65 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpha266_2388 on replicon NC_008639
Organism: Chlorobium phaeobacteroides DSM 266



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011060  Ppha_0324  light-independent protochlorophyllide reductase subunit N  89.76 
 
 		 420 aa  784    Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.754207  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2029  light-independent protochlorophyllide reductase subunit N  81.19 
 
 		 420 aa  725    Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.0292807 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2260  light-independent protochlorophyllide reductase subunit N  80.24 
 
 		 420 aa  714    Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.307743 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0215  light-independent protochlorophyllide reductase subunit N  88.1 
 
 		 420 aa  786    Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2194  light-independent protochlorophyllide reductase subunit N  91.67 
 
 		 420 aa  800    Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1815  light-independent protochlorophyllide reductase subunit N  84.2 
 
 		 427 aa  751    Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2388  light-independent protochlorophyllide reductase subunit N  100 
 
 		 420 aa  865    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1910  light-independent protochlorophyllide reductase subunit N  67.07 
 
 		 415 aa  590  1e-167  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.902944  hitchhiker  0.00090668 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1536  light-independent protochlorophyllide reductase subunit N  66.34 
 
 		 414 aa  581  1.0000000000000001e-165  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.120446  hitchhiker  0.00259667 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3481  light-independent protochlorophyllide reductase subunit N  63.41 
 
 		 425 aa  557  1e-157  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2304  light-independent protochlorophyllide reductase subunit N  37.41 
 
 		 467 aa  307  3e-82  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2373  light-independent protochlorophyllide reductase subunit N  36.36 
 
 		 466 aa  306  4.0000000000000004e-82  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1420  light-independent protochlorophyllide reductase subunit N  35.57 
 
 		 466 aa  304  2.0000000000000002e-81  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.172263  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2330  light-independent protochlorophyllide reductase subunit N  37.56 
 
 		 467 aa  304  2.0000000000000002e-81  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0817  light-independent protochlorophyllide reductase subunit N  35.71 
 
 		 466 aa  303  5.000000000000001e-81  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0125392  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0789  light-independent protochlorophyllide reductase subunit N  35.71 
 
 		 466 aa  302  7.000000000000001e-81  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3941  light-independent protochlorophyllide reductase subunit N  37.73 
 
 		 468 aa  301  2e-80  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.620591  normal  0.804646 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1530  light-independent protochlorophyllide reductase subunit N  36.38 
 
 		 465 aa  300  3e-80  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0646926 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_07951  light-independent protochlorophyllide reductase subunit N  36.45 
 
 		 418 aa  259  6e-68  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6417  light-independent protochlorophyllide reductase subunit N  36.8 
 
 		 428 aa  253  4.0000000000000004e-66  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.577987  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0161  light-independent protochlorophyllide reductase subunit N  36.25 
 
 		 427 aa  252  8.000000000000001e-66  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1619  light-independent protochlorophyllide reductase subunit N  36.65 
 
 		 416 aa  252  8.000000000000001e-66  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.43602  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0623  light-independent protochlorophyllide reductase subunit N  37.98 
 
 		 440 aa  251  1e-65  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.957648  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1848  light-independent protochlorophyllide reductase subunit N  37.77 
 
 		 424 aa  251  2e-65  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00937776 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1873  light-independent protochlorophyllide reductase subunit N  35.54 
 
 		 418 aa  250  4e-65  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3534  light-independent protochlorophyllide reductase subunit N  35.52 
 
 		 427 aa  249  4e-65  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_05471  light-independent protochlorophyllide reductase subunit N  36.08 
 
 		 418 aa  249  6e-65  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_05981  light-independent protochlorophyllide reductase subunit N  35.28 
 
 		 419 aa  248  1e-64  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.926498 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1313  light-independent protochlorophyllide reductase subunit N  36.1 
 
 		 428 aa  248  2e-64  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.29904 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2042  light-independent protochlorophyllide reductase subunit N  36.45 
 
 		 426 aa  246  4e-64  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.147701 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0747  light-independent protochlorophyllide reductase subunit N  35.56 
 
 		 425 aa  244  1.9999999999999999e-63  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.957633  normal  0.357282 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3981  light-independent protochlorophyllide reductase subunit N  35.54 
 
 		 428 aa  243  5e-63  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.120682 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5283  light-independent protochlorophyllide reductase subunit N  37.2 
 
 		 422 aa  241  2e-62  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1637  light-independent protochlorophyllide reductase subunit N  35.44 
 
 		 424 aa  241  2e-62  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1730  light-independent protochlorophyllide reductase subunit N  34.54 
 
 		 429 aa  239  5e-62  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0285  light-independent protochlorophyllide reductase subunit N  35.12 
 
 		 428 aa  238  1e-61  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1010  light-independent protochlorophyllide reductase subunit N  34.37 
 
 		 428 aa  237  3e-61  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.398895  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3736  light-independent protochlorophyllide reductase subunit N  33.89 
 
 		 428 aa  236  6e-61  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.255529  hitchhiker  0.00206765 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1928  light-independent protochlorophyllide reductase subunit N  34.88 
 
 		 428 aa  236  6e-61  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.472722  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3718  light-independent protochlorophyllide reductase subunit N  35.96 
 
 		 420 aa  236  8e-61  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.834431  normal  0.0122696 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4816  light-independent protochlorophyllide reductase subunit N  36.23 
 
 		 422 aa  235  1.0000000000000001e-60  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.596165  normal  0.0186172 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5361  light-independent protochlorophyllide reductase subunit N  36.57 
 
 		 422 aa  232  1e-59  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.752323  normal  0.24577 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0545  light-independent protochlorophyllide reductase subunit N  33.25 
 
 		 418 aa  230  3e-59  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_06091  light-independent protochlorophyllide reductase subunit N  33.25 
 
 		 418 aa  226  6e-58  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_06011  light-independent protochlorophyllide reductase subunit N  32.53 
 
 		 418 aa  223  4e-57  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_05711  light-independent protochlorophyllide reductase subunit N  32.05 
 
 		 418 aa  223  4.9999999999999996e-57  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.847677  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0605  hypothetical protein  25.84 
 
 		 447 aa  142  8e-33  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3744  chlorophyllide reductase subunit Y  26.43 
 
 		 422 aa  57.4  0.0000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000125918 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0093  Nitrogenase  23.84 
 
 		 511 aa  51.6  0.00003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.061617 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0280  NifH/frxC  21.12 
 
 		 728 aa  49.3  0.0001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.359044  normal  0.513981 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2607  Nitrogenase  24.04 
 
 		 501 aa  48.5  0.0002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0234589  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0324  chlorophyllide reductase subunit Y  21.16 
 
 		 412 aa  48.5  0.0002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1817  oxidoreductase/nitrogenase component 1  28 
 
 		 410 aa  48.1  0.0003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2035  chlorophyllide reductase subunit Y  23.43 
 
 		 412 aa  47  0.0006  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2004  nitrogenase  25.34 
 
 		 515 aa  46.6  0.0007  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.811675 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1863  chlorophyllide reductase subunit Y  21.71 
 
 		 415 aa  46.6  0.0009  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0178  chlorophyllide reductase subunit Y  22.03 
 
 		 521 aa  45.1  0.002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2273  nitrogenase associated protein N  22.42 
 
 		 446 aa  45.4  0.002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.1891 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4029  oxidoreductase/nitrogenase, component 1  25.16 
 
 		 466 aa  44.7  0.003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.522703 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2082  oxidoreductase/nitrogenase, component 1  24.61 
 
 		 347 aa  44.3  0.004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2028  light-independent protochlorophyllide reductase subunit B  21.47 
 
 		 533 aa  43.9  0.006  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.0312494 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2009  nitrogenase  25.54 
 
 		 516 aa  43.5  0.007  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0918882  normal  0.238149 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1355  Nitrogenase  21.64 
 
 		 505 aa  43.5  0.007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0527028  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3518  bacteriachlorophyllide reductase iron protein subunit Y  24.07 
 
 		 534 aa  43.5  0.007  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.292352 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0342  chlorophyllide reductase subunit Y  19.41 
 
 		 418 aa  43.1  0.008  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.680799  normal  0.193791 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>