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_05711  light-independent protochlorophyllide reductase subunit N  59.11 
 
 		 418 aa  502  1e-141  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.847677  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0545  light-independent protochlorophyllide reductase subunit N  60.54 
 
 		 418 aa  501  1e-141  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_06091  light-independent protochlorophyllide reductase subunit N  60.1 
 
 		 418 aa  499  1e-140  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_06011  light-independent protochlorophyllide reductase subunit N  58.62 
 
 		 418 aa  500  1e-140  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0215  light-independent protochlorophyllide reductase subunit N  40.29 
 
 		 420 aa  273  3e-72  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1420  light-independent protochlorophyllide reductase subunit N  37.3 
 
 		 466 aa  273  6e-72  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.172263  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2373  light-independent protochlorophyllide reductase subunit N  36.02 
 
 		 466 aa  269  8e-71  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1910  light-independent protochlorophyllide reductase subunit N  39.61 
 
 		 415 aa  265  1e-69  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.902944  hitchhiker  0.00090668 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0817  light-independent protochlorophyllide reductase subunit N  35.12 
 
 		 466 aa  265  1e-69  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0125392  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0789  light-independent protochlorophyllide reductase subunit N  35.12 
 
 		 466 aa  265  2e-69  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2304  light-independent protochlorophyllide reductase subunit N  36.16 
 
 		 467 aa  263  3e-69  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3941  light-independent protochlorophyllide reductase subunit N  37.25 
 
 		 468 aa  264  3e-69  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.620591  normal  0.804646 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1536  light-independent protochlorophyllide reductase subunit N  39.66 
 
 		 414 aa  263  4e-69  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.120446  hitchhiker  0.00259667 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1530  light-independent protochlorophyllide reductase subunit N  35.43 
 
 		 465 aa  263  6.999999999999999e-69  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0646926 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2330  light-independent protochlorophyllide reductase subunit N  36.5 
 
 		 467 aa  259  5.0000000000000005e-68  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2388  light-independent protochlorophyllide reductase subunit N  37.98 
 
 		 420 aa  257  4e-67  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2194  light-independent protochlorophyllide reductase subunit N  37.65 
 
 		 420 aa  254  2.0000000000000002e-66  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1815  light-independent protochlorophyllide reductase subunit N  38.57 
 
 		 427 aa  254  3e-66  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0324  light-independent protochlorophyllide reductase subunit N  37.41 
 
 		 420 aa  251  3e-65  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.754207  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2260  light-independent protochlorophyllide reductase subunit N  37.92 
 
 		 420 aa  249  7e-65  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.307743 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3481  light-independent protochlorophyllide reductase subunit N  37.65 
 
 		 425 aa  249  8e-65  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2029  light-independent protochlorophyllide reductase subunit N  36.93 
 
 		 420 aa  248  2e-64  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.0292807 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0605  hypothetical protein  34.22 
 
 		 447 aa  93.2  8e-18  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0404  NifH/frxC-family protein  23.19 
 
 		 731 aa  54.7  0.000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.394931 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2607  Nitrogenase  28.69 
 
 		 501 aa  52  0.00002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0234589  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4027  oxidoreductase/nitrogenase, component 1  21.56 
 
 		 463 aa  52.4  0.00002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.762261 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1863  chlorophyllide reductase subunit Y  22.67 
 
 		 415 aa  45.1  0.002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2009  nitrogenase  26.98 
 
 		 516 aa  44.7  0.003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0918882  normal  0.238149 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1614  oxidoreductase/nitrogenase component 1  22.36 
 
 		 425 aa  45.1  0.003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1838  light-independent protochlorophyllide reductase subunit B  24.18 
 
 		 508 aa  44.3  0.004  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.0579609 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2411  chlorophyllide reductase subunit Y  23.53 
 
 		 411 aa  44.3  0.005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3698  chlorophyllide reductase subunit Y  26.54 
 
 		 516 aa  43.5  0.009  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.465391  hitchhiker  0.00482074 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2703  nitrogen fixation protein NifH/NifE  24.05 
 
 		 746 aa  43.1  0.009  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.15509 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>