52 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RSP_0285 on replicon NC_007493
Organism: Rhodobacter sphaeroides 2.4.1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007493  RSP_0285  light-independent protochlorophyllide reductase subunit N  100 
 
 		 428 aa  852    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3534  light-independent protochlorophyllide reductase subunit N  81.38 
 
 		 427 aa  654    Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1010  light-independent protochlorophyllide reductase subunit N  93.46 
 
 		 428 aa  779    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.398895  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1928  light-independent protochlorophyllide reductase subunit N  99.53 
 
 		 428 aa  848    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.472722  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0161  light-independent protochlorophyllide reductase subunit N  81.9 
 
 		 427 aa  678    Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3981  light-independent protochlorophyllide reductase subunit N  66.11 
 
 		 428 aa  538  9.999999999999999e-153  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.120682 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4816  light-independent protochlorophyllide reductase subunit N  67.63 
 
 		 422 aa  531  1e-150  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.596165  normal  0.0186172 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5283  light-independent protochlorophyllide reductase subunit N  67.47 
 
 		 422 aa  532  1e-150  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5361  light-independent protochlorophyllide reductase subunit N  66.43 
 
 		 422 aa  529  1e-149  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.752323  normal  0.24577 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3718  light-independent protochlorophyllide reductase subunit N  68.66 
 
 		 420 aa  530  1e-149  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.834431  normal  0.0122696 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1730  light-independent protochlorophyllide reductase subunit N  66.83 
 
 		 429 aa  530  1e-149  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1313  light-independent protochlorophyllide reductase subunit N  64.61 
 
 		 428 aa  529  1e-149  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.29904 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0623  light-independent protochlorophyllide reductase subunit N  66.35 
 
 		 440 aa  528  1e-149  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.957648  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3736  light-independent protochlorophyllide reductase subunit N  66.83 
 
 		 428 aa  522  1e-147  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.255529  hitchhiker  0.00206765 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2042  light-independent protochlorophyllide reductase subunit N  64.82 
 
 		 426 aa  523  1e-147  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.147701 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1848  light-independent protochlorophyllide reductase subunit N  66.35 
 
 		 424 aa  521  1e-147  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00937776 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6417  light-independent protochlorophyllide reductase subunit N  68.38 
 
 		 428 aa  516  1.0000000000000001e-145  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.577987  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_05471  light-independent protochlorophyllide reductase subunit N  59.11 
 
 		 418 aa  495  1e-139  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1873  light-independent protochlorophyllide reductase subunit N  58.37 
 
 		 418 aa  494  9.999999999999999e-139  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1619  light-independent protochlorophyllide reductase subunit N  60.74 
 
 		 416 aa  491  9.999999999999999e-139  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.43602  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0747  light-independent protochlorophyllide reductase subunit N  62.07 
 
 		 425 aa  494  9.999999999999999e-139  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.957633  normal  0.357282 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_05981  light-independent protochlorophyllide reductase subunit N  58.37 
 
 		 419 aa  493  9.999999999999999e-139  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.926498 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_07951  light-independent protochlorophyllide reductase subunit N  59.12 
 
 		 418 aa  490  1e-137  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0545  light-independent protochlorophyllide reductase subunit N  58.33 
 
 		 418 aa  486  1e-136  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1637  light-independent protochlorophyllide reductase subunit N  62.81 
 
 		 424 aa  479  1e-134  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_06091  light-independent protochlorophyllide reductase subunit N  58.06 
 
 		 418 aa  476  1e-133  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_06011  light-independent protochlorophyllide reductase subunit N  56.86 
 
 		 418 aa  477  1e-133  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_05711  light-independent protochlorophyllide reductase subunit N  56.13 
 
 		 418 aa  473  1e-132  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.847677  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1910  light-independent protochlorophyllide reductase subunit N  37.62 
 
 		 415 aa  261  2e-68  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.902944  hitchhiker  0.00090668 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2373  light-independent protochlorophyllide reductase subunit N  34.22 
 
 		 466 aa  253  3e-66  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3941  light-independent protochlorophyllide reductase subunit N  35.41 
 
 		 468 aa  253  5.000000000000001e-66  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.620591  normal  0.804646 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2330  light-independent protochlorophyllide reductase subunit N  35.04 
 
 		 467 aa  253  5.000000000000001e-66  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1530  light-independent protochlorophyllide reductase subunit N  34.15 
 
 		 465 aa  252  7e-66  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0646926 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1536  light-independent protochlorophyllide reductase subunit N  37.38 
 
 		 414 aa  252  8.000000000000001e-66  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.120446  hitchhiker  0.00259667 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0215  light-independent protochlorophyllide reductase subunit N  35.52 
 
 		 420 aa  249  7e-65  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2304  light-independent protochlorophyllide reductase subunit N  34.6 
 
 		 467 aa  248  1e-64  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0817  light-independent protochlorophyllide reductase subunit N  33.41 
 
 		 466 aa  248  1e-64  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0125392  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0789  light-independent protochlorophyllide reductase subunit N  33.41 
 
 		 466 aa  248  2e-64  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2194  light-independent protochlorophyllide reductase subunit N  36.27 
 
 		 420 aa  247  2e-64  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1420  light-independent protochlorophyllide reductase subunit N  33.93 
 
 		 466 aa  244  3e-63  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.172263  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1815  light-independent protochlorophyllide reductase subunit N  34.22 
 
 		 427 aa  243  5e-63  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2260  light-independent protochlorophyllide reductase subunit N  34.71 
 
 		 420 aa  243  5e-63  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.307743 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2388  light-independent protochlorophyllide reductase subunit N  35.61 
 
 		 420 aa  242  7e-63  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2029  light-independent protochlorophyllide reductase subunit N  35.52 
 
 		 420 aa  241  1e-62  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.0292807 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0324  light-independent protochlorophyllide reductase subunit N  34.72 
 
 		 420 aa  242  1e-62  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.754207  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3481  light-independent protochlorophyllide reductase subunit N  35.05 
 
 		 425 aa  236  7e-61  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0605  hypothetical protein  32.43 
 
 		 447 aa  84.3  0.000000000000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0773  nitrogenase  28.84 
 
 		 487 aa  48.9  0.0002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0404  NifH/frxC-family protein  24.87 
 
 		 731 aa  48.9  0.0002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.394931 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1817  oxidoreductase/nitrogenase component 1  25.52 
 
 		 410 aa  48.1  0.0003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2607  Nitrogenase  28 
 
 		 501 aa  45.1  0.003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0234589  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0850  chlorophyllide reductase subunit Y  30.65 
 
 		 438 aa  43.5  0.008  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.053677  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>