More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Reut_A2944 on replicon NC_007347
Organism: Ralstonia eutropha JMP134



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007347  Reut_A2944  sensor histidine kinase  100 
 
 
705 aa  1403    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.549384  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2643  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  54.17 
 
 
679 aa  635    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3091  multi-sensor signal transduction histidine kinase  70.67 
 
 
678 aa  917    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3053  multi-sensor signal transduction histidine kinase  53.99 
 
 
679 aa  634  1e-180  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2808  transmembrane sensor histidine kinase transcription regulator protein  52.59 
 
 
682 aa  558  1e-157  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.561745  normal  0.251067 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3217  signal transduction histidine kinase  30.55 
 
 
642 aa  184  4.0000000000000006e-45  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.478958 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3289  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  41.8 
 
 
531 aa  170  7e-41  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.290961  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0875  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  41.18 
 
 
548 aa  157  5.0000000000000005e-37  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0661  signal transduction histidine kinase  40.5 
 
 
537 aa  152  1e-35  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0215  signal transduction histidine kinase  37.25 
 
 
531 aa  153  1e-35  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.69088 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1806  periplasmic sensor Signal transduction histidine kinase  38.52 
 
 
619 aa  147  9e-34  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1175  hypothetical protein  33.82 
 
 
528 aa  145  2e-33  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1181  hypothetical protein  33.82 
 
 
528 aa  145  3e-33  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2939  histidine kinase  27.35 
 
 
566 aa  145  3e-33  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.875107  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3629  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  27.54 
 
 
566 aa  143  9.999999999999999e-33  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0723  type IV pilus sensor protein PilS  35.88 
 
 
530 aa  143  9.999999999999999e-33  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0824  sensor protein PilS  35.63 
 
 
531 aa  142  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.1537  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2554  sensor protein PilS  33.33 
 
 
528 aa  142  3e-32  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.041487 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2545  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  41.13 
 
 
556 aa  138  4e-31  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.668362  normal  0.0765765 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1504  histidine kinase  33.12 
 
 
587 aa  135  3.9999999999999996e-30  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2617  histidine kinase  37.14 
 
 
531 aa  134  5e-30  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  decreased coverage  0.000901254  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5186  two-component sensor PilS  36.72 
 
 
530 aa  133  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3344  multi-sensor signal transduction histidine kinase  32.33 
 
 
584 aa  133  1.0000000000000001e-29  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4839  sensor protein PilS  37.93 
 
 
529 aa  131  4.0000000000000003e-29  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.82522  normal  0.50188 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_60250  two-component sensor PilS  36.72 
 
 
530 aa  131  4.0000000000000003e-29  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000371089 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3382  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.88 
 
 
572 aa  129  1.0000000000000001e-28  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0676  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  32.17 
 
 
576 aa  128  3e-28  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.268239  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04880  two-component system sensor protein  32.8 
 
 
537 aa  127  5e-28  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.457628  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0959  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  34.65 
 
 
566 aa  126  2e-27  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0379  histidine kinase  32.92 
 
 
694 aa  124  5e-27  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0254109 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0867  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.62 
 
 
568 aa  123  9e-27  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.134517 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1499  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.95 
 
 
565 aa  123  9.999999999999999e-27  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3165  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.8 
 
 
592 aa  119  1.9999999999999998e-25  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.374256  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1111  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  31.6 
 
 
571 aa  119  3e-25  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.28025  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0966  sensor protein PilS  33.58 
 
 
530 aa  118  3.9999999999999997e-25  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.253807  normal  0.772393 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0722  signal transduction histidine kinase  38.31 
 
 
552 aa  115  4.0000000000000004e-24  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00200947  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2036  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.52 
 
 
555 aa  115  4.0000000000000004e-24  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.435386  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2116  two-component system, sensor protein  32.52 
 
 
536 aa  114  5e-24  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2270  multi-sensor signal transduction histidine kinase  34.89 
 
 
548 aa  114  5e-24  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2123  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  34.4 
 
 
549 aa  104  7e-21  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.0815467 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0091  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.71 
 
 
486 aa  95.5  3e-18  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1524  histidine kinase  33.64 
 
 
592 aa  92.8  2e-17  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.64718e-19 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2716  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.18 
 
 
592 aa  92  3e-17  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0531  sensory histidine kinase AtoS  31.2 
 
 
611 aa  91.7  5e-17  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1700  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  33.59 
 
 
591 aa  90.5  9e-17  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0184  sensor protein PilS, putative  29.61 
 
 
530 aa  89.7  2e-16  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2013  multi-sensor hybrid histidine kinase  28.62 
 
 
801 aa  89.4  2e-16  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0813  histidine kinase  31.17 
 
 
587 aa  89  2e-16  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0363  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  29.61 
 
 
530 aa  89.7  2e-16  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal  0.63729 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3598  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  29.22 
 
 
479 aa  89  3e-16  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0962  sensor histidine kinase  30.2 
 
 
655 aa  87.8  6e-16  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1953  histidine kinase  32.27 
 
 
661 aa  87.4  7e-16  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2632  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.06 
 
 
510 aa  87.4  8e-16  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0437  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  29.46 
 
 
412 aa  87.4  9e-16  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.148474  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0619  histidine kinase  29.91 
 
 
313 aa  86.7  0.000000000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2495  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  31.53 
 
 
363 aa  86.7  0.000000000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2511  multi-sensor signal transduction histidine kinase  30.34 
 
 
543 aa  86.7  0.000000000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0173  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.33 
 
 
495 aa  86.3  0.000000000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.875361  hitchhiker  0.00423579 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1487  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  28.52 
 
 
491 aa  86.3  0.000000000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.470629  normal  0.424816 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2677  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  29.55 
 
 
395 aa  85.5  0.000000000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.971959  normal  0.344308 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1199  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  25.72 
 
 
604 aa  84.7  0.000000000000005  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00529725 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2848  histidine kinase  29.52 
 
 
481 aa  84.7  0.000000000000005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0589  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  20.55 
 
 
520 aa  84.7  0.000000000000005  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0969  sensory histidine kinase AtoS  27.62 
 
 
622 aa  84.7  0.000000000000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000351141  normal  0.40359 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2551  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  30.41 
 
 
396 aa  84.7  0.000000000000006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.14529e-19 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1119  sensor histidine kinase/response regulator  27.23 
 
 
420 aa  84.3  0.000000000000007  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1662  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  27.89 
 
 
396 aa  84.3  0.000000000000007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1311  sensory histidine kinase AtoS  28.4 
 
 
614 aa  84  0.000000000000009  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3601  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  27.08 
 
 
399 aa  83.6  0.00000000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2932  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  28.17 
 
 
394 aa  82.4  0.00000000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000651793  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4629  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.45 
 
 
559 aa  82.4  0.00000000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.119322  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2015  two component hybrid sensor response regulator  27.85 
 
 
391 aa  82.8  0.00000000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1396  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  28.22 
 
 
547 aa  83.2  0.00000000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0172  sensory histidine kinase AtoS  28.33 
 
 
621 aa  82.8  0.00000000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.557198  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1306  histidine kinase  28.48 
 
 
663 aa  82  0.00000000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0116699  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1907  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  29.24 
 
 
747 aa  82.4  0.00000000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1016  sensor protein ZraS  31 
 
 
450 aa  82.4  0.00000000000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0625472  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0448  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  29.07 
 
 
519 aa  82.4  0.00000000000003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1952  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  26.76 
 
 
752 aa  81.6  0.00000000000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.664907  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2270  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.27 
 
 
661 aa  81.6  0.00000000000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1628  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  26.91 
 
 
929 aa  82  0.00000000000004  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3120  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  28.99 
 
 
561 aa  81.3  0.00000000000005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2997  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.06 
 
 
490 aa  81.3  0.00000000000005  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.45317 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4825  multi-sensor signal transduction histidine kinase  30.77 
 
 
582 aa  81.6  0.00000000000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.924426 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2551  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  31.42 
 
 
401 aa  81.3  0.00000000000005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.203481  normal  0.134636 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0016  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  30.8 
 
 
679 aa  81.6  0.00000000000005  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.225702  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2402  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  27.91 
 
 
803 aa  81.6  0.00000000000005  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.623752 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1494  sensory box histidine kinase  31.4 
 
 
550 aa  81.3  0.00000000000006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.102326  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0670  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  29.66 
 
 
546 aa  81.3  0.00000000000006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0451507  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1365  histidine kinase  29.3 
 
 
496 aa  80.9  0.00000000000007  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2985  histidine kinase  33.64 
 
 
498 aa  80.9  0.00000000000007  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3392  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.09 
 
 
662 aa  80.9  0.00000000000008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000136214  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0739  histidine kinase  26.67 
 
 
420 aa  80.5  0.00000000000009  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0617  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.57 
 
 
557 aa  80.9  0.00000000000009  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.543989  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1059  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  27.63 
 
 
498 aa  80.1  0.0000000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5442  two-component sensor CbrA  30.77 
 
 
983 aa  80.1  0.0000000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1178  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.27 
 
 
616 aa  80.5  0.0000000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.375911  normal  0.307553 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0632  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  28.63 
 
 
695 aa  80.5  0.0000000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.554525  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0494  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.31 
 
 
491 aa  80.1  0.0000000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2667  histidine kinase  31.86 
 
 
486 aa  80.1  0.0000000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>