More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Maqu_0875 on replicon NC_008740
Organism: Marinobacter aquaeolei VT8



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008740  Maqu_0875  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  100 
 
 
548 aa  1117    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0824  sensor protein PilS  41.94 
 
 
531 aa  374  1e-102  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.1537  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5186  two-component sensor PilS  41.35 
 
 
530 aa  370  1e-101  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_60250  two-component sensor PilS  41.17 
 
 
530 aa  368  1e-100  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000371089 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0723  type IV pilus sensor protein PilS  42.02 
 
 
530 aa  363  3e-99  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0966  sensor protein PilS  42.42 
 
 
530 aa  356  5e-97  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.253807  normal  0.772393 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2554  sensor protein PilS  36.28 
 
 
528 aa  327  3e-88  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.041487 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4839  sensor protein PilS  41.32 
 
 
529 aa  325  2e-87  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.82522  normal  0.50188 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1175  hypothetical protein  32.58 
 
 
528 aa  279  9e-74  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1181  hypothetical protein  32.58 
 
 
528 aa  278  1e-73  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0215  signal transduction histidine kinase  36.43 
 
 
531 aa  274  4.0000000000000004e-72  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.69088 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2036  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  37.06 
 
 
555 aa  259  1e-67  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.435386  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2116  two-component system, sensor protein  36.84 
 
 
536 aa  256  9e-67  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0722  signal transduction histidine kinase  39.88 
 
 
552 aa  251  2e-65  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00200947  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3165  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.78 
 
 
592 aa  249  7e-65  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.374256  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2617  histidine kinase  37.77 
 
 
531 aa  248  2e-64  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  decreased coverage  0.000901254  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04880  two-component system sensor protein  32.64 
 
 
537 aa  248  2e-64  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.457628  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2123  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  34.73 
 
 
549 aa  247  4e-64  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.0815467 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2545  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  34.76 
 
 
556 aa  233  8.000000000000001e-60  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.668362  normal  0.0765765 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2270  multi-sensor signal transduction histidine kinase  34.73 
 
 
548 aa  218  2e-55  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0676  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  31.02 
 
 
576 aa  218  2e-55  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.268239  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0661  signal transduction histidine kinase  33.14 
 
 
537 aa  214  2.9999999999999995e-54  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1806  periplasmic sensor Signal transduction histidine kinase  33.02 
 
 
619 aa  206  6e-52  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3289  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  31.91 
 
 
531 aa  182  1e-44  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.290961  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3217  signal transduction histidine kinase  29.77 
 
 
642 aa  176  9.999999999999999e-43  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.478958 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0379  histidine kinase  29.02 
 
 
694 aa  171  3e-41  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0254109 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0363  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  32.63 
 
 
530 aa  163  7e-39  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal  0.63729 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0184  sensor protein PilS, putative  32.63 
 
 
530 aa  163  7e-39  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2643  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  40.08 
 
 
679 aa  163  9e-39  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2808  transmembrane sensor histidine kinase transcription regulator protein  40.96 
 
 
682 aa  161  2e-38  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.561745  normal  0.251067 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2944  sensor histidine kinase  41.18 
 
 
705 aa  158  3e-37  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.549384  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3091  multi-sensor signal transduction histidine kinase  39.37 
 
 
678 aa  154  2.9999999999999998e-36  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3053  multi-sensor signal transduction histidine kinase  38.8 
 
 
679 aa  154  4e-36  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1504  histidine kinase  28.11 
 
 
587 aa  152  2e-35  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0959  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  28.33 
 
 
566 aa  146  1e-33  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3344  multi-sensor signal transduction histidine kinase  26.52 
 
 
584 aa  142  1.9999999999999998e-32  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2511  multi-sensor signal transduction histidine kinase  26.87 
 
 
543 aa  142  1.9999999999999998e-32  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2592  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  28.26 
 
 
539 aa  139  1e-31  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1634  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  28.4 
 
 
538 aa  138  3.0000000000000003e-31  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2146  two component signal transduction histidine kinase  26.61 
 
 
559 aa  137  3.0000000000000003e-31  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3629  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.54 
 
 
566 aa  136  9e-31  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2939  histidine kinase  28.29 
 
 
566 aa  135  1.9999999999999998e-30  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.875107  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1499  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  27.86 
 
 
565 aa  134  3.9999999999999996e-30  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1111  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  26.53 
 
 
571 aa  133  9e-30  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.28025  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3382  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  26.23 
 
 
572 aa  133  1.0000000000000001e-29  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0172  sensory histidine kinase AtoS  27.91 
 
 
621 aa  131  3e-29  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.557198  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0670  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  26.71 
 
 
546 aa  131  4.0000000000000003e-29  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0451507  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0531  sensory histidine kinase AtoS  30.64 
 
 
611 aa  130  7.000000000000001e-29  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1494  sensory box histidine kinase  26.24 
 
 
550 aa  126  1e-27  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.102326  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0867  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  27.89 
 
 
568 aa  124  4e-27  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.134517 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2679  multi-sensor signal transduction histidine kinase  27.24 
 
 
544 aa  123  9e-27  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1396  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  27.27 
 
 
547 aa  122  9.999999999999999e-27  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0659  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  27.56 
 
 
525 aa  122  1.9999999999999998e-26  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0659  multi-sensor signal transduction histidine kinase  28.2 
 
 
525 aa  122  1.9999999999999998e-26  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0426  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  28.29 
 
 
598 aa  120  4.9999999999999996e-26  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.830485  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2402  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.03 
 
 
803 aa  120  7.999999999999999e-26  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.623752 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0016  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  27.92 
 
 
679 aa  120  7.999999999999999e-26  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.225702  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0915  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  28.68 
 
 
362 aa  120  9e-26  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.115848  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4825  multi-sensor signal transduction histidine kinase  24.91 
 
 
582 aa  119  9.999999999999999e-26  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.924426 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0701  Cache sensor signal transduction histidine kinase  35.65 
 
 
655 aa  117  5e-25  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.831837  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0625  multi-sensor signal transduction histidine kinase  28.24 
 
 
526 aa  117  6e-25  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0119  multi-sensor signal transduction histidine kinase  23.23 
 
 
571 aa  117  7.999999999999999e-25  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.412791  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1952  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  33.48 
 
 
752 aa  116  8.999999999999998e-25  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.664907  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1523  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.96 
 
 
656 aa  115  2.0000000000000002e-24  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2693  histidine kinase  33.96 
 
 
656 aa  115  3e-24  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.23882e-16 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1831  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  30.16 
 
 
793 aa  114  3e-24  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.836817  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1422  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.16 
 
 
655 aa  114  4.0000000000000004e-24  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000957952  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2057  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  30.35 
 
 
747 aa  113  7.000000000000001e-24  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.376311  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1907  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  30.86 
 
 
747 aa  113  7.000000000000001e-24  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1972  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  30.35 
 
 
747 aa  113  7.000000000000001e-24  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.466348  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1311  sensory histidine kinase AtoS  32.02 
 
 
614 aa  113  9e-24  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0632  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  27.89 
 
 
695 aa  112  1.0000000000000001e-23  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.554525  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2698  multi-sensor signal transduction histidine kinase  25.47 
 
 
438 aa  113  1.0000000000000001e-23  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1656  multi-sensor signal transduction histidine kinase  26.22 
 
 
549 aa  111  3e-23  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.367879  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2560  multi-sensor signal transduction histidine kinase  31.3 
 
 
540 aa  111  3e-23  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.948735  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0675  multi-sensor signal transduction histidine kinase  26.89 
 
 
855 aa  110  5e-23  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2908  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  27.79 
 
 
604 aa  110  5e-23  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.293686  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1389  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  23.77 
 
 
550 aa  110  6e-23  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.531963  normal  0.0257718 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2712  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  29.27 
 
 
564 aa  110  6e-23  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2821  sensory box histidine kinase  27.79 
 
 
604 aa  110  7.000000000000001e-23  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1139  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  27.55 
 
 
578 aa  110  8.000000000000001e-23  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2015  two component hybrid sensor response regulator  30.04 
 
 
391 aa  110  8.000000000000001e-23  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0343  multi-sensor signal transduction histidine kinase  27.27 
 
 
689 aa  109  1e-22  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.135812 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1012  sensory histidine kinase AtoS  27.7 
 
 
611 aa  109  1e-22  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.0763097 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2632  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.11 
 
 
510 aa  109  1e-22  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0642  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.87 
 
 
492 aa  109  1e-22  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.400591  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0668  histidine kinase  31.38 
 
 
542 aa  109  1e-22  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.512830000000001e-32 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02146  sensory histidine kinase in two-component regulatory system with AtoC  27.22 
 
 
608 aa  108  2e-22  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1439  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  27.22 
 
 
608 aa  108  2e-22  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.36941  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2360  sensory histidine kinase AtoS  27.22 
 
 
608 aa  108  2e-22  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00013069  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1431  sensory histidine kinase AtoS  27.22 
 
 
608 aa  109  2e-22  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.250093  hitchhiker  0.00150562 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3741  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.45 
 
 
367 aa  108  2e-22  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.49679  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0213  multi-sensor signal transduction histidine kinase  27.96 
 
 
722 aa  108  2e-22  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.100019 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1404  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  30.18 
 
 
361 aa  108  2e-22  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000236023 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02105  hypothetical protein  27.22 
 
 
608 aa  108  2e-22  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2807  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  28.88 
 
 
505 aa  108  3e-22  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2368  sensory histidine kinase AtoS  26.36 
 
 
608 aa  107  4e-22  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0221711  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2787  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  26.82 
 
 
365 aa  107  5e-22  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.220649  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3168  histidine kinase  28.85 
 
 
369 aa  107  5e-22  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3646  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.62 
 
 
522 aa  107  6e-22  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00328327  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>