More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Veis_1499 on replicon NC_008786
Organism: Verminephrobacter eiseniae EF01-2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008752  Aave_0867  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  66.49 
 
 		 568 aa  660    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.134517 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1499  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  100 
 
 		 565 aa  1141    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2939  histidine kinase  62.7 
 
 		 566 aa  628  1e-179  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.875107  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3629  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  62.7 
 
 		 566 aa  627  1e-178  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1504  histidine kinase  53.81 
 
 		 587 aa  517  1.0000000000000001e-145  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3382  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  51.4 
 
 		 572 aa  511  1e-144  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3344  multi-sensor signal transduction histidine kinase  50.18 
 
 		 584 aa  510  1e-143  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1111  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  53.17 
 
 		 571 aa  511  1e-143  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.28025  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0959  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  50.82 
 
 		 566 aa  486  1e-136  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3217  signal transduction histidine kinase  38.97 
 
 		 642 aa  315  1.9999999999999998e-84  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.478958 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0379  histidine kinase  41.4 
 
 		 694 aa  299  1e-79  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0254109 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1806  periplasmic sensor Signal transduction histidine kinase  32.08 
 
 		 619 aa  171  3e-41  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0661  signal transduction histidine kinase  29.76 
 
 		 537 aa  167  6.9999999999999995e-40  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0215  signal transduction histidine kinase  29.93 
 
 		 531 aa  162  2e-38  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.69088 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0966  sensor protein PilS  29.46 
 
 		 530 aa  156  1e-36  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.253807  normal  0.772393 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_60250  two-component sensor PilS  27.9 
 
 		 530 aa  152  1e-35  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000371089 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0723  type IV pilus sensor protein PilS  25.38 
 
 		 530 aa  151  2e-35  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3091  multi-sensor signal transduction histidine kinase  27.74 
 
 		 678 aa  150  5e-35  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5186  two-component sensor PilS  27.39 
 
 		 530 aa  147  4.0000000000000006e-34  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3289  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  29.89 
 
 		 531 aa  147  5e-34  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.290961  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4839  sensor protein PilS  30.16 
 
 		 529 aa  144  6e-33  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.82522  normal  0.50188 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2545  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  32.89 
 
 		 556 aa  143  7e-33  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.668362  normal  0.0765765 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0824  sensor protein PilS  27.29 
 
 		 531 aa  138  2e-31  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.1537  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3165  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.07 
 
 		 592 aa  139  2e-31  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.374256  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0875  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  27.86 
 
 		 548 aa  134  3.9999999999999996e-30  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04880  two-component system sensor protein  29.88 
 
 		 537 aa  133  7.999999999999999e-30  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.457628  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2617  histidine kinase  30.26 
 
 		 531 aa  130  7.000000000000001e-29  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  decreased coverage  0.000901254  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2270  multi-sensor signal transduction histidine kinase  27.71 
 
 		 548 aa  128  2.0000000000000002e-28  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2643  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  33.59 
 
 		 679 aa  127  5e-28  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2808  transmembrane sensor histidine kinase transcription regulator protein  35.39 
 
 		 682 aa  126  1e-27  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.561745  normal  0.251067 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2116  two-component system, sensor protein  28.45 
 
 		 536 aa  125  2e-27  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3053  multi-sensor signal transduction histidine kinase  34.3 
 
 		 679 aa  125  2e-27  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2036  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.24 
 
 		 555 aa  123  7e-27  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.435386  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2944  sensor histidine kinase  31.95 
 
 		 705 aa  122  9.999999999999999e-27  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.549384  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1181  hypothetical protein  24.41 
 
 		 528 aa  121  3.9999999999999996e-26  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0722  signal transduction histidine kinase  28.72 
 
 		 552 aa  120  4.9999999999999996e-26  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00200947  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1175  hypothetical protein  24.05 
 
 		 528 aa  119  1.9999999999999998e-25  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2712  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  26.74 
 
 		 564 aa  111  4.0000000000000004e-23  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0363  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  29.66 
 
 		 530 aa  111  5e-23  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.63729 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0184  sensor protein PilS, putative  29.66 
 
 		 530 aa  111  5e-23  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2123  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  30.77 
 
 		 549 aa  110  9.000000000000001e-23  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.0815467 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2848  histidine kinase  29.88 
 
 		 481 aa  107  8e-22  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2554  sensor protein PilS  24.07 
 
 		 528 aa  107  8e-22  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.041487 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0676  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  27.07 
 
 		 576 aa  105  3e-21  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.268239  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0879  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  24.15 
 
 		 903 aa  104  4e-21  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3530  histidine kinase  33.62 
 
 		 548 aa  102  2e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02146  sensory histidine kinase in two-component regulatory system with AtoC  27.27 
 
 		 608 aa  101  3e-20  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1439  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  27.27 
 
 		 608 aa  102  3e-20  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.36941  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1431  sensory histidine kinase AtoS  27.27 
 
 		 608 aa  102  3e-20  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.250093  hitchhiker  0.00150562 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2360  sensory histidine kinase AtoS  27.27 
 
 		 608 aa  102  3e-20  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00013069  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02105  hypothetical protein  27.27 
 
 		 608 aa  101  3e-20  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1225  sensor histidine kinase; sporulation kinase  29.05 
 
 		 498 aa  100  6e-20  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.485232  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1250  histidine kinase  29.06 
 
 		 498 aa  100  7e-20  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.792826  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3957  sensor histidine kinase KinD  29.06 
 
 		 498 aa  100  7e-20  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.5608 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3383  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  32.75 
 
 		 548 aa  100  8e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.918408  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1227  sensor histidine kinase; sporulation kinase  28.86 
 
 		 498 aa  100  9e-20  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1424  sensor histidine kinase KinD  28.86 
 
 		 498 aa  100  9e-20  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00267919 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1252  sensor histidine kinase KinD  28.86 
 
 		 498 aa  100  1e-19  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0172  sensory histidine kinase AtoS  29.68 
 
 		 621 aa  99.8  1e-19  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.557198  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1351  sensor histidine kinase KinD  28.86 
 
 		 498 aa  100  1e-19  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1387  sensor histidine kinase KinD  29.06 
 
 		 498 aa  99.8  1e-19  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3466  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.75 
 
 		 548 aa  99  2e-19  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0535402  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0285  multi-sensor signal transduction histidine kinase  24.14 
 
 		 867 aa  98.2  3e-19  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.00119398  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0142  histidine kinase  35.21 
 
 		 614 aa  98.6  3e-19  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1033  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.91 
 
 		 581 aa  98.6  3e-19  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.487661 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0119  multi-sensor signal transduction histidine kinase  23.84 
 
 		 571 aa  98.6  3e-19  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.412791  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0854  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  32.24 
 
 		 490 aa  98.2  3e-19  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1470  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  22.66 
 
 		 755 aa  98.2  4e-19  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.797654  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1449  sensor histidine kinase KinD  28.57 
 
 		 498 aa  97.4  6e-19  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2368  sensory histidine kinase AtoS  26.98 
 
 		 608 aa  97.4  7e-19  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0221711  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1059  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.33 
 
 		 498 aa  96.7  1e-18  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2146  two component signal transduction histidine kinase  26.92 
 
 		 559 aa  95.5  2e-18  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0531  sensory histidine kinase AtoS  27.83 
 
 		 611 aa  95.5  2e-18  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2270  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.81 
 
 		 661 aa  95.5  3e-18  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3414  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.34 
 
 		 406 aa  95.1  3e-18  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1952  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  28.73 
 
 		 752 aa  94.7  4e-18  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.664907  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1490  sensor histidine kinase KinD  28.08 
 
 		 498 aa  94.4  5e-18  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1658  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  28.24 
 
 		 579 aa  94.4  5e-18  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0362267  normal  0.337398 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0084  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.26 
 
 		 372 aa  94.4  5e-18  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2560  multi-sensor signal transduction histidine kinase  30.59 
 
 		 540 aa  94.4  6e-18  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.948735  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1424  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  22.82 
 
 		 720 aa  94  7e-18  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.916012  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0039  histidine kinase  30 
 
 		 655 aa  93.6  8e-18  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3582  multi-sensor signal transduction histidine kinase  27.3 
 
 		 516 aa  93.2  1e-17  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0103358 
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3646  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.97 
 
 		 372 aa  92.8  1e-17  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0110  multi-sensor signal transduction histidine kinase  26.55 
 
 		 592 aa  92.4  2e-17  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1907  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  28.51 
 
 		 747 aa  92.4  2e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0078  histidine kinase  32.24 
 
 		 475 aa  92  2e-17  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0426  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  27.43 
 
 		 598 aa  91.7  3e-17  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.830485  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2592  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  26.98 
 
 		 539 aa  91.3  4e-17  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0016  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  24.72 
 
 		 679 aa  91.7  4e-17  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.225702  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1057  histidine kinase  30.52 
 
 		 673 aa  90.9  5e-17  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.0263803 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2057  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  28.51 
 
 		 747 aa  90.9  5e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.376311  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0941  sensor histidine kinase, putative  31.75 
 
 		 248 aa  90.9  6e-17  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1972  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  28.51 
 
 		 747 aa  90.9  6e-17  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.466348  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3393  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  24.64 
 
 		 607 aa  90.9  6e-17  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.391866  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4580  sensor protein ZraS  27.6 
 
 		 465 aa  90.5  7e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.910728 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0471  sensor histidine kinase  30.33 
 
 		 419 aa  90.1  9e-17  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.328588  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0670  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  29.03 
 
 		 546 aa  90.1  9e-17  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0451507  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4506  sensor protein ZraS  27.19 
 
 		 465 aa  90.1  9e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.0449014 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1137  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  23.63 
 
 		 412 aa  90.1  9e-17  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000397625  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>