More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mchl_2530 on replicon NC_011757
Organism: Methylobacterium chloromethanicum CM4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010172  Mext_2255  PAS sensor protein  97.77 
 
 
371 aa  659    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.383857  normal  0.0714746 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2530  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  100 
 
 
370 aa  724    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2212  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  86.22 
 
 
370 aa  580  1e-164  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.284425 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0550  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  55.43 
 
 
365 aa  362  8e-99  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.671139  normal  0.0432359 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5843  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  48.43 
 
 
383 aa  268  1e-70  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5104  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  51.7 
 
 
376 aa  253  4.0000000000000004e-66  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0174826 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4874  histidine kinase  36.44 
 
 
544 aa  187  2e-46  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.300744  normal  0.0460746 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3567  histidine kinase  33.24 
 
 
539 aa  183  4.0000000000000006e-45  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.464366  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3139  histidine kinase  34.46 
 
 
533 aa  183  5.0000000000000004e-45  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.468681  normal  0.330779 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3461  histidine kinase  34.54 
 
 
533 aa  182  8.000000000000001e-45  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3336  histidine kinase  34.05 
 
 
531 aa  182  1e-44  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3564  histidine kinase  34.73 
 
 
544 aa  179  4.999999999999999e-44  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0880  histidine kinase  32.67 
 
 
534 aa  175  9.999999999999999e-43  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2357  histidine kinase  32.94 
 
 
533 aa  166  4e-40  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0826278 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2535  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  36.89 
 
 
688 aa  166  5e-40  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.121998  normal  0.468356 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1931  histidine kinase  33.89 
 
 
541 aa  166  6.9999999999999995e-40  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.300086  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1649  histidine kinase  33.89 
 
 
541 aa  166  6.9999999999999995e-40  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.784453 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1581  histidine kinase  34.08 
 
 
541 aa  164  3e-39  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2896  sensory box histidine kinase/response regulator  31.3 
 
 
534 aa  158  1e-37  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.287234  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01426  histidine kinase  34.11 
 
 
507 aa  158  1e-37  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.643455  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2700  histidine kinase  32.24 
 
 
534 aa  157  3e-37  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0483155  normal  0.0451896 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0272  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  38.76 
 
 
766 aa  152  8.999999999999999e-36  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1809  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  37.32 
 
 
927 aa  150  4e-35  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.295908 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5389  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  35 
 
 
762 aa  149  8e-35  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2588  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  36.01 
 
 
766 aa  148  1.0000000000000001e-34  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3549  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.24 
 
 
702 aa  149  1.0000000000000001e-34  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2406  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.04 
 
 
773 aa  149  1.0000000000000001e-34  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2148  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  35.71 
 
 
655 aa  148  2.0000000000000003e-34  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.440522  normal  0.494902 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3298  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  33.13 
 
 
922 aa  147  3e-34  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.25103 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3860  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  38.34 
 
 
520 aa  147  3e-34  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2264  multi-sensor hybrid histidine kinase  31.93 
 
 
692 aa  146  5e-34  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6213  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  31.43 
 
 
559 aa  145  1e-33  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1952  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  32.21 
 
 
692 aa  145  1e-33  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1530  multi-sensor hybrid histidine kinase  38.11 
 
 
1164 aa  144  3e-33  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3741  putative PAS/PAC sensor protein  31.68 
 
 
1268 aa  144  3e-33  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2401  multi-sensor hybrid histidine kinase  28.99 
 
 
991 aa  143  4e-33  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.986059 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1555  sensory box histidine kinase/response regulator  32.85 
 
 
1112 aa  142  9.999999999999999e-33  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0463  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  31.07 
 
 
642 aa  142  9.999999999999999e-33  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.683271 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0437  PAS sensor protein  35.06 
 
 
1225 aa  141  1.9999999999999998e-32  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.719852  normal  0.440419 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3507  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  32.54 
 
 
662 aa  140  3e-32  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2554  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  39 
 
 
551 aa  140  3e-32  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.344016  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2045  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  36.33 
 
 
812 aa  140  3e-32  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000148537 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0171  multi-sensor hybrid histidine kinase  36.56 
 
 
740 aa  140  3.9999999999999997e-32  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1329  PAS sensor protein  37.74 
 
 
1164 aa  140  3.9999999999999997e-32  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.488954 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2181  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  38.62 
 
 
712 aa  140  3.9999999999999997e-32  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.113069  normal  0.344517 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0517  histidine kinase  36.56 
 
 
726 aa  140  4.999999999999999e-32  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.978002  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0471  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.06 
 
 
1225 aa  140  4.999999999999999e-32  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.221036  normal  0.153067 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2379  multi-sensor hybrid histidine kinase  32 
 
 
1509 aa  139  4.999999999999999e-32  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4268  histidine kinase  36.61 
 
 
575 aa  140  4.999999999999999e-32  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.396925 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0096  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.94 
 
 
741 aa  139  1e-31  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.770159  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3132  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  34.27 
 
 
743 aa  139  1e-31  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.583735  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3336  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  31.44 
 
 
1065 aa  138  1e-31  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.115718  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1812  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  31.47 
 
 
773 aa  139  1e-31  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.021882 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1968  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  36.22 
 
 
933 aa  138  2e-31  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0802  PAS sensor protein  30.59 
 
 
1065 aa  137  2e-31  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0508  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.13 
 
 
1215 aa  137  2e-31  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.722414  normal  0.07841 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2081  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.52 
 
 
899 aa  137  3.0000000000000003e-31  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00980702 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2267  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  36.36 
 
 
721 aa  137  3.0000000000000003e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0115994  normal  0.0775846 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3362  PAS sensor protein  30.72 
 
 
678 aa  137  3.0000000000000003e-31  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4456  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  32.41 
 
 
1415 aa  137  4e-31  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2665  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  34.15 
 
 
637 aa  137  4e-31  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.266574  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3045  multi-sensor hybrid histidine kinase  29.89 
 
 
954 aa  137  4e-31  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00011876  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0428  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.14 
 
 
943 aa  137  4e-31  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.94781  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4905  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  35.04 
 
 
822 aa  137  4e-31  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.28937 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3125  putative sensor/response regulator hybrid  35.47 
 
 
650 aa  135  8e-31  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.70953  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2137  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  31.87 
 
 
943 aa  135  9.999999999999999e-31  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3488  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  33.22 
 
 
508 aa  135  9.999999999999999e-31  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3692  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  37.01 
 
 
951 aa  135  9.999999999999999e-31  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.408416  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0541  response regulator receiver sensor hybrid histidine kinase  36.95 
 
 
575 aa  135  1.9999999999999998e-30  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2885  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  35.25 
 
 
818 aa  134  1.9999999999999998e-30  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0237924  normal  0.0700462 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3277  ATP-binding region, ATPase-like  31.82 
 
 
812 aa  134  1.9999999999999998e-30  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.438196  hitchhiker  0.00707292 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_36420  putative sensor/response regulator hybrid  34.71 
 
 
699 aa  134  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.426849  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2043  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  34.96 
 
 
691 aa  135  1.9999999999999998e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.10086  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1684  histidine kinase  36.84 
 
 
701 aa  134  3e-30  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1681  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.94 
 
 
926 aa  134  3e-30  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.270935  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6615  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  34.71 
 
 
660 aa  133  3.9999999999999996e-30  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0224174  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0269  multi-sensor hybrid histidine kinase  30.77 
 
 
885 aa  133  3.9999999999999996e-30  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5728  multi-sensor hybrid histidine kinase  36.33 
 
 
727 aa  133  3.9999999999999996e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0878  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  35.32 
 
 
754 aa  133  5e-30  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.307069  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3535  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  33.14 
 
 
695 aa  133  5e-30  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.02065  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4846  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  35.92 
 
 
701 aa  133  6e-30  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.110474 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5991  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  31.62 
 
 
642 aa  132  7.999999999999999e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1666  ATP-binding region, ATPase-like  31.27 
 
 
1427 aa  132  7.999999999999999e-30  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.207779 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0235  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  32.66 
 
 
941 aa  132  7.999999999999999e-30  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1396  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  35.69 
 
 
721 aa  132  9e-30  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.814379  normal  0.333041 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3591  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  33.79 
 
 
650 aa  132  9e-30  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0098  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  35.38 
 
 
1050 aa  132  1.0000000000000001e-29  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3083  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  36.14 
 
 
845 aa  132  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2370  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.26 
 
 
795 aa  132  1.0000000000000001e-29  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0114838  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3208  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  36.14 
 
 
702 aa  132  1.0000000000000001e-29  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.289512 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3679  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  31.89 
 
 
979 aa  132  1.0000000000000001e-29  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.138825  normal  0.0339746 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2956  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  32.23 
 
 
650 aa  132  1.0000000000000001e-29  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.753222  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0146  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.84 
 
 
1381 aa  131  2.0000000000000002e-29  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.436687 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5545  two component sensor kinase/response regulator hybrid  33.33 
 
 
1036 aa  130  2.0000000000000002e-29  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1277  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  33.05 
 
 
807 aa  131  2.0000000000000002e-29  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.912371  normal  0.18237 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2373  multi-sensor hybrid histidine kinase  30.5 
 
 
769 aa  131  2.0000000000000002e-29  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6265  sensor histidine kinase  35.95 
 
 
490 aa  131  2.0000000000000002e-29  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0824359  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3211  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  34.26 
 
 
696 aa  130  3e-29  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.7085  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3039  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  31.83 
 
 
1067 aa  130  3e-29  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.635771  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2619  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  34.02 
 
 
789 aa  130  3e-29  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0163342  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>