63 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PCC8801_0789 on replicon NC_011726
Organism: Cyanothece sp. PCC 8801



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007413  Ava_2330  light-independent protochlorophyllide reductase subunit N  88.44 
 
 
467 aa  875    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2373  light-independent protochlorophyllide reductase subunit N  91.63 
 
 
466 aa  904    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0789  light-independent protochlorophyllide reductase subunit N  100 
 
 
466 aa  966    Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1530  light-independent protochlorophyllide reductase subunit N  86.7 
 
 
465 aa  853    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.0646926 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2304  light-independent protochlorophyllide reductase subunit N  86.3 
 
 
467 aa  859    'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0817  light-independent protochlorophyllide reductase subunit N  99.79 
 
 
466 aa  965    Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0125392  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1420  light-independent protochlorophyllide reductase subunit N  78.4 
 
 
466 aa  770    Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.172263  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3941  light-independent protochlorophyllide reductase subunit N  85.68 
 
 
468 aa  843    Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.620591  normal  0.804646 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1910  light-independent protochlorophyllide reductase subunit N  39.09 
 
 
415 aa  331  2e-89  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.902944  hitchhiker  0.00090668 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3481  light-independent protochlorophyllide reductase subunit N  38.43 
 
 
425 aa  320  3e-86  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1536  light-independent protochlorophyllide reductase subunit N  37.95 
 
 
414 aa  320  3e-86  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.120446  hitchhiker  0.00259667 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0324  light-independent protochlorophyllide reductase subunit N  36.38 
 
 
420 aa  307  3e-82  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.754207  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2260  light-independent protochlorophyllide reductase subunit N  35.71 
 
 
420 aa  305  1.0000000000000001e-81  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.307743 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2029  light-independent protochlorophyllide reductase subunit N  36.4 
 
 
420 aa  303  4.0000000000000003e-81  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.0292807 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2388  light-independent protochlorophyllide reductase subunit N  35.71 
 
 
420 aa  302  8.000000000000001e-81  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0215  light-independent protochlorophyllide reductase subunit N  36.16 
 
 
420 aa  300  4e-80  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2194  light-independent protochlorophyllide reductase subunit N  35.49 
 
 
420 aa  300  5e-80  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1815  light-independent protochlorophyllide reductase subunit N  35.42 
 
 
427 aa  290  3e-77  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_07951  light-independent protochlorophyllide reductase subunit N  34.23 
 
 
418 aa  268  1e-70  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0747  light-independent protochlorophyllide reductase subunit N  34.42 
 
 
425 aa  266  5e-70  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.957633  normal  0.357282 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_05471  light-independent protochlorophyllide reductase subunit N  35.18 
 
 
418 aa  260  3e-68  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1619  light-independent protochlorophyllide reductase subunit N  34.14 
 
 
416 aa  260  3e-68  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.43602  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6417  light-independent protochlorophyllide reductase subunit N  34.75 
 
 
428 aa  258  2e-67  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.577987  normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_05981  light-independent protochlorophyllide reductase subunit N  33.63 
 
 
419 aa  257  3e-67  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.926498 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1873  light-independent protochlorophyllide reductase subunit N  33.63 
 
 
418 aa  256  4e-67  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2042  light-independent protochlorophyllide reductase subunit N  35.12 
 
 
426 aa  256  5e-67  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.147701 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_06011  light-independent protochlorophyllide reductase subunit N  34.58 
 
 
418 aa  256  6e-67  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0623  light-independent protochlorophyllide reductase subunit N  35.12 
 
 
440 aa  254  2.0000000000000002e-66  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.957648  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0545  light-independent protochlorophyllide reductase subunit N  34.07 
 
 
418 aa  253  4.0000000000000004e-66  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_05711  light-independent protochlorophyllide reductase subunit N  33.92 
 
 
418 aa  253  6e-66  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.847677  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_06091  light-independent protochlorophyllide reductase subunit N  34.07 
 
 
418 aa  252  1e-65  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1637  light-independent protochlorophyllide reductase subunit N  33.56 
 
 
424 aa  251  3e-65  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5283  light-independent protochlorophyllide reductase subunit N  33.11 
 
 
422 aa  249  8e-65  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1730  light-independent protochlorophyllide reductase subunit N  32.67 
 
 
429 aa  248  1e-64  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1010  light-independent protochlorophyllide reductase subunit N  34.3 
 
 
428 aa  248  2e-64  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.398895  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1848  light-independent protochlorophyllide reductase subunit N  32 
 
 
424 aa  248  2e-64  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00937776 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5361  light-independent protochlorophyllide reductase subunit N  32.74 
 
 
422 aa  247  3e-64  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.752323  normal  0.24577 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0161  light-independent protochlorophyllide reductase subunit N  34 
 
 
427 aa  247  3e-64  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1313  light-independent protochlorophyllide reductase subunit N  32.58 
 
 
428 aa  246  6e-64  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.29904 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1928  light-independent protochlorophyllide reductase subunit N  33.41 
 
 
428 aa  244  3e-63  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.472722  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3981  light-independent protochlorophyllide reductase subunit N  32.09 
 
 
428 aa  244  3e-63  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.120682 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0285  light-independent protochlorophyllide reductase subunit N  33.41 
 
 
428 aa  243  5e-63  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4816  light-independent protochlorophyllide reductase subunit N  32.44 
 
 
422 aa  243  6e-63  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.596165  normal  0.0186172 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3736  light-independent protochlorophyllide reductase subunit N  32.53 
 
 
428 aa  239  5.999999999999999e-62  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.255529  hitchhiker  0.00206765 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3534  light-independent protochlorophyllide reductase subunit N  32.52 
 
 
427 aa  237  4e-61  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3718  light-independent protochlorophyllide reductase subunit N  32.4 
 
 
420 aa  233  5e-60  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.834431  normal  0.0122696 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0605  hypothetical protein  33.01 
 
 
447 aa  136  8e-31  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0794  nitrogenase  21.74 
 
 
511 aa  48.5  0.0002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4029  oxidoreductase/nitrogenase, component 1  21.62 
 
 
466 aa  48.5  0.0003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.522703 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0557  nitrogenase molybdenum-iron protein beta chain  23.47 
 
 
455 aa  48.1  0.0003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0151336  normal  0.228475 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6436  bacteriochlorophyllide reductase subunit  19.37 
 
 
512 aa  48.1  0.0003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0178  chlorophyllide reductase subunit Y  22.51 
 
 
521 aa  47.8  0.0004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3518  bacteriachlorophyllide reductase iron protein subunit Y  23.63 
 
 
534 aa  47.8  0.0004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.292352 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1146  nitrogenase molybdenum-iron protein beta chain  23.17 
 
 
455 aa  47.8  0.0004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.101192  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0104  nitrogenase  20.05 
 
 
458 aa  47  0.0007  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.294919  normal  0.143181 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1797  nitrogenase  19.9 
 
 
458 aa  46.2  0.001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.561613  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0059  nitrogenase  19.63 
 
 
458 aa  46.2  0.001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.148206  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3755  chlorophyllide reductase subunit Y  23.08 
 
 
540 aa  46.6  0.001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00652475 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2276  nitrogenase, subunit beta  22.8 
 
 
461 aa  43.9  0.005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.665587  normal  0.115682 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1711  chlorophyllide reductase subunit Y  21.43 
 
 
528 aa  44.3  0.005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0648  nitrogenase molybdenum-iron protein beta chain  18.89 
 
 
489 aa  43.9  0.006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1532  nitrogenase molybdenum-iron protein beta chain  23.74 
 
 
459 aa  43.5  0.008  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2035  chlorophyllide reductase subunit Y  22.84 
 
 
500 aa  43.1  0.01  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.201918  normal  0.260715 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>