60 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Paes_2029 on replicon NC_011059
Organism: Prosthecochloris aestuarii DSM 271



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010803  Clim_2194  light-independent protochlorophyllide reductase subunit N  80.71 
 
 		 420 aa  718    Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2260  light-independent protochlorophyllide reductase subunit N  87.14 
 
 		 420 aa  769    Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.307743 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2388  light-independent protochlorophyllide reductase subunit N  81.19 
 
 		 420 aa  725    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0215  light-independent protochlorophyllide reductase subunit N  79.52 
 
 		 420 aa  716    Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2029  light-independent protochlorophyllide reductase subunit N  100 
 
 		 420 aa  862    Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.0292807 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1815  light-independent protochlorophyllide reductase subunit N  79.42 
 
 		 427 aa  704    Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0324  light-independent protochlorophyllide reductase subunit N  81.43 
 
 		 420 aa  726    Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.754207  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1910  light-independent protochlorophyllide reductase subunit N  67.32 
 
 		 415 aa  593  1e-168  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.902944  hitchhiker  0.00090668 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1536  light-independent protochlorophyllide reductase subunit N  66.1 
 
 		 414 aa  584  1.0000000000000001e-165  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.120446  hitchhiker  0.00259667 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3481  light-independent protochlorophyllide reductase subunit N  64.39 
 
 		 425 aa  561  1.0000000000000001e-159  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2304  light-independent protochlorophyllide reductase subunit N  39.24 
 
 		 467 aa  316  5e-85  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1420  light-independent protochlorophyllide reductase subunit N  37.53 
 
 		 466 aa  307  3e-82  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.172263  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2373  light-independent protochlorophyllide reductase subunit N  37.08 
 
 		 466 aa  305  8.000000000000001e-82  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2330  light-independent protochlorophyllide reductase subunit N  38.34 
 
 		 467 aa  304  2.0000000000000002e-81  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1530  light-independent protochlorophyllide reductase subunit N  37.82 
 
 		 465 aa  304  2.0000000000000002e-81  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0646926 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0789  light-independent protochlorophyllide reductase subunit N  36.4 
 
 		 466 aa  303  3.0000000000000004e-81  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0817  light-independent protochlorophyllide reductase subunit N  36.4 
 
 		 466 aa  303  3.0000000000000004e-81  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0125392  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3941  light-independent protochlorophyllide reductase subunit N  38.19 
 
 		 468 aa  301  2e-80  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.620591  normal  0.804646 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_05471  light-independent protochlorophyllide reductase subunit N  36.03 
 
 		 418 aa  250  4e-65  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3534  light-independent protochlorophyllide reductase subunit N  36.59 
 
 		 427 aa  248  1e-64  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_07951  light-independent protochlorophyllide reductase subunit N  35.9 
 
 		 418 aa  248  1e-64  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1619  light-independent protochlorophyllide reductase subunit N  36.25 
 
 		 416 aa  247  3e-64  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.43602  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1637  light-independent protochlorophyllide reductase subunit N  36.74 
 
 		 424 aa  246  4e-64  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3981  light-independent protochlorophyllide reductase subunit N  35.66 
 
 		 428 aa  246  4.9999999999999997e-64  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.120682 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6417  light-independent protochlorophyllide reductase subunit N  35.68 
 
 		 428 aa  246  6e-64  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.577987  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0747  light-independent protochlorophyllide reductase subunit N  35.7 
 
 		 425 aa  244  1.9999999999999999e-63  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.957633  normal  0.357282 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0161  light-independent protochlorophyllide reductase subunit N  36.34 
 
 		 427 aa  244  1.9999999999999999e-63  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1873  light-independent protochlorophyllide reductase subunit N  35.68 
 
 		 418 aa  243  5e-63  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_05981  light-independent protochlorophyllide reductase subunit N  36.17 
 
 		 419 aa  242  7.999999999999999e-63  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.926498 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0623  light-independent protochlorophyllide reductase subunit N  36.93 
 
 		 440 aa  242  9e-63  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.957648  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2042  light-independent protochlorophyllide reductase subunit N  36.06 
 
 		 426 aa  242  1e-62  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.147701 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1730  light-independent protochlorophyllide reductase subunit N  35.59 
 
 		 429 aa  241  1e-62  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1313  light-independent protochlorophyllide reductase subunit N  35.61 
 
 		 428 aa  241  2e-62  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.29904 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5283  light-independent protochlorophyllide reductase subunit N  37.69 
 
 		 422 aa  239  9e-62  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1848  light-independent protochlorophyllide reductase subunit N  36.89 
 
 		 424 aa  238  2e-61  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00937776 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3736  light-independent protochlorophyllide reductase subunit N  34.94 
 
 		 428 aa  238  2e-61  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.255529  hitchhiker  0.00206765 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4816  light-independent protochlorophyllide reductase subunit N  37.44 
 
 		 422 aa  236  5.0000000000000005e-61  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.596165  normal  0.0186172 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0285  light-independent protochlorophyllide reductase subunit N  35.28 
 
 		 428 aa  235  9e-61  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1928  light-independent protochlorophyllide reductase subunit N  35.04 
 
 		 428 aa  234  3e-60  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.472722  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3718  light-independent protochlorophyllide reductase subunit N  34.93 
 
 		 420 aa  233  7.000000000000001e-60  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.834431  normal  0.0122696 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1010  light-independent protochlorophyllide reductase subunit N  35.29 
 
 		 428 aa  232  9e-60  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.398895  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5361  light-independent protochlorophyllide reductase subunit N  36.68 
 
 		 422 aa  231  1e-59  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.752323  normal  0.24577 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_05711  light-independent protochlorophyllide reductase subunit N  35.78 
 
 		 418 aa  230  4e-59  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.847677  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_06011  light-independent protochlorophyllide reductase subunit N  35.63 
 
 		 418 aa  230  4e-59  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0545  light-independent protochlorophyllide reductase subunit N  34.95 
 
 		 418 aa  228  1e-58  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_06091  light-independent protochlorophyllide reductase subunit N  34.72 
 
 		 418 aa  228  1e-58  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0605  hypothetical protein  26.19 
 
 		 447 aa  132  1.0000000000000001e-29  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3744  chlorophyllide reductase subunit Y  27.2 
 
 		 422 aa  61.6  0.00000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000125918 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1863  chlorophyllide reductase subunit Y  24.71 
 
 		 415 aa  55.5  0.000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3257  chlorophyllide reductase subunit Y  27.72 
 
 		 422 aa  54.7  0.000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0212884 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2411  chlorophyllide reductase subunit Y  24.73 
 
 		 411 aa  52.8  0.00001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4029  oxidoreductase/nitrogenase, component 1  23.8 
 
 		 466 aa  52.4  0.00002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.522703 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0093  Nitrogenase  24.3 
 
 		 511 aa  49.7  0.0001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.061617 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2082  oxidoreductase/nitrogenase, component 1  22.66 
 
 		 347 aa  48.9  0.0002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6416  light-independent protochlorophyllide reductase subunit B  23.51 
 
 		 517 aa  47  0.0006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1009  light-independent protochlorophyllide reductase subunit B  25.85 
 
 		 522 aa  44.7  0.003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1929  light-independent protochlorophyllide reductase subunit B  25.96 
 
 		 534 aa  45.1  0.003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.86894  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0286  light-independent protochlorophyllide reductase subunit B  25.96 
 
 		 534 aa  45.1  0.003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2273  nitrogenase associated protein N  24.38 
 
 		 446 aa  43.9  0.006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.1891 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2004  nitrogenase  27.33 
 
 		 515 aa  43.1  0.01  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.811675 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>